日本筑波大學(xué)和日本國(guó)家農(nóng)業(yè)與食品研究組織(NARO)的研究人員最近在《生物學(xué)通訊》(Communications?Biology)上發(fā)表的一項(xiàng)研究表明,當(dāng)甜瓜基因組多樣化時(shí),逆轉(zhuǎn)座子可以改變基因表達(dá),并可能影響果實(shí)成熟。
甜瓜是全球最重要的經(jīng)濟(jì)作物之一。甜瓜的一個(gè)特殊特征是兩種水果類型共存:呼吸躍變型(產(chǎn)生乙烯,指某些肉質(zhì)果實(shí)從生長(zhǎng)停止到開始進(jìn)入衰老之間的時(shí)期,其呼吸速率的突然升高)和非呼吸躍變型。乙烯是一種重要的植物激素,對(duì)調(diào)節(jié)果實(shí)的貨架期等躍變期果實(shí)成熟性狀具有重要的經(jīng)濟(jì)意義。
Harukei-3由于其口感和美觀,在日本作為選育高檔甜瓜的標(biāo)準(zhǔn)類型已經(jīng)使用了很長(zhǎng)時(shí)間,這種甜瓜如果生長(zhǎng)在合適的季節(jié),會(huì)產(chǎn)生特別甜的果實(shí)。由于Harukei-3甜瓜在成熟過程中會(huì)產(chǎn)生乙烯,研究人員通過使用第三代納米孔測(cè)序結(jié)合光學(xué)測(cè)序和下一代測(cè)序,組裝了Harukei-3的整個(gè)基因組序列。
研究結(jié)果表明,當(dāng)甜瓜基因組多樣化時(shí),逆轉(zhuǎn)座子有助于基因表達(dá)方式的變化。逆轉(zhuǎn)座子也可能影響導(dǎo)致果實(shí)成熟的基因表達(dá)。
來源:Seedquest