趙子慧,王緒華
(天津康圣達(dá)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司,天津 300300)
國(guó)家癌癥中心發(fā)布的中國(guó)2019年最新癌癥報(bào)告顯示,在中國(guó)每10萬人口中有57人患有肺癌,其中每年約有63萬人死于肺癌,并且患病趨勢(shì)逐年遞增。隨著國(guó)民健康意識(shí)的增強(qiáng)和螺旋CT等早期篩查技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用,在新增肺癌患者中,首次確診為中晚期肺癌的比例有所下降。但腫瘤的異質(zhì)性、晚期治療效果不佳、預(yù)后差等因素造成肺癌患者5年相對(duì)生存率僅16.1%,且據(jù)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,中國(guó)肺癌人口的死亡數(shù)高于世界平均水平。如何有效進(jìn)行早期診斷和延長(zhǎng)肺癌患者的生存率,一直是中國(guó)乃至世界肺癌臨床治療中的主要關(guān)注點(diǎn)。
肺癌是中國(guó)乃至世界發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤,臨床上分為小細(xì)胞癌和非小細(xì)胞癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),其中絕大多數(shù)是NSCLC,占80%~85%。不同組織亞型、驅(qū)動(dòng)基因?qū)е碌腘SCLC患者對(duì)于同一治療方式會(huì)產(chǎn)生不同的治療效果和預(yù)后。對(duì)于多數(shù)早期NSCLC患者,手術(shù)切除腫瘤仍是首選的治療方式。晚期NSCLC患者,病灶發(fā)生轉(zhuǎn)移,手術(shù)無法達(dá)到預(yù)期的治療效果。因此對(duì)NSCLC進(jìn)行準(zhǔn)確分期、確定亞型、分析分子標(biāo)記物以及驅(qū)動(dòng)基因,選擇合適的治療手段和靶向藥物是晚期NSCLC合理且更有效的治療策略。相關(guān)數(shù)據(jù)表明,接受了靶向藥物和免疫治療的NSCLC患者預(yù)后得到改善,生存期得以延長(zhǎng)。
為確?;颊甙邢蛴盟幇踩椭委熜Ч?,伴隨診斷(companion diagnostic,CD)應(yīng)運(yùn)而生。伴隨診斷是一種體外診斷技術(shù),可提供安全有效的信息為患者藥物和治療方案的選擇提供依據(jù),并且?guī)椭t(yī)護(hù)人員確定治療對(duì)患者的獲益是否超過潛在的副作用或風(fēng)險(xiǎn)。伴隨診斷的優(yōu)勢(shì)概括來講,具有以下兩點(diǎn):①可以幫助醫(yī)生充分了解患者信息,制定最佳治療方案;②可以幫助患者規(guī)避用藥風(fēng)險(xiǎn),節(jié)省大量開支,降低醫(yī)療成本。本文主要闡述當(dāng)前NSCLC伴隨診斷中的分子標(biāo)記物和相關(guān)的檢測(cè)手段。
根據(jù)最新版美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(national comprehensive cancer network,NCCN)非小細(xì)胞肺癌治療指南,將表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)、間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)、肉瘤致癌因子-受體酪氨酸激酶(ROSproto-oncogene1,receptortyrosine kinase,ROS1)、鼠類肉瘤病毒基因同源體B(v-Raf murine sarcoma viral oncogene homolog B,BRAF)、免疫治療靶點(diǎn)程序性死亡配體(programmed cell death ligand 1,PD-L1)、神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體酪氨酸激酶(neurotrophic receptor kinase,NTRK)納入常規(guī)臨床分子檢測(cè),并建議檢測(cè)新的分子靶標(biāo)間充質(zhì)-上皮轉(zhuǎn)變(mesenchymal-epithelial transition,MET)、原癌基因(proto-oncogene,RET)、人表皮生長(zhǎng)因子受體-2(human epidermalgrowth factor receptor-2,HER2)及腫瘤突變負(fù)荷(tumor mutational burden,TMB)以評(píng)估不同人群對(duì)不同靶向藥物的藥敏性及預(yù)后。
EGFR是一種受體型酪氨酸激酶,在細(xì)胞膜上表達(dá)。正常情況下,EGFR胞外端與配體結(jié)合形成二聚體,胞內(nèi)端與ATP結(jié)合后發(fā)生磷酸化,然后激活多種下游信號(hào)通路,如蛋白激酶C(protein kinase C,PKC)、酪氨酸激酶(Janus kinase,JAK)、細(xì)胞外調(diào)節(jié)蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK)等信號(hào)通路,調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分化和發(fā)育等多種生理過程。EGFR突變會(huì)造成EGFR結(jié)構(gòu)域的活化,異常激活下游信號(hào)通路,促使腫瘤細(xì)胞惡性增殖。EGFR突變常見于腫瘤細(xì)胞中,包括NSCLC,在亞洲NSCLC患者中,EGFR突變約占50%,且EGFR的突變多發(fā)生在18~21號(hào)外顯子上,目前已經(jīng)檢測(cè)到的EGFR突變約70余種。多種小分子酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitors,TKI)通過阻斷EGFR信號(hào)向下游信號(hào)通路的傳遞,用于NSCLC的治療。
ALK是NSCLC的驅(qū)動(dòng)基因之一,有1%~7%的NSCLC患者中會(huì)出現(xiàn)ALK重排,目前臨床上已經(jīng)發(fā)現(xiàn)有多種異常基因重排,ALK-EML4重排是NSCLC中最常見的類型。臨床研究發(fā)現(xiàn)ALK重排的NSCLC患者對(duì)EGFR-TKI具有耐藥性。
BRAF蛋白是一種絲氨酸/蘇氨酸激酶,有1%~2%的NSCLC患者表現(xiàn)為BARF
基因突變,BRAF
V600E是最常見的突變亞型,臨床研究發(fā)現(xiàn)同時(shí)出現(xiàn)BARF
突變、EGFR
突變、ALK
重排和ROS1
重排,在NSCLC患者中比較罕見。ROS1也是一種受體型酪氨酸激酶。與EGFR類似,ROS1重排后會(huì)導(dǎo)致下游信號(hào)通路持續(xù)激活,促使細(xì)胞惡性增殖。有1%~2%的NSCLC患者會(huì)表現(xiàn)出ROS1重排,且多數(shù)出現(xiàn)在EGFR突變、KRAS突變和ALK重排3者皆是陰性的患者中。
KRAS是GTPase活性的G蛋白,是MAP/ERK途徑的一部分。KRAS
基因突變驅(qū)動(dòng)的NSCLC患者人數(shù)僅次于EGFR
基因突變患者,是NSCLC的第二大驅(qū)動(dòng)基因,KRAS
突變狀態(tài)也預(yù)示著EGFR-TKI類藥物缺乏療效。KRAS
突變通常不會(huì)與EGFR
、ROS1
、BRAF
和ALK
基因變異重疊。因此,KRAS
突變檢測(cè)可能會(huì)識(shí)別出無法從進(jìn)一步的分子檢測(cè)中受益的患者。靶向治療目前尚不能用于具有KRAS
突變的患者。PD-L1是NSCLC的免疫篩查點(diǎn),腫瘤細(xì)胞上表達(dá)的PD-L1蛋白與T細(xì)胞上的程序性死亡受體(programmed cell death 1,PD1)結(jié)合,阻止T細(xì)胞對(duì)腫瘤細(xì)胞的識(shí)別?;谝陨蠙C(jī)制,NSCLC的免疫療法是靶向藥物通過競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合PD-L1/PD-1免疫位點(diǎn),激發(fā)或調(diào)動(dòng)機(jī)體的免疫系統(tǒng),增強(qiáng)抗腫瘤免疫力,從而控制和殺傷腫瘤細(xì)胞,恢復(fù)患者的免疫系統(tǒng),使其可以被正常激活。
ERBB2
突變、RET
基因融合、高水平MET擴(kuò)增腫瘤突變負(fù)擔(dān)(TMB)均是NSCLC新的驅(qū)動(dòng)基因。盡管NCCN指南建議可將上述標(biāo)志物作為NSCLC晚期患者生物標(biāo)志物的篩查范圍,但這些新的生物標(biāo)記物目前廣泛應(yīng)用到實(shí)際臨床檢測(cè)中仍需要大量的臨床試驗(yàn)。就目前分子標(biāo)記物的檢測(cè)方法看,盡管同一分子標(biāo)志物可以用不同的方法進(jìn)行檢測(cè),但不同檢測(cè)技術(shù)的成本、檢測(cè)靈敏度不同(表1)。臨床應(yīng)用可根據(jù)NSCLC患者的具體情況,選擇合適的檢測(cè)技術(shù)。
表1 NCCN推薦的非小細(xì)胞肺癌分子靶標(biāo)的主要檢測(cè)方法
免疫組化(immunohistochemistry,IHC)檢測(cè)方法可檢測(cè)某個(gè)基因的全蛋白表達(dá),可以檢測(cè)新鮮腫瘤組織、石蠟組織、胸腹水等不同來源的樣本,具有檢測(cè)靈敏度高,檢測(cè)周期短且檢測(cè)成本相對(duì)比較低等優(yōu)勢(shì)。但免疫組化檢測(cè)是一種半定量檢測(cè)技術(shù),檢測(cè)結(jié)果受抗體質(zhì)量影響很大,對(duì)抗原表達(dá)程度的判斷主要通過人眼識(shí)別,主觀因素影響大。隨著其他技術(shù)的發(fā)展,IHC多用于分子標(biāo)記物PD-L1的檢測(cè)。
最新版的美國(guó)病理學(xué)家聯(lián)合學(xué)會(huì)(CAP)/國(guó)際肺癌研究協(xié)會(huì)(IASLC)/分子病理學(xué)協(xié)會(huì)(AMP)肺癌治療指南推薦使用具有高靈敏度和特異性的克隆號(hào)為5A4和D5F3的ALK抗體檢測(cè)。其中NCCN指南建議可采用IHC的方法快速初篩評(píng)估ALK
重排情況,后續(xù)用熒光原位雜交(fluorescencein situ
hybridization,F(xiàn)ISH)確認(rèn),F(xiàn)DA批準(zhǔn)的利用IHC方法檢測(cè)ALK重排的[D5F3]CDx Assay試劑盒無需后續(xù)FISH判斷。PD-L1的檢測(cè)尚無統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),但NCCN推薦使用FDA批準(zhǔn)的4個(gè)檢測(cè)試劑Ventana PD-L1 SP263測(cè)定法、Dako 28-8 PharmDx、22C3 PharmDx和Ventana PD-L1 SP142測(cè)定。FISH可用于檢測(cè)ALK
重排、ROS1
基因融合和NTRT
基因融合。FISH可以檢測(cè)肺癌新鮮組織、石蠟組織、細(xì)胞懸液等多種來源的樣本,具有檢測(cè)周期短、特異性高、結(jié)果易于觀察的優(yōu)勢(shì)。但缺點(diǎn)是FISH探針的設(shè)計(jì)需要明確待測(cè)基因的檢測(cè)位點(diǎn),因此FISH只能定性檢測(cè)到目的基因重排。并且較多的測(cè)試步驟容易使信號(hào)丟失,造成假陰性結(jié)果。FISH作為檢測(cè)ALK
重排的金標(biāo)準(zhǔn),是NCCN治療指南和CAP/IASLC/AMP肺癌治療指南推薦的檢測(cè)ALK
重排方法之一。NCCN推薦使用FDA批準(zhǔn)的雅培公司的Vysis ALK Break Apart FISH Probe Kit評(píng)估ALK
重排情況。一代測(cè)序Sanger測(cè)序法可以檢測(cè)EGFR
突變和BRAF
突變,是目前臨床上檢測(cè)EGFR
突變的常用方法之一。Sanger測(cè)序法可以檢測(cè)新鮮組織和石蠟組織切片。盡管Sanger測(cè)序可以檢測(cè)已知突變位點(diǎn)和未知突變,但是檢測(cè)靈敏度相對(duì)較低,通常只有超過20%的突變才可以被檢測(cè)到,但檢測(cè)成本低、周期短是其最大的優(yōu)勢(shì),被認(rèn)為是NSCLC中檢測(cè)EGFR
突變的“金標(biāo)準(zhǔn)”,也是目前臨床上用于檢測(cè)EGFR
突變最通用的方法之一。二代測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)具有高通量的測(cè)序特點(diǎn),可以同時(shí)檢測(cè)除PD-L1外的所有分子標(biāo)志物的已知和未知點(diǎn)突變、重排或基因融合,可檢測(cè)標(biāo)本遺傳變化,篩選新的驅(qū)動(dòng)基因或生物標(biāo)志物。NGS的靈敏度比Sanger測(cè)序高得多,并且根據(jù)測(cè)序深度,原則上可以檢測(cè)到低至0.1%的等位基因頻率。但是NGS周期長(zhǎng),通常需要10~20個(gè)工作日,且成本較高。目前NGS多用于檢測(cè)多個(gè)指標(biāo)的腫瘤方案,為患者選擇個(gè)性化治療方案提供信息。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)可用來檢測(cè)基因突變,檢測(cè)樣本可以是新鮮組織、血清和石蠟組織等多種來源的核酸,操作簡(jiǎn)單、檢測(cè)成本低、周期短、結(jié)果可視。與Sanger測(cè)試法類似,qPCR只能檢測(cè)已知突變,但檢測(cè)時(shí)間遠(yuǎn)低于Sanger測(cè)序。利用qPCR方法檢測(cè)NSCLC的EGFR
突變、ALK重排、ROS1
基因融合、NTRT
基因融合在臨床上被廣泛應(yīng)用。突變擴(kuò)增系統(tǒng)(amplification refractory mutation system,PCR-ARMS)可檢測(cè)新鮮組織、血清、胸腹水和保存少于2年的石蠟組織,優(yōu)勢(shì)是特異性高、檢測(cè)時(shí)間短、靈敏度遠(yuǎn)高于Sanger測(cè)序法。與qPCR相比,PCR-AMRS檢測(cè)基因突變只能對(duì)已知突變進(jìn)行檢測(cè),無法檢測(cè)未知突變。PCR-ARMS也是NCCN指南和最新版CAP/IASLC/AMP指南推薦的檢測(cè)EGFR
已知突變的方法之一,在臨床上檢測(cè)上得到廣泛應(yīng)用。最早出現(xiàn)的伴隨診斷產(chǎn)品是1998年FDA批準(zhǔn)的一種名為赫賽汀的靶向藥物產(chǎn)品。盡管目前該領(lǐng)域中已經(jīng)有相當(dāng)多的生物醫(yī)學(xué)相關(guān)的知名企業(yè)包括Dako(安捷倫科技)、Qiagen公司、羅氏、雅培、Ventana醫(yī)療、生物梅里埃(bioMerieux)、Myriad Genetics、Resonance Health、及Leica Microsystems等正與制藥公司合作開發(fā)伴隨診斷試劑盒,但事實(shí)上伴隨診斷市場(chǎng)仍然處于發(fā)展階段,大量產(chǎn)品處于研發(fā)時(shí)期。美國(guó)是目前伴隨診斷產(chǎn)品和技術(shù)最先進(jìn)的國(guó)家,占伴隨診斷市場(chǎng)的30%。
腫瘤學(xué)是伴隨診斷市場(chǎng)中創(chuàng)收最高的疾病領(lǐng)域,多種用于各類癌癥生物標(biāo)志物檢測(cè)的伴隨診斷產(chǎn)品被開發(fā),截止到2020年1月,F(xiàn)DA共批準(zhǔn)了38個(gè)伴隨診斷產(chǎn)品,與腫瘤相關(guān)的高達(dá)36個(gè),涉及包括NSCLC在內(nèi)的多種腫瘤如乳腺癌、NSCLC、卵巢癌、B細(xì)胞慢性淋巴細(xì)胞性白血病等多種靶向藥物的診斷。其中用于NSCLC的伴隨診斷試劑共9種,涉及15種靶向藥物的伴隨診斷(表2)。
中國(guó)尚無明確的關(guān)于伴隨診斷的定義或法規(guī)條文,國(guó)內(nèi)審批通過的NSCLC伴隨診斷產(chǎn)品共3個(gè),ALK
基因斷裂熒光原位雜交法檢測(cè)試劑盒(Vysis ALK break apart FISH probe kit)、PD-L1免疫組織化學(xué)法檢測(cè)試劑盒(PD-L1 IHC 22C3 pharmDx)和新一代cobasEGFR突變檢測(cè)試劑盒(cobasEGFR mutation test v2),以體外診斷試劑的名目歸類在3類醫(yī)療器械中。目前國(guó)內(nèi)獲批上市腫瘤相關(guān)的3類醫(yī)療器械診斷試劑盒約800種,其中與NSCLC相關(guān)的檢測(cè)試劑盒最多,這意味著NSCLC的伴隨診斷在中國(guó)有潛在的巨大市場(chǎng)。EGFR
突變、ALK
和ROS1
重排及BRAF
突變。NSCLC的臨床診斷技術(shù)在不斷革新,新的伴隨診斷產(chǎn)品的發(fā)展必將結(jié)合不同的技術(shù)方法(如多重IHC分析、NGS測(cè)序、代謝組學(xué)等),整合多種檢測(cè)結(jié)果的信息,為患者更精準(zhǔn)的個(gè)性化治療方案提供幫助。然而如何整合這些技術(shù),提供可靠的整合信息,是包括NSCLC在內(nèi)的所有伴隨診斷面臨的一大難題。伴隨診斷試劑因?yàn)槭褂貌煌脑\斷技術(shù)、試劑和平臺(tái),與使用單一技術(shù)的檢測(cè)試劑價(jià)格會(huì)有所不同。大多數(shù)情況下,伴隨診斷價(jià)格昂貴,且未納入醫(yī)保。因此,高昂的價(jià)格促使人們選擇那些有相等或可接受的靈敏度和特異性的替代檢測(cè)方法和診斷試劑盒。如2013年FDA批準(zhǔn)上市的檢測(cè)EGFR
突變的伴隨診斷試劑therascreen EGFR RGQ PCR,其利用PCR方法檢測(cè)EGFR
突變陽性的NSCLC患者適宜接受吉非替尼、阿法替尼、達(dá)克替尼這3種藥物治療。然而實(shí)際臨床中,NCCN推薦的檢測(cè)EGFR
突變的方法包括但不限于PCR,用于體外診斷檢測(cè)EGFR
突變的試劑盒多達(dá)數(shù)十種。高昂價(jià)格使得NSCLC伴隨診斷試劑的臨床應(yīng)用效果并不理想。生物標(biāo)記物發(fā)展與靶向藥物的發(fā)展不平衡也是伴隨診斷難以廣泛應(yīng)用于臨床的一個(gè)問題。FDA批準(zhǔn)的PD-L1伴隨診斷體系Ventana PD-L1 SP142利用IHC方法檢測(cè)PD-L1的表達(dá),PD-L1陽性的患者適宜接受阿替利珠單抗用于免疫治療。但是,實(shí)際情況是一些IHC顯示PDL1強(qiáng)陽性的患者并不一定對(duì)免疫療法有反應(yīng),伴隨診斷試劑的完善需要靶向藥物的研發(fā)作支撐。基于中國(guó)的人口基數(shù)、NSCLC的發(fā)病率以及國(guó)內(nèi)市場(chǎng)上明確的伴隨診斷產(chǎn)品的空白等原因,中國(guó)伴隨診斷的市場(chǎng)發(fā)展?jié)摿薮?,但中?guó)想要發(fā)展自己的伴隨診斷產(chǎn)品仍然有實(shí)際困難。首先,國(guó)內(nèi)沒有明確的伴隨診斷的定義和相關(guān)法規(guī)條文,缺乏有效的市場(chǎng)監(jiān)管體系。其次,伴隨診斷產(chǎn)品對(duì)靈敏度和特異性的要求很高,而影響伴隨診斷檢測(cè)的結(jié)果較多,包括樣本來源、處理時(shí)間、保存方式、操作人員的熟練程度等均可能影響結(jié)果的判定。所以明確定義,制定嚴(yán)格的生產(chǎn)標(biāo)準(zhǔn),行業(yè)準(zhǔn)則,規(guī)范市場(chǎng)監(jiān)管體系是國(guó)內(nèi)伴隨診斷產(chǎn)品發(fā)展首先要解決的問題。
表2 FDA批準(zhǔn)可用于非小細(xì)胞肺癌的伴隨診斷產(chǎn)品[41]
NSCLC作為全球致死率較高的腫瘤,改善預(yù)后、提高患者的生存率一直是臨床關(guān)注的主要問題,而腫瘤異質(zhì)性是NSCLC患者預(yù)后較差的主要原因。隨著人們醫(yī)療意識(shí)的提升,檢測(cè)手段和靶向藥物的發(fā)展,NSCLC患者的生存率得到了一定程度的改善。伴隨診斷以靶向藥物用藥安全為出發(fā)點(diǎn),通過多種檢測(cè)技術(shù)整合檢測(cè)信息,為患者提供較為精確的用藥建議,從而達(dá)到個(gè)性化、精準(zhǔn)化醫(yī)療的目的。伴隨診斷可以幫助醫(yī)生充分了解患者信息,疾病進(jìn)展,為患者制定最佳治療方案,規(guī)避用藥風(fēng)險(xiǎn),達(dá)到節(jié)省開支,降低醫(yī)療成本的作用。對(duì)于相關(guān)企業(yè)來講,開發(fā)伴隨診斷產(chǎn)品、明確靶向藥物的應(yīng)用特性,有助于新藥研發(fā)和產(chǎn)品定位,可推動(dòng)企業(yè)擴(kuò)大市場(chǎng),帶來更多利潤(rùn)。盡管中國(guó)伴隨診斷市場(chǎng)的開發(fā)仍有多種實(shí)際困難,但伴隨診斷的研發(fā)應(yīng)用可以使多方獲益,是診斷市場(chǎng)發(fā)展的一大趨勢(shì)。