浩海云
盡管在挖掘現(xiàn)場沒有發(fā)現(xiàn)任何人類遺骸,但考古學(xué)家們通過提取一塊5700年前“口香糖”中保存的DNA,成功復(fù)原了其主人的樣貌。并發(fā)現(xiàn)她的食譜和其攜帶的細菌、病毒信息,甚至還有她家族的源頭,以及他們開始農(nóng)耕生活的可能時間。這塊普通的“口香糖”或許可以揭開古人類和人體微生物組演化研究的新篇章。
石器時代末期,在丹麥南部有一個小漁村,它坐落在濱海瀉湖旁邊,沿岸的一排沙壩將這里與波羅的海隔開,考古學(xué)家們稱其為“Syltholm”。在這里生活的人們會建造枝條籬來攔截游魚,再用骨矛將其捕獲。某一天,村莊里一位有著深色皮膚、棕色頭發(fā)和清澈藍眼睛的姑娘正嚼著一塊“口香糖”。當(dāng)然,她的“口香糖”只是一塊黏黏的、凝固了的樺樹瀝青。
樺樹瀝青是石器時代常用的粘合劑,軟化后的樺樹瀝青可以用來修復(fù)破碎的陶器或燧石工具。新石器時代的遺址中曾發(fā)現(xiàn)一些帶有齒痕的樺樹瀝青,因此考古學(xué)家們判斷,這可能還是一種新石器時代的“口香糖”。
被復(fù)原的女孩當(dāng)時或許正在用樺樹瀝青修復(fù)工具,隨手放了一塊在嘴里,又或許只是突然想吃一塊“口香糖”。總之,當(dāng)她吐掉“口香糖”后,這塊樺樹瀝青就被埋在了一堆泥沙里,直到5700年后才被考古學(xué)家發(fā)現(xiàn)。神奇的是,考古學(xué)家從這塊樺樹瀝青中提取出了她完整的基因組,她口腔中的菌群,甚至還有她吃過的食物的DNA。
這項研究指出,從被嚼過的樺樹瀝青中,或許能復(fù)原古人類及其體內(nèi)微生物的DNA,這些證據(jù)可以為古人類的人口歷史、健康狀況和生存策略等方面的研究提供線索。
“這本來只是一塊毫不起眼的樺樹瀝青,在幾千年前被某個人隨手丟掉了,但現(xiàn)在我們卻借此‘召喚出了一個女孩”,文章的通訊作者、哥本哈根大學(xué)的考古學(xué)家漢內(nèi)斯·施羅德這樣說道,“居然能從這么一小塊東西中得到這么多信息,實在是太神奇了。”
事實上,施羅德并不是第一個從新石器時代的“口香糖”中尋找DNA的人。論文的另一位作者,哥本哈根大學(xué)的生物考古學(xué)家詹森,在另一個瑞典的挖掘現(xiàn)場工作時看到了許多塊帶有牙印的樺樹瀝青,隨后第一次有了嘗試從中提取基因組信息的想法。據(jù)他介紹,在當(dāng)時“新一代基因測序技術(shù)打破了過去對DNA材料的限制,因此我認為這些‘口香糖或許也保存了基因信息”。他的想法隨后得到了確認——詹森的同事們從幾塊一萬年前的樺樹瀝青中提取出了三個人的部分DNA,研究結(jié)果發(fā)表于《通訊生物學(xué)》。
據(jù)瑞典烏普薩拉大學(xué)的納塔利婭·卡舒巴介紹,“Syltholm”的樺樹瀝青樣品,連同其中封存的基因組信息,可能埋藏在了一個無氧的封閉環(huán)境中,因此才能保存得如此完好。她表示,如果考古學(xué)家們可以發(fā)現(xiàn)更多古代微生物組的樣本,他們或許就能拼湊出影響人類健康的細菌和病毒的演化史。“對那些人類健康與環(huán)境的研究來說,這種材料簡直就是無價之寶?!?/p>
施羅德和他的同事們在樣品中發(fā)現(xiàn)了許多種類微生物的DNA,其中有一部分被稱作“微生物組”的群落是與人體共生且無害的。他們也找到了一些有害的微生物,比如一種會導(dǎo)致牙周病的口腔細菌,伯斯坦-巴爾病毒(一種非常常見的皰疹病毒),和幾種會導(dǎo)致肺炎的菌株。然而,盡管研究人員成功辨識出了26種致病微生物及會增強病原體感染能力的分子,他們依然無法確定這個姑娘的健康狀況。
另外,研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)時這個村莊可能剛從狩獵和采集轉(zhuǎn)向了畜牧和農(nóng)耕的生產(chǎn)方式。比如,這位姑娘有乳糖不耐受,這種癥狀在剛接觸畜牧業(yè)的狩獵采集社會非常常見。另外,口香糖中還發(fā)現(xiàn)了榛子和綠頭鴨的DNA,證明她最近可能吃了這些東西,這也很符合狩獵者和采集者的食譜。
研究人員認為,耕種在比較晚的時候,大約到了這位姑娘生活的時代,才傳到了丹麥。不過在此之后,這種生產(chǎn)方式就在當(dāng)?shù)匮杆俚貍鞑ラ_來。然而,考古學(xué)家們?nèi)圆磺宄?,農(nóng)耕技術(shù)究竟是由這里的原住民自行開發(fā)的,還是隨著外來者傳來的。據(jù)施羅德及其同事介紹,這位“Syltholm”姑娘的基因組顯示,她與同一時期丹麥以外的其他農(nóng)耕族群并沒有親緣關(guān)系。她出身于一個被考古學(xué)家們稱為西部狩獵采集者的族群,這個部落在11700年前,從南部到達了斯堪的納維亞,并在此定居。
在農(nóng)耕社會出現(xiàn)后,人們可以獲得更多富含碳水化合物的食物,因此腸道內(nèi)和口腔內(nèi)的微生物組也發(fā)生了第一次變化。(第二次變化發(fā)生在工業(yè)革命后,當(dāng)時精制砂糖和植物油主宰了餐桌。)研究者們期待著從“口香糖”中發(fā)現(xiàn)的口腔菌群可以幫助了解這一過程,但這非常困難。
賓夕法尼亞州立大學(xué)的古微生物學(xué)家勞拉·溫里什評論說,只從一塊嚼過的口香糖里,很難復(fù)原出“Syltholm”姑娘口腔中微生物組的具體種類,更不用說她的全部食譜了。這是因為人類牙齒上的細菌種群,與唾液中或舌頭上的差別很大,而我們從口香糖中找到的,“很可能是所有這些口腔微生物的混合體”,她表示,“如果不能研究更多的狩獵采集者,就很難對這些微生物組進行分類?!?/p>
盡管如此,溫里什仍然認為,這個研究或許揭開了古人類和人體微生物組演化研究的新篇章。她認為:“古人類DNA領(lǐng)域的發(fā)展,可以對人類基因組和人類微生物組的共同演化的研究提供很大幫助?;蛟S在未來,會有一個叫‘口香糖基因?qū)W的新領(lǐng)域出現(xiàn)”。