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        多囊卵巢綜合征與THADA基因多態(tài)性研究

        2021-02-05 09:34:02帕孜力亞牙生
        醫(yī)學(xué)研究雜志 2021年1期
        關(guān)鍵詞:分析研究

        帕孜力亞·牙生 姚 華 占 瓊 趙 靜

        多囊卵巢綜合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)是一種高度流行的內(nèi)分泌疾病和婦科疾病,伴有月經(jīng)不規(guī)律、不孕、肥胖、多毛、痤瘡和血生化水平異常等癥狀[1~3]。據(jù)統(tǒng)計(jì),全球18~44歲的女性PCOS的發(fā)生率為5%~20%,且呈逐年上升趨勢(shì)[4,5]。許多研究表明遺傳因素與PCOS的病因有密切關(guān)系,經(jīng)過(guò)2期PCOS的全基因組相關(guān)性研究(genome-wide association studies,GWAS)發(fā)現(xiàn)了11個(gè)PCOS的易感位點(diǎn)與17個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)[6],其中包括甲狀腺腺瘤相關(guān)蛋白THADA基因。

        甲狀腺激素主要參與能量代謝,若甲狀腺功能障礙會(huì)干擾能量代謝[7]。THADA編碼在腎上腺髓質(zhì)、腎上腺皮質(zhì)、甲狀腺、胰腺、睪丸、胸腺、小腸和胃中表達(dá)的甲狀腺腺瘤相關(guān)蛋白,與能量代謝紊亂有關(guān)。研究表明,THADA基因可能通過(guò)減少能量產(chǎn)生并增加肥胖易感性影響PCOS的風(fēng)險(xiǎn)[7,8]。但是,確切病因仍未完全闡明。因此本研究旨在分析可能與PCOS發(fā)生相關(guān)的THADA基因多態(tài)性,為PCOS的診斷和病因?qū)W研究提供依據(jù),為制定預(yù)防PCOS的措施奠定基礎(chǔ)。

        材料與方法

        1.研究對(duì)象:經(jīng)筆者醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理學(xué)委員會(huì)審核通過(guò)后,收集2018年4月~2019年10月在新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院婦科門(mén)診做備孕檢查的健康備孕女性166例和同期同院生殖助孕中心的PCOS確診患者166例臨床資料及全血標(biāo)本,用iMLDR技術(shù)檢測(cè)THADA基因多態(tài)性。兩組女性年齡控制在20~35歲且均已簽署知情同意書(shū),并排除合并糖尿病等內(nèi)分泌疾病、其他婦科疾病、合并感染者。

        2.研究方法:主要包括以下兩方面:(1)通過(guò)病歷查閱的方式收集兩組女性實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)指標(biāo):抗苗勒管激素(anti-Müllerian hormone,AMH)、卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone,F(xiàn)SH)、黃體生成素(Luteinizing hormone,LH)、雌二醇(estrodiol,E2)、空腹血糖(fasting plasma glucose,F(xiàn)PG)、同型半胱氨酸(homocysteine,Hcy)。(2)兩組女性在靜息空腹?fàn)顟B(tài)下自前臂肘正中靜脈取4ml血,用全血基因組DNA快速提取試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司,離心柱型]提取DNA并用超微量分光光度計(jì)進(jìn)行定量,檢測(cè)DNA濃度。根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)以及利用國(guó)際HapMap數(shù)據(jù)庫(kù)中的中國(guó)人群基因組SNPs基因型信息(CHB),挑選與PCOS相關(guān)的THADA基因3個(gè)位點(diǎn),分別為rs12468394、rs13429458和rs7563201。根據(jù)目標(biāo)位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物(上海生工生物工程有限公司提供,表1),進(jìn)行多重PCR反應(yīng)。采用改良多重高溫連接酶反應(yīng)(improve multiplex ligasedetection reaction,iMLDR)技術(shù)測(cè)定基因型。

        表1 PCR引物序列

        3.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:采用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件和SHEsis軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,所有研究對(duì)象進(jìn)行基因位點(diǎn)的Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)。PCOS組和對(duì)照組基因型和等位基因頻率的變量組間比較采用χ2檢驗(yàn),通過(guò)Logistic回歸衡量?jī)山M基因組分布及等位基因頻率的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度。隨后用單因素方差分析去比較所研究的PCOS相關(guān)臨床指標(biāo)與相關(guān)基因位點(diǎn)的多種基因型。

        結(jié) 果

        1.THADA基因位點(diǎn)的Hardy-Weinberg遺傳平衡性檢驗(yàn):經(jīng)Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)顯示,THADA基因的基因型頻率分布均符合平衡定律 (P均>0.05),而且,所選位點(diǎn)遺傳標(biāo)記在人群中的最小等位基因頻率(MAF)≥5%,由此提示,本次研究樣本來(lái)自一個(gè)穩(wěn)定的群體,收集的樣本具有較好的代表性,詳見(jiàn)表2。

        表2 Hardy-Weinberg遺傳平衡性檢驗(yàn)

        2.THADA基因各基因型和等位基因頻率的分布比較:分析PCOS組和對(duì)照組各位點(diǎn)的基因型及基因頻率的分布,對(duì)等位基因進(jìn)行OR值和95%CI的計(jì)算,分析比較不同等位基因的分布與PCOS發(fā)生的關(guān)聯(lián)。THADA基因各位點(diǎn)的基因型和等位基因在兩組女性中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。對(duì)各位點(diǎn)的等位基因納入單因素Logistic回歸分析中,發(fā)現(xiàn)各位點(diǎn)OR值的95%CI均包含1,尚不能認(rèn)為不同等位基因是PCOS的危險(xiǎn)因素,詳見(jiàn)表3。

        表3 PCOS組和對(duì)照組各位點(diǎn)基因型及等位基因頻率分布的結(jié)果[n(%)]

        3.THADA基因在不同遺傳模型中基因突變與PCOS易感性分析:進(jìn)一步構(gòu)建模型分析THADA基因多態(tài)性與PCOS易感性進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,THADA基因3個(gè)位點(diǎn)在不同模型下兩組間比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,詳見(jiàn)表4。

        4.3個(gè)基因位點(diǎn)多態(tài)性與臨床指標(biāo)之間的聯(lián)系:對(duì)兩組女性進(jìn)行THADA基因各位點(diǎn)與臨床指標(biāo)之間的關(guān)聯(lián)性分析,發(fā)現(xiàn)PCOS組中E2在rs12468394位點(diǎn)CC、AC、AA 3個(gè)基因型間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。對(duì)照組中E2在THADA基因rs13429458位點(diǎn)AA、CA、CC 3個(gè)基因型間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),詳見(jiàn)表5~表7。

        5.3個(gè)基因位點(diǎn)的連鎖不平衡分析:采用SHEsis軟件分析THADA基因3個(gè)位點(diǎn)的連鎖不平衡,按規(guī)定,當(dāng)D′>0.8和r2>0.33時(shí)代表所分析的兩位點(diǎn)連鎖不平衡,D′值和r2值越接近于1,說(shuō)明其連鎖越明顯[9]。檢驗(yàn)結(jié)果如表8和圖1所示,THADA基因rs12468394位點(diǎn)與rs13429458位點(diǎn)、rs12468394位點(diǎn)與rs7563201位點(diǎn)、rs13429458位點(diǎn)與rs7563201位點(diǎn)間均具有較強(qiáng)的連鎖不平衡(D′≥0.85)?;谏鲜鰳?gòu)建單倍體型滿足單倍體型頻率>0.03的條件時(shí)THADA基因Block 可形成3種單倍型。經(jīng)分析,THADA基因的各單倍體型與PCOS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)未觀察到明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(P>0.05,95%CI包含1),詳見(jiàn)表9。

        討 論

        PCOS是臨床上常見(jiàn)的婦科及內(nèi)分泌科疾病,近年來(lái),雖然大量PCOS相關(guān)研究對(duì)于PCOS的診治工作做出了重大貢獻(xiàn),但PCOS的發(fā)生率在世界范圍內(nèi)仍呈現(xiàn)逐年上升的趨勢(shì),其中各國(guó)報(bào)道的育齡期女性PCOS發(fā)生率為5%~20%[2]。我國(guó)育齡期女性PCOS發(fā)生率為5.6%[10]。因此,PCOS的研究依然是內(nèi)分泌及婦科學(xué)術(shù)界的熱點(diǎn)。目前關(guān)于PCOS的發(fā)生機(jī)制尚未完全闡明,大量研究資料顯示,PCOS的發(fā)生是多種因素綜合作用的結(jié)果,包括環(huán)境因素以及遺傳因素,遺傳因素是多因素變異累積的過(guò)程,涉及多種基因異常[11~13]。

        THADA基因,也稱甲狀腺腺瘤相關(guān)蛋白,位于2號(hào)染色體短臂2p21,首次發(fā)現(xiàn)于甲狀腺瘤。THADA的遺傳變異可能改變能量消耗并導(dǎo)致體重增加,肥胖會(huì)增加胰島素抵抗。因此,THADA基因變異可能通過(guò)胰島素抵抗增加PCOS風(fēng)險(xiǎn)[6]。Ⅱ期GWAS研究結(jié)果顯示THADA基因rs12468394、rs13429458、rs12478601與漢族女性PCOS發(fā)病有關(guān)[14]。隨后一項(xiàng)家系研究進(jìn)一步證實(shí)了rs13429458與PCOS的關(guān)系[15]。國(guó)外一項(xiàng)針對(duì)歐美人的研究中rs12468394也得到了驗(yàn)證,但提示rs13429458、rs12478601并無(wú)關(guān)聯(lián)。Louwers等[16]進(jìn)行的Meta分析顯示,rs12468394、rs12478601位點(diǎn)與PCOS易感性有一定的關(guān)系,rs13429458與之無(wú)關(guān)。由于眾多研究結(jié)果不一致,因此本研究也分析THADA基因rs12468394、rs13429458及rs7563201位點(diǎn),但以上3個(gè)位點(diǎn)在PCOS和對(duì)照組女性中比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。對(duì)其進(jìn)行進(jìn)一步的分析,在3種模型下分析其與PCOS的關(guān)聯(lián)性,仍未發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)的顯著差異性,因此未得出THADA基因多態(tài)性是PCOS的危險(xiǎn)因素或保護(hù)因素的結(jié)論。得出上述結(jié)論的可能原因是這些位點(diǎn)與PCOS發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)存在微效作用,而本次研究由于樣本數(shù)量不夠多,導(dǎo)致其檢驗(yàn)效能不夠強(qiáng);但也有可能是這些位點(diǎn)的確與PCOS發(fā)生不相關(guān)。

        表4 不同模型中PCOS組與對(duì)照組各基因多態(tài)性的關(guān)聯(lián)性分析[n(%)]

        表5 THADA基因rs12468394位點(diǎn)各基因型與PCOS相關(guān)因素分析[M(Q1,Q3)]

        表6 THADA基因rs13429548位點(diǎn)各基因型與PCOS相關(guān)因素分析[M(Q1,Q3)]

        表7 THADA基因rs7563201位點(diǎn)各基因型與PCOS相關(guān)因素分析[M(Q1,Q3)]

        表8 PCOS組和對(duì)照組THADA基因多態(tài)性 位點(diǎn)連鎖不平衡檢驗(yàn)

        圖1 THADA基因多態(tài)性各位點(diǎn)連鎖不平衡檢驗(yàn) 左側(cè)為D′檢驗(yàn),右側(cè)為r2檢驗(yàn)

        表9 THADA基因構(gòu)建的單倍體型在PCOS組和對(duì)照組中的分布[n(%)]

        既往基因型-表型研究表明,THADA基因與脂代謝和LH、T分泌關(guān)系密切, 對(duì)PCOS臨床特點(diǎn)的改變有一定的影響,且與卵巢多囊改變的表型有關(guān)[17]。故本研究進(jìn)一步在THADA基因rs12468394、rs13429458、rs7563201這3個(gè)位點(diǎn)的不同基因型下分析兩組女性臨床檢測(cè)指標(biāo)的差異,在PCOS組中rs12468394位點(diǎn)雜合子突變CA型的E2水平低于野生型純合子CC型,且差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),而對(duì)照組中剛好相反。分析其原因可能是該位點(diǎn)突變有可能會(huì)影響下丘腦-垂體-卵巢軸調(diào)節(jié)功能,使E2水平降低,但具體機(jī)制還需要進(jìn)一步分析。

        本研究也具有一定的局限性,本研究為單中心研究,且樣本例數(shù)偏少,可能出現(xiàn)患者的選擇偏倚,而且在分析相關(guān)基因型與疾病關(guān)聯(lián)時(shí)出現(xiàn)個(gè)別基因型未檢測(cè)的現(xiàn)象,導(dǎo)致這種現(xiàn)象的原因可能是樣本量不足所引起的偏倚。因此筆者將在后續(xù)入選病例中,完善實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),補(bǔ)充樣本量,對(duì)PCOS相關(guān)因素及機(jī)制進(jìn)行更全面、深入的研究。

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