俄羅斯圣彼得堡國立理工大學(xué)(SPbPU)的研究人員開發(fā)了一種新的數(shù)學(xué)模型來預(yù)測作物的經(jīng)濟表現(xiàn)。這種方法可以幫助育種者獲得盡可能高質(zhì)量的植物。該研究成果已在第五屆“植物遺傳學(xué)、基因組學(xué)、生物信息學(xué)和生物技術(shù)”(PlantGen2019)會議上進行匯報,并發(fā)表在《BMC遺傳學(xué)》(BMC Genetics)期刊上,由俄羅斯基礎(chǔ)研究基金會項目(編號:18-29-13033)提供支持。
這種新的數(shù)學(xué)模型被用于預(yù)測作為功能基因型的作物表型性狀,農(nóng)業(yè)中的此類模型被稱為基因組選擇模型。培育新的植物品種通常需要10到12年的時間,而使用基因組選擇模型,將使培育植物新品種的過程加速好幾倍。由于包含的參數(shù)較少,這一基于機器學(xué)習(xí)方法的數(shù)學(xué)模型比現(xiàn)代的模擬模型表現(xiàn)得更好。
研究人員已應(yīng)用該模型對一種重要作物——大豆的表型特征進行了預(yù)測,分析了作物的株高、單株種子數(shù)、產(chǎn)量、種子中的蛋白質(zhì)和油分含量。
對于育種者來說,選擇能夠產(chǎn)生高質(zhì)量后代的親本植物是非常重要的,由于模型中參數(shù)的數(shù)量很少,育種者可以根據(jù)后代的質(zhì)量對親本對(breeding pairs)進行排序,從而篩選出代表新的、具備潛在理想性狀的優(yōu)良的親本對。
來源:SeedWorld