新算法將基因測序速度提升5倍
2020-12-18 05:43:11
農(nóng)業(yè)科技與信息 2020年14期
中國農(nóng)業(yè)科學院農(nóng)業(yè)基因組研究所阮玨團隊在《自然—方法學》上發(fā)表第三代測序數(shù)據(jù)組裝算法wtdbg。該算法極大地提高了三代基因測序數(shù)據(jù)的分析效率。
實驗證實，與2019年4月1日發(fā)表在《自然—生物技術》上的Flye算法相比，該算法分析速度提升了5倍，并首次將測序數(shù)據(jù)分析時間降低到少于測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出時間，同時實現(xiàn)了相當?shù)倪B續(xù)性和準確性。它代表了算法上的重大進步，并為將來群體規(guī)模的組裝分析鋪平道路。
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