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        環(huán)狀RNA在急性髓系白血病中的研究進(jìn)展

        2021-01-29 06:51:54徐秉岐孔德勝邊思成李英花
        醫(yī)學(xué)綜述 2021年2期
        關(guān)鍵詞:白血病標(biāo)志物測(cè)序

        徐秉岐,孔德勝,邊思成,李英花

        (1.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院血液內(nèi)科,哈爾濱 150001; 2.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院血液內(nèi)科,哈爾濱 150001)

        急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)是最常見(jiàn)的血液系統(tǒng)惡性腫瘤之一,與其他類型的白血病相比,成人AML患者的死亡率居第一位[1]。近年來(lái),針對(duì)AML的分子靶向治療、免疫治療及造血干細(xì)胞移植等均取得了長(zhǎng)足進(jìn)步,但由于復(fù)發(fā)以及耐藥的產(chǎn)生,每年仍有許多患者死于疾病進(jìn)展[1-2]。因此,深入研究AML發(fā)生及發(fā)展的分子機(jī)制,對(duì)尋找新的臨床標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)具有重要意義。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)被發(fā)現(xiàn)廣泛分布于真核生物體內(nèi)并執(zhí)行復(fù)雜的生物學(xué)功能[3]。與信使RNA(messenger RNA,mRNA)相比,circRNA更穩(wěn)定,能在一定程度上耐受RNA酶的降解作用,并具有高度的空間、時(shí)序和組織特異性[4]。與其他非編碼RNA類似,circRNA在腫瘤的調(diào)節(jié)過(guò)程中發(fā)揮重要作用:Chen等[5]基于芯片及二代測(cè)序技術(shù),證實(shí)circCSNK1G3在前列腺癌細(xì)胞的增殖過(guò)程中發(fā)揮重要作用;Feng等[6]對(duì)多發(fā)性骨髓瘤小鼠模型的研究發(fā)現(xiàn),hsa_circ_0000190可在骨髓瘤細(xì)胞胞質(zhì)中通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源性RNA(competing endogenous RNA,CeRNA)機(jī)制結(jié)合微RNA(microRNA,miRNA/miR)-767-5p,進(jìn)而靶向上調(diào)促分裂原活化的蛋白激酶4的表達(dá),從而抑制疾病進(jìn)展;Ping等[7]發(fā)現(xiàn),circ_0009910在AML患者骨髓標(biāo)本中表達(dá)顯著上調(diào),并提示不良的預(yù)后?,F(xiàn)就circRNA的性質(zhì)、生物學(xué)功能及其在AML中的作用予以綜述,以期為AML的臨床診治提供新思路。

        1 circRNA概述

        1.1性質(zhì) circRNA以其閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)為特征,因不具有5′端的帽子結(jié)構(gòu)和3′端的多聚腺苷酸尾結(jié)構(gòu),故不易被RNA酶識(shí)別及降解,從而在生物體內(nèi)更穩(wěn)定地存在并發(fā)揮作用,顯示出極強(qiáng)的穩(wěn)定性[8]。circRNA亦數(shù)量豐富,目前擁有人類全基因組注釋信息的circRNA超過(guò)14萬(wàn)種,而mRNA僅有3萬(wàn)余種[9]。在某些細(xì)胞(如人類成纖維細(xì)胞)中,circRNA對(duì)應(yīng)的基因占比達(dá)到14%左右[10]。circRNA富集于生物體內(nèi)的同時(shí),也表現(xiàn)出一定的保守性,Werfel等[11]在3個(gè)不同的物種中共發(fā)現(xiàn)了9 000余種circRNA,其中1 288 種circRNA在3種物種中均有發(fā)現(xiàn),提示某些circRNA具有一定的進(jìn)化保守性。此外,隨著高分辨率熒光原位雜交、熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)等實(shí)驗(yàn)技術(shù)的不斷優(yōu)化,circRNA被檢測(cè)出具有高度組織和發(fā)育時(shí)序特異性。研究發(fā)現(xiàn),circRNA在神經(jīng)系統(tǒng),尤其是樹(shù)突中含量更高,且在老年人的腦組織中更易聚集[12-13]。Ruan等[14]檢測(cè)了1 000種人癌細(xì)胞系中circRNA的表達(dá)情況發(fā)現(xiàn),circRNA在不同的癌細(xì)胞中高度特異表達(dá)??梢?jiàn),circRNA兼具穩(wěn)定性、豐富性、保守性和特異性,這些特殊的性質(zhì)與其生物學(xué)功能具有密切聯(lián)系,有待學(xué)者們進(jìn)一步探索。

        1.2生物學(xué)功能 目前,關(guān)于circRNA生物學(xué)功能的研究主要集中于circRNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控作用。最初的研究認(rèn)為,circRNA有兩種調(diào)控基因表達(dá)的機(jī)制[3],其中一種為circRNA通過(guò)CeRNA機(jī)制調(diào)控靶基因的表達(dá)。CeRNA機(jī)制是指富含miRNA應(yīng)答元件的RNA,可競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合并抑制特定的miRNA,解除miRNA對(duì)靶基因的抑制作用,富含miRNA應(yīng)答元件的circRNA可經(jīng)過(guò)circRNA-miRNA-mRNA途徑調(diào)控靶基因的表達(dá)[3]。Yang等[15]發(fā)現(xiàn),circHECW2可通過(guò)CeRNA機(jī)制競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-30d,上調(diào)血管緊張素原5的表達(dá),進(jìn)而促進(jìn)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化,破壞血腦屏障的完整性,提示其在腫瘤細(xì)胞的腦轉(zhuǎn)移過(guò)程中起重要作用。另一種機(jī)制認(rèn)為,circRNA通過(guò)順式調(diào)控作用影響基因轉(zhuǎn)錄,如環(huán)狀內(nèi)含子RNA可在細(xì)胞核中促進(jìn)RNA聚合酶Ⅱ?qū)﹀^蛋白重復(fù)結(jié)構(gòu)域52親本基因的轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而調(diào)控其表達(dá)[16]。circRNA不僅能調(diào)控基因的表達(dá),早在1986年,就出現(xiàn)了關(guān)于circRNA可以表達(dá)多肽的文獻(xiàn)報(bào)道[17]。Yang等[18]發(fā)現(xiàn)circFBXW7可以編碼一種新的蛋白質(zhì)FBXW7-185aa,此蛋白可以協(xié)同野生型FBXW7蛋白抑制惡性膠質(zhì)瘤的進(jìn)展。這些研究不僅了顛覆circRNA、miRNA等非編碼RNA不能編碼蛋白的傳統(tǒng)認(rèn)知,也提示circRNA在生物體內(nèi)執(zhí)行著重要的生物學(xué)功能。近年來(lái),外泌體成為circRNA功能研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。circRNA在外泌體中高度富集,外泌體直徑為40~160 nm,是細(xì)胞外囊泡的一部分,可作為細(xì)胞間信息交流的重要途徑[19-20]。外泌體數(shù)據(jù)庫(kù)exoRBase收錄了包括健康志愿者、冠心病和結(jié)腸癌患者等92份血清外泌體的測(cè)序樣本,其中包含58 330種circRNA、18 333種mRNA[21]。Zhang等[22]證實(shí),circNRIP1由外泌體分泌后,可以被胃癌細(xì)胞吸收并促進(jìn)癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。所以,外泌體被認(rèn)為可以充當(dāng)circRNA在生物體內(nèi)的搬運(yùn)工,并放大其生物學(xué)功能。以上研究表明,circRNA在調(diào)控基因表達(dá)、編碼多肽和腫瘤發(fā)生及發(fā)展的過(guò)程中起至關(guān)重要的作用。

        2 circRNA與急性髓系白血病

        研究學(xué)者通過(guò)高通量測(cè)序和芯片技術(shù),已經(jīng)在各種組織和細(xì)胞系中發(fā)現(xiàn)了成千上萬(wàn)的circRNA,且經(jīng)相關(guān)體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)證實(shí),circRNA在各種良惡性疾病中均發(fā)揮重要的生物學(xué)功能[5-6,21]。但有關(guān)其在AML中的具體功能和分子機(jī)制研究較少。目前,已有的circRNA在AML中的研究大致可分為兩大類:AML的生物標(biāo)志物和功能機(jī)制研究。

        2.1生物標(biāo)志物

        2.1.1診斷標(biāo)志物 circRNA具有高度的穩(wěn)定性和特異性,在腫瘤相關(guān)的生物標(biāo)志物領(lǐng)域顯示出良好的應(yīng)用前景。Hirsch等[23]首先發(fā)現(xiàn)由核仁磷酸蛋白1環(huán)化而成的hsa_circ_0075001與AML存在相關(guān)性,從而開(kāi)啟了circRNA作為AML生物標(biāo)志物的研究。一項(xiàng)關(guān)于circRNA的臨床研究發(fā)現(xiàn),circVIM在非急性早幼粒細(xì)胞白血病患者中表達(dá)明顯上調(diào),通過(guò)繪制受試者工作特征曲線,可顯著區(qū)分非急性早幼粒細(xì)胞白血病和細(xì)胞遺傳學(xué)正常的AML患者,提示circVIM為AML理想的診斷標(biāo)志物[24]。AML的髓外浸潤(rùn)(extramedullary infiltration,EMI)是指骨髓中的白血病細(xì)胞浸潤(rùn)到骨髓以外的任何其他器官和組織,目前沒(méi)有檢測(cè)EMI的理想實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)[25]。Lv等[26]利用AML患者的骨髓血進(jìn)行circRNA芯片檢測(cè),通過(guò)比較EMI和非EMI樣本中circRNA的表達(dá)差異,篩選出17個(gè)與EMI相關(guān)的circRNA分子,并對(duì)其中的hsa_circRNA_004520進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)驗(yàn)證,證實(shí)其在EMI中表達(dá)上調(diào)4.38倍,為尋找AML中EMI的診斷標(biāo)志物提供了新思路??梢?jiàn),circRNA的出現(xiàn),在分子生物學(xué)層面豐富了AML的檢測(cè)手段,從而為AML患者的診斷及治療提供更有力的科學(xué)依據(jù)。

        2.1.2預(yù)后標(biāo)志物 AML依據(jù)形態(tài)學(xué)和細(xì)胞遺傳學(xué)檢查等即可確診,但能夠準(zhǔn)確、動(dòng)態(tài)地監(jiān)測(cè)AML疾病進(jìn)展的生物標(biāo)志物較少[27],而早期監(jiān)測(cè)AML的緩解、復(fù)發(fā)及浸潤(rùn)對(duì)AML的預(yù)后評(píng)估均具有重要意義。Li等[28]應(yīng)用芯片技術(shù)檢測(cè)circRNA在AML中的表達(dá)發(fā)現(xiàn),hsa_circ_0004277在AML患者中表達(dá)下調(diào),在復(fù)發(fā)難治性AML患者中表達(dá)進(jìn)一步下調(diào),提示hsa_circ_0004277可用來(lái)監(jiān)測(cè)AML早期復(fù)發(fā);且在化療后獲得完全緩解的AML患者中,hsa_circ_0004277表達(dá)上調(diào),提示其也可作為評(píng)估AML化療療效的動(dòng)態(tài)指標(biāo)。在EMI相關(guān)的17個(gè)circRNA中,通過(guò)結(jié)合醫(yī)學(xué)癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)17個(gè)靶基因進(jìn)行預(yù)后分析并繪制生存曲線發(fā)現(xiàn),其中5個(gè)靶基因的高表達(dá)在AML中提示不良預(yù)后[26]。Yi等[24]還發(fā)現(xiàn),高表達(dá)circVIM的AML患者的總生存期和無(wú)白血病生存期更短。上述研究表明,circRNA在AML中具有生物標(biāo)志物的價(jià)值,但其臨床應(yīng)用仍存在以下問(wèn)題:①高通量測(cè)序及芯片技術(shù)價(jià)格昂貴,今后可通過(guò)完善算法和改進(jìn)技術(shù)降低成本,使得大樣本的AML進(jìn)行circRNA研究成為現(xiàn)實(shí),從而更加全面、系統(tǒng)地評(píng)估circRNA在AML中的預(yù)后因素。②circRNA不僅僅存在于骨髓中,更在外泌體中大量富集,目前有關(guān)AML-外泌體-circRNA的研究處于初始階段,未來(lái)circRNA與AML的研究應(yīng)盡可能地按AML發(fā)病時(shí)間軸“初治-緩解-復(fù)發(fā)/浸潤(rùn)”納入AML的研究對(duì)象,并應(yīng)在單個(gè)研究對(duì)象中收集“骨髓血-外周血-外泌體-浸潤(rùn)組織”標(biāo)本,以助于完善AML患者的預(yù)后評(píng)價(jià)體系。

        2.2功能機(jī)制

        2.2.1細(xì)胞增殖與分化 AML的發(fā)生和疾病進(jìn)展與多種調(diào)控因素有關(guān),如AML細(xì)胞增殖失控、分化障礙等。已有研究發(fā)現(xiàn),circRNA在AML中廣泛參與調(diào)節(jié)上述過(guò)程。Fan等[29]發(fā)現(xiàn),circ_100290通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-203上調(diào)靶基因Rab10的表達(dá),進(jìn)而抑制凋亡,促進(jìn)AML細(xì)胞增殖。白血病中染色體異位重排形成融合基因的現(xiàn)象十分普遍,Guarnerio等[30]首次發(fā)現(xiàn)急性早幼粒細(xì)胞白血病和AML的融合基因能產(chǎn)生融合circRNA(fusion-circular RNA,f-circRNA),f-circRNA在體外實(shí)驗(yàn)中可以促進(jìn)小鼠胚胎成纖維細(xì)胞增殖并增強(qiáng)其克隆能力,且這一過(guò)程獨(dú)立于mRNA之外;在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,f-circRNA可在融合蛋白的協(xié)同下,導(dǎo)致健康小鼠進(jìn)展為白血病。Ping等[7]的研究證實(shí),過(guò)表達(dá)circ_0009910可以促進(jìn)白血病細(xì)胞增殖,而沉默circ_0009910可以抑制細(xì)胞增殖并促進(jìn)其凋亡。有研究表明,AML與circRNA之間的作用并不是單向的,AML基因組存在雙微體基因擴(kuò)增區(qū)域,轉(zhuǎn)錄因子p64的雙微體擴(kuò)增可以促進(jìn)白血病細(xì)胞的增殖,同樣轉(zhuǎn)錄因子p64的雙微體擴(kuò)增也可以引起circRNA的異常表達(dá)[31]。circRNA不僅參與調(diào)控AML中的細(xì)胞增殖過(guò)程,Li等[32]通過(guò)測(cè)序技術(shù)得到全反式視黃酸治療前后508種差異表達(dá)的circRNA,提示circRNA在全反式視黃酸誘導(dǎo)急性早幼粒細(xì)胞白血病細(xì)胞分化過(guò)程中具有獨(dú)立的功能,尤其以circHIPK2對(duì)急性早幼粒細(xì)胞白血病細(xì)胞分化的調(diào)節(jié)作用最為重要。Sun等[33]基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),與無(wú)Fms樣酪氨酸激酶3基因內(nèi)部串聯(lián)重復(fù)(Fms-like tyrosine kinase 3-internal tandem duplication,F(xiàn)LT3-ITD)突變相比,F(xiàn)LT3-ITD突變的AML患者circMYBL2的表達(dá)水平更高。且該研究進(jìn)一步證實(shí),circMYBL2通過(guò)多聚嘧啶區(qū)結(jié)合蛋白1提高FLT3蛋白的翻譯效率,進(jìn)而促進(jìn)AML細(xì)胞分化。這些研究不僅揭示了circRNA在AML中調(diào)控細(xì)胞增殖和分化的作用,也使得開(kāi)發(fā)以circRNA為治療靶點(diǎn)的藥物成為可能。

        2.2.2白血病細(xì)胞耐藥 白血病細(xì)胞耐藥是AML患者進(jìn)展為復(fù)發(fā)難治性AML的重要原因,進(jìn)而導(dǎo)致化療方案的失敗和極高的死亡率[34-35]。目前,AML化療耐藥的具體分子機(jī)制尚不明確,成為相關(guān)研究領(lǐng)域的難點(diǎn)。早期研究發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)f-circRNA可增強(qiáng)白血病細(xì)胞對(duì)化療藥物的耐受性[30],提示circRNA可參與調(diào)控AML的耐藥機(jī)制。FLT3-ITD突變的AML患者長(zhǎng)期預(yù)后不佳,目前已開(kāi)發(fā)出針對(duì)其突變的抑制劑,研究人員通過(guò)敲除circMYBL2,逆轉(zhuǎn)了AML細(xì)胞對(duì)FLT3-ITD突變抑制劑的耐藥,提示circMYBL2適用于FLT3-ITD突變的AML患者的靶向治療[33]。阿霉素作為AML化療方案中常見(jiàn)的蒽環(huán)類化療藥物,在臨床應(yīng)用過(guò)程中表現(xiàn)出較低的化療敏感性,Shang等[36]通過(guò)CeRNA機(jī)制揭示了AML中circRNA介導(dǎo)阿霉素耐藥的分子機(jī)制,與正常人相比,circPAN3在復(fù)發(fā)難治性AML患者的骨髓樣本中表達(dá)增加,并能通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-153-5p/miR-183-5p,上調(diào)X連鎖凋亡抑制蛋白的表達(dá),進(jìn)而增強(qiáng)AML細(xì)胞對(duì)阿霉素的耐藥性。以上研究表明,circRNA在調(diào)控白血病細(xì)胞耐藥的相關(guān)領(lǐng)域中具有極大的研究潛力,未來(lái)隨著circRNA靶向藥物的出現(xiàn),有望提高AML患者的長(zhǎng)期生存率。但是AML的疾病進(jìn)展不僅與細(xì)胞增殖、分化和耐藥相關(guān),腫瘤免疫、腫瘤微環(huán)境和血管新生等病理生理過(guò)程在AML中的調(diào)控作用也不可忽視,需引起學(xué)者們的重視。

        3 小 結(jié)

        目前,AML的常規(guī)檢查方法包括形態(tài)學(xué)、細(xì)胞遺傳學(xué)和微小殘留病變檢測(cè)等,近年來(lái)二代測(cè)序也逐漸用于評(píng)價(jià)基因突變?cè)贏ML預(yù)后中的意義[27]。在傳統(tǒng)化療的基礎(chǔ)上,表觀遺傳藥物(如地西他濱)在復(fù)發(fā)難治性AML患者中的應(yīng)用[37],細(xì)胞免疫治療和造血干細(xì)胞移植技術(shù)的發(fā)展,為AML患者帶來(lái)了相對(duì)豐富和有效的治療手段。雖然AML的生物標(biāo)志物和預(yù)后評(píng)價(jià)體系多次進(jìn)行更新和改進(jìn),但仍有許多預(yù)后良好的AML患者死亡率較高[38],接受最新分子靶向治療的患者仍面臨耐藥和疾病復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)[39-40],從而導(dǎo)致較短的生存期和較差的生活質(zhì)量。未來(lái),需擴(kuò)大樣本量及樣本類型,在快速發(fā)展的生物信息學(xué)算法、測(cè)序和芯片技術(shù)的支持下,尋找出更多具有代表性的circRNA作為生物標(biāo)志物,以完善對(duì)AML乃至整個(gè)腫瘤領(lǐng)域的預(yù)后評(píng)估體系。目前,circRNA在AML致病機(jī)制中的研究尚處于起步階段,且大多數(shù)研究均基于circRNA的CeRNA機(jī)制,缺乏足夠的創(chuàng)新性。隨著更多功能機(jī)制實(shí)驗(yàn)和臨床試驗(yàn)的證實(shí),靶向治療AML的circRNA相關(guān)藥物必將出現(xiàn),并廣泛實(shí)現(xiàn)臨床-基礎(chǔ)-臨床的轉(zhuǎn)化與應(yīng)用。

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