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        基于多分類SVM的石榴葉片病害檢測(cè)方法

        2020-09-26 00:58:36王燕妮
        關(guān)鍵詞:孢屬石榴病斑

        王燕妮,賀 莉

        (西安建筑科技大學(xué) 信息與控制工程學(xué)院,西安 710055)

        0 引言

        在中國(guó),臨潼是最大規(guī)模的石榴生產(chǎn)基地。目前,臨潼區(qū)石榴栽植面積達(dá)10萬(wàn)畝,年產(chǎn)鮮果8萬(wàn)噸,從事石榴生產(chǎn)銷售的企業(yè)、專業(yè)合作社有30余家,石榴產(chǎn)業(yè)年產(chǎn)值達(dá)5億元以上[1]。石榴是臨潼重要的水果作物,由于石榴的病害,約有10~30%的作物損失。因此,需要在開始階段確定疾病,并向農(nóng)民提出解決辦法,以便可以避免最大損害,從而提高產(chǎn)量。

        植物的疾病大多是在它們的葉子、果實(shí)和植物的莖上,石榴由于果腐病、炭疽病、枯萎病和褐斑病等葉病而遭受巨大損失。在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,對(duì)葉類疾病的早期檢測(cè)是主要的挑戰(zhàn)。農(nóng)民一般用肉眼觀察來(lái)判斷疾病,但這種方法有時(shí)可能會(huì)造成誤判,而且在很多時(shí)候,農(nóng)民還需要召集專家來(lái)檢測(cè)同樣的疾病,在大農(nóng)場(chǎng)中,如果采取這種檢測(cè)方式是很費(fèi)時(shí)的。利用數(shù)字圖像處理技術(shù),在工業(yè)檢驗(yàn)、醫(yī)學(xué)成像、遙感、農(nóng)業(yè)加工等不同領(lǐng)域發(fā)現(xiàn)了大量的應(yīng)用。

        對(duì)于各種農(nóng)業(yè)應(yīng)用中的分析,數(shù)字圖像處理技術(shù)已經(jīng)被建立為一種有效的方法,如植物識(shí)別、土壤質(zhì)量估計(jì)以及在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域中作物產(chǎn)量的估算等。數(shù)字圖像處理技術(shù)在農(nóng)業(yè)中的應(yīng)用之一是對(duì)植物病害的檢測(cè)。

        病害類型可分為細(xì)菌、病毒、真菌等,在中國(guó)發(fā)現(xiàn)的石榴葉病害主要有交鏈孢屬和炭疽病[2]。文章重點(diǎn)研究了應(yīng)用圖像處理技術(shù)對(duì)交鏈孢屬、炭疽病和健康葉片進(jìn)行識(shí)別和分類,介紹了如何實(shí)現(xiàn)石榴葉片疾病的自動(dòng)檢測(cè)。該研究為石榴葉病的檢測(cè)和分類提供了快速、準(zhǔn)確、成本低廉的方法。

        在農(nóng)業(yè)應(yīng)用中,許多學(xué)者利用數(shù)字圖像處理技術(shù)對(duì)植物葉片病害的檢測(cè)進(jìn)行了大量的研究。由于不同植物的病害癥狀表現(xiàn)大不相同,每種疾病都有自己獨(dú)特的特點(diǎn),僅僅依靠傳統(tǒng)的病理知識(shí)和歷史經(jīng)驗(yàn)可能會(huì)誤判病期,所以對(duì)葉子上的疾病的視覺(jué)識(shí)別不太準(zhǔn)確,需要有更多的經(jīng)驗(yàn)和知識(shí)。

        植物病害自動(dòng)檢測(cè)在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域具有優(yōu)勢(shì),因此是一個(gè)重要的研究課題。在處理較復(fù)雜的圖像背景時(shí),張芳[3]運(yùn)用了一種超像素和形狀上下文結(jié)合的分割算法使黃瓜病葉圖像的背景部分與目標(biāo)區(qū)域成功分離,達(dá)到了預(yù)期效果。在Tobias Baum,Udo Seiffert[4]等人的大麥分割斑塊實(shí)驗(yàn)中,預(yù)處理使用二值化進(jìn)行圖像增強(qiáng),然后使用Sobel邊緣檢測(cè)算子分割并最終分離葉斑。Al-Hiary H,Bani-Ahmad S[5]等,首先識(shí)別大多數(shù)綠色像素,然后根據(jù)Otsu方法計(jì)算的特定閾值對(duì)這些像素進(jìn)行屏蔽,最后完全去除紅色、綠色和藍(lán)色零值像素和受感染集群邊界上的像素。張武、黃帥[6]等人首先使用K-means聚類分割算法去除圖像背景,然后使用Otsu閾值法和面積閾值法等各種算法,對(duì)小麥植株圖像進(jìn)行多次分割,最終很好地分割出了帶有病斑的小麥圖像。Prasad,Shitala[7]等人提出了一種新的高效、魯棒的移動(dòng)視覺(jué)系統(tǒng),用于移動(dòng)設(shè)備中的無(wú)監(jiān)督葉子圖像分割,開發(fā)了一種基于紋理的植物葉片圖像分割聚類算法和一種像素聚類方法。尚怡君[8]等人在3種玉米病害葉片圖像數(shù)據(jù)庫(kù)上通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)比了主成分分析技術(shù)(PCA)+概率神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(PNN)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)與貝葉斯方法,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,采用監(jiān)督局部保持映射(DLPP)算法與最近鄰分類器相結(jié)合識(shí)別植物病害,識(shí)別精度達(dá)到85.5%。

        1 系統(tǒng)算法實(shí)現(xiàn)

        1.1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)

        植物病斑檢測(cè)過(guò)程分為圖像處理和機(jī)器學(xué)習(xí)兩部分。首先,需要獲取實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)圖像,然后進(jìn)一步處理這些數(shù)據(jù)。最后,機(jī)器學(xué)習(xí)模型基于圖像特征對(duì)疾病進(jìn)行分類。圖像處理技術(shù)的總體流程包括圖像采集、圖像預(yù)處理、圖像分割和圖像特征提取。機(jī)器學(xué)習(xí)包括特征選擇和分類,植物葉片病斑識(shí)別技術(shù)如圖1所示。

        圖1 系統(tǒng)方框圖

        具體算法步驟如下:

        1)首先將采集到的彩色葉片圖像進(jìn)行裁剪,保留圖像的病斑部分和綠葉正常部分,并將圖像大小統(tǒng)一到275×183的尺寸;

        2)對(duì)裁剪后的圖像使用高斯濾波進(jìn)行去噪,并使用直方圖均衡化增強(qiáng)病斑圖像細(xì)節(jié);

        3)采用基于權(quán)重的改進(jìn)距離公式,根據(jù)k均值(k-means)算法重新計(jì)算聚類中心,以確定各部分所屬類別;

        4)基于顏色矩提取HSI顏色空間3個(gè)通道的顏色特征,利用灰度共生矩提取圖像的9個(gè)紋理特征;

        5)將得到的特征參數(shù)輸入到線性支持向量機(jī)中進(jìn)行分類識(shí)別。

        計(jì)算機(jī)的視覺(jué)和圖像處理技術(shù)具有很強(qiáng)的客觀性和及時(shí)性,將計(jì)算機(jī)視覺(jué)技術(shù)應(yīng)用于果農(nóng)業(yè)的發(fā)展研究中,依靠高科技創(chuàng)新技術(shù)來(lái)帶動(dòng)果農(nóng)業(yè)發(fā)展并提高經(jīng)濟(jì)作物產(chǎn)量,是一項(xiàng)很有現(xiàn)實(shí)意義的課題。

        1.2 圖像獲取

        圖像識(shí)別首先需要獲取實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),這一步的主要任務(wù)是利用相關(guān)電子設(shè)備或通過(guò)其他途徑將所需要的實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)采集下來(lái),當(dāng)把采集到的圖像輸入計(jì)算機(jī)時(shí),圖像的模擬信號(hào)轉(zhuǎn)換為數(shù)字信號(hào)。圖像采集過(guò)程的合理性將直接影響圖像的質(zhì)量和后續(xù)圖像處理的效果。

        在本研究中,石榴葉圖像來(lái)自AI challenger農(nóng)作物病害檢測(cè)競(jìng)賽中的plant village數(shù)據(jù)集,圖片格式保存為 JPG格式,用于訓(xùn)練和測(cè)試。收集到的圖像包括交鏈孢屬、炭疽病和健康葉片。

        1.3 預(yù)處理

        獲取到的植物葉片上可能會(huì)出現(xiàn)灰塵、露珠、昆蟲糞便,這些被認(rèn)為是圖像噪聲,為了避免這些噪聲影響后續(xù)分割病斑的效果,一般情況下,需要對(duì)采集到的原始圖像進(jìn)行預(yù)處理。此外,捕捉到的圖像可能會(huì)出現(xiàn)一些水滴和陰影效應(yīng)的失真,這將會(huì)在分割和特征提取階段造成問(wèn)題,因此,可以使用不同的去噪濾波器來(lái)衰減或消除這種失真的影響。

        在這個(gè)步驟中,首先調(diào)整圖像大小到275×183的尺寸,然后進(jìn)行高斯濾波以去除圖像中的噪聲,最后對(duì)病害圖像進(jìn)行增強(qiáng)。預(yù)處理既消除了背景噪聲,又抑制了不想要的失真,提高了圖像質(zhì)量。

        2 算法描述

        2.1 K-means算法

        在圖像分割中,是將給定的圖像分割成與某些特征有關(guān)的均勻區(qū)域。分割的目的則是為了將圖像進(jìn)行簡(jiǎn)化表示,并將其轉(zhuǎn)換為更有意義且更易于分析的內(nèi)容。聚類是將大型數(shù)據(jù)集分組為小集合或相似數(shù)據(jù)段的一種方法。本次研究中,采用K均值聚類算法將預(yù)處理后的圖像分割成三簇,如圖4所示。所述簇包含葉的患病部分,正常綠葉部分和背景區(qū)域。

        k-means算法應(yīng)用于植物病害圖像分割的優(yōu)點(diǎn)[9]和k-means算法過(guò)程如下所示。

        1)K-means算法的優(yōu)點(diǎn):

        (1)聚類是一種無(wú)監(jiān)督學(xué)習(xí)的方法,可以將一些沒(méi)有標(biāo)簽的數(shù)據(jù)劃分成若干類,算法原理簡(jiǎn)單,收斂速度快,能夠很好地區(qū)分圖像區(qū)域間存在較大差異的圖像。

        (2)適用于球類型分布的數(shù)據(jù)。由于石榴葉出現(xiàn)的病斑大多呈現(xiàn)橢圓斑狀,所以利用K-means聚類算法分割具有很好的效果。

        (3)需要調(diào)節(jié)的參數(shù)只有簇?cái)?shù)K,當(dāng)選取合適的初始聚類中心后,僅僅依據(jù)圖像的顏色信息就可以對(duì)圖像進(jìn)行聚類,具有很強(qiáng)的魯棒性。

        2)K-means算法過(guò)程:

        (1)將數(shù)據(jù)集劃分為K個(gè)簇?cái)?shù),并將數(shù)據(jù)點(diǎn)隨機(jī)分配給聚類。

        (2)對(duì)于每個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn),采用近鄰思想將其劃分到最近鄰所在的簇中,本文給出的改進(jìn)算法通過(guò)權(quán)重來(lái)計(jì)算距離,從而界定是否屬于一類,任意兩個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)(x1,y1),(x2,y2)的歐式距離為:

        (1)

        改進(jìn)的距離公式為:

        (2)

        其中:Si是聚類中心i所屬的類別中數(shù)據(jù)的個(gè)數(shù),S是所有數(shù)據(jù)的個(gè)數(shù)。

        (3)如果數(shù)據(jù)點(diǎn)最靠近它自己的群集,則將其放在它所在的位置。

        (4)如果數(shù)據(jù)點(diǎn)不是最接近其自己的群集,則將其轉(zhuǎn)移到附近的集群中。

        (5)重復(fù)所有步驟,直到所有的數(shù)據(jù)點(diǎn)滿足條件為止。

        (6)若集群趨于穩(wěn)定,聚類過(guò)程停止。

        算法偽代碼:

        輸入:數(shù)據(jù)集S={x1,x2,…,xn};

        聚類簇?cái)?shù)K;

        過(guò)程:

        從S中隨機(jī)選擇K個(gè)數(shù)據(jù)作為初始向量{α1,α2,…αk}

        Repeat

        令Cj=φ(1≤j≤k)

        fori=1,2,…,ndo

        利用權(quán)重計(jì)算數(shù)據(jù)xi與各向量αj的距離:

        根據(jù)最近鄰原則確定xi的簇標(biāo)記:υi=argmindij

        將數(shù)據(jù)xi劃分到相應(yīng)的簇:Cυi=Cvi∪{xi}

        end for

        Forj=1,2,…,k

        Ifαj′≠αjthen

        將此時(shí)的均值向量αj更新為αj′

        else

        保持此時(shí)的均值向量不變

        end if

        end for

        Until 此時(shí)均值向量均未更新

        輸出:簇劃分C={C1,C2,…,Ck}

        其中,S為數(shù)據(jù)集,C為聚類所得簇。

        2.2 特征提取

        特征提取用于提取可用于確定給定樣本的重要性的信息,圖像分析的特征提取方面?zhèn)戎赜谧R(shí)別圖像中的固有特性或存在對(duì)象的特征,一般情況下,這些特征可以用來(lái)描述對(duì)象。圖像特征的主要類型是形狀、顏色和紋理,這些特征主要用于圖像處理技術(shù)[10]。

        在該系統(tǒng)中,顏色是圖像的一個(gè)重要的特征,因?yàn)樗梢詮牟∪~中區(qū)分出不屬于正常葉片顏色的區(qū)域,紋理特征指出顏色圖案如何在圖像中分布。因此,顏色特征和紋理特征都被提取出來(lái),以獲得更好的精度。以下步驟用于計(jì)算給定圖像的顏色特征:

        1)首先將RGB圖像轉(zhuǎn)換為HSI顏色空間。

        2)將圖像細(xì)分為3×3塊。

        3)使用以下公式計(jì)算九個(gè)塊中每個(gè)塊的平均顏色:

        (3)

        其中:xi是像素強(qiáng)度,N是像素總數(shù)。

        將計(jì)算出的平均值作為其中的一個(gè)顏色特征。

        4)對(duì)于每個(gè)塊,使用以下公式計(jì)算方差:

        (4)

        所計(jì)算的方差具有測(cè)量可變性的能力。

        5)計(jì)算H/S/I各塊的偏度:

        (5)

        利用偏度來(lái)判斷圖像表面分布的對(duì)稱情況。

        這樣每個(gè)區(qū)塊將有3+3+3=9種顏色特征。

        然后采用病斑圖像的9種紋理特征:對(duì)比度,能量,最大概率,均勻度,逆差分矩,差異方差,對(duì)角線方差,熵,相關(guān)性[11]。計(jì)算公式如表1所示。

        表1 紋理特征的數(shù)學(xué)公式

        2.3 分類識(shí)別

        分類是分析圖像特征的各種屬性并將其分類為各種聲明類的過(guò)程。在植物病害的分類中,利用分類技術(shù)根據(jù)圖像提取的特征對(duì)疾病進(jìn)行分類,從而檢測(cè)葉片病害類型。分類處理是將給定的輸入模式與一個(gè)不同的類相關(guān)聯(lián),不同的分類模型包括支持向量機(jī),神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),最近鄰分類器和基于規(guī)則的分類器。該系統(tǒng)采用線性支持向量機(jī)( Linear Support Vector Machine,簡(jiǎn)稱LSVM)對(duì)葉病進(jìn)行分類。

        支持向量機(jī)是一種二元分類器,它使用一個(gè)超平面,稱為兩類之間的決策邊界。支持向量機(jī)的主要目的是實(shí)現(xiàn)超平面和類邊界之間的最大距離,以避免將向量錯(cuò)誤劃分為其他類。這個(gè)超平面將劃分為一個(gè)包含標(biāo)記為+1的目標(biāo)訓(xùn)練向量的類,另一類包含標(biāo)記為-1的訓(xùn)練向量。

        使用此標(biāo)記的訓(xùn)練向量,SVM優(yōu)化器找到一個(gè)超平面ωTx+b=0,在超平面的上方定義y=1,在超平面下方定義y=-1,然后將使兩個(gè)類中的分離邊緣最大化,如圖2所示。

        圖2 支持向量機(jī)模型

        分類通常涉及兩個(gè)階段,分別為訓(xùn)練和測(cè)試。首先使用特征值及其相應(yīng)目標(biāo)值訓(xùn)練分類器,然后使用這個(gè)經(jīng)過(guò)訓(xùn)練的分類器對(duì)測(cè)試圖像進(jìn)行分類。

        3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

        本研究共使用了750幅石榴葉片圖像,包括病害圖像和健康圖像,其中600幅為病害圖像,150幅為健康葉片圖像。

        圖像處理第一步是預(yù)處理,圖3顯示出原始圖像和增強(qiáng)圖像。

        圖3 原始圖像和增強(qiáng)圖像

        然后使用k-means聚類將濾波后的圖像分割為3個(gè)簇,最后提取所有3個(gè)分割圖像的顏色和紋理特征。圖4顯示出了使用k-means聚類形成的3個(gè)簇。

        圖4 使用k-means分類結(jié)果

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,使用改進(jìn)的k-means聚類算法成功地將圖像聚為三類,由炭疽病和交鏈孢屬原始彩色圖像可以直觀看出,聚類1為葉片背景區(qū)域,聚類2為病斑區(qū)域,聚類3為葉片正常綠色區(qū)域,分割出的交鏈孢屬病斑和炭疽病病斑圖像均完整清晰。圖5為使用標(biāo)記符控制的分水嶺變換分割結(jié)果,從圖中可以看出,石榴葉的交鏈孢屬病斑圖像分割結(jié)果較好,但是炭疽病病斑圖像的右側(cè)區(qū)域分割效果不佳。

        圖5 使用標(biāo)記符控制的分水嶺變換分割結(jié)果

        本文對(duì)單葉圖像的3個(gè)分割部分分別計(jì)算了9個(gè)顏色特征和9個(gè)紋理特征。因此,單葉圖像的特征值總數(shù)變?yōu)?9+9)×3=54。這些特征值統(tǒng)稱為特征向量,給出了經(jīng)過(guò)訓(xùn)練的支持向量機(jī)分類器,該分類器根據(jù)特征值將輸入的石榴葉圖像分為交鏈孢屬、炭疽病和健康葉片三類。

        圖3所示的圖像是石榴的交鏈孢屬病斑,SVM將其分類成交鏈孢屬類,并將此結(jié)果呈現(xiàn)到如圖6中所示的消息框中。

        圖6 消息框顯示出的分類結(jié)果

        支持向量機(jī)分類器的總體性能概括為表2,圖7為支持向量機(jī)性能分析。從圖7可以看出,支持向量機(jī)對(duì)石榴葉片病斑的分類效果顯著。

        圖7 支持向量機(jī)性能分析

        表2 SVM分類結(jié)果

        (6)

        4 結(jié)束語(yǔ)

        該系統(tǒng)使用調(diào)整大小、高斯濾波和增強(qiáng)對(duì)圖像進(jìn)行預(yù)處理。為了分割病葉面積,采用K均值聚類技術(shù)對(duì)圖像進(jìn)行分割,然后利用顏色和紋理特征進(jìn)行特征提取。最后,利用支持向量機(jī)分類技術(shù)對(duì)葉片病害類型進(jìn)行檢測(cè)。實(shí)驗(yàn)中考慮了三類石榴葉片,即交鏈孢屬病斑、炭疽病病斑和健康葉片。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該系統(tǒng)對(duì)交鏈孢屬、炭疽病和健康葉片的平均準(zhǔn)確率為89.55%。今后的研究將重點(diǎn)放在以下幾點(diǎn):

        1)利用融合分類技術(shù),開發(fā)出多種算法的組合,提高分類過(guò)程的檢出率。

        2)在檢測(cè)疾病的基礎(chǔ)上,根據(jù)病害面積,向種植石榴的農(nóng)民提供適當(dāng)?shù)臍⒕鷦┗旌衔?,以便他們?cè)谵r(nóng)場(chǎng)中進(jìn)一步使用。

        3)在嵌入式系統(tǒng)的幫助下,設(shè)計(jì)一套自動(dòng)噴施殺菌劑混合物的自動(dòng)化系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)使用噴霧機(jī)構(gòu)自動(dòng)噴霧。

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