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        基于影像學(xué)機(jī)器視覺的乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別*

        2020-10-20 10:22:26李高軍
        生物醫(yī)學(xué)工程研究 2020年3期
        關(guān)鍵詞:特征

        陳 佳,李高軍

        (安康學(xué)院醫(yī)學(xué)院,陜西 安康 725000)

        1 引 言

        乳腺腫瘤的發(fā)病率和死亡率在女性惡性腫瘤中占據(jù)首位。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),2019年全球新增腫瘤病例約1 910萬,其中乳腺腫瘤新增228.9萬,占新增癌癥病例的11.98%,癌癥死亡病例約980萬,其中乳腺腫瘤死亡65.7萬,占死亡病例的6.7%[1]。隨著社會(huì)的發(fā)展和環(huán)境的變化,包括乳腺腫瘤在內(nèi)的惡性腫瘤的發(fā)病率在未來一段時(shí)間內(nèi)都將呈上升趨勢(shì)。

        早期發(fā)現(xiàn)和治療是提升腫瘤治療效果的關(guān)鍵。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展,可以利用相關(guān)技術(shù)方法實(shí)現(xiàn)對(duì)乳腺腫瘤病理圖像的識(shí)別,從而確定患者的病情。通過圖像識(shí)別方法也可以降低醫(yī)生的誤診。傳統(tǒng)圖像識(shí)別的工作流程分為圖像采集、圖像預(yù)處理、特征提取匹配和圖像識(shí)別[2]。受乳腺腫瘤病理圖像采集清晰度的限制,傳統(tǒng)乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別存在錯(cuò)誤率高的問題,針對(duì)該問題,本研究引入影像學(xué)理論和機(jī)器視覺技術(shù),將其應(yīng)用到乳腺腫瘤病理圖像的識(shí)別工作中,以期降低圖像識(shí)別錯(cuò)誤率,實(shí)現(xiàn)對(duì)乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別方法的優(yōu)化設(shè)計(jì)。

        2 病理圖像識(shí)別方法設(shè)計(jì)

        本研究乳腺腫瘤病理圖像的識(shí)別原理是結(jié)合影像學(xué)的分析結(jié)果,確定乳腺腫瘤疾病的病理特征,利用機(jī)器視覺技術(shù)收集患者的乳腺病理初始圖像,經(jīng)過一系列處理得出對(duì)應(yīng)的特征提取結(jié)果[3]。將圖像的提取特征與乳腺腫瘤疾病的病理特征做比對(duì),并計(jì)算兩者之間的相似度,從而判斷患者是否患有乳腺腫瘤疾病及疾病的發(fā)展變化狀態(tài)。

        2.1 影像學(xué)分析腫瘤病理特征

        乳腺腫瘤疾病的典型體征為乳腺腫塊,80%的乳腺腫瘤患者以乳腺腫塊首診,除此之外乳頭溢液、皮膚改變、腋窩淋巴結(jié)腫大等也是乳腺腫瘤基本的特征。本研究主要針對(duì)乳腺位置上的腫塊作為乳腺腫瘤病理圖像的識(shí)別特征。根據(jù)醫(yī)學(xué)上乳腺腫瘤的聲像圖表現(xiàn)特征,乳腺腫塊形態(tài)回聲類型可以分為巨塊型、結(jié)節(jié)型和彌漫型三類。其中,巨塊型乳腺腫塊邊界清晰、形態(tài)較為規(guī)則,其外周常顯示有聲暈存在。結(jié)節(jié)型直徑多在2~5 cm之間,腫瘤邊界不甚清晰,其外周可以出現(xiàn)不典型聲暈或有較薄的不完整高回聲帶包繞。彌漫型就是腫瘤數(shù)目眾多呈彌漫散布于整個(gè)乳腺,這種類型的結(jié)節(jié)較小[4]。乳腺腫瘤分為良性和惡性兩種類型,其中良性腫瘤的細(xì)胞核基本上為橢圓型或類圓形,且細(xì)胞邊緣較為平滑,形狀大小較為一致,胞漿豐富,染色質(zhì)細(xì)致、紋理清晰,分布較為均勻。相反惡性腫瘤會(huì)存在不規(guī)則或畸形的情況,邊緣出現(xiàn)突刺,平滑度較低,細(xì)胞核大于普通細(xì)胞核,體積一般為正常類型的一至四倍,數(shù)量增多,染色加深且紋理不均。

        2.2 利用機(jī)器視覺技術(shù)采集病理圖像

        病理圖像采集設(shè)備主要分為圖像采集卡、運(yùn)動(dòng)控制部分和視覺系統(tǒng)三個(gè)部分。其中,圖像采集卡的內(nèi)部結(jié)構(gòu),見圖1。

        機(jī)器視覺涉及到照明、光電和高精度電機(jī)技術(shù),因此,需要安裝光源、攝像機(jī)、伺服電機(jī)等設(shè)備。其中,光源設(shè)備的選擇,需要綜合考慮光纖的均勻度、光照強(qiáng)度、發(fā)光效率以及使用壽命等多種因素,最大程度地顯示目標(biāo)物體的特征量[5]。攝像機(jī)設(shè)備選擇的是松下CP450 型彩色 CCD攝像頭,安裝攝像機(jī)的基本物理參數(shù)見表1。

        圖1 機(jī)器視覺圖像采集卡結(jié)構(gòu)圖

        表1 機(jī)器視覺中攝像機(jī)的物理參數(shù)

        表2 機(jī)器視覺中運(yùn)動(dòng)控制設(shè)備選型

        在采集乳腺腫瘤病理圖像過程中,將目標(biāo)位置放置在攝像范圍內(nèi),攝像機(jī)在運(yùn)動(dòng)控制硬件的驅(qū)動(dòng)控制下,到達(dá)合適的拍攝位置,采集到乳腺腫瘤病理圖像。

        2.3 圖像預(yù)處理

        利用機(jī)器視覺設(shè)備取得乳腺腫瘤的病理初始圖像,但受到采集環(huán)境以及操作等多種因素的影響,初始采集的圖像不能直接進(jìn)行識(shí)別處理,需要經(jīng)過色度轉(zhuǎn)換、平滑處理、均值濾波等多個(gè)步驟對(duì)初始圖像進(jìn)行預(yù)處理。

        2.3.1色度轉(zhuǎn)換 機(jī)器視覺成像設(shè)備生成的圖像大部分為彩色圖像,信息量大,但在醫(yī)學(xué)病理的研究方面價(jià)值不大,在預(yù)處理時(shí),需要將待處理的彩色圖像進(jìn)行灰度化處理,實(shí)現(xiàn)圖像的色度轉(zhuǎn)換。采用圖像色度和明度分離的方式,保留反映病理圖像本質(zhì)特征的色度并進(jìn)行聚類分析,具體的操作過程可以表示為:

        (1)

        其中,r、g和b分別表示的是乳腺腫瘤病理初始圖像中紅、綠、藍(lán)的色度坐標(biāo)值。

        2.3.2平滑處理 圖像平滑處理的目的是減少和抑制圖像噪聲,并盡量保留圖像中的細(xì)節(jié)特征[7]。假設(shè)線性機(jī)器視覺系統(tǒng)的單位樣本響應(yīng)為h(n),若輸入一個(gè)隨機(jī)信號(hào)x(n),且隨機(jī)信號(hào)滿足式(2)表示的關(guān)系式,則可以得出對(duì)應(yīng)的輸出表達(dá)式(3)。

        x(n)=s(n)+v(n)

        (2)

        其中,s(n)和v(n)分別表示的是乳腺腫瘤病理圖像信號(hào)和噪聲信號(hào),得出的輸出表達(dá)式為:

        y(n)=h(n)*x(n)=h(n)*[s(n)+v(n)]

        (3)

        隨機(jī)信號(hào)通過機(jī)器視覺圖像采集系統(tǒng)后,得到的y(n)越接近s(n),其均方差越小,均方差的計(jì)算表達(dá)式為:

        隨著互聯(lián)網(wǎng)金融的快速發(fā)展、大學(xué)生網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái)迅速興起。本文通過調(diào)查問卷的方式,以大學(xué)生群體為主要對(duì)象,了解大學(xué)生對(duì)網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái)的認(rèn)知和使用現(xiàn)狀。并通過深入的實(shí)證分析得出大學(xué)生的家庭收入、每月生活費(fèi)水平和網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái)的安全性是影響大學(xué)生對(duì)借貸平臺(tái)選擇的因素。大學(xué)生首先應(yīng)該量入為出、適度消費(fèi),合理規(guī)劃每月收入和支出,確保對(duì)網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái)的使用不會(huì)影響自身的學(xué)習(xí)和生活。其次,應(yīng)該盡量選擇信譽(yù)好、安全性高的網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái),降低網(wǎng)絡(luò)借貸平臺(tái)使用風(fēng)險(xiǎn)。

        e2=E{[s(n)-y(n)]2}

        (4)

        其中,E{·}表示的是期望值。由此便實(shí)現(xiàn)了對(duì)一組一維信號(hào)的平滑處理[8]。在實(shí)際的圖像處理過程中,用G表示采集的初始病理圖像,平滑處理后輸出的圖像可以表示為:

        (5)

        通過初始病理圖像和輸出圖像之間的像素局部均值和方差實(shí)現(xiàn)對(duì)圖像的濾波處理,并得出平滑處理結(jié)果。

        2.3.3圖像增強(qiáng) 病理圖像的增強(qiáng)處理直接關(guān)系到乳腺腫瘤細(xì)節(jié)的增強(qiáng),在一定意義上能反映整個(gè)乳腺紋理信息。定義圖像的對(duì)比度用C(x,y)來表示,對(duì)應(yīng)表達(dá)式為:

        (6)

        其中,uf(x,y)表示的是乳腺腫瘤的紋理信息,表示為:

        (7)

        式(7)中σ(x,y)為權(quán)值函數(shù)[9]。通過對(duì)乳腺腫瘤病理采集圖像的一系列預(yù)處理,處理前后的對(duì)比情況,見圖2。

        圖2 預(yù)處理前后乳腺腫瘤病理圖像示意圖

        2.4 圖像分割

        在乳腺腫瘤病理圖像預(yù)處理輸出結(jié)果上,結(jié)合乳腺腫瘤的特性計(jì)算圖像中的紋理域和亮度域的邊緣置信圖,得到腫瘤區(qū)域的邊緣,沿著腫瘤邊緣實(shí)現(xiàn)對(duì)乳腺腫瘤病理圖像的分割處理。計(jì)算腫瘤紋理域的邊緣置信圖的過程,見式(8):

        (8)

        同理可以得出病理圖像的亮度域。接著確定乳腺腫瘤區(qū)域的邊緣起點(diǎn),起點(diǎn)位置為置信圖首行中最大值所在的位置,即:

        (9)

        由邊緣起點(diǎn)(H(1),1)和置信圖,通過遞推方式得到其他邊緣點(diǎn)[10]。假設(shè)第i行的腫瘤邊緣點(diǎn)坐標(biāo)為(H(i),i),則第i+1行邊緣點(diǎn)為Map(x,i+1)最大值所處的位置,具體的計(jì)算過程可以表示為:

        (10)

        其中,r為乳腺腫瘤病理圖像中乳腺腫瘤的鄰域半徑。沿著得出的邊緣檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行圖像分割,并得出對(duì)應(yīng)的處理結(jié)果。

        2.5 圖像特征提取

        相比于自然圖像,病理圖像具有一定的啟發(fā)式特征,在乳腺腫瘤的識(shí)別和分類中,可以觀察良性和惡性腫瘤圖像在細(xì)胞核中的數(shù)量、大小、分布情況以及染色質(zhì)紋理上存在的差異,通過對(duì)病理圖像中邊緣、紋理、形狀等特征的提取,將提取結(jié)果與乳腺腫瘤的影像學(xué)病理特征做對(duì)比,便可實(shí)現(xiàn)對(duì)乳腺腫瘤病理圖像的識(shí)別[11]。其中,邊緣特征可直接提取圖像分割過程中得出的分割線。以乳腺腫瘤病理圖像的形狀特征為例,可以由目標(biāo)對(duì)象邊界所包含的像素?cái)?shù)計(jì)算得出,假設(shè)病理圖像中目標(biāo)區(qū)域的長(zhǎng)和寬分別為M和N,則腫瘤的面積特征為:

        (11)

        其中,B(i,j)表示的是圖像的像素值。另外腫瘤中心的位置坐標(biāo)可以用式(12)計(jì)算。

        (12)

        其中,dx和dy分別為病理圖像中腫瘤部分左上角頂點(diǎn)的橫縱坐標(biāo)。綜合面積特征向量以及位置特征向量,可以得出病理圖像形狀特征的提取結(jié)果,同理,可得出圖像的紋理特征。綜合所有特征的提取結(jié)果,整合成特征向量的形式輸出。

        2.6 圖像識(shí)別

        將乳腺腫瘤的影像學(xué)特征與采集并處理完成的病理圖像進(jìn)行相似性計(jì)算,實(shí)現(xiàn)特征的匹配與識(shí)別。將乳腺腫瘤的影像學(xué)圖像記為X1,采集的病理圖像為X2,則全局相似性的計(jì)算公式為:

        (13)

        其中,A1和A2是圖像X1和X2的特征向量[12]。設(shè)置相似度闕值為η,若計(jì)算得出的d(X1,X2)大于η,則證明該圖像為乳腺腫瘤病理圖像,且乳腺腫瘤為惡性,否則證明采集的圖像為普通圖像或乳腺腫瘤為良性的圖像。

        3 識(shí)別性能測(cè)試實(shí)驗(yàn)分析

        為測(cè)試本研究設(shè)計(jì)的基于影像學(xué)機(jī)器視覺的乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別方法的應(yīng)用性能,設(shè)計(jì)對(duì)比實(shí)驗(yàn),其主要測(cè)試指標(biāo)為識(shí)別的錯(cuò)誤率,為保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可信度,采取多次實(shí)驗(yàn)取平均值的方式,得出更加精準(zhǔn)的測(cè)試結(jié)果。

        3.1 患者臨床資料

        收集某市所有經(jīng)過穿刺或手術(shù)病理結(jié)果證實(shí)為乳腺腫瘤患者共400例,并嚴(yán)格按照納入及排除標(biāo)準(zhǔn),篩選入組病例。實(shí)驗(yàn)對(duì)象的排除標(biāo)準(zhǔn)是既往有乳腺手術(shù)、化療、放療或靶向治療史的患者,最終確定380例患者納入本研究。

        3.2 準(zhǔn)備病理圖像數(shù)據(jù)集

        乳腺腫瘤病理圖像的數(shù)據(jù)集是為圖像的識(shí)別提供標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)。本研究采用的乳腺圖像包括mini-MIAS數(shù)據(jù)庫、DDSM數(shù)據(jù)庫和北京大學(xué)人民醫(yī)院乳腺中心提供的乳腺圖像,其中數(shù)據(jù)集中的部分圖像見圖3。

        3.3 識(shí)別性能測(cè)試過程

        測(cè)試實(shí)驗(yàn)中,實(shí)驗(yàn)對(duì)象除了設(shè)置的乳腺腫瘤患者之外,還包含120例具有乳腺疾病但無乳腺腫瘤疾病的患者以及無乳腺疾病的健康者。將實(shí)驗(yàn)對(duì)象隨機(jī)分為8組,每組至少50例,但每組中乳腺腫瘤患者數(shù)量不固定。通過機(jī)器視覺的圖像采集、影像學(xué)分析、圖像處理、特征提取與匹配等多個(gè)步驟,得出最終的識(shí)別結(jié)果見圖4。

        對(duì)比實(shí)驗(yàn)中,除本研究方法之外,還設(shè)置了傳統(tǒng)的圖像識(shí)別方法和文獻(xiàn)[12]提出的基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的圖像識(shí)別方法。

        3.4 識(shí)別性能測(cè)試結(jié)果分析

        通過與設(shè)置數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比得出的測(cè)試結(jié)果,見表3。

        圖3 數(shù)據(jù)集中部分乳腺圖像

        圖4 乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別結(jié)果輸出界面

        表3 識(shí)別性能測(cè)試對(duì)比結(jié)果

        通過對(duì)表3中數(shù)據(jù)的對(duì)比分析,發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)識(shí)別方法中識(shí)別錯(cuò)誤的數(shù)量為17例,文獻(xiàn)[12]識(shí)別方法和本研究方法的識(shí)別錯(cuò)誤數(shù)量分別為11例和4例。由此可以算出,傳統(tǒng)識(shí)別方法和文獻(xiàn)[12]提出的識(shí)別方法的識(shí)別錯(cuò)誤率分別為3.4%和2.2%,而本研究識(shí)別方法的錯(cuò)誤率為0.8%。

        4 結(jié)束語

        乳腺腫瘤是女性發(fā)病率較高的疾病之一,乳腺腫瘤早期可以通過治療得以治愈,腫瘤發(fā)現(xiàn)的越晚,治愈的可能性越低。本研究設(shè)計(jì)開發(fā)的基于影像學(xué)機(jī)器視覺的乳腺腫瘤病理圖像識(shí)別方法,可以在提高乳腺腫瘤識(shí)別精準(zhǔn)度的同時(shí),加快識(shí)別速度。因此,在臨床工作中具有較高的應(yīng)用價(jià)值。

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