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        金魚(Carassius auratus)咽部寄生洪湖碘泡蟲(Myxobolus honghuensis)的分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析

        2021-03-05 02:51:10張善霹江小斌王洪城蔡雷鳴楊小強
        漁業(yè)研究 2021年1期

        郭 睿,張善霹,江小斌,王 偉,王洪城,蔡雷鳴,楊小強

        (福州市海洋與漁業(yè)技術中心,福建 福州 350007)

        粘孢子綱(Myxosporea)類群是一類種類繁多、分布廣泛的后生動物寄生蟲,已鑒定的種類約2 200種,其主要寄主為魚類[1-2],也可寄生于昆蟲、兩棲類、爬行類及哺乳動物等[3-4],是水生動物養(yǎng)殖中的重要寄生蟲病原。碘泡蟲在廣義上泛指胞質內含有嗜碘泡的一類粘孢子蟲;狹義上指碘泡科(Myxobolidae)的種類,為粘孢子綱最大的一科,該科種類及相關類群在屬和種階元的分類問題上一直存在爭議[5]。

        金魚(Carassiusauratus)隸屬于硬骨魚綱、鯉形目、鯉科、鯽屬,是我國傳統(tǒng)的名貴觀賞魚類和人們樂于飼養(yǎng)的觀賞魚類。金魚在養(yǎng)殖過程中易受到寄生蟲、細菌和病毒等病原的侵襲,不僅影響觀賞價值,嚴重時還會引起死亡,造成較大經(jīng)濟損失。金魚養(yǎng)殖中常見寄生蟲有多子小瓜蟲(Ichthyophthiriusmultifilis)、車輪蟲(Trichodinaspp.)、指環(huán)蟲(Dactylogyrusspp.)和粘孢子蟲,其中粘孢子蟲中的碘泡蟲寄生部位在鰓較為常見,未見有寄生在金魚咽部的碘泡蟲報道。

        在2018年開展福州地區(qū)金魚病害監(jiān)測調查中,筆者首次發(fā)現(xiàn)某養(yǎng)殖場所采集部分金魚的咽部存在大量粘孢子蟲(碘泡蟲),為確定病原,對其使用18SrDNA和ITS-5.8S基因進行了分子鑒定及系統(tǒng)發(fā)育樹的構建和分析,以期為金魚粘孢子蟲病的防控提供理論參考和技術支持。

        1 材料與方法

        1.1 樣本采集和保存

        金魚病樣采自福州地區(qū)某金魚養(yǎng)殖場,隨機采樣20尾,體質量5~10 g。采樣時水溫27~29℃,病魚離群獨游、游動乏力、浮頭消瘦。鰓絲及體表黏液水封片未見寄生蟲,但發(fā)現(xiàn)部分魚體咽部發(fā)紅略腫大,將病魚鰓蓋沿鰓弓線剪開,可見咽部存在大量白色包囊,刮取包囊制備水封片使用Zeiss Axio Imager A2顯微鏡觀察拍照,發(fā)現(xiàn)大量碘泡蟲。吸取部分蟲體使用95%乙醇固定后,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 蟲體基因組DNA的提取

        將95%乙醇固定的部分孢子,5 000 r/min離心10 min后去除上清,使用DNeasy Blood & Tissue Kit(Qiagen,德國)按照說明書操作提取基因組DNA,標記為FZCL18,作為寄生蟲分子鑒定模板,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 蟲體目的片段的克隆和測序

        使用C1000 Touch基因擴增儀(Bio-rad,美國)進行PCR。擴增18SrDNA基因所用引物參考Andree等[6],擴增ITS-5.8S基因所用引物參考李丹等[7],引物序列、退火溫度及擴增片段大小見表1,具體為94℃預變性5 min,運行32個循環(huán),包括94℃變性30 s、52℃(或57℃)退火30 s、72℃延伸100 s(或30 s)、72℃充分延伸7 min。PCR反應體系(50 μL)包括:Go Taq Green Master Mix(Promega,美國)25 μL,25 mM的引物各1 μL,模板DNA 1 μL,用去離子水調整終體積至50 μL。PCR產(chǎn)物經(jīng)15 g/L瓊脂糖凝膠電泳后使用E.Z.N.A Gel Extraction Kit(Omega,美國)切膠回收目的片段,參照pMD18-T克隆試劑盒的操作步驟對目的片段進行連接和轉化。經(jīng)菌落PCR篩選陽性克隆后提取質粒使用ABI 3730 DNA 測序儀測序,并用Mega 5.2對測序結果進行校正。

        表1 PCR反應所用引物及目的片段大小

        1.4 系統(tǒng)發(fā)育樹的構建和分析

        將FZCL18的18SrDNA和ITS-5.8S基因序列與GenBank中已報道核酸序列進行在線BLAST分析,調出與所測序列同源性較高的核酸序列,并參照劉曉聰?shù)萚2]下載相關蟲株對應序列。將上述序列使用Mega 5.2完成序列比對后,以相近蟲屬尾孢蟲(Henneguyaspp.)或單極蟲(Thelohanellussp.)為外群,采用臨接近法(Neighbor-joining method,NJ)構建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過自舉分析(Bootstrap)進行置信度檢測,自舉次數(shù)1 000次,以估算內分支支持率。

        首先,在縮減開支方面,不少大中型企業(yè)極力縮減不必要的營銷崗位,以鏈家網(wǎng)為例,今年下半年,房地產(chǎn)業(yè)在高杠桿的影響下開始進行產(chǎn)業(yè)調整,鏈家網(wǎng)旗下?lián)碛谢ヂ?lián)網(wǎng)、二手房中介、自如長租公寓、大數(shù)據(jù)分析等數(shù)項業(yè)務,但受近年來企業(yè)信貸融資的萎縮,除自如公寓接收到社會天使融資外,鏈家網(wǎng)線下實體店已經(jīng)實行大規(guī)模減少二手房置業(yè)經(jīng)理的策略,縮減開支,熬過房地產(chǎn)行業(yè)的嚴冬。

        2 結果

        2.1 蟲體形態(tài)

        孢子正面觀察呈梨形,縫面觀察呈梭形,前端稍尖后端鈍圓。孢子長為14.5~18.0 μm,平均值為(16.0±0.8)μm;孢子寬8.5~11.0 μm,平均值為(10.1±0.8)μm,有2個大小略有差異的極囊,極絲圈數(shù)為6~7(圖1)。

        注:A為光學顯微鏡下孢子形態(tài),標尺=20 μm;B為單孢子經(jīng)數(shù)碼放大圖片。

        2.2 蟲株18S rDNA基因和ITS-5.8S基因序列分析

        蟲株FZCL18的18SrDNA基因測序結果經(jīng)校正后獲得長度為1 353 bp的序列(GenBank登錄號為MT303850),與GenBank中已報道的洪湖碘泡蟲(M.honghuensis)和瓶囊碘泡蟲(M.ampullicapsulatus)的對應序列同源性較高,序列相似性在97.27%~98.08%,F(xiàn)ZCL18與洪湖碘泡蟲在1 353個堿基中有26個差異位點;ITS-5.8S基因測序結果經(jīng)校正后獲得長度為480 bp的序列(GenBank登錄號為MT303857),因GenBank中暫未收錄洪湖碘泡蟲對應序列,故BLAST后發(fā)現(xiàn)與本文蟲株序列相似性最高的為GenBank中收錄的2株瓶囊碘泡蟲的對應序列,序列相似性在94.58%~94.80 %之間,F(xiàn)ZCL18與瓶囊碘泡蟲在480個堿基中有25個差異位點。

        2.3 依據(jù)18S rDNA基因和ITS-5.8S基因的系統(tǒng)發(fā)育樹分析

        結合比對結果,選取相關碘泡蟲屬蟲株,采用NJ法基于18SrDNA和ITS-5.8S基因序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹如圖2和圖3,可見蟲株FZCL18與多株報道的洪湖碘泡蟲聚類,且具有較高Bootstrap值。在依據(jù)18SrDNA序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,F(xiàn)ZCL18與洪湖碘泡蟲和咽碘泡蟲(M.pharynae)聚為一個分支,在依據(jù)ITS-5.8S序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,F(xiàn)ZCL18與瓶囊碘泡蟲分別形成一個分支,沒有聚類。

        3 討論

        粘孢子蟲是一類世界性分布的動物寄生蟲,主要寄生于魚類。碘泡蟲(Myxobolusspp.)是粘孢子蟲中的最大類群,全世界報道850多種[8],我國記錄有320余種,其中寄生鯽(C.auratus)的碘泡蟲種類最多,達到50余種。部分碘泡蟲種類寄生魚類后引起嚴重的碘泡蟲病,導致魚類生長緩慢、畸形甚至致死[9]。其中寄生在異育銀鯽咽部的洪湖碘泡蟲是異育銀鯽“喉孢子蟲病”的病原,給其養(yǎng)殖帶來嚴重經(jīng)濟損失,因Liu等[10]最早在湖北洪湖地區(qū)發(fā)現(xiàn),遂鑒定命名為洪湖碘泡蟲(M.honghuensisn.sp.)。同年陸宏達等[11]報道一例江蘇鹽城地區(qū)池養(yǎng)異育銀鯽咽寄生碘泡蟲病原,命名為咽碘泡蟲(M.pharynaen.sp.),并認為該寄生蟲特異寄生在異育銀鯽口咽腔上顎的咽組織內,具有寄主和寄生咽部的專一性。之后,劉曉聰?shù)萚2]在河南龍湖地區(qū)發(fā)現(xiàn)異育銀鯽的鰓部感染洪湖碘泡蟲,但未見形成孢囊,沒有造成嚴重病害。以往有關洪湖碘泡蟲的報道,其寄主皆為異育銀鯽,主要寄生在咽部,未見有寄生在金魚咽部的碘泡蟲報道。筆者在福州地區(qū)某池養(yǎng)金魚的咽部檢出一種咽寄生的碘泡蟲,從孢子形態(tài)上觀察,與Liu等[10]和陸宏達等[11]描述的洪湖碘泡蟲或咽碘泡蟲相似,從寄生部位和形態(tài)上可初步判斷本研究碘泡蟲為洪湖碘泡蟲或咽碘泡蟲。

        由于碘泡蟲屬種類繁多以及種間形態(tài)結構的相似性,僅通過顯微觀察依靠孢子形態(tài)學對碘泡蟲屬種類進行分類鑒定存在不確定性,故對本文蟲株進行分子鑒定。除了在碘泡蟲屬等粘孢子蟲中廣泛應用的18SrDNA序列,還使用了ITS-5.8SrDNA序列外,后者包含的變異區(qū)域較多,適合于種間和種內差異研究,可用于相似物種的區(qū)別和鑒定[7,12]。在ITS-5.8SrDNA序列的擴增中,選用的引物為李丹等[7]報道的洪湖碘泡蟲特異性檢測方法中的引物,具有較高的特異性和靈敏度。本文碘泡蟲18SrDNA測序結果顯示與洪湖碘泡蟲對應序列的相似性在98.08%,依據(jù)18SrDNA構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,F(xiàn)ZCL18與洪湖碘泡蟲聚為一支,其中咽碘泡蟲與洪湖碘泡蟲聚在一起,暗示二者可能是同物異名,與劉曉聰?shù)萚2]認為二者是同一物種的結論一致。ITS-5.8S測序結果顯示與瓶囊碘泡蟲對應序列的相似性小于95 %,而GenBank中未見報道洪湖碘泡蟲或咽碘泡蟲的ITS-5.8S序列,故在依據(jù)ITS-5.8S構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,F(xiàn)ZCL18與瓶囊碘泡蟲形成姊妹群,由于本文使用的ITS-5.8S為洪湖碘泡蟲特異性檢測引物,可推測本文碘泡蟲與洪湖碘泡蟲更為接近。綜上,鑒于優(yōu)先命名的原則,將本文碘泡蟲鑒定為洪湖碘泡蟲。此外,本文所鑒定碘泡蟲與寄生異育銀鯽鰓部的瓶囊碘泡蟲[13]相比,在形態(tài)上較短、較寬,2個極囊大小略有差異且極絲圈數(shù)少于瓶囊碘泡蟲的9~10圈,在分子序列信息上,依據(jù)18SrDNA構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,瓶囊碘泡蟲沒有與洪湖碘泡蟲聚為一支,二者ITS-5.8S基因序列差異較大,再結合本文碘泡蟲與瓶囊碘泡蟲的寄生部位不同,可區(qū)分本文碘泡蟲與瓶囊碘泡蟲。

        洪湖碘泡蟲多寄生于湖北、江蘇等地區(qū)池養(yǎng)異育銀鯽上,引起諸如“喉孢子蟲病”的大規(guī)模碘泡蟲病害[10-11],也有寄生在河南地區(qū)和吉林地區(qū)養(yǎng)殖異育銀鯽的報道[2,14],可見洪湖碘泡蟲會對異育銀鯽的養(yǎng)殖造成嚴重損失。筆者發(fā)現(xiàn)洪湖碘泡蟲除了危害異育銀鯽外,也可寄生于金魚,當感染嚴重時亦可阻塞咽部或使咽部穿孔,危害金魚養(yǎng)殖。異育銀鯽是以方正銀鯽為母本與興國紅鯉為父本經(jīng)人工授精所產(chǎn)生的子代,在遺傳進化關系上,大部分學者認為銀鯽起源于鯽[15],故異育銀鯽屬于比鯽起源分化還晚的類群,以往報道洪湖碘泡蟲僅寄生于異育銀鯽,而異育銀鯽因和鯽的生境和食性相似,在養(yǎng)殖過程中可能存在混養(yǎng),本文發(fā)現(xiàn)洪湖碘泡蟲可寄生金魚(鯽),或可說明洪湖碘泡蟲可寄生有限種的鯽屬魚類。此外,本文金魚咽寄生碘泡蟲18SrDNA與異育銀鯽的咽寄生碘泡蟲對應序列存在較多差異位點,可能與同一碘泡蟲與不同宿主經(jīng)歷協(xié)同進化的自然歷史過程有關,尚需更多種群序列信息,有待進一步研究。

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