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        豬圓環(huán)病毒3型熒光定量PCR檢測方法的建立及其在豬體中的組織分布研究

        2021-01-01 03:22:10石寶蘭徐丹丹顧素云漆世華李婷婷謝紅玲
        中國獸藥雜志 2021年11期
        關鍵詞:檢測方法

        薛 霜,石寶蘭,徐 松,徐丹丹,顧素云,漆世華,李婷婷,馮 釗,謝紅玲

        (國藥集團動物保健股份有限公司,武漢 430075)

        豬圓環(huán)病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)是近幾年發(fā)現(xiàn)的一種新型的豬圓環(huán)病毒,基因組全長2.0 kb,為單鏈環(huán)狀、無囊膜的DNA病毒,形態(tài)呈正二十面體形,GC含量50%,包含3個主要開放閱讀框(opening reading frame,ORF),與其他圓環(huán)病毒科病毒具有類似的基因組結構,但衣殼蛋白氨基酸序列同源性很低。PCV3與PCV2的Cap蛋白同源性僅約30%,且二者在Cap蛋白抗原表位上無任何同源性,表明這2種毒株之間不具有交叉免疫保護特性。PCV3能引起豬的皮炎腎病綜合征、繁殖障礙以及心臟和多系統(tǒng)的炎癥反應[1-2],與PCV2引起的臨床癥狀極其相似,給臨床確診帶來一定的難度。自2016年以來,PCV3已在多個國家豬群中相繼被檢測到[3-5]。我國研究人員通過大范圍的檢測發(fā)現(xiàn),該病原在來自我國多個省份的樣品中也有檢測到[6-7]。

        本研究以臨床分離的PCV3陽性組織毒感染斷奶仔豬,并通過建立的熒光定量PCR檢測方法研究PCV3在豬不同組織臟器中的感染情況,以期為PCV3感染的診斷、預防和控制提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料 PCV3陽性組織毒懸液,采自湖北某豬場一PCV3陽性豬,由國藥集團動物保健股份有限公司制備并鑒定;PCV1、PCV2、豬細小病毒(PPV)、豬偽狂犬病病毒(PRV)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬瘟病毒(CSFV)、豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV),均由國藥集團動物保健股份有限公司鑒定和保存;大腸桿菌Trans5α感受態(tài)細胞,購自北京全式金生物技術有限公司。

        1.2 主要試劑 Taq DNA聚合酶、DNA片段回收純化試劑盒、質粒小量快速提取試劑盒、病毒核酸小量提取試劑盒、pMD18-T載體和Premix Ex Taq試劑盒(探針法)均購自寶生物工程(大連)有限公司。

        1.3 熒光定量PCR檢測方法的建立

        1.3.1 引物及探針設計 從GenBank中下載多條具有代表性的PCV3基因全序列,利用DNAStar生物軟件分析選出基因高度保守的核苷酸區(qū)域,然后應用Becon Design軟件設計篩選出最佳引物和探針組合,確定為本方法中所使用的引物和探針。同時設計一對擴增PCV3 Cap蛋白基因的引物。

        1.3.2 定量標準品的制備 取PCV3陽性組織毒200 μL,按病毒核酸小量提取試劑盒說明書提取病毒核酸,用所設計的PCV3 Cap蛋白基因引物對提取的病毒DNA進行PCR擴增,PCR體系為10×PCR Buffer 5 μL,dNTPs 4 μL,上、下游引物終濃度均為0.5 μmol/L,Taq酶0.5 μL,模板5 μL,補加無菌無核酸酶水至50 μL。反應條件為:95 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s,56 ℃ 40 s,72 ℃ 45 s(35 cycles);72 ℃ 10 min。PCR產物經膠回收試劑盒純化,連接至pMD18-T載體上,轉化Trans5α感受態(tài)細胞,37 ℃培養(yǎng)12~16 h。隨機挑取若干單菌落接種于5 mL LB/Ampr培養(yǎng)液中,37 ℃振搖過夜,提取質粒。按上述PCR體系和條件進行鑒定,將初步鑒定為陽性的重組質粒送生物公司測序。測序鑒定正確后作為PCV3熒光定量PCR陽性質粒,-20 ℃保存?zhèn)溆谩=涀贤夥止夤舛扔嫓y定質粒濃度(連續(xù)測定3次取平均值),計算出每微升所含的DNA拷貝數(shù)并進行10倍梯度稀釋,取其中101~107copies/μL的陽性質粒作為定量標準品。

        1.3.3 反應體系的建立 參考寶生物Premix Ex Taq試劑盒說明書,用所構建的陽性重組質粒為模板對熒光PCR引物、探針濃度進行優(yōu)化后確定反應體系。

        1.3.4 標準曲線的建立 以1.3.2中制備的定量標準品為模板,利用1.3.3中確定的反應體系進行熒光定量PCR檢測,得到相關標準曲線。

        1.3.5 熒光定量PCR檢測方法的特異性 按照1.3.3中確定的反應體系檢測PCV1、PCV2、PCV3、PPV、PRV、PRRSV、CSFV、PEDV、TGEV等豬體常見病原的核酸,并設陰性水對照組,從而確定該方法的特異性。

        1.3.6 熒光定量PCR檢測方法的靈敏度 將已計算出拷貝數(shù)的陽性質粒梯度稀釋至1 copy/μL,按照1.3.3確定的反應體系對所稀釋的不同濃度陽性質粒進行檢測,以此確定該方法的檢測靈敏度。

        1.4 PCV3在豬體中的組織分布研究

        1.4.1 動物分組 將5頭28日齡健康易感仔豬隨機分為兩組,分別為PCV3攻毒組和空白對照組,1#、2#、3#豬為攻毒組,4#、5#豬為空白對照組。

        1.4.2 攻毒方法 肌肉注射PCV3陽性組織毒懸液2 mL、滴鼻8 mL,對照組按同樣方法接種無菌生理鹽水,將兩組試驗動物隔離飼養(yǎng),逐日觀察。

        1.4.3 采樣和檢測 如試驗豬攻毒后28 d內死亡,試驗豬發(fā)現(xiàn)死亡的第一時間進行解剖。攻毒后第28 d,剖殺其余仔豬。采集仔豬的腦、心臟、脾臟、肺臟、扁桃體、腸系膜淋巴結、肺門淋巴結、腹股溝淋巴結和頜下淋巴結的部分組織用于熒光定量PCR檢測。

        2 結果與分析

        2.1 熒光定量PCR檢測方法的建立

        2.1.1 引物及探針設計 本方法中所使用的引物和探針序列信息見表1。

        表1 PCV3熒光定量PCR引物及探針序列信息Tab 1 Fluorescent quantitative PCR primers and probe of PCV3

        2.1.2 定量標準品的制備 鑒定正確的陽性質粒(圖1)經紫外分光光度計測定核酸濃度,按公式換算成DNA拷貝數(shù)為2×1010copies/μL。1∶10倍比稀釋后取2×107~2×101copies/μL的陽性質粒作為熒光PCR定量標準品。

        M:Trans2K plusⅡ DNA Marker;1:PCV3 Cap蛋白基因PCR產物;2:陰性對照圖1 PCV3 Cap蛋白基因PCR鑒定Fig 1 Identification of PCV3 Cap protein gene by PCR

        2.1.3 反應體系的建立 優(yōu)化后的最佳反應體系為:上下游引物、熒光探針終濃度均為0.2 μmol/L,Premix Ex TaqTM(2×) 10 μL,DNA模板2 μL,補加滅菌蒸餾水至總體積20 μL。反應程序為:95 ℃預變性30 s;95 ℃變性5 s,60 ℃ 35 s(收集熒光信號FAM),40個循環(huán)。

        2.1.4 標準曲線的建立 本研究建立的PCV3熒光定量PCR檢測方法在2×101~2×107copies/μL的線性范圍內可以得到良好的動力學曲線(圖2),且標準曲線較理想(圖3)。標準曲線方程為Y=-3.257lgX+36.388(X代表核酸拷貝數(shù),Y代表Ct值),線性相關系數(shù)R2為1,擴增效率為102.8%,說明本方法的檢測誤差較小,可信度較高。

        A~G:2×107~2×101 copies/μL的定量標準品;H:陰性水對照圖2 PCV3熒光定量標準品擴增曲線圖Fig 2 Fluorescent quantitative PCR amplification curves of PCV3 standard plasmid

        圖3 PCV3熒光定量標準曲線Fig 3 Fluorescent quantitative standard curve of PCV3

        2.1.5 熒光定量PCR檢測方法的特異性 圖4檢測結果顯示,除PCV3外,對PCV1、PCV2及其他幾種常見豬病毒病原的檢測結果均為陰性。

        2.1.6 熒光定量PCR檢測方法的靈敏度 熒光定量PCR檢測到的最小病毒核酸量為1 copy/μL,Ct值為36.94。檢測結果見圖5。

        2.2 PCV3在豬體中的組織分布研究 試驗豬攻毒后28 d內均無死亡、無明顯發(fā)病癥狀。剖殺各試驗豬,采集腦、心臟、脾臟、肺臟、扁桃體、腸系膜淋巴結、肺門淋巴結、腹股溝淋巴結和頜下淋巴結的部分組織用于熒光定量PCR檢測。結果顯示,空白對照組試驗豬各組織檢測均為陰性,攻毒組試驗豬部分組織檢出PCV3陽性,病毒主要存在于肺臟、淋巴結和脾臟中,在扁桃體中有少量存在,在心臟和腦組織中均未檢測到PCV3病毒核酸(表2)。

        A:PCV3擴增曲線;B~J:PCV1、PCV2、PPV、PRV、PRRSV、CSFV、PEDV、TGEV及陰性水對照擴增曲線圖4 熒光定量PCR特異性檢測結果Fig 4 The specific detection result of fluorescent quantitative PCR

        A~G:1×106~1 copy/μL;H:陰性水對照圖5 熒光定量PCR靈敏度檢測結果Fig 5 The sensitivity detection result of fluorescent quantitative PCR

        表2 PCV3在豬體主要免疫器官及部分內臟組織的分布情況Tab 2 Distribution of PCV3 in the main immune organs and some visceral tissues of pigs

        3 討論與結論

        病毒分離是實驗室確診特定病原體感染的經典方法,但由于PCV3在PK15細胞、ST細胞、Vero細胞等細胞上均不產生細胞病變,目前仍未有研究資料報道能夠成功通過體外細胞培養(yǎng)分離到PCV3,而僅僅只是使用分子生物學檢測方法檢測到PCV3病毒核酸的存在,并進行測序鑒定。目前對該病的研究還處于起始階段,針對PCV3的預防和控制還處于探索階段。常規(guī)PCR檢測方法簡單快速,但容易出現(xiàn)交叉污染,容易產生假陽性,而隱性感染和混合感染的豬群中病毒含量可能并不高。實時熒光PCR方法操作簡便、快速高效、具有較高的敏感度和特異性,而且封閉性好、不需要后續(xù)處理,大大降低了污染的可能性。顯著的優(yōu)越性使得該方法不僅在生物技術方面應用廣泛,現(xiàn)今更作為一種診斷方法應用于臨床。本研究結果表明所建立的熒光定量PCR檢測方法特異性好、敏感性高,可用于PCV3的快速定量檢測。

        在本次研究中,雖然在PCV3人工感染豬體多種組織器官中檢測到了PCV3病毒的存在,但并未引起明顯的臨床癥狀,這可能與攻毒病毒劑量較低和該毒株毒力較弱有關。同時,檢測結果顯示1#豬的陽性組織中病毒含量較其余豬只高,而在臨床觀察中1#豬曾有鏈球菌感染情況,說明當豬體狀態(tài)較弱或存在其他病原混合感染時可能更容易受PCV3感染。本研究人工感染PCV3豬體中,病毒主要存在于肺臟、淋巴結,在扁桃體和脾臟中有少量存在,顯示出PCV3對豬體呼吸器官和免疫器官具有較高的組織嗜性。多項調查研究提示PCV3可能與母豬繁殖障礙、豬皮炎腎病綜合征(PDNS)、發(fā)熱、呼吸系統(tǒng)疾病以及多系統(tǒng)炎癥相關,且還可能引起新生仔豬先天性震顫和心肌炎等[8]。因此對PCV3在豬體中的組織分布情況的研究可為進一步揭示PCV3的感染途徑、組織嗜性和致病機理等提供理論依據(jù)。

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