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        儀器噪聲在近紅外光譜偏最小二乘模型內(nèi)的傳播效應(yīng)

        2020-11-06 12:17:56張若秋杜一平
        分析測(cè)試學(xué)報(bào) 2020年10期
        關(guān)鍵詞:模型

        張若秋,杜一平

        (華東理工大學(xué) 上海市功能性材料化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 化學(xué)與分子工程學(xué)院,上海 200237)

        近紅外(Near-infrared,NIR)光譜分析是近年來(lái)最引人關(guān)注的分析技術(shù)之一,在農(nóng)業(yè)、制藥、化工等眾多領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用[1-2]。目前NIR技術(shù)的發(fā)展重點(diǎn)是應(yīng)用,簡(jiǎn)便、快速、無(wú)損、準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn)正是其受重視并被廣泛應(yīng)用于國(guó)民經(jīng)濟(jì)發(fā)展各個(gè)領(lǐng)域的本質(zhì)原因。但在使用NIR技術(shù)的基層單位,技術(shù)隊(duì)伍的研究能力往往不如研發(fā)單位,更不及高校和專(zhuān)門(mén)的科研機(jī)構(gòu)。而NIR技術(shù)使用和推廣的難點(diǎn)是近紅外光譜分析模型的建立需要一些專(zhuān)門(mén)的技術(shù),尤其是依賴(lài)于化學(xué)計(jì)量學(xué)。因此,模型的建立和維護(hù)是近紅外光譜技術(shù)發(fā)展的一個(gè)突出難點(diǎn)和瓶頸。

        偏最小二乘(Partial least squares,PLS)是近紅外光譜多元校正領(lǐng)域使用最為廣泛的算法之一[3-4]。在光譜多元校正的實(shí)際應(yīng)用中,有很多因素會(huì)影響該算法的建模過(guò)程和模型的預(yù)測(cè)能力,其中包括光譜儀器噪聲。然而,目前絕大多數(shù)研究都針對(duì)如何使用濾波器或平滑算法減少光譜噪聲[5-6],鮮有針對(duì)儀器噪聲如何影響偏最小二乘建模過(guò)程及其預(yù)測(cè)能力的研究。本文重點(diǎn)闡述和討論儀器噪聲怎樣通過(guò)第一個(gè)隱變量的計(jì)算被引入模型中,并隨著后續(xù)隱變量不斷在模型中傳遞和累積從而對(duì)整個(gè)建模過(guò)程產(chǎn)生影響,可為今后進(jìn)一步研究在建模中減少或抑制噪聲在模型內(nèi)的傳播和放大提供理論依據(jù)。

        1 儀器噪聲對(duì)偏最小二乘建模的影響

        樣本的測(cè)量光譜用X表示,組分含量用y表示,多元校正關(guān)系模型為y=Xβ+e。考慮測(cè)量光譜存在誤差,將X表示為:

        X=X0+E

        (1)

        其中,X0為不含測(cè)量誤差的真光譜,E表示儀器噪聲,假設(shè)矩陣中的每個(gè)元素均滿(mǎn)足均值為0且方差相同的高斯分布。類(lèi)似地,含量真值用y0表示(本文只考慮光譜存在誤差,含量無(wú)誤差,即y0=y)。

        1.1 偏最小二乘算法實(shí)現(xiàn)

        PLS的主流實(shí)現(xiàn)方式有非線(xiàn)性迭代偏最小二乘(NIPALS)[7]和SIMPLS兩種,為方便理論推導(dǎo)本文使用SIMPLS,下文給出SIMPLS的偽代碼[8]。SIMPLS算法流程如下:

        Fora=1,…,A;

        a=1:對(duì)S0進(jìn)行奇異值分解;

        a>1:對(duì)(I-P(PTP)-1PT)S0進(jìn)行奇異值分解;

        計(jì)算得到權(quán)重向量r=第一個(gè)左奇異向量;

        計(jì)算得到得分向量t=X0r;

        將r、t和p分別存入R、T和P;

        End

        無(wú)噪光譜矩陣X0含有p個(gè)變量和n個(gè)樣本,濃度向量y0含有n個(gè)樣本。R、T和P分別代表權(quán)重矩陣、得分矩陣和載荷矩陣,而βpls則為偏最小二乘模型的回歸系數(shù)向量。為方便,本文使用LSV1(S0)表示S0的第一個(gè)左奇異向量。

        1.2 儀器噪聲傳遞

        當(dāng)PLS模型的隱變量數(shù)量(nLVs)為k個(gè)時(shí),在不同隱變量下所形成的空間和由Krylov序列形成的空間滿(mǎn)足如下等式[5]:

        {Rk}={S0,XTXS0,(XTX)2S0,…,(XTX)k-1S0}

        (2)

        {Pk}={XTXS0,(XTX)2S0,…,(XTX)kS0}

        (3)

        以上兩個(gè)等式表明協(xié)方差矩陣S0(當(dāng)預(yù)測(cè)指標(biāo)只有1個(gè)時(shí)是協(xié)方差向量)和XTX完全確定了βpls。前者確定模型的初始方向,而后者則影響每個(gè)隱變量的實(shí)際計(jì)算。當(dāng)光譜數(shù)據(jù)中包含了儀器噪聲時(shí),S0和pk的計(jì)算可改寫(xiě)為如下形式:

        (4)

        (5)

        因此,通過(guò)上述公式發(fā)現(xiàn)偏最小二乘模型將從第一個(gè)隱變量開(kāi)始發(fā)生偏離真模型的現(xiàn)象,噪聲同時(shí)被引入到模型中,并在隨后隱變量的計(jì)算過(guò)程中被不斷傳遞和累積:

        (6)

        Rk=[LSV1(S1),LSV1(S2),…,LSV1(Sk)]

        (7)

        βpls=RkRkTS0

        (8)

        上述噪聲傳遞過(guò)程同時(shí)也會(huì)對(duì)偏最小二乘模型的預(yù)測(cè)能力產(chǎn)生影響。預(yù)測(cè)殘差可表示為:

        (9)

        (10)

        (11)

        (12)

        圖1 噪聲傳遞和偏最小二乘預(yù)測(cè)誤差關(guān)系示意圖Fig.1 The scheme of the relationship between noise propagation and prediction error

        噪聲傳遞和偏最小二乘的預(yù)測(cè)誤差關(guān)系如圖1所示,不同噪聲水平下的最優(yōu)隱變量數(shù)也將發(fā)生改變,噪聲水平越高,最優(yōu)隱變量的數(shù)值越小。這說(shuō)明噪聲傳遞不僅影響偏最小二乘模型的預(yù)測(cè)能力,還會(huì)給模型的選擇帶來(lái)影響。

        2 數(shù)據(jù)集與計(jì)算方法

        2.1 數(shù)據(jù)集模擬

        本文用模擬數(shù)據(jù)對(duì)上述討論進(jìn)行驗(yàn)證。模擬數(shù)據(jù)集包含了2 000個(gè)建模樣本和2 000個(gè)獨(dú)立預(yù)測(cè)樣本,其變量數(shù)為1 000。數(shù)據(jù)集中包含1個(gè)待測(cè)組分和40個(gè)干擾組分,共41個(gè)組分。每個(gè)模擬組分的純光譜信號(hào)均滿(mǎn)足一個(gè)隨機(jī)均值和方差的高斯分布。建模集中待測(cè)組分和干擾組分的濃度值服從0到1的均勻分布,而在預(yù)測(cè)集中服從0.05到0.95的均勻分布。模擬光譜由濃度矩陣和純光譜信號(hào)矩陣相乘得到。

        對(duì)于每個(gè)固定的光譜信號(hào)xi(i=1,2,…,n)均產(chǎn)生一個(gè)服從標(biāo)準(zhǔn)高斯分布的噪聲向量ei,噪聲水平的大小定義為ei的最大值和xi的比值。更高的噪聲水平意味著更低的信噪比(S/N),反之亦然。3個(gè)不同水平的噪聲(0.3%、0.75%和1%)用于給無(wú)噪光譜數(shù)據(jù)添加人為噪聲。

        2.2 指標(biāo)與計(jì)算軟件評(píng)價(jià)

        評(píng)價(jià)所建立的NIR模型通常考慮模型誤差和相關(guān)系數(shù)兩個(gè)指標(biāo),本文只考慮模型誤差指標(biāo)。建模時(shí)一般將數(shù)據(jù)集劃分為校正集(C)、交互檢驗(yàn)集(CV)和預(yù)測(cè)集(P),因此模型誤差也包括校正誤差、交互檢驗(yàn)誤差和預(yù)測(cè)誤差。模型誤差用均方根誤差(Root mean squared error,RMSE)表示:

        (13)

        已有不少研究表明蒙特-卡洛采樣(Monte-carlo sampling,MCS)能夠降低模型過(guò)擬合的風(fēng)險(xiǎn)[9-10],因此本文采用基于MCS的方法,即采樣誤差分布分析的交互檢驗(yàn)(Cross-validation based on sampling error profile analysis,SEPA-CV)[11]確定偏最小二乘的最優(yōu)隱變量大小。MCS的采樣數(shù)和建模樣本比例分別設(shè)定為2 000和0.8。所有計(jì)算均使用MATLAB完成(Version 2010a,The MathWorks,USA)。

        為準(zhǔn)確量化偏最小二乘模型的噪聲水平,采用Durbin-Watson(DW)[12-16]統(tǒng)計(jì)量評(píng)價(jià)噪聲對(duì)模型的影響程度。DW統(tǒng)計(jì)量由下式計(jì)算得到:

        (14)

        xi和xi-1是p維向量中的兩個(gè)連續(xù)元素。如果整個(gè)向量中連續(xù)元素間的相關(guān)性很弱,例如該向量中每個(gè)元素均為隨機(jī)變量,則DW統(tǒng)計(jì)量的大小將收斂于2。一個(gè)擁有至少100個(gè)元素的隨機(jī)向量的DW統(tǒng)計(jì)量的95%置信區(qū)間在1.7和2.3之間。

        3 結(jié)果與討論

        3.1 噪聲傳遞對(duì)偏最小二乘模型回歸向量的影響

        首先使用DW統(tǒng)計(jì)量對(duì)3種不同噪聲水平的光譜所建立的偏最小二乘模型的權(quán)重向量r、載荷向量p和回歸系數(shù)向量βpls進(jìn)行噪聲程度的估計(jì),其結(jié)果見(jiàn)圖2。

        由圖2可知,偏最小二乘模型中這3種向量的DW統(tǒng)計(jì)量均隨著隱變量數(shù)的增加而增加,這反映了噪聲在偏最小二乘模型中的傳遞和累積現(xiàn)象,與“1.2”理論推導(dǎo)的結(jié)果相符合。對(duì)于無(wú)噪光譜所建立的PLS模型,在1~41個(gè)隱變量范圍內(nèi),r、p和βpls的DW統(tǒng)計(jì)量遠(yuǎn)小于有噪光譜建模得到的各中間向量的DW值。r和p的DW統(tǒng)計(jì)量在第42個(gè)隱變量處突然增至2左右,說(shuō)明此時(shí)這兩個(gè)向量已無(wú)法包含任何有用的光譜信息,因?yàn)槟M數(shù)據(jù)集的真實(shí)組分?jǐn)?shù)是41。然而βpls的DW在第42個(gè)隱變量處卻增加不明顯,這是因?yàn)棣聀ls是由全部權(quán)重向量r的線(xiàn)性組合,其DW的大小應(yīng)該由這些權(quán)重向量的噪聲程度共同決定。對(duì)于包含了儀器噪聲的光譜所建立的PLS模型來(lái)說(shuō),在前25個(gè)隱變量下r、p和βpls的DW與無(wú)噪光譜PLS模型相比其對(duì)應(yīng)的向量DW相差不大,但在第25個(gè)隱變量之后它們的差異顯著增加,這是因?yàn)樵肼暤膫鬟f和累積的顯著程度會(huì)隨著隱變量數(shù)的增加而增加。

        圖2 模擬數(shù)據(jù)集在隱變量1~42下建立的偏最小二乘模型的r(A)、p(B)和βpls(C)的DW統(tǒng)計(jì)量Fig.2 DW values of r(A),p(B) and βpls(C) from simulated dataset with different noise levels at nLVs from 1 to 42

        3.2 噪聲傳遞對(duì)模型預(yù)測(cè)能力的影響

        圖3 模擬數(shù)據(jù)集中不同噪聲水平光譜所建立 模型的預(yù)測(cè)誤差示意圖Fig.3 The prediction error of PLS models built by simulated dataset with different noise levels

        采用上述模擬數(shù)據(jù)驗(yàn)證噪聲傳遞對(duì)PLS模型預(yù)測(cè)能力的影響,結(jié)果見(jiàn)圖3和表1。Mp為無(wú)噪光譜所建立的偏最小二乘模型的RSS,隨著隱變量的增加,模型復(fù)雜度不斷增加,Mp則不斷降低,直至隱變量數(shù)量和模型的真實(shí)組分?jǐn)?shù)(41)達(dá)到一致,此時(shí)模型的復(fù)雜度最優(yōu)。使用無(wú)噪光譜建立的PLS模型的預(yù)測(cè)誤差并不包含Np項(xiàng),因?yàn)镹p是由儀器噪聲產(chǎn)生。由圖3可知,Np的大小受兩方面影響,一是其隨著PLS隱變量數(shù)量的增加而增加,二是其隨著噪聲水平的增加而增加,這與“1.2”的理論分析一致。由圖4和表1可知,Np的存在和增大會(huì)使模型的預(yù)測(cè)能力下降。

        表1 模擬數(shù)據(jù)集的交互檢驗(yàn)和RMSEP結(jié)果Table 1 Results of cross-validation and RMSEP to simulated dataset

        圖4和表1描述了模擬數(shù)據(jù)集交互檢驗(yàn)和RMSEP的結(jié)果。對(duì)于無(wú)噪光譜建立的模型,最優(yōu)隱變量數(shù)量和期望的情況一致(均為41),且在該隱變量下的RMSECV和RMSEP均很接近于0(1.190 2×10-6和2.774 5×10-6),此時(shí)該模型是這套模擬數(shù)據(jù)集的真實(shí)模型。隨著光譜的噪聲水平增加,模型的RMSECV和RMSEP相應(yīng)增加,但更重要的是模型的最優(yōu)隱變量也不斷發(fā)生變化(例如:對(duì)于噪聲程度為0.3%和1%的光譜來(lái)說(shuō),最優(yōu)隱變量分別為33和31)。此外,不同噪聲水平下所建立模型的RMSECV和RMSEP的差異隨著隱變量的增加而增加,這證明了“1.2”的理論推導(dǎo),即噪聲會(huì)在PLS模型中不斷傳遞和累積。由圖4還能發(fā)現(xiàn),無(wú)噪光譜建立的偏最小二乘模型的預(yù)測(cè)誤差在隱變量超過(guò)41后會(huì)突然顯著增加,這意味著模型的過(guò)擬合。

        圖4 模擬數(shù)據(jù)集包含不同水平噪聲的光譜所建立模型的RMSECV(A)和RMSEP(B)Fig.4 RMSECV(A) and RMSEP(B) values at nLVs from 1 to 42 for simulated dataset

        圖5 第一個(gè)隱變量下PLS和PoLiSh模型的回歸系數(shù) 及二者差值Fig.5 Regression coefficients of PLS and PoLiSh and their differences

        3.3 去噪算法對(duì)噪聲傳遞的驗(yàn)證

        采用PoLiSh算法對(duì)人為添加1%噪聲的模擬數(shù)據(jù)進(jìn)行噪聲傳遞的驗(yàn)證。PoLiSh算法的原理為,在使用NIPALS計(jì)算每一個(gè)隱變量下權(quán)重向量時(shí),對(duì)其使用Savizky-Golay平滑[17]以消除噪聲的積累。本文中Savizky-Golay平滑窗口大小為21,擬合階數(shù)為2,使用PoLiSh所建立模型的最優(yōu)隱變量數(shù)為35,相應(yīng)RMSEP值為0.076 0。與表1中引入了1%噪聲的光譜所建立的PLS模型相比,RMSEP降低且最優(yōu)隱變量的數(shù)目增加,說(shuō)明PoLiSh一定程度上減少了噪聲的影響。圖5反映了第一個(gè)隱變量的部分PLS模型和PoLiSh模型,可以明顯看出使用包含儀器噪聲的光譜建立的PLS模型從第一個(gè)隱變量開(kāi)始包含噪聲,而PoLiSh算法建立的模型可在一定程度上減弱噪聲的影響。

        4 結(jié) 論

        本文闡述了儀器噪聲如何從第一個(gè)隱變量的計(jì)算開(kāi)始被引入偏最小二乘模型中并通過(guò)隨后的隱變量計(jì)算被不斷傳遞和累積,通過(guò)對(duì)偏最小二乘的計(jì)算過(guò)程相關(guān)公式的推導(dǎo)和對(duì)一套模擬光譜數(shù)據(jù)集的詳細(xì)研究,總結(jié)并論證了與無(wú)噪的光譜相比,噪聲的引入將使得偏最小二乘模型的預(yù)測(cè)能力變差且模型最優(yōu)隱變量數(shù)減少,且光譜中包含的噪聲水平越高,則其對(duì)模型預(yù)測(cè)能力和最優(yōu)隱變量的改變?cè)酱蟮慕Y(jié)論。

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