(2021.1.4 iPlants)
大豆馴化起源于中國(guó),隨后廣泛傳播于世界各地,為人類提供了主要的植物油料和蛋白資源,是重要的糧食經(jīng)濟(jì)作物。對(duì)大豆馴化和改良過(guò)程的了解有助于促進(jìn)基因組學(xué)輔助的育種工作。2021年1月4日,Nature Communicatons雜志在線發(fā)表了來(lái)自韓國(guó)生物科學(xué)與生物技術(shù)研究所Soon-Chun Jeong課題組題為“The patterns of deleterious mutations during the domestication of soybean”的研究論文。該研究組提供了781種大豆品種的1060萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性和140萬(wàn)個(gè)插入缺失的全基因組變異圖譜,并表明大豆馴化過(guò)程中有害突變一直在減少。
大豆馴化起源于中國(guó),隨后廣泛傳播于世界各地,為人類提供了主要的植物油料和蛋白資源,是重要的糧食經(jīng)濟(jì)作物。對(duì)大豆馴化和改良過(guò)程的了解有助于促進(jìn)基因組學(xué)輔助的育種工作。2021年1月4日,Nature Communicatons雜志在線發(fā)表了來(lái)自韓國(guó)生物科學(xué)與生物技術(shù)研究所Soon-Chun Jeong課題組題為“The patterns of deleterious mutations during the domestication of soybean”的研究論文。該研究組提供了781種大豆品種的1060萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性和140萬(wàn)個(gè)插入缺失的全基因組變異圖譜,并表明大豆馴化過(guò)程中有害突變一直在減少。
該研究分析了781種大豆品種(包括418種馴化大豆,345種野生大豆和18個(gè)天然雜種大豆)的高覆蓋率(> 13X)WGS數(shù)據(jù),獲得了1060萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性和140萬(wàn)個(gè)插入缺失的全基因組變異圖。進(jìn)一步分析表明,與野生大豆相比,馴化大豆的總體有害突變減少了7.1%,從地方品種到改良種質(zhì)則進(jìn)一步減少了1.4%。用這種資源進(jìn)行基因型估算提高了大豆多樣性研究小組對(duì)種子蛋白和油性狀的全基因組關(guān)聯(lián)研究的作圖分辨率。因此結(jié)果表明,馴化和野生品種的自交繁殖方式都有助于減少馴化相對(duì)于野生大豆品種的突變負(fù)擔(dān)。故該研究有助于更好的設(shè)計(jì)雜交和自交結(jié)合,以有效地從育種程序中消除有害的等位基因,從而從野生大豆中選擇具有農(nóng)學(xué)意義的重要未開發(fā)基因。