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        鑒定動物奶源的多重RCR方法建立及應(yīng)用

        2020-11-16 07:26:26王天添王艷雙李明成孫麗媛
        中國農(nóng)業(yè)大學學報 2020年11期
        關(guān)鍵詞:體系檢測

        王天添 劉 悅 趙 遠 王艷雙 李明成,3 孫麗媛*

        (1.北華大學 醫(yī)學技術(shù)學院, 吉林 吉林132013;2.北華大學 醫(yī)學院, 吉林 吉林 132013;3.吉林省中藥DNA指紋檢測技術(shù)科技創(chuàng)新中心,吉林 吉林132013)

        據(jù)《中國統(tǒng)計年鑒2018》數(shù)據(jù)顯示,我國奶制品產(chǎn)出量位居世界前五。作為高蛋白、高營養(yǎng)且易于被人體吸收的飲用品之一,奶產(chǎn)品深受大眾歡迎。近年來,除牛奶外,羊奶、馬奶、駱駝奶等特色奶也逐漸進入大眾視野。受產(chǎn)出量[1]、稀有度以及營養(yǎng)價值不同的影響[2-8],不同奶制品差價顯著。不法商家借由對特色奶功效盲目吹捧,導致牛奶及各特色奶間價格差異不斷增大[9-11],并以低價奶、水、甚至偽乳蛋白摻假至高價奶中售賣,不僅侵犯消費者權(quán)益,也對國民身體健康造成嚴重威脅[12-13]。

        針對動物奶源的研究多集中于相同奶制品中不同添加劑的檢測及2種/3種奶源種屬相近樣品間檢測[14-22]。未見成體系的牛奶與特色奶間的鑒別方法,無法一次性實現(xiàn)對各奶樣的鑒別檢測。多重PCR技術(shù)又稱多重引物PCR或復(fù)合PCR技術(shù),具有高效性、系統(tǒng)性及經(jīng)濟簡便性等優(yōu)點,可同時檢測多種DNA,便于實行快速檢測。本研究旨在建立一種多重PCR檢測體系,對常見的5種液態(tài)奶(牛奶、山羊奶、綿羊奶、馬奶和駱駝奶)進行鑒別,為我國奶制品市場監(jiān)管提供便利。

        1 材料與儀器

        1.1 試驗樣品與試劑

        牛奶、山羊奶、綿羊奶標準品奶樣采自當?shù)啬翀?,馬奶、駱駝奶標準品奶樣采自新疆南山牧場。24份混合奶樣由標準品奶樣等比例混合而成(具體可見2.4.4)。市售樣品10份(牛奶5份,羊奶1份,山羊奶1份,馬奶2份,駱駝奶1份),購自當?shù)爻幸约熬€上銷售處。

        100 bp DNA Marker、50 bp DNA Marker、2×Taq PCR MasterMix、組織/細胞/血液基因組DNA提取試劑盒、植物基因組DNA提取試劑盒均購自北京天根生化科技有限公司;引物Bos-157、Cap-133、Ovi-80、Equ-188和Cam-113由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 儀器設(shè)備

        TC9600-G多功能梯度PCR儀(美國Labnet公司)、JY300E通用型電泳儀(北京君意東方電泳設(shè)備有限公司)、UV WHITE-2020D紫外凝膠成像分析儀 (美國Biorad公司)、NanoDropOne微量核酸蛋白測定儀(美國Thermo公司)、YXQ-LS-75S11立式蒸汽滅菌器(上海博訊實業(yè)有限公司)、Thermo Fisher高速離心機(賽默飛世爾科技有限公司)。

        2 試驗方法

        2.1 奶制品 DNA提取

        量取待測奶樣約2 mL,分別置于干凈Ep管中,7 000 r/min 離心3 min;棄去上層脂質(zhì)層與中間層液體,400 μL PBS 溶液反復(fù)沖洗沉淀,7 000 r/min 離心3 min;棄去上層脂質(zhì)層與中間層液體,加入400 μL體積比為酚∶氯仿∶異戊醇=25∶24∶1的提取液,用移液槍反復(fù)吹吸,渦旋振蕩至完全混合,12 000 r/min 離心5 min;棄去下層有機溶劑,加入400 μL 氯仿溶液,移液槍反復(fù)吹吸,振蕩,12 000 r/min 離心5 min;棄去下層有機溶劑,余下步驟參照天根細胞基因組提取試劑盒說明書。

        NanoDrop One微量核酸蛋白測定儀,1 μL上樣測量。

        2.2 設(shè)計特異性引物

        GenBank中選取各動物線粒體基因序列為靶基因序列:牛(序列ID:KU291093.1)、山羊(序列ID:LT560065.1)、綿羊(序列ID:KU146454.1)、馬(序列ID:LT560065.1)、駱駝(序列ID:KU146454.1),NCBI Primer-Blast設(shè)計相應(yīng)特異性引物(表1)。

        表1 特異性引物序列Table 1 Sequences of specific primers

        2.3 PCR反應(yīng)

        單重PCR反應(yīng)體系:2×Taq PCR Master Mix 10 μL,引物 F和R(10 ng/μL)各0.5 μL,DNA 模板(10 ng/μL) 1 μL,無菌ddH2O補足至20 μL。反應(yīng)參數(shù):94 ℃預(yù)變性 5 min;94 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,30個循環(huán);72 ℃延伸 10 min,4 ℃保存。

        五重PCR反應(yīng)體系:2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL;Bos-157(1.55 μmmol/L)、Cap-133(2.0 μmmol/L)、Ovi-80(10.0 μmmol/L)、Equ-188(10.0 μmmol/L)、Cam-113(10.0 μmmol/L);每一物種DNA 模板(10 ng/μL)0.5 μL,共計2.5 μL;無菌ddH2O補足至30 μL。反應(yīng)參數(shù):94 ℃預(yù)變性 5 min;94 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s, 30 個循環(huán);72 ℃延伸 10 min,4 ℃保存。

        PCR 產(chǎn)物檢測:1.5%~2% 瓊脂糖凝膠,100 V/cm 電泳60~100 min。紫外分析儀觀察。

        2.4 方法學評價

        2.4.1引物特異性評價

        以常見物種DNA(牛、山羊、綿羊、馬、駱駝、驢、大豆和核桃)作為模板,分別以Bos-157、Cap-133、Ovi-80、Equ-188和Cam-113作為引物,按單重PCR反應(yīng)體系、反應(yīng)參數(shù)進行擴增,分析每對引物特異性。ddH2O作為陰性對照模板。1.5%瓊脂糖凝膠,100 V/cm電泳60 min。紫外分析儀觀察。

        2.4.2多重PCR反應(yīng)體系特異性評價

        以1為遞減數(shù)量依次減少體系中模板DNA物種數(shù),按2.3中五重PCR反應(yīng)體系、反應(yīng)參數(shù)進行擴增,分析多重PCR反應(yīng)體系特異性。ddH2O作為陰性對照模板。2% 瓊脂糖凝膠,100 V/cm 電泳100 min。

        2.4.3多重PCR反應(yīng)體系靈敏性評價

        提取標準品奶樣DNA,ddH2O梯度稀釋,終濃度為10~10-5ng/μL。參照2.3中五重PCR反應(yīng)體系,保持其中4種模板濃度不變,改變剩余物種模板濃度,相同反應(yīng)參數(shù)進行PCR擴增。根據(jù)電泳結(jié)果分析多重PCR反應(yīng)體系靈敏度。

        2.4.4混合奶樣檢測

        取標準品奶樣,均等混合制備混合奶樣:4種奶源奶樣混合(1∶1∶1∶1)、3種奶源奶樣混合(1∶1∶1)、2種奶源奶樣混合(1∶1),共計24份混合奶樣。參照2.1方法提取DNA,五重PCR反應(yīng)體系進行擴增。2% 瓊脂糖凝膠,100 V/cm 電泳100 min。紫外分析儀觀察。

        隨機抽取其中5份混合奶樣DNA,對本檢測體系做重復(fù)性評價。

        2.5 市售奶制品檢測

        按照2.1方法提取10份市售樣品DNA,NanoDrop One微量核酸蛋白測定儀測定準確濃度,稀釋至10 ng/μL。按照2.3中五重PCR反應(yīng)體系擴增。2% 瓊脂糖凝膠,100 V/cm 電泳100 min。

        3 結(jié)果

        3.1 奶制品 DNA提取

        2.1方法提取奶樣DNA,微量核酸蛋白測定儀測定,純度均處于1.70~2.10,質(zhì)量濃度均不低于100 ng/μL(表2),證明本研究所建立奶制品DNA提取方法可有效提取奶樣DNA,市售加工奶制品提取效率稍次于標準品,但皆可滿足后續(xù)PCR要求。

        表2 奶樣DNA濃度及純度檢測Table 2 Concentration and purity of samples DNA

        3.2 特異性檢測

        如圖1(a)~(e)所示,各物種引物特異性試驗中分別僅在牛、山羊、綿羊、馬、駱駝處見單一特異條帶,其他泳道皆無條帶擴增,表明本研究所設(shè)計引物具有良好特異性。

        如圖1(f)所示,1~5號泳道依次見牛/山羊/綿羊/馬/駱駝;牛/山羊/綿羊/馬;牛/山羊/綿羊;牛/山羊;牛特異性條帶。初步表明本研究所建立五重PCR反應(yīng)體系特異性良好。

        M,100 bp DNA Ladder;N,空白對照.(a)~(e): 1,牛;2,山羊;3,綿羊;4,馬;5,駱駝;6,驢;7,大豆;8,核桃.(f): 1,牛/山羊/綿羊/馬/駱駝;2,牛/山羊/綿羊/馬;3,牛/山羊/綿羊;4,牛/山羊;5,牛M, 100 bp DNA Ladder; N, negative control. (a)-(e): 1, cow; 2, goat; 3, sheep; 4, horse; 5, camel; 6, donkey; 7, soybean; 8, walnut. (f): 1, cow/goat/sheep/horse/camel/donkey; 2, cow/goat/sheep/horse/camel; 3, cow/goat/sheep; 4, cow/goat; 5, cow圖1 引物特異性檢測Fig.1 Specific tests of primers

        3.3 靈敏性檢測

        如圖2(a)~(e)所示,調(diào)節(jié)5種動物奶源模板DNA濃度,使其中任一模板濃度梯度遞減,其余4種模板濃度保持不變。最佳多重PCR反應(yīng)條件進行擴增檢測,牛、山羊、綿羊、馬、駱駝最低檢測限均可達到1 ng/μL,其他4種特異條帶亮度不受影響。表明本研究所建立多重PCR檢測體系結(jié)果穩(wěn)定,當任意一種DNA減少至1 ng/μL時,仍可準確檢測,且無交叉干擾。

        M, 100 bp DNA Ladder; 1, 10 ng/μl; 2, 1 ng/μl; 3, 10-1 ng/μl; 4, 10-2 ng/μl; 5, 10-3ng/μl; 6, 10-4ng/μl; 7, 10-5 ng/μl; N, 空白對照Note: M, 100 bp DNA Ladder; 1, 10 ng/μl; 2, 1 ng/μl; 3, 10-1 ng/μl; 4, 10-2 ng/μl; 5, 10-3 ng/μl; 6, 10-4 ng/μl; 7, 10-5ng/μl; N, Negative control圖2 多重PCR檢測體系靈敏性檢測Fig.2 Sensitivity test of multiplex PCR detection system

        3.4 混合奶樣檢測

        人工模擬均等混合奶樣檢測,5種標準品奶樣均等混合檢測結(jié)果作為陽性對照,顯示5條特異性條帶;無模板檢測結(jié)果為陰性對照,對應(yīng)泳道無條帶。圖3為10份2種奶樣均等混合、10份3種奶樣均等混合和4份4種奶樣均等混合檢測結(jié)果,各泳道僅出現(xiàn)特異性條帶,所有條帶清晰明亮。試驗結(jié)果表明本五重PCR檢測體系可基本滿足動物奶源實際摻假情況檢測。

        M,50 bp DNA Ladder;P,陽性對照;N,空白對照.(a): 1,牛/山羊;2,牛/綿羊;3,牛/馬;4,牛/駱駝;5,山羊/綿羊;6,山羊/馬;7,山羊/駱駝;8,綿羊/馬;9,綿羊/駱駝;10,馬/駱駝;11,牛/山羊/綿羊;12,牛/山羊/馬 (b): 1,牛/山羊/駱駝;2,牛/綿羊/馬;3,牛/綿羊/駱駝;4,牛/馬/駱駝;5,山羊 -綿羊/馬;6,山羊/綿羊/駱駝;7,山羊/馬/駱駝;8,綿羊/馬/駱駝;9,牛/山羊/綿羊/馬;10,牛/山羊/綿羊/駱駝;11,山羊/綿羊/馬/駱駝;12,牛/綿羊/馬/駱駝M, 50 bp DNA Ladder; P, Positive control; N, Negative control. (a): 1, cow/goat; 2, cow/sheep; 3, cow/horse; 4, cow/camel; 5, goat/sheep; 6, goat/horse; 7, goat/camel; 8, sheep/horse; 9, sheep/camel; 10, horse/camel; 11, cow/goat/sheep; 12, cow/goat/horse (b): 1,cow/goat/camel; 2, cow/sheep/horse; 3, cow/sheep/camel; 4, cow/horse/camel; 5, goat/sheep/horse; 6, goat/sheep/camel; 7, goat/horse/camel; 8, sheep/horse- camel; 9, cow/goat/sheep/horse; 10, cow/goat/sheep/camel; 11, goat/sheep/horse/camel; 12, cow/sheep/horse/camel圖3 混合奶樣檢測Fig.3 Detection of mixed milk samples

        3.5 市售樣本檢測

        10份奶樣中,5份牛奶試樣僅檢測出牛源性特異性目的條帶,2份羊奶試樣中除了檢出羊源性條帶,皆檢出牛源性條帶,說明有牛奶摻入,2份馬奶、1份駱駝奶中均只檢出相應(yīng)的馬與駱駝源性成分,未見摻假其他動物源性成分的情況(圖4)。

        M,50 bp DNA Ladder;P,陽性對照;1,牛奶;2,牛奶;3,牛奶;4,牛奶;5,牛奶;6,羊奶;7,山羊奶;8,馬奶;9,馬奶;10,駱駝奶;N,空白對照M, 50 bp DNA Ladder; P, positive control; 1, milk; 2, milk; 3, milk; 4, milk; 5, milk; 6, goat milk; 7, goat milk; 8, horse milk; 9, horse milk; 10, camel milk; N, negative control圖4 市售樣品檢測Fig.4 Testing of commercially available samples

        4 討 論

        中國奶文化傳承數(shù)千年,奶產(chǎn)品在日新月異的今天儼然已經(jīng)成為廣大民眾的生活必需品。不同動物奶的產(chǎn)出率、營養(yǎng)價值及受歡迎程度等差異使奶產(chǎn)品間差價愈發(fā)顯著。駱駝奶、馬奶等高價奶受不完善產(chǎn)業(yè)鏈的影響,產(chǎn)出率較牛奶低。不法商家為謀求利益,擾亂奶制品市場,恣意出售摻假高價奶,嚴重侵犯消費者權(quán)益。良好的產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)管既是中國奶業(yè)快速發(fā)展的必需條件,也是保障消費者權(quán)益的重要前提。目前,奶產(chǎn)品摻假鑒定方法主要通過不同奶制品營養(yǎng)成分的差異(蛋白質(zhì)、脂肪、DNA分子和β-胡蘿卜素等)作為切入口,對奶產(chǎn)品做質(zhì)量分析[15-19]。

        尹艷[19]應(yīng)用SDS-PK法區(qū)分駱駝奶與豆?jié){,PCR方法對牛奶、羊奶、水牛奶、駱駝奶和豆奶進行鑒別,酶切鑒別牛奶、水牛奶與耗牛奶,并進一步建立熒光定量PCR方法對牛奶進行定量分析。雖然可以對牛奶及常見奶制品進行簡單鑒別,但檢測一種樣品需多次PCR驗證,試劑耗損嚴重,檢測時間長,不適合廣泛應(yīng)用于市場上奶制品監(jiān)管檢測。杜文博[20]根據(jù)揮發(fā)物質(zhì)的不同應(yīng)用氣相色譜-離子遷移譜對牛奶粉、羊奶粉及摻假羊奶粉進行鑒別,但此方法并不適用于多種液態(tài)奶間鑒別。陳筱婷[21]針對牛奶、羊奶、豆奶建立了三重熒光PCR檢測體系,實現(xiàn)了牛、羊奶間摻假鑒別。范陽陽等[22]通過多重PCR檢測體系檢測羊奶中牛、大豆源性成分。未見牛奶、山羊奶、綿羊奶、馬奶及駱駝奶間完好鑒定體系。

        本研究基于多重PCR技術(shù),建立針對牛奶、山羊奶、綿羊奶、馬奶及駱駝奶的多重PCR檢測體系,動物奶源DNA含量低至檢測樣品總DNA含量2.4%時,仍可準確檢測。檢測靈敏度高,重復(fù)性好,充分保證檢測準確性;無需大型精密檢測儀器,耗費較少;應(yīng)用最常見的瓊脂糖凝膠電泳即可對結(jié)果進行分析。一次檢測即可鑒定常見奶源DNA摻假情況,良好特異性引物的選擇,避免了假陽性的出現(xiàn),在條件允許時,可進一步對樣品PCR產(chǎn)物進行測序分析,對檢測結(jié)果做進一步驗證。高準確性、低成本的特點為市場奶產(chǎn)品摻假檢測提供便利基礎(chǔ),適用于奶類市場質(zhì)控監(jiān)測。未來可考慮將本研究成果與側(cè)向流技術(shù)聯(lián)用,將檢測體系試紙條化,實現(xiàn)現(xiàn)場即時檢測;也可通過熒光定量PCR技術(shù),建立多重熒光定量檢測體系,進一步分析待測樣品中動物奶源DNA含量。

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