于恒響 周黎明
(1. 四川大學(xué)華西基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與法醫(yī)學(xué)院,四川 成都 610041;2. 四川大學(xué)華西基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與法醫(yī)學(xué)院藥理學(xué)教研室,四川 成都 610041)
結(jié)直腸癌在世界范圍內(nèi)是最為常見(jiàn)的腫瘤之一,根據(jù)2018年全球癌癥報(bào)告,結(jié)直腸癌新發(fā)病例占全部病例的6.1%,位居第四位[1]。在我國(guó),報(bào)告顯示2015年中國(guó)結(jié)直腸癌發(fā)病人數(shù)和死亡人數(shù)均位居第五位[2]。研究顯示,結(jié)直腸癌Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期的五年生存率分別為81.2%、71.7%、58.4%和14.4%[3],然而由于發(fā)病隱匿,早期癥狀不明顯,盡管早期結(jié)直腸癌患者擁有較高的五年存活率,但只有30%-40%患者在結(jié)直腸癌早期被確診,60%-70%患者直到晚期時(shí)才能被確診[4]。因此,結(jié)直腸癌的早期篩查及診斷具有重要意義。然而報(bào)道顯示,在美國(guó),2018年50歲至54歲人群篩查率僅為48%,55歲至64歲人群中的篩查率也只有68%[5]。目前,美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)(American Cancer Society,ACS)建議50歲以上人群定期進(jìn)行結(jié)直腸癌篩查,包括:每年進(jìn)行一次糞便免疫化學(xué)試驗(yàn)(Fecal immunochemical test,F(xiàn)IT),高靈敏度糞便隱血試驗(yàn)(High sensitivity guaiac fecal occult blood test,HSgFOBT)每年一次,多靶點(diǎn)糞便DNA檢測(cè)(Multitarget stool DNA test,mtsDNA)每3年一次,結(jié)腸鏡檢查每10年一次,CT結(jié)腸造影(CT colonography,CTC)每5年一次,柔性乙狀結(jié)腸鏡檢查(Flexible sigmoidoscopy,F(xiàn)S)每5年一次[6]。然而這些檢查大多是侵入性的,具有有創(chuàng)性,無(wú)法進(jìn)行長(zhǎng)期檢測(cè),患者依從性不佳,且由于腫瘤的異質(zhì)性,單一組織樣本難以反映腫瘤的整體情況等缺點(diǎn)。除此之外,有研究表明與糞便標(biāo)本相比78%患者更愿意提供血液樣本[7]。因此,目前越來(lái)越多的研究投入到尋找基于血液樣本的結(jié)直腸癌診斷方法,人們通常稱之為液體活檢(Liquid biopsy)。本文就ctDNA在結(jié)直腸癌診斷應(yīng)用研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。
血液中含有許多有潛力用作生物標(biāo)記物的物質(zhì),包括蛋白質(zhì)、外泌體、核小體、循環(huán)癌細(xì)胞和循環(huán)腫瘤DNA等[8]。其中,循環(huán)腫瘤DNA(Circulating tumor DNA,ctDNA)正逐漸受到人們關(guān)注。1948年,Mandel和Métais首次在人類血液中發(fā)現(xiàn)了非細(xì)胞游離核酸(Cell free DNA,cfDNA)[9]。cfDNA是在血液、糞便、尿液或唾液中均可發(fā)現(xiàn)的游離于細(xì)胞外的基因片段,它由核酸鏈組成,核酸鏈來(lái)源于多種細(xì)胞,包括但不限于腫瘤細(xì)胞。1989年,Stroun等通過(guò)比較DNA鏈的熱力學(xué)穩(wěn)定性,首次證實(shí)腫瘤患者外周血中的一部分cfDNA來(lái)源于腫瘤細(xì)胞,稱之為ctDNA[10]。ctDNA是cfDNA中來(lái)源于腫瘤細(xì)胞的部分,由腫瘤凋亡、壞死,或循環(huán)腫瘤細(xì)胞裂解產(chǎn)生,但其具體機(jī)制尚不清楚[4]。Gasparello等用LoVo和LS174T兩種細(xì)胞系進(jìn)行了體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示在體外LoVo細(xì)胞系比LS174T細(xì)胞更有效地釋放ctDNA,而相反當(dāng)這些腫瘤細(xì)胞作為異種移植物在小鼠體內(nèi)生長(zhǎng)時(shí),LS174T 細(xì)胞系在血液中ctDNA含量更加豐富,且這種差別與“管家”因素?zé)o關(guān),如細(xì)胞增殖,腫瘤異種移植物的生長(zhǎng),壞死或微血管密度。顯示在細(xì)胞和全身兩個(gè)方面存在有兩種不同的途徑影響ctDNA的釋放[11]。
ctDNA長(zhǎng)度在166 bp左右[12],半衰期從15分鐘到幾個(gè)小時(shí)不等,通常被腎臟、肝臟和脾臟迅速清除。淋巴系統(tǒng)和血液的各種生理過(guò)濾(清除、降解等)也決定了血液循環(huán)中ctDNA的數(shù)量[13]。不同類型腫瘤ctDNA檢出率不同,Bettegowda等報(bào)道結(jié)直腸癌、胃食管癌、胰腺癌和乳腺癌患者中ctDNA的檢出率分別為73%、57%、48%和50%;不同分期患者ctDNA檢出率也不同,有47%的Ⅰ期癌癥患者可檢出ctDNA,而 Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期癌的ctDNA檢出率分別為 55%、69% 和82%[14]。ctDNA的特征在于存在癌癥相關(guān)的遺傳和表觀遺傳突變,例如點(diǎn)突變,基因組序列重排,拷貝數(shù)變異(Copy number variations,CNV),微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite instability,MSI),雜合性缺失(Loss of heterozygosity,LOH)和DNA甲基化[15]。這些特征有助于將它們與剩余cfDNA片段區(qū)分開(kāi)來(lái),從而使ctDNA成為能夠用于早期診斷與篩查,監(jiān)測(cè)疾病狀態(tài)、進(jìn)展和復(fù)發(fā)的潛在生物標(biāo)志物。
目前,已有多項(xiàng)研究闡釋了ctDNA作為生物標(biāo)記物用于結(jié)直腸癌診斷的價(jià)值。Yu等研究發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者血液中ctDNA含量高于健康人,患者ctDNA樣本與腫瘤組織樣本的KRAS和BRAF基因突變一致性為92%[16]。Yang等研究發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者血液ctDNA濃度隨腫瘤大小增加而增加,I期與IV期患者之間ctDNA濃度具有顯著差異。ctDNA 的檢出率高于目前5種常用腫瘤生物標(biāo)志物,包括癌胚抗原(Carcinoembryonic antigen,CEA)、甲胎蛋白(Alpha fetoprotein,AFP)、糖類抗原19-9(Carbohy drate antigen 19-9,CA19-9)、癌抗原125(Cancer antigen125,CA125)、癌抗原72-4(Cancerantigen72-4,CA72-4)[17]。Hsu等檢測(cè)了32例結(jié)直腸癌患者的ctDNA樣本和腫瘤組織樣本中的基因變異,發(fā)現(xiàn)他們之間的一致性很高(85%),且ctDNA水平的變化與腫瘤縮小顯著相關(guān);與ctDNA下降<80%的患者相比,治療后ctDNA下降>80%的患者無(wú)進(jìn)展生存期更長(zhǎng)(HR,0.22)[18]。He等研究發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌的分期、大小、浸潤(rùn)深度與檢測(cè)靈敏度呈正相關(guān),而不同部位的腫瘤間檢測(cè)靈敏度無(wú)差異。浸潤(rùn)性結(jié)直腸癌比潰瘍性和突出性結(jié)直腸癌表現(xiàn)出更高的敏感性,而不同組織學(xué)類型之間的敏感性沒(méi)有差異。有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的結(jié)直腸癌(M1)比無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移的結(jié)直腸癌有更高的敏感性,而有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的結(jié)直腸癌(N1和N2)與無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的結(jié)直腸癌相比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[19]??梢?jiàn),ctDNA檢測(cè)相比其它常用腫瘤生物標(biāo)志物具有優(yōu)勢(shì),且能一定程度反應(yīng)腫瘤負(fù)荷和腫瘤狀態(tài),在結(jié)直腸癌早期診斷應(yīng)用前景廣泛。
對(duì)ctDNA進(jìn)行基因檢測(cè)亦能用于結(jié)直腸癌早期診斷。Luo等對(duì)1493名結(jié)直腸癌高危人群進(jìn)行的一項(xiàng)前瞻性隊(duì)列研究,發(fā)現(xiàn)ctDNA甲基化標(biāo)記cg10673833檢測(cè)確定21例結(jié)直腸癌患者中的19例,8例原位結(jié)直腸癌患者中的7例,敏感性為89.7%(95%CI,0.727~0.978),特異性為86.8%(95%CI,0.849~0.884),AUC為0.90(95%CI,0.885~0.942);對(duì)晚期癌前病變的敏感性為33.3%(95%CI,0.231~0.449),遠(yuǎn)高于無(wú)癌或晚期癌前病變的陽(yáng)性率(12.1%;95%CI,0.101~0.139),有望成為一種有效的非侵入性的結(jié)直腸癌篩查工具[20]。Church等研究發(fā)現(xiàn)了ctDNA中 SEPT9基因甲基化檢測(cè)敏感度為48.2%(95%CI 32.4%~63.6%);結(jié)直腸癌Ⅰ~Ⅳ期分別為35.0%、63.0%、46.0%和77.4%;特異性91.5%(95%CI 89.7%~93.1%),顯示其在結(jié)直腸癌篩查或診斷中的價(jià)值[21]。Cohen等人描述了一種多分析物試驗(yàn)(Cancer Seek),通過(guò)評(píng)估循環(huán)中蛋白和ctDNA突變水平,檢測(cè)八種常見(jiàn)癌癥,包括結(jié)直腸癌;使用對(duì)總共16種不同癌癥基因中的多個(gè)突變的分析結(jié)合選定的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物,作者在43%的I期結(jié)直腸癌患者中檢測(cè)到ctDNA,而在II-III期檢測(cè)率為70%,特異性為99%[22]。Osumi等通過(guò)下一代測(cè)序(NGS)對(duì)血漿中結(jié)直腸癌常見(jiàn)的14種突變基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)血漿中突變基因頻率與腫瘤轉(zhuǎn)移(肝臟,淋巴結(jié),轉(zhuǎn)移器官數(shù)),腫瘤標(biāo)志物(CEA,CA19-9,LDH)和腫瘤直徑(最大值)顯著相關(guān)[23]。Ou等利用集成化綜合液滴數(shù)字檢測(cè)(Integrated comprehensive droplet digital detection,IC3D)數(shù)字PCR系統(tǒng)提出了一種新的液體活檢方法,該系統(tǒng)可大大提升ctDNA檢測(cè)靈敏度,比現(xiàn)有的商業(yè)液體活檢ddPCR和qPCR平臺(tái)高50-1000倍。目前,該團(tuán)隊(duì)正在進(jìn)行一項(xiàng)臨床研究評(píng)估IC3D ctDNA檢測(cè)對(duì)預(yù)測(cè)早期結(jié)直腸癌的微小殘留病變和復(fù)發(fā)的預(yù)后的意義[24]。
ctDNA也可用于結(jié)直腸癌復(fù)發(fā)的監(jiān)測(cè),Scholer等對(duì)27名結(jié)直腸癌患者進(jìn)行了縱向追蹤,顯示所有復(fù)發(fā)患者術(shù)后均檢測(cè)到ctDNA(n=14),而非復(fù)發(fā)患者未檢測(cè)到ctDNA。另外利用ctDNA檢測(cè)復(fù)發(fā),與CT相比,平均提前9.4個(gè)月[25]。Symonds等檢測(cè)了144名患者的ctDNA BCAT1/IKZF1基因甲基化突變和CEA水平,顯示甲基化ctDNA檢測(cè)對(duì)復(fù)發(fā)的敏感性為66.0%(95%CI,57.1%-69.3%),顯著高于CEA(31.9%;95%CI,22.8%-36.6%);特異性無(wú)差異(ctDNA,97.9%;95%CI,93.2%-99.6%;CEA,96.4%;95%CI,91.4%-99.0%)[26]。Benesova等研究顯示在22名復(fù)發(fā)患者中,22例ctDNA檢測(cè)陽(yáng)性(100%),而影像學(xué)檢測(cè)到16例陽(yáng)性(73%),腫瘤標(biāo)志物升高15例(68%)[27]。Tie等檢測(cè)了96例III期結(jié)腸癌患者的術(shù)后樣本,發(fā)現(xiàn)20例中可檢測(cè)到循環(huán)腫瘤DNA,并且與較低的無(wú)復(fù)發(fā)生存率相關(guān)(風(fēng)險(xiǎn)比,3.8;95%CI,2.4-21.0)[28]。Tarazona等同樣報(bào)道了在接受輔助化療的結(jié)直腸癌患者中,治療后檢測(cè)到ctDNA與復(fù)發(fā)相關(guān)(HR 10.02)[29]。
ctDNA檢測(cè)具有非侵入、特異性高、敏感性高、以及能夠全面反映腫瘤異質(zhì)性等優(yōu)點(diǎn),在結(jié)直腸癌早期診斷中應(yīng)用前景廣泛。在預(yù)測(cè)化療療效和臨床預(yù)后[30],全面準(zhǔn)確提供患者體內(nèi)不同腫瘤的信息[31],檢測(cè)腫瘤耐藥性[32]等方面亦具有使用價(jià)值。但ctDNA檢測(cè)仍存在成本高、技術(shù)復(fù)雜、不同方法的結(jié)果尚無(wú)固定標(biāo)準(zhǔn)、可靠性與穩(wěn)定性無(wú)法確定,且ctDNA產(chǎn)生機(jī)制尚不清楚等問(wèn)題[33,34]。 因此2018年美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(American Society of Clinical Oncology,ASCO)和美國(guó)病理學(xué)家學(xué)會(huì)(College of American Pathologists,CAP)的一篇聯(lián)合評(píng)論認(rèn)為沒(méi)有臨床實(shí)用性的證據(jù)表明ctDNA檢測(cè)在早期癌癥,治療監(jiān)測(cè)或殘留疾病檢測(cè)中的臨床有效性。除臨床試驗(yàn)之外,沒(méi)有臨床有效性或臨床效用的證據(jù)表明ctDNA測(cè)定可用于癌癥篩查[35]。ctDNA在結(jié)直腸癌診斷的應(yīng)用仍需要進(jìn)一步研究。