程雅婷,鮮凌瑾,武秋申,揭曉蝶,田 旭,陳霈瑤,李開(kāi)秀,鐘 航,章 杰*
(1.西南大學(xué) 動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,重慶 402460;2.樂(lè)山職業(yè)技術(shù)學(xué)院,四川 樂(lè)山 614000;3.重慶市畜牧科學(xué)院,重慶 402460)
飼糧纖維是指植物中固有的、完整的不易被動(dòng)物小腸消化酶所消化利用,但能被大腸微生物發(fā)酵利用的可食碳水化合物和木質(zhì)素的總稱(chēng)[1]。研究表明,在飼糧中適量添加纖維有利于動(dòng)物的生長(zhǎng)發(fā)育。GONZLEZ-ALVARADO等[2]研究顯示飼糧中添加燕麥殼和大豆殼可顯著提高肉仔雞日增體質(zhì)量、平均日采食量、料重比以及有機(jī)物、可溶性灰分和脂肪等的消化率。MARGüENDA等[3]研究指出,飼糧中添加37%中性洗滌纖維水平可提高兔日采食量和胴體產(chǎn)量,降低生長(zhǎng)期死亡率。RENAUDEAU等[4]報(bào)道在母豬哺乳期飼喂高纖維飼糧(20%中性洗滌纖維)可增加仔豬的生長(zhǎng)速度和體質(zhì)量。此外,研究還發(fā)現(xiàn)飼糧中添加不同來(lái)源的纖維對(duì)動(dòng)物生長(zhǎng)發(fā)育具有不同的影響。HE等[5]研究了飼糧中添加玉米秸稈、蒸汽爆破玉米秸稈、蒸汽爆破麥秸和蒸汽爆破稻草對(duì)灰鵝生長(zhǎng)發(fā)育的影響,結(jié)果顯示飼喂玉米秸稈的平均日采食量和飼料轉(zhuǎn)化率最高。JIMéNEZ-MORENO等[6]研究了纖維素、甜菜漿、燕麥殼飼糧對(duì)肉雞胃腸道發(fā)育和pH值的影響,結(jié)果指出甜菜漿和燕麥殼可降低胃腸道的pH值,提高脂肪、灰分和淀粉等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化率。反芻動(dòng)物對(duì)飼糧纖維的消化利用主要依靠瘤胃微生物,單胃動(dòng)物則主要依靠腸道后段內(nèi)的微生物,而胃腸道微生物是影響宿主營(yíng)養(yǎng)吸收、能量代謝、免疫平衡和生長(zhǎng)繁殖的重要因素之一[7]。因此,研究腸道微生物菌群構(gòu)成是了解飼糧纖維對(duì)宿主生長(zhǎng)發(fā)育影響的基礎(chǔ)。CHEN等[8]研究表明,飼糧中添加豌豆和麥麩可增加腸道有益微生物的濃度來(lái)抵抗細(xì)胞外病原體數(shù)量,進(jìn)而降低斷奶仔豬的發(fā)病率。AMERAH等[9]研究指出,不同纖維源會(huì)影響回腸微生物菌群特征,從而改變營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消化率。鵝是草食性家禽,具有耐粗飼的特點(diǎn),可大量利用草和秸稈,對(duì)粗纖維的消化率可達(dá)40%~50%,是研究動(dòng)物飼糧纖維理論基礎(chǔ)的理想模型[10]。目前,鵝因耗精料少而在中國(guó)被大范圍養(yǎng)殖,飼養(yǎng)量占全球總量的90%以上[11],但不同來(lái)源的纖維飼糧對(duì)鵝腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)的影響鮮見(jiàn)報(bào)道。因此,本試驗(yàn)以四川白鵝為研究對(duì)象,探討了不同纖維源(苜蓿、黑麥、燕麥和花生秧)飼糧對(duì)其腸道微生物菌群的影響,為更好地了解四川白鵝對(duì)粗纖維的消化利用情況提供科學(xué)數(shù)據(jù),同時(shí)也為生產(chǎn)實(shí)際中利用牧草纖維及制定飼糧配方提供科學(xué)依據(jù)。
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物選取體況健康、體質(zhì)量相近的1日齡四川白鵝120只,隨機(jī)分為4組,分別為苜蓿組、黑麥組、燕麥組和花生秧組,每個(gè)處理3個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)10只鵝。試驗(yàn)在西南大學(xué)畜牧實(shí)訓(xùn)基地進(jìn)行,采用半開(kāi)放式鵝舍,地面圈養(yǎng),自由采食與飲水,每日飼喂4次(7:30,12:30,17:00,21:00)。試驗(yàn)持續(xù)時(shí)間為70 d,試驗(yàn)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)成分見(jiàn)表1。試驗(yàn)期環(huán)境溫度為(28.77±0.11)℃,濕度為(86.78±0.42)%。
1.2 生長(zhǎng)性能測(cè)定70日齡時(shí)進(jìn)行空腹稱(chēng)體質(zhì)量(稱(chēng)體質(zhì)量前禁食6 h),記錄并計(jì)算平均日增體質(zhì)量(ADG:average daily gain)、平均日采食量(ADFI:average daily feed intake)和料重比(F/G)。
1.3 腸道微生物采集70日齡時(shí),每組隨機(jī)選取3只鵝進(jìn)行屠宰,迅速取出盲腸并結(jié)扎,經(jīng)75%酒精擦拭消毒外表后轉(zhuǎn)移至無(wú)菌超凈臺(tái)。將盲腸剪開(kāi)后用無(wú)菌生理鹽水沖洗腸道內(nèi)壁,沖洗干凈后,用滅菌手術(shù)刀片輕輕刮取腸道黏膜并收集于凍存管中,于-80℃ 保存?zhèn)溆谩?/p>
表1 試驗(yàn)飼糧組成及營(yíng)養(yǎng)水平(風(fēng)干基礎(chǔ)) %
1.4 16S rRNA PCR擴(kuò)增及測(cè)序利用QIAamp DNA Stool Mini Kit(Qiagen,德國(guó))提取微生物總DNA,然后選用引物338F(5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3′)和806R(5′-GGACTACH VGGGTWTCT AAT-3′)對(duì)16S rRNA(V3-V4)區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其中引物338F的5′尾端帶有條形碼標(biāo)記。PCR反應(yīng)參數(shù):95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸90 s,22個(gè)循環(huán);最后72℃延伸8 min。將PCR產(chǎn)物用QuantiFluorTM-ST藍(lán)色熒光定量系統(tǒng)進(jìn)行定量檢測(cè),之后按照每個(gè)樣本的測(cè)序量要求進(jìn)行相應(yīng)比例的混合來(lái)構(gòu)建Miseq文庫(kù)并進(jìn)行Miseq測(cè)序。
1.5 測(cè)序序列處理測(cè)序得到雙端序列數(shù)據(jù),根據(jù)PE reads之間的overlap關(guān)系,將成對(duì)的reads 拼接(merge)成1條序列,允許的最大錯(cuò)配比率為0.2,最小overlap長(zhǎng)度為10 bp,篩選掉不合格序列。根據(jù)序列首尾兩端的barcode和引物區(qū)分有效序列,并調(diào)整序列方向,barcode允許的錯(cuò)配數(shù)為0,最大引物錯(cuò)配數(shù)為2。同時(shí)對(duì)reads的質(zhì)量和merge的效果進(jìn)行質(zhì)控,過(guò)濾reads尾部質(zhì)量值20以下的堿基,設(shè)置50 bp的窗口,如果窗口內(nèi)的平均質(zhì)量值低于 20,從窗口開(kāi)始截去后端堿基,并且過(guò)濾質(zhì)控后50 bp以下的reads,去除含N堿基的reads。
1.6 生物信息學(xué)分析在97%相似度下通過(guò)Usearch(version7.1)軟件將序列進(jìn)行聚類(lèi),得到分類(lèi)操作單元(OTUs)。通過(guò)RDP Classifer將OTUs代表序列與數(shù)據(jù)庫(kù)Silva進(jìn)行比對(duì),置信度閾值為0.6[12],進(jìn)而分析物種多樣性指數(shù)及群落結(jié)構(gòu)。同時(shí)利用序列數(shù)量與其所代表的OTU數(shù)目來(lái)構(gòu)建稀釋曲線,以及利用序列數(shù)量在不同測(cè)序深度時(shí)的微生物多樣性指數(shù)來(lái)構(gòu)建Shannon-winner曲線。
1.7 多樣性分析根據(jù)樣本OTU數(shù)據(jù)來(lái)估計(jì)菌群的α多樣性和β多樣性。α多樣性以物種豐富度指數(shù)(Chao和Ace)和多樣性指數(shù)(Shannon和Simpson)表現(xiàn)。利用β多樣性距離矩陣,使用非加權(quán)組平均算法構(gòu)建樹(shù)狀結(jié)構(gòu),然后使用主成分分析(PCA)和主坐標(biāo)分析(PCoA)進(jìn)行可視化展示。
1.8 數(shù)據(jù)處理采用SAS 8.2軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,數(shù)據(jù)以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差”表示,采用F檢驗(yàn)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行差異顯著性分析,P<0.05表示差異顯著,P>0.05表示差異不顯著,并用Met-astats方法對(duì)各處理組間物種差異性進(jìn)行分析。
2.1 生長(zhǎng)性能分析由表2可知,不同纖維源飼糧組鵝初始體質(zhì)量(1日齡)差異不顯著(P>0.05),符合隨機(jī)取樣的原則,排除個(gè)體差異對(duì)結(jié)果的影響,表明本研究結(jié)果具有代表性。結(jié)束體質(zhì)量(70日齡)和平均日增體質(zhì)量在不同纖維源飼糧組之間差異顯著(P<0.05),其中苜蓿組顯著高于黑麥組(P<0.05),與燕麥組和花生秧組無(wú)顯著性差異(P>0.05),而黑麥組、燕麥組和花生秧組之間差異均不顯著(P>0.05);并且兩者變化趨勢(shì)一致,均為苜蓿組>花生秧組>燕麥組>黑麥組。不同纖維源飼糧組平均日采食量和料重比差異不顯著(P>0.05),變化趨勢(shì)均為燕麥組>黑麥組>花生秧組>苜蓿組。上述結(jié)果表明,鵝對(duì)不同纖維源飼糧在消化利用率上存在差異,暗示對(duì)腸道具有調(diào)控作用的微生物菌群的差異。
表2 不同纖維源飼糧組鵝生產(chǎn)性能比較
2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估由表3可知,本次12個(gè)測(cè)序序列文庫(kù)覆蓋率均達(dá)到了99.7%以上,共得到803 498條有效序列,335.7 Mp堿基,平均序列長(zhǎng)度為438.14 bp,比對(duì)得到877個(gè)OTUs(苜蓿組:583;黑麥組:478;燕麥組:470;花生秧組:443)。此外,稀釋曲線及Shannon-winner曲線均隨著測(cè)序數(shù)據(jù)量的增加趨于平坦(圖1),說(shuō)明測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大,數(shù)據(jù)具有代表性和真實(shí)性,可以反映樣本中微生物菌群信息。
表3 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
圖1 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 A.稀釋曲線;B.Shannon-winner曲線
2.3 腸道微生物菌群α多樣性分析如表4所示,Chao、Ace、Shannon和Simpson在不同纖維源飼糧組之間差異均不顯著(P>0.05),其中Chao和Ace指數(shù)為苜蓿組>花生秧組>黑麥組>燕麥組,說(shuō)明苜蓿組微生物菌群豐富度較高,而燕麥組微生物菌群豐富度最低。Simpson和Shannon指數(shù)在不同纖維源飼糧組之間變化趨勢(shì)不一致,但研究表明多樣性指數(shù)區(qū)分度越大,其有效性越高[13]。本試驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示Shannon指數(shù)區(qū)分度高于Simpson指數(shù),故本研究采用Shannon指數(shù)評(píng)估微生物菌群多樣性。不同纖維源飼糧組之間Shannon指數(shù)為花生秧組>苜蓿組>黑麥組>燕麥組,說(shuō)明花生秧組微生物菌群多樣性較高,而燕麥組最低。
表4 腸道微生物多樣性指數(shù)
2.4 腸道微生物菌群組成分析
2.4.1門(mén)水平上微生物菌群組成分析 如圖2A所示,不同纖維源飼糧組在門(mén)水平上共得到15種已知細(xì)菌(苜蓿組14種,花生秧組12種,黑麥組15種,燕麥組14種),其中12種為共有細(xì)菌,說(shuō)明這12種細(xì)菌在維持腸道菌群功能上發(fā)揮著重要的作用,不會(huì)輕易受飼糧的變化而發(fā)生改變。比較細(xì)菌相對(duì)豐度可知(圖2B),不同纖維源飼糧組相對(duì)豐度大于0.1% 的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌均為11種共有細(xì)菌,其中厚壁菌門(mén)(Firmicutes)占到了65.91%~68.05%,擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)占到了16.84%~18.17%,變形桿菌門(mén)(Proteobacteria)占到了4.58%~5.70%,放線菌門(mén)(Actinobacteria)占到了4.45%~4.78%。
圖2 門(mén)水平菌群組成分析 A.韋恩圖;B.門(mén)水平上菌群相對(duì)豐度分布
2.4.2屬水平上微生物菌群組成分析 由圖3A可知,不同纖維源飼糧組在屬水平上共得到155個(gè)已知細(xì)菌(苜蓿組138種,花生秧組126種,黑麥組127種,燕麥組124種),其中108種為共有細(xì)菌,說(shuō)明這108種細(xì)菌在維持腸道菌群功能上發(fā)揮著重要的作用,不會(huì)輕易受飼糧的變化而發(fā)生改變。此外,有26種細(xì)菌為不同纖維源飼糧組所特有(苜蓿組11種、黑麥組5種、燕麥組2種、花生秧組8種),說(shuō)明這些細(xì)菌可能與不同纖維源飼糧有直接聯(lián)系。比較細(xì)菌相對(duì)豐度可知(圖3B),苜蓿組相對(duì)豐度含量大于0.1%的優(yōu)勢(shì)菌屬有66種,占總豐度的97.64%;黑麥組有67種,占98.20%;燕麥組有63種,占98.11%;花生秧組65種,占97.89%;說(shuō)明腸道微生物菌群功能的實(shí)現(xiàn)主要依靠?jī)?yōu)勢(shì)細(xì)菌。從單一菌屬來(lái)看,某些菌屬所占比例很高,并且不同纖維源飼糧組之間有所差異,比如苜蓿組Bacteroides(18.76%)、Megamonas(14.88%)、[Ruminococcus]_torques_group(6.67%);黑麥組Bacteroides(18.70%)、Megamonas(10.63%)、[Ruminococcus]_torques_group(6.69%);燕麥組Bacteroides(17.06%)、Megamonas(11.67%)、[Ruminococcus]_torques_group(6.1%);花生秧組Bacteroides(24.37%)、[Ruminococcus]_torques_group(6.3%)、Desulfovibrio(6.1%)。
圖3 屬水平上菌群組成分析 A.韋恩圖;B.屬水平上菌群相對(duì)豐度分布
2.5 腸道微生物菌群β多樣性分析如圖4所示,PCA和PCoA分析結(jié)果均顯示不同纖維源飼糧組在第一軸明顯發(fā)生了分離(PC1+PC2>50%),且同一纖維源飼糧組的重復(fù)之間較為接近,表明飼糧中的纖維來(lái)源對(duì)鵝腸道微生物菌群有一定的影響。
圖4 PCA和PCoA分析
2.6 腸道微生物菌群豐度差異性分析對(duì)不同纖維源飼糧組之間共有的優(yōu)勢(shì)菌群相對(duì)豐度分析顯示(表5),門(mén)水平上僅有黏膠球菌(Lentisphaerae)差異顯著(P<0.05),其中燕麥組和苜蓿組顯著高于花生秧和黑麥組(P<0.05),而花生秧和黑麥組之間差異不顯著(P>0.05)。屬水平上有理研菌(Alistipes)、梭菌(Shuttleworthia)、互養(yǎng)菌(Synergistes)、放線菌(Slackia)、真桿菌(Eubacteriumcoprostanoligenes)、多形桿狀菌(Bacteroides)、瘤胃菌(Faecalibacterium)、巨單胞菌(Megamonas)和柔嫩梭菌(Subdoligranulum)差異顯著(P<0.05),其中花生秧組Alistipes顯著高于燕麥組、黑麥組和苜蓿組(P<0.05),且苜蓿組和黑麥組顯著高于燕麥組,但兩者之間差異不顯著(P>0.05);燕麥組Shuttleworthia顯著低于苜蓿組、黑麥組及花生秧組(P<0.05),且苜蓿組、黑麥組及花生秧組之間差異不顯著(P>0.05);Slackia在苜蓿組和花生秧組之間差異不顯著(P>0.05),但均顯著低于燕麥草組(P<0.05);Bacteroides在苜蓿組、黑麥組和燕麥組之間差異不顯著(P>0.05),且顯著低于花生秧組(P<0.05);黑麥組Faecalibacterium顯著低于苜蓿組、燕麥組和花生秧組(P<0.05),且苜蓿組顯著高于花生秧組(P<0.05),但與燕麥組差異不顯著(P>0.05);苜蓿組Megamonas顯著高于黑麥組、燕麥組和花生秧組(P<0.05),黑麥組和燕麥組顯著高于花生秧組(P<0.05);Subdoligranulum在燕麥組和花生秧組之間差異不顯著(P>0.05),但顯著低于苜蓿組和黑麥組(P<0.05),且苜蓿組顯著高于黑麥組(P<0.05);Eubacteriumcoprostanoligenes在花生秧組和黑麥組之間差異不顯著(P>0.05),但顯著高于燕麥組(P<0.05)。
表5 腸道微生物菌群豐度差異 %
飼糧是畜禽動(dòng)物賴(lài)以生存的基礎(chǔ),通過(guò)腸道消化酶攝取其營(yíng)養(yǎng)成分如蛋白質(zhì)、糖類(lèi)、水分和脂肪等,然后合成機(jī)體所需的物質(zhì)并釋放能量來(lái)維持生命活動(dòng),而將不被消化酶分解的成分(纖維素、木質(zhì)素等)運(yùn)送至腸道后段,依靠腸道微生物作用進(jìn)行消化吸收,為機(jī)體提供所需的代謝底物、酶和能量[14]。腸道微生物主要包括保護(hù)機(jī)體免受傷害及提高機(jī)體免疫力的共生微生物和使機(jī)體感染或誘發(fā)疾病的有害微生物[15],均依附于機(jī)體提供的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)來(lái)生長(zhǎng)繁殖,受到飼糧組成成分影響。因此,飼糧纖維源的不同將引起腸道微生物菌群組成的變化[16]。
目前,飼糧纖維的來(lái)源主要是干草、秸稈和農(nóng)副產(chǎn)品等,其選擇依據(jù)是種植廣泛、營(yíng)養(yǎng)豐富、產(chǎn)量高和適口性好,備受畜禽動(dòng)物的喜愛(ài)[17-20]。因此,本試驗(yàn)選用苜蓿、黑麥、燕麥和花生秧作為纖維源來(lái)探討其對(duì)鵝腸道微生物菌群的影響,在此采用了高通量測(cè)序法從分子水平來(lái)檢測(cè)微生物菌群種類(lèi)及數(shù)量,并進(jìn)行了OTU分類(lèi)、多樣性指數(shù)及群落結(jié)構(gòu)等統(tǒng)計(jì)分析。與前人[21]研究結(jié)果相比,該研究的微生物菌群多樣性明顯提高,優(yōu)勢(shì)菌門(mén)屬種類(lèi)及相對(duì)豐度有所差異,這可能是由于高通量測(cè)序法與傳統(tǒng)的培養(yǎng)法相比有明顯的優(yōu)勢(shì),前者對(duì)細(xì)菌的覆蓋率和準(zhǔn)確性更高,錯(cuò)誤率較低[22]。此外,所選鵝品種、腸道黏膜發(fā)育狀態(tài)、纖維源類(lèi)型也可能是造成差異的原因。
本試驗(yàn)結(jié)果表明,飼喂苜蓿、燕麥、黑麥和花生秧等4種纖維源飼糧對(duì)鵝腸道微生物菌群多樣性無(wú)顯著性影響(P>0.05),表明它們之間的腸道微生物菌群組成基本一致,而腸道微生物菌群組成主要受遺傳和環(huán)境因素的影響[23],因此,推測(cè)不同纖維源對(duì)腸道菌群無(wú)顯著性影響的原因:一是該研究對(duì)象為四川白鵝這一品種,其遺傳背景一致;二是飼養(yǎng)的外部環(huán)境條件完全一樣,如溫度、濕度、光照等;三是不同飼糧纖維組成相同,均包含中性、酸性和堿性洗滌纖維,區(qū)別在于各組分所占比例不同。雖然纖維源對(duì)微生物菌群多樣性的影響從統(tǒng)計(jì)學(xué)上來(lái)看不顯著,但相互之間也存在高低差異,比如花生秧組多樣性高于其他組,這主要與花生秧的粗纖維含量高有關(guān),即粗纖維含量越高,相應(yīng)的降解酶種類(lèi)需要量越多,其微生物多樣性越高[24]。腸道微生物菌群的豐度分析顯示各纖維源組的優(yōu)勢(shì)菌門(mén)主要是Firmicutes和Bacteroidetes,兩者占到總豐度的80%以上,此與前人對(duì)反芻動(dòng)物瘤胃及家禽腸道微生物菌群的研究結(jié)果基本一致[25-26],但各菌門(mén)比例略有不同,這主要與動(dòng)物種類(lèi)有關(guān)。
DE FILIPPO等[27]研究發(fā)現(xiàn),Bacteroidetes對(duì)纖維具有極強(qiáng)的消化能力。DALY等[28]發(fā)現(xiàn),F(xiàn)irmicutes和Bacteroidetes包含有許多纖維分解菌。上述結(jié)論以此佐證了本研究中優(yōu)勢(shì)菌屬(Bacteroides、Ruminococcus、Megamonas)均為桿菌門(mén)下菌屬的合理性。此外,苜蓿和燕麥組的纖維素分解菌門(mén)的數(shù)量有所升高,這與PITTA等[29]研究指出的纖維素分解菌門(mén)(屬)數(shù)量與纖維素含量呈正相關(guān)的結(jié)論一致。
對(duì)微生物菌群相對(duì)豐度進(jìn)行差異性分析發(fā)現(xiàn)不同的纖維源在門(mén)水平上顯著影響Lentisphaerae,研究證實(shí)Lentisphaerae的豐度與纖維二糖的降解有關(guān)[30]。本試驗(yàn)中燕麥組和苜蓿組Lentisphaerae豐度高于黑麥組和花生秧組,可能歸因于前者可溶性纖維含量較高,需要更多的Lentisphaerae來(lái)進(jìn)行降解。在屬水平上豐度受到顯著影響的有Alistipes、Shuttleworthia、Slackia、Eubacteriumcoprostanoligenes、Bacteroides、Faecalibacterium、Megamonas和Subdoligranulum。Bacteroides可通過(guò)編碼多種糖苷酶來(lái)水解并利用宿主攝入的植物性多糖[31],進(jìn)而促進(jìn)碳水化合物的代謝,其豐度與飼糧多糖含量有關(guān)[32]。本試驗(yàn)中花生秧組Bacteroides顯著高于苜蓿、黑麥和燕麥組,可能是花生秧粗纖維含量較高且植物性細(xì)胞壁含量多。Subdoligranulum、Faecalibacterium和Megamonas均屬于厚壁菌門(mén),Subdoligranulum和Faecalibacterium可表達(dá)乙酰/丙酰輔酶A羧化酶,參與丁酸鹽的合成,而Megamonas則主要參與丙酸鹽的合成[33]。丁酸鹽和丙酸鹽等短鏈脂肪酸的合成與細(xì)菌的發(fā)酵作用有關(guān),飼糧中可溶性多糖越多,需要的細(xì)菌的數(shù)量越多。Eubacteriumcoprostanoligenes是可降低膽固醇的微生物[34],其在不同纖維源飼糧組的差異性可能與飼糧所含脂質(zhì)的量有關(guān)。Alistipes和Shuttleworthia是致病菌屬,TYRRELL等[35]研究指出Alistipes是革蘭陰性厭氧桿菌,具有膽汁抗性,主要存在于病畜腸道和腹部。Slackia主要與人類(lèi)牙周炎有關(guān)[36],但在腸道中的作用尚不清楚。MCDONALD等[37]研究表明珍珠大麥中的纖維會(huì)增加仔豬腸道病原菌,提高腹瀉率。因此,以上與致病、感染等有關(guān)的菌屬豐度在不同纖維源飼糧間具有顯著性差異,可能是纖維源中的抗?fàn)I養(yǎng)因子(黃酮、單寧、蛋白酶抑制因子和植酸等)的差異所引起的[38]。
本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)四川白鵝飼喂苜蓿、黑麥、燕麥和花生秧4種纖維源飼糧研究纖維源對(duì)腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果表明,不同纖維源飼糧對(duì)腸道微生物菌群多樣性無(wú)顯著性差異(P>0.05),但可影響菌群結(jié)構(gòu)及顯著影響Lentisphaerae、Alistipes、Shuttleworthia、Slackia、Eubacteriumcoprostanoligenes、Bacteroides、Faecalibacterium、Megamonas和Subdoligranulum的相對(duì)豐度(P<0.05)。