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        RT-FQPCR法快速檢測葡萄酒中醋酸菌群

        2020-09-04 07:09:38錢云開肖艷霞柳吉芹王海洋王傳現(xiàn)閻賀靜
        中國釀造 2020年8期
        關(guān)鍵詞:醋酸檢出限葡萄酒

        李 斌,錢云開,肖艷霞,單 超,柳吉芹,高 飛,王海洋,王傳現(xiàn),鄒 靜,閻賀靜

        (1.秦皇島海關(guān)技術(shù)中心,河北 秦皇島066004;2.河北科技師范學(xué)院 食品科技學(xué)院,河北 秦皇島066004;3.上海海關(guān)動植物與食品檢驗檢疫技術(shù)中心,上海200135)

        醋酸菌屬于醋桿菌科(Acetobacteriaceae),目前有11個屬中的46種被認(rèn)為是醋酸菌[1],其中絕大部分的醋酸菌存在于發(fā)酵食品中的醋、酸奶、泡菜和葡萄酒中[2-5]。醋酸菌是革蘭氏陰性專性好氧菌,是葡萄酒生產(chǎn)過程中的有害微生物之一,它能夠?qū)⒁掖佳趸梢胰┖痛姿?,使酒中的揮發(fā)酸含量增高,受醋酸菌污染的葡萄酒明顯會有醋酸味產(chǎn)生,因此控制葡萄酒中的醋酸菌顯得尤為重要[6-9]。目前國內(nèi)醋酸菌的檢測方法通常是在固體選擇培養(yǎng)基上分離,然后鑒定其生理生化特性[10],還有一些方法是針對醋酸菌中的個別物種設(shè)計了實時熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-timepolymerase chain reaction,RT-PCR)的方法,GAMMON K S等[11]成功運用RT-PCR技術(shù)檢測了電解質(zhì)飲料中微量的葡萄糖桿菌,VALERA M J等[12]設(shè)計16S~23S r RNA間區(qū)序列的2個特異性探針,成功定量檢測了醋酸菌Acetobacter malorum和Acetobacter cerevisiae的數(shù)量。但大多數(shù)的醋酸菌卻不能在食品和環(huán)境樣品中被檢測到。

        實時熒光PCR技術(shù)特異性強,靈敏度高,重復(fù)性好,已被廣泛應(yīng)用到檢測過程中[13]。而在實驗過程中發(fā)現(xiàn),在葡萄酒中存在大量的單寧、多糖和色素,這些成分作PCR抑制因子在進(jìn)行RT-PCR時可能會成為干擾實驗準(zhǔn)確性的存在[14]。PCR抑制劑通常通過與脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)直接相互作用或?qū)岱€(wěn)定DNA聚合酶的干擾而發(fā)揮作用,會影響PCR的擴增效率,所以在實際樣品檢測過程中,應(yīng)使用生理鹽水對葡萄酒進(jìn)行洗脫,以排除干擾因素對基因組的提取[15]。

        在本研究中,參考了KIM D H等[16]設(shè)計的引物序列,利用SYBR Green I染料法[17],建立了一種應(yīng)用到葡萄酒中醋酸菌檢驗的實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time fluorescent quantative polymerase chain reaction,RT-FQPCR)檢測方法來快速檢測葡萄酒中是否含有醋酸菌群,以此來對葡萄酒釀造過程中的醋酸菌群進(jìn)行快速檢測,并做出預(yù)警分析。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1 菌株和檢測樣品

        醋酸菌標(biāo)準(zhǔn)菌株7株,分別為巴氏醋桿菌(Acetobacter pasteurianus)、食蔗糖駒形氏桿菌(Acetobacter pasteurianus)、氧化葡萄糖桿菌(Gluconobacter oxydans)、日本葡糖桿菌(Gluconobacter japonicas)、蠟狀葡糖桿菌(Gluconobacter cerinus)、醋化醋桿菌(Acetobacter aceti)及熱帶醋桿菌(Acetobacter tropicalis);其他非醋酸菌株7株,分別為金葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、單核細(xì)胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes)、大腸桿菌(Escherichia coli)、志賀菌(Shigella sonnei)、鼠傷寒沙門菌(Salmonella typhimurium):中國工業(yè)微生物菌種保藏管理中心(China center of indus trial culture collection,CICC)和中國普通微生物菌種保藏管理中心(China general microbiological culture collection center,CGMCC);腸膜明串珠菌(Leuconostoc mesenteroides)和乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)來自實驗室分離菌種。

        紅葡萄酒(賽曦吉普斯蘭黑比諾、麥格根·黑牌、2015拜倫灣西拉子),白葡萄酒(愛在深秋、駿馬酒莊霞多麗、駿馬酒莊霞多麗、卡聶高金伯爵、康斯汀特),桃紅葡萄酒(拉亞莫斯卡托),冰酒(VQA維達(dá)爾):市場抽樣。

        1.1.2 試劑

        細(xì)菌基因組脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)提取試劑盒:天根生化科技(北京)有限公司。

        1.1.3 培養(yǎng)基

        醋酸菌培養(yǎng)基:北京陸橋技術(shù)股份有限公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        X3R高速冷凍離心機:美國Thermo公司;PCR System 7900基因擴增儀、StepOnePlus實時定量熒光PCR儀、SYBR Green Master Mix:美國ABI公司。

        1.3 方法

        1.3.1 醋酸菌培養(yǎng)條件

        7株醋酸菌在無菌環(huán)境下各挑取一菌環(huán)于醋酸菌培養(yǎng)基上劃線,在需氧條件下30 ℃培養(yǎng)4~5 d。

        1.3.2 基因組DNA的提取

        7株醋酸菌經(jīng)過恢復(fù)培養(yǎng)后,將長勢處于指數(shù)生長期的醋酸菌,參考細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取核酸[18]。其他非醋酸菌也參考細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取核酸。

        1.3.3 引物組

        引物組:K-AAB_F:5'-AAGGGGGCTAGCGTTGCTCG-3';K-AAB_R:5'-ACCGCCTACACGCCCTTTACG-3'。

        1.3.4 RT-FQPCR反應(yīng)體系

        RT-FQPCR反應(yīng)體系(25 μL):SYBR Green Master Mix 12.5 μL,上游引物K-AAB_F 0.5 μL,下游引物K-AAB_R 0.5 μL,DNA模板2 μL,超純水9.5 μL。

        RT-FQPCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃、5 s;62 ℃、34 s;循環(huán)45次,熔解曲線測定程序溫度(0.5 ℃/s)速率從65 ℃升至95 ℃,同時收集熒光數(shù)據(jù)。

        1.3.5 葡萄酒中DNA的提取

        吸取1 mL葡萄酒樣,8 000 r/min離心2 min,棄去上清液,加入200 μL生理鹽水(0.85%)漩渦混勻,12 000 r/min離心2 min,所得沉淀按上述方法洗滌2次。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 引物特異性實驗結(jié)果

        利用醋酸菌通用引物,以7種醋酸菌的DNA模板為陽性對照,剩余5種常見病原菌(金葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、單核細(xì)胞增生李斯特氏菌(Listeria monocytogenes)、大腸桿菌(Escherichia coli)、志賀菌(Shigella sonnei)、鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella typhimurium))和2種益生乳酸菌(腸膜明串珠菌(leuconostoc mesenteroides)和乳酸乳球菌(lactococcus lactis))的DNA為模板為陰性對照,以無菌去離子水為空白對照,按照1.3.4中的反應(yīng)體系進(jìn)行特異性檢測,結(jié)果如圖1所示。

        圖1 實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)特異性擴增曲線Fig. 1 Amplification curve of real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction specific

        由圖1可知,7株醋酸菌出現(xiàn)陽性擴增曲線,其他非醋酸菌熒光信號均在閾值以內(nèi),空白對照也無擴增曲線,說明引物特異性良好。葡萄酒添加實驗過程中的陰性對照和空白對照在擴增曲線中出現(xiàn)少量翹尾現(xiàn)象,分析得DNA模板提取過程中存在污染現(xiàn)象或成品酒中存在少量醋酸菌被檢測出。由于出現(xiàn)的量很少,不干擾實驗的進(jìn)行。

        2.2 不同菌株靈敏度實驗結(jié)果

        為了驗證不同菌株的靈敏度,對7種醋酸菌用生理鹽水進(jìn)行梯度稀釋,菌液濃度稀釋至10-7,按照1.3.4的反應(yīng)體系進(jìn)行RT-FQPCR擴增,同時進(jìn)行平板計數(shù)?;罹嫈?shù)(CFU/mL)=同一稀釋度三次重復(fù)的平均菌落數(shù)×稀釋倍數(shù)×5,計算得到最低檢出限,結(jié)果見表1。

        表1 菌落計數(shù)結(jié)果Table 1 Results of colony count

        由表1可知,7株醋酸菌在不同菌液稀釋倍數(shù)下的菌落計數(shù)結(jié)果值各不相同,選取每種醋酸菌能被活菌計數(shù)的最低稀釋度得到結(jié)果:氧化葡萄糖桿菌最低檢出限240 CFU/mL、醋化醋桿菌最低檢出限60 CFU/mL、日本葡糖桿菌最低檢出限105 CFU/mL、巴氏醋桿菌最低檢出限125 CFU/mL熱帶醋桿菌最低檢出限60 CFU/mL、蠟狀葡糖桿菌最低檢出限270 CFU/mL和食蔗糖駒形氏桿菌最低檢出限35 CFU/mL,綜合檢測限為124 CFU/mL,符合活菌計數(shù)標(biāo)準(zhǔn)范圍內(nèi)。

        2.3 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立[19-20]

        根據(jù)擴增產(chǎn)物的熒光信號達(dá)到設(shè)定的熒光閾值時所

        對應(yīng)的擴增循環(huán)數(shù)(cycle threshold,Ct)值(y)與菌液稀釋

        倍數(shù)的對數(shù)值(x)制作醋酸菌標(biāo)準(zhǔn)曲線,結(jié)果如圖2所示。標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程、相關(guān)系數(shù)見表2。

        圖2 7株醋酸菌標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig. 2 Standard curves of 7 acetic acid bacteria strains

        表2 7株醋酸菌的標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程及相關(guān)系數(shù)Table 2 Regression equation and correlation coefficient of standard curves of 7 acetic acid bacteria strains

        由圖2及表2可知,檢測到7株醋酸菌標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程線性關(guān)系良好,相關(guān)系數(shù)R2均可達(dá)到0.9以上,檢測結(jié)果可靠,可以用作定量分析。

        2.4 醋酸菌株添加葡萄酒中檢測結(jié)果

        以不加醋酸菌的葡萄酒為陰性對照,無菌去離子水為空白對照,參考表1中每株醋酸菌在不同菌濃下的檢測限,混勻吸取5 mL醋酸菌菌液加入45 mL葡萄酒中,按照1.3.4的反應(yīng)體系進(jìn)行RT-FQPCR擴增,結(jié)果見表3。

        表3 醋酸菌株添加葡萄酒中檢測結(jié)果Table 3 Determination results of acetic acid bacteria strains addition in wines

        由表3可知,7株醋酸菌添加到成品葡萄酒中均可被檢測出,而在不添加醋酸菌的葡萄酒和空白對照中均未檢出,表明此方法可用于實際生產(chǎn)過程中。

        3 結(jié)論

        本研究依據(jù)醋酸菌通用引物進(jìn)行反應(yīng)條件的優(yōu)化并通過7株醋酸菌,進(jìn)行實時熒光定量PCR擴增。結(jié)果表明此方法綜合靈敏度可達(dá)124 CFU/mL,該方法對醋酸菌具有良好的特異性,耗時短,通用性強在實際樣品中的實驗結(jié)果也真實可靠,能夠快速檢測葡萄酒釀造過程中的醋酸菌,可應(yīng)用于實驗室檢測或者實際生產(chǎn)過程,具有實際意義。

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