中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團隊和美國康奈爾大學(xué)BTI合作解析了世界重大農(nóng)業(yè)害蟲溫室白粉虱基因組,揭示了其發(fā)育特異性表達和抗藥性分子機制,對深入開展白粉虱功能基因組學(xué)研究、植物—昆蟲—微生物及病毒互作、粉虱類害蟲抗性治理應(yīng)用均具有重要意義。相關(guān)研究成果與3月27日在線發(fā)表于《分子生態(tài)資源(Molecular Ecology Resource)》上。
溫室白粉虱和煙粉虱是世界上分布最廣且危害最為嚴重的2種粉虱類害蟲。煙粉虱基因組早在2016年和2017年由以上合作雙方共同解析完成。本研究利用三代測序平臺Pacbio長reads和Hi-C技術(shù),實現(xiàn)了白粉虱基因組染色體級別的組裝。結(jié)果發(fā)現(xiàn):白粉虱基因組組裝大小為787 Mb,含11條染色體級別scaffolds;注釋到18 275個蛋白編碼基因,重復(fù)序列占基因組的56.6%;對白粉虱發(fā)育階段特異性表達分析找到一些和白粉虱蛹化和羽化關(guān)聯(lián)的基因,例如卵黃蛋白基因和cuticle基因;白粉虱和煙粉虱的比較基因組發(fā)現(xiàn),天冬氨酰蛋白酶家族在白粉虱中有顯著擴張,這可能和白粉虱所特有的寄主偏好有關(guān);通過細胞色素P450家族的比較分析,在白粉虱找到和煙粉虱CYPCM1同源的4個P450基因,這4個基因有可能幫助到白粉虱代謝新煙堿類藥劑。