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        貴州高原山地野生西南紅山茶ISSR遺傳多樣性分析

        2020-12-05 09:56:08
        種子 2020年11期
        關(guān)鍵詞:分析

        (貴州省林業(yè)科學(xué)研究院, 貴陽 550005)

        西南紅山茶(Camelliapitardii)是山茶科(Theaceae)山茶屬(Camellia)植物,生于海拔1 000~2 400 m的林下、林緣或灌叢中。在貴州西部至中部、四川西南部至南部、云南南部至東南部、廣西北部、湖南西部和湖北西部均有分布。貴州盤州市是西南紅山茶的主要分布區(qū),現(xiàn)有集中成片分布的野生林分約2 000 hm2。西南紅山茶樹型美觀,花朵美麗,是一種優(yōu)良的園林綠化樹種[1,2];西南紅山茶籽油的脂肪酸組成與普通油茶籽油無差異,平均果油率9.2%,種仁含油率49.3%,不飽和脂肪酸含量87.29%,是貴州西部高海拔地區(qū)發(fā)展油茶產(chǎn)業(yè)的首選樹種[3]。目前,西南紅山茶的研究主要集中在脂肪酸組成、種質(zhì)資源收集、表型性狀變異及優(yōu)良單株選擇[4,5]等方面。ISSR(inter-simple sequence repeat)標(biāo)記技術(shù)具有穩(wěn)定性高、重復(fù)性好,操作簡單等優(yōu)點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于遺傳多樣性分析、品種鑒定及親緣關(guān)系分析、基因定位和分子標(biāo)記輔助選擇等方面[6-8]。桂騰琴等[9]對(duì)影響ISSR-PCR擴(kuò)增的因子進(jìn)行優(yōu)化設(shè)計(jì),建立了荷花品種的ISSR-PCR最佳擴(kuò)增體系;曾惠敏等[10]利用ISSR分子標(biāo)記,分析了八仙花的遺傳多樣;西南紅山茶多處于野生狀態(tài),天然雜交形成了豐富的變異類型,本研究對(duì)>貴州西南紅山茶自然分布的6個(gè)野生居群的37個(gè)單株進(jìn)行ISSR分子遺傳多樣性分析,為野生西南紅山茶的合理開發(fā)和有效利用提供科學(xué)依據(jù)和參考。

        表1 采樣地點(diǎn)及編號(hào)

        圖1 856號(hào)引物瓊脂糖凝膠電泳圖

        1 材料與方法

        1.1 材料來源

        材料來源于西南紅山茶自然分布的盤州市、威寧等地,每個(gè)居群隨機(jī)選取2~12株長勢健壯、無病蟲害的植株,采集葉片放于-80 ℃冰箱中保存?zhèn)溆?。供試材料編?hào)及采集地詳見表1。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1總DNA的提取

        西南紅山茶的DNA采用北京索萊寶公司植物基因組DNA試劑盒提取,DNA提取、純化后用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的濃度及純度。用1×TE溶液稀釋至100 ng·μL-1后置于-20 ℃冰箱保存。

        1.2.2ISSR-PCR 反應(yīng)體系的建立

        從合成的100條引物中篩選出6條多態(tài)性好的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)反應(yīng)條件進(jìn)行優(yōu)化,建立西南紅山茶ISSR-PCR最佳擴(kuò)增體系,西南紅山茶ISSR-PCR擴(kuò)增的引物由上海生工生物有限公司合成。

        1.2.3PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測及條帶統(tǒng)計(jì)

        PCR產(chǎn)物用2.0%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測并拍照。

        1.2.4條帶統(tǒng)計(jì)及數(shù)據(jù)處理方法

        ISSR為顯性標(biāo)記,同一引物擴(kuò)增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的條帶具有同源性[11]。根據(jù)電泳結(jié)果進(jìn)行條帶統(tǒng)計(jì),同一位置強(qiáng)帶和弱帶均記為1,無記為 0,利用Popgene 32 軟件分別計(jì)算平均觀察等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)和Shannon 多樣性指數(shù)(I)等[12]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ISSR-PCR擴(kuò)增體系的建立

        利用4個(gè)不同種源的西南紅山茶DNA對(duì)引物進(jìn)行篩選,最終篩選出6條多態(tài)性高、穩(wěn)定性好的引物分別對(duì)37個(gè)西南紅山茶的DNA進(jìn)行擴(kuò)增,經(jīng)優(yōu)化后的西南紅山茶ISSR-PCR 反應(yīng)體系為:ISSR-PCR 反應(yīng)總體積為20 μL,其中DNA 模板2 μL(約200 ng),引物2 μL(10 μmol),2×Mix(10 μL),ddH2O 6 μL。反應(yīng)程序?yàn)?94 ℃預(yù)變性5 min,然后94 ℃30 s,52 ℃退火40 s,72 ℃延伸80 s,共35個(gè)循環(huán),72 ℃延伸10 min,最后4 ℃保存,PCR產(chǎn)物經(jīng)2.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,擴(kuò)增結(jié)果如圖1所示。

        2.2 西南紅山茶ISSR擴(kuò)增結(jié)果

        從表1可以看出,用于西南紅山茶ISSR擴(kuò)增的引物多態(tài)性高,共擴(kuò)增出條帶89條,其中多態(tài)性條帶82條,多態(tài)性比例為92.13%,8條引物擴(kuò)增的條帶數(shù)為12~18條,其中引物827擴(kuò)增的條帶最多;多態(tài)性條帶為11~18條,平均為13.7條,其中引物827和引物845多態(tài)性最高,多態(tài)性比例達(dá)100%,擴(kuò)增的條帶片段大小集中在300~900 bp之間。

        2.3 西南紅山茶遺傳多樣性分析

        利用 Popgene 32 軟件對(duì)6個(gè)野生西南紅山茶群體37個(gè)單株進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,37個(gè)單株的平均觀察等位基因數(shù)(Na)為1.921 3,平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.501 2,Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)為0.296 2,Shannon信息指數(shù)(I)為0.447 7,說明西南紅山茶單株間遺傳多樣性高,變異豐富。

        2.4 西南紅山茶親緣關(guān)系分析

        根據(jù)ISSR擴(kuò)增結(jié)果對(duì)6個(gè)野生西南紅山茶居群的遺傳相似性進(jìn)行分析,結(jié)果(表2)表明,6個(gè)居群的野生西南紅山茶的遺傳相似系數(shù)為0.705 9~0.936 7,遺傳距離為0.065 4~0.384 2,其中威寧和清鎮(zhèn)居群的西南紅山茶遺傳相似系數(shù)最低,為0.705 9;盤州市野生居群和畢節(jié)遺傳相似系數(shù)最高,達(dá)0.936 7;遺傳距離最小為0.065 4,由于居群1的分布點(diǎn)盤州市和居群2的分布點(diǎn)水城地理位置相近,氣候特征相似,導(dǎo)致2個(gè)居群的野生西南紅山茶相似性最大。

        表2 不同引物的擴(kuò)增結(jié)果

        表3 遺傳相似度和遺傳距離

        3 結(jié)論與討論

        目前,分子標(biāo)記已廣泛應(yīng)用于山茶屬植物的遺傳多樣性分析、品種鑒定、文庫構(gòu)建及重要基因的挖掘[13],彭繼慶等[14]構(gòu)建了博白大果油茶的ISSR-PCR反應(yīng)體系;宋倩倩等[15]利用ISSR分子標(biāo)記對(duì)福建省浙江紅花油茶遺傳多樣性進(jìn)行了分析。本研究通過構(gòu)建西南紅山茶ISSR-PCR擴(kuò)增體系,對(duì)貴州省6個(gè)居群37個(gè)西南紅山茶單株進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,37個(gè)野生西南紅山茶多態(tài)性豐富、遺傳多樣性高;6條引物共擴(kuò)增出89個(gè)條帶,其中多態(tài)性條帶82條,多態(tài)性位點(diǎn)百分率為92.13%;平均觀察等位基因數(shù)(Na)為1.921 3,平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.501 2,Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)為0.296 2,Shannon信息指數(shù)(I)為0.447 7,說明貴州野生西南紅山茶變異豐富。李芳等研究表明,西南紅山果花的性狀變異豐富[2];李彥福等對(duì)西南紅山茶果實(shí)性狀進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),西南紅山茶單株在果高、果徑、果皮厚度、籽粒數(shù)、脂肪酸成分及含量等性狀間存在極顯著差異[5],為西南紅山茶的選育提供了豐富的材料。ISSR-PCR擴(kuò)增從分子水平揭示了西南紅山茶的遺傳多樣性。從遺傳相似系數(shù)和遺傳距離可以看出,野生西南紅山茶居群內(nèi)遺傳相似系數(shù)大,居群間相似度高,貴州省野生西南紅山茶的遺傳距離與實(shí)際的地理距離關(guān)系顯著,說明西南紅山茶的遺傳變異受環(huán)境因素影響較大。由于分布區(qū)內(nèi)海拔高差大,氣候多樣,形成了豐富的自然變異,為西南紅山茶的選育奠定了豐富的物種基礎(chǔ);西南紅山茶是高海拔地區(qū)重要的木本油料樹種,本研究分析了貴州省西南紅山茶的遺傳多樣性及親緣關(guān)系,為西南紅山茶種質(zhì)資源的開發(fā)及品種配置提供了理論依據(jù)。

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