吳雪琪 張立佩 曹陽(yáng) 文曉剛 周小紅
(1. 上海師范大學(xué)環(huán)境與地理科學(xué)學(xué)院,上海 200234;2. 清華大學(xué)環(huán)境學(xué)院環(huán)境模擬與污染控制國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100084;3. 嘉興學(xué)院南湖學(xué)院,嘉興 314001)
近年來(lái),銀作為一種抗菌劑在醫(yī)院得到廣泛的使用,特別是在傷口敷料、外用制劑和醫(yī)療器械(氣管內(nèi)呼吸管、骨假體等)中。然而,長(zhǎng)期接觸銀和銀化合物會(huì)導(dǎo)致銀質(zhì)沉淀癥及其他癥狀,如頭痛、胃痛、疲勞、皮膚刺激或更嚴(yán)重的神經(jīng)、腎臟或肝臟并發(fā)癥。膠體銀還可能干擾某些藥物的吸收,如培那西拉敏、喹諾酮類、四環(huán)素和甲狀腺素。由于人類對(duì)銀的接觸越來(lái)越普遍,因此需要開(kāi)發(fā)一種簡(jiǎn)單快速的方法來(lái)監(jiān)測(cè)水源和體內(nèi)的銀[1-2]。
大量研究表明,在分子水平上某些重金屬離子可與特定的基因序列發(fā)生作用,使其空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變[3],而這種結(jié)構(gòu)和性能的關(guān)系使重金屬離子,如Ag+、Hg2+的快速、特異識(shí)別有了一條便捷的途徑。上述能夠發(fā)生特異結(jié)構(gòu)變化的DNA或RNA鏈,被稱為功能核酸[4],它們通過(guò)3種類型的傳感方式實(shí)現(xiàn)重金屬離子的檢測(cè):第一種是利用DNA,基因錯(cuò)配特異性結(jié)合重金屬離子實(shí)現(xiàn)檢測(cè)[5]。本課題組報(bào)道了基于Hg2+與T堿基錯(cuò)配形成T-Hg2+-T復(fù)合物的倏逝波定量檢測(cè)Hg2+的研究,對(duì)Hg2+的檢測(cè)限為2.1 nmol/L[6];第二種是與鳥(niǎo)嘌呤(G)-四聯(lián)體發(fā)生特異性反應(yīng),G-四聯(lián)體是由ssDNA(單鏈DNA)中的多個(gè)G-4面互相重疊而產(chǎn)生,重金屬離子可進(jìn)入G-四聯(lián)體的中心,從而影響其與其他離子結(jié)合[7-8];第三種是基于金屬依賴性的核酸酶DNAzyme,即在特定重金屬離子的存在下,DNAzyme催化發(fā)生水解斷裂反應(yīng),不可逆地將帶有熒光標(biāo)記的核酸片段剪斷,從而實(shí)現(xiàn)檢測(cè)[9]。目前依據(jù)這些傳感設(shè)計(jì)思路已經(jīng)用于多種重金屬的單指標(biāo)甚至多指標(biāo)的同時(shí)測(cè)定。最常見(jiàn)的傳感策略是基于熒光體(供體)和猝滅劑(受體)之間的能量共振轉(zhuǎn)移(FRET)[10]。然而,傳統(tǒng)的基于熒光生物傳感的方法需要在DNA鏈上修飾兩種或更多的猝滅劑以降低背景信號(hào)。因此,尋找不含標(biāo)記物或含有較少標(biāo)記物的熒光染料或猝滅材料是適配體的發(fā)展方向。
近幾年,納米技術(shù)取得飛速發(fā)展,納米材料也成為很有發(fā)展前景的生物分析材料。石墨烯是一種單層碳原子通過(guò)sp2雜化形成二維蜂窩狀點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)的二維碳納米材料[11-12],這種特殊的單層碳原子結(jié)構(gòu)決定石墨烯材料具有特別的物理和化學(xué)性質(zhì)[13-14]。同時(shí)石墨烯特殊的結(jié)構(gòu)決定其可與生物大分子尤其是DNA分子相互作用,從而為構(gòu)建新型化學(xué)和生物傳感器奠定了基礎(chǔ)。研究發(fā)現(xiàn),單鏈DNA和雙鏈DNA在石墨烯上具有不一樣的結(jié)合能力,而且石墨烯可以作為優(yōu)異的能量或電子受體猝滅發(fā)光材料的熒光[15-16],由此可以選擇性的吸附和猝滅有熒光標(biāo)記的單鏈(ss-)DNA探針。其作為猝滅劑的優(yōu)點(diǎn)包括無(wú)需標(biāo)記到DNA上,長(zhǎng)距離熒光猝滅效應(yīng),低背景噪聲等[17]。因此如果能以石墨烯作為新的信號(hào)傳導(dǎo)基體,無(wú)疑將為目標(biāo)物的快速、高靈敏和高通量檢測(cè)提供新的思路。
本實(shí)驗(yàn)利用石墨烯對(duì)單鏈DNA和雙鏈DNA不一樣的連接能力,以及其優(yōu)異的熒光猝滅能力,結(jié)合適配體錯(cuò)配原理,設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)了C-Ag+-C和石墨烯的新型熒光傳感器用于快速和高靈敏檢測(cè)Ag+。
1.1.1 材料及來(lái)源 硝酸銀(AgNO3),氫氧化鈉(NaOH):分析純,北京化工廠(北京);氧化石墨烯(GO):先豐納米科技有限公司(南京);熒光基團(tuán)FAM修飾的Ag+適配體:DNA探針(SSO-FAM,5'-FAM-CTC TCT TCT CTT CAT TTT TCA ACA CAA CAC AC-3',該 探 針 設(shè) 計(jì) 參 考 了Ono等[18],Wen等[19]的研究),上海生工生物科技有限公司(上海);HEPES:4-羥乙基哌嗪乙磺酸;N-(2-羥乙基)哌嗪-N’-2-乙烷磺酸,1M溶液,Mediatech公司(美國(guó));SDS:十二烷基硫酸鈉,≥95.0%,拜爾迪生物技術(shù)有限公司(北京)。
1.1.2 儀器 F-7000熒光分光光度計(jì)(Hitachi,日本);pH計(jì)(梅特勒-托利多儀器有限公司,中國(guó));CF16RX II離 心 機(jī)(Hitachi,日 本);MTC-100恒溫混勻儀(南京戶川電子,中國(guó));超純水:Barnstead,NANOpure Dlamond,≥18.2MΩ。
1.1.3 溶液配制 0.5 g/L的GO溶液:稱取0.25 g GO,用超純水定容至500 mL,以200 W的功率超聲4 h以上(控制溫度不超過(guò)40℃)(溶液在使用前需再超聲10 min)。
1 μmol/L的SSO-FAM溶液:先將引物以12 000 r/min離心2 min,加入35 μL的超純水定容,配成100 μmol/L的儲(chǔ)備液,使用時(shí)再稀釋到合適濃度。
100 μmol/L和1 μmol/L的AgNO3溶液:準(zhǔn)確稱取AgNO3粉末1.698 7 g,加少量超純水溶解,定容至10 mL,混合均勻,濃度即為100 mol/L。
1 mol/L的NaNO3溶液:稱取NaNO3粉末8.499 g,取少量水溶解,定容至100 mL濃度即為1 mol/L。
1 mol/L的HEPES溶液:購(gòu)得。
1.2.1 可行性分析 分別測(cè)試SSO-FAM體系,SSOFAM-GO體系,以及在SSO-FAM-GO體系下加入不同濃度Ag+的熒光強(qiáng)度。
1.2.2 GO超聲時(shí)間優(yōu)化 GO溶液對(duì)SSO的猝滅效率有至關(guān)重要的作用,影響Ag+檢測(cè)的信噪比,是實(shí)現(xiàn)Ag+檢測(cè)的關(guān)鍵因素。本實(shí)驗(yàn)將不同濃度的GO溶液在超聲0 min、10 min和30 min后加入SSOFAM溶液中,測(cè)定其熒光強(qiáng)度,并計(jì)算熒光猝滅效率。
1.2.3 SSO-FAM和GO反應(yīng)時(shí)間優(yōu)化 SSO-FAM和GO的反應(yīng)時(shí)間會(huì)的熒光信號(hào)產(chǎn)生影響,將終濃度為10 nmol/L的SSO-FAM溶液和10 mg/L的GO溶液的反應(yīng)時(shí)間設(shè)置為0 min、10 min、20 min、30 min、40 min,檢測(cè)熒光強(qiáng)度,觀察反應(yīng)時(shí)間對(duì)GO熒光猝滅效率的影響。
1.2.4 SSO-FAM與GO溶液反應(yīng)用量的優(yōu)化 選取3組不同比例的SSO-FAM溶液和GO溶液,第1組為終濃度10 nmol/L的SSO-FAM溶液和10 mg/L的GO溶液,第2組為終濃度20 nmol/L的SSO-FAM溶液和10 mg/L的GO溶液,第3組為終濃度20 nmol/L的SSO-FAM溶液和20 mg/L的GO溶液,將不同濃度的Ag+加入上述3組溶液中,測(cè)定熒光強(qiáng)度。
1.2.5 Ag+的檢測(cè)方法 將20 μL 1 μmol/L的DNA探針溶液與0-800 nmol/L不同濃度梯度的Ag+溶液混合均勻,將10 μL 1 mol/L HEPES溶液和50 μL 1 mol/L的NaNO3溶液加入上述溶液中,定容體積為1 mL,pH 7.10,37℃下避光反應(yīng)20 min,生成C-Ag+-C的復(fù)合物。然后再加入終濃度為20 mg/L的GO,混合反應(yīng)10 min,以494 nm的激發(fā)波長(zhǎng)檢測(cè)熒光信號(hào)。
1.2.6 其他金屬離子的干擾測(cè)定 保持反應(yīng)條件不變,將1 μmol/L Cd2+、Pb2+、Hg2+等金屬離子作為干擾離子加入樣品中,檢測(cè)各金屬離子的熒光強(qiáng)度。
1.2.7 Ag+的加標(biāo)回收試驗(yàn) 使用熒光分光光度計(jì)檢測(cè)200-500 nmol/L不同濃度梯度的Ag+溶液的熒光強(qiáng)度,根據(jù)樣品濃度與測(cè)得的熒光強(qiáng)度建立Ag+標(biāo)準(zhǔn)曲線;使用飲用水配制樣品溶液,并將一定濃度的Ag+加入樣品中,檢測(cè)加入Ag+后樣品的熒光強(qiáng)度,結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)曲線的熒光信號(hào)對(duì)照,計(jì)算樣品加標(biāo)回收率。
為了證明該傳感器設(shè)計(jì)的合理性,我們考察了各體系的熒光光譜。如圖1所示,當(dāng)體系中不存在Ag+時(shí),SSO修飾的FAM熒光被一定量的石墨烯完全猝滅,表明單鏈DNA與石墨烯之間存在π-π作用力;當(dāng)Ag+存在時(shí),該體系表現(xiàn)出較強(qiáng)的熒光,說(shuō)明Ag+能夠與兩個(gè)胞嘧啶堿基結(jié)合,使SSO折疊成為穩(wěn)定的分子內(nèi)C-Ag+-C雙鏈結(jié)構(gòu),減弱了與石墨烯之間的作用力,從而使該體系的熒光得到恢復(fù),并且加入濃度越高,熒光恢復(fù)強(qiáng)度越大,由此證明Ag+檢測(cè)的可行性。
圖1 不同條件下SGI的熒光強(qiáng)度
實(shí)驗(yàn)對(duì)比了不同濃度的GO溶液在不同超聲時(shí)間下對(duì)SSO-FAM的猝滅效率的影響。結(jié)果如圖2所示。未經(jīng)超聲處理的GO溶液,即使增加溶液的濃度到30 mg/L時(shí),其猝滅效率依然低于30%;當(dāng)GO經(jīng)過(guò)分別10 min和30 min超聲處理后,10 mg/L的GO添加量就可達(dá)到95%的猝滅效率,說(shuō)明GO在使用前需要進(jìn)行10 min以上的超聲處理。
圖2 GO超聲時(shí)間對(duì)其熒光猝滅效率的影響
將 10 nmol/L的DNA探針溶液和10 mg/L的氧化石墨烯溶液設(shè)置0-40 min的反應(yīng)時(shí)間,觀察熒光猝滅效果,結(jié)果如圖3所示。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,DNA探針溶液和氧化石墨烯溶液的熒光強(qiáng)度隨著反應(yīng)時(shí)間的增加而下降,20 min后熒光強(qiáng)度出現(xiàn)回升,40 min與10 min處的熒光強(qiáng)度基本相同,說(shuō)明Ag+與SSO錯(cuò)配反應(yīng)充分。因此,本實(shí)驗(yàn)的反應(yīng)時(shí)間設(shè)定為10 min。
圖3 反應(yīng)時(shí)間對(duì)GO熒光猝滅效率的影響
考察了3組比例不同的DNA探針溶液和石墨烯溶液對(duì)Ag+熒光測(cè)試的影響,結(jié)果如圖4所示。其中,曲線1為10 nmol/L的DNA探針溶液和10 mg/L的石墨烯溶液的混合溶液。在加入的Ag+濃度低于100 nmol/L時(shí),檢測(cè)出的熒光強(qiáng)度出現(xiàn)下降,加入的Ag+濃度超過(guò)100 nmol/L時(shí),樣品的測(cè)試值出現(xiàn)上升,但穩(wěn)定性差,并且上升緩慢;曲線2為20 nmol/L的DNA探針溶液和10 mg/L的石墨烯溶液的混合溶液,在加入的Ag+濃度低于200 nmol/L時(shí),測(cè)試出的熒光強(qiáng)度不斷下降,這是由于石墨烯的用量不足未能將熒光完全猝滅,當(dāng)添加的Ag+濃度超過(guò)200 nmol/L后,檢測(cè)出的熒光強(qiáng)度隨著Ag+濃度上升;曲線3為終濃度20 nmol/L的DNA探針溶液和20 mg/L的石墨烯溶液的混合溶液,熒光強(qiáng)度從50 nmol/L開(kāi)始出現(xiàn)逐漸上升的趨勢(shì),當(dāng)Ag+濃度大于800 nmol/L后,檢測(cè)出的熒光強(qiáng)度逐漸趨于穩(wěn)定。根據(jù)3組實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,曲線3的樣品信噪比低,且檢測(cè)的線性范圍最寬,因此實(shí)驗(yàn)選用20 nmol/L的DNA探針溶液和20 mg/L的石墨烯溶液作為最佳比例的反應(yīng)用量。
圖4 SSO濃度對(duì)Ag+檢測(cè)的影響
在最優(yōu)的條件下,熒光增強(qiáng)強(qiáng)度與Ag+濃度在150 nmol/L-400 nmol/L濃度范圍呈線性相關(guān)(圖5),校正曲線方程為F= 0.917 3CAg-80.006,相關(guān)系數(shù)為0.991,按照IUPAC定義的檢出限(LOD)計(jì)算方法求得檢出限(3 σ)為23 nmol/L。
為了驗(yàn)證本方法適用于復(fù)雜水體中的Ag+濃度的測(cè)試,通過(guò)實(shí)驗(yàn)測(cè)試了幾種常見(jiàn)的金屬離子在本方法下的熒光強(qiáng)度響應(yīng)。將1 μmol/L的Fe3+、Zn2+、Mg2+、Pb2+、Co2+、Ni2+、Cd2+、Hg2+、Ca2+、Mn2+和Cu2+加入DNA探針與石墨烯的混合體系中,保持其他的方法不變,檢測(cè)不同金屬離子的熒光強(qiáng)度,結(jié)果如圖6所示。200 nmol/L的Ag+的樣品熒光強(qiáng)度為240,其他金屬離子的熒光強(qiáng)度都低于50,不足Ag+的1/10。結(jié)果顯示,本方法對(duì)于Ag+具有特異性,適用于復(fù)雜水體。
進(jìn)一步將該探針用于自來(lái)水中Ag+的檢測(cè),該樣品中未檢測(cè)出Ag+,向這些樣品中加入300 nmol/L的Ag+,其回收率為96.6%,證明該方法對(duì)于實(shí)際樣品分析具有一定的指導(dǎo)意義。
圖5 不同濃度Ag+對(duì)應(yīng)的熒光強(qiáng)度
圖6 選擇性分析
有些核酸探針的信號(hào)單元同時(shí)包括了染料分子和納米材料,這類探針?lè)Q為核酸-染料/納米探針[23]。該探針多數(shù)是通過(guò)染料分子和納米材料之間的FRET效應(yīng)實(shí)現(xiàn)的。以石墨烯納米材料為例,如Yang課題組首先利用石墨烯對(duì)單鏈DNA和雙鏈DNA吸附能力的不同,實(shí)現(xiàn)了DNA分子的檢測(cè)[16]。檢測(cè)機(jī)理如下:染料標(biāo)記的單鏈DNA探針可以通過(guò)π-π作用力與石墨烯結(jié)合,從而拉近染料和石墨烯之間的距離,導(dǎo)致二者發(fā)生能量共振轉(zhuǎn)移,染料熒光發(fā)生猝滅,當(dāng)目標(biāo)物DNA存在時(shí),可以與探針?lè)肿与s交形成雙鏈DNA,從而減弱了核酸與石墨烯之間的作用力,阻礙了能量共振轉(zhuǎn)移的發(fā)生,體系熒光得以恢復(fù)[24]。本研究傳感原理,如圖7所示,重金屬離子可與特定的基因序列發(fā)生作用[25],當(dāng)體系中無(wú)Ag+存在時(shí),由于堿基與石墨烯之間的π-π作用力,單鏈DNA與石墨烯形成石墨烯/單鏈DNA復(fù)合物,此時(shí)FAM與石墨烯之間發(fā)生共振能量轉(zhuǎn)移或電子轉(zhuǎn)移,其熒光猝滅。當(dāng)體系中加入Ag+時(shí),由于Ag+能夠選擇性的與兩個(gè)胞嘧啶堿基結(jié)合,使得DNA發(fā)生構(gòu)型變化折疊成為穩(wěn)定的分子內(nèi)C-Ag+-C雙鏈結(jié)構(gòu)[26],由于空間位阻的存在,此時(shí)加入的石墨烯不會(huì)與產(chǎn)物發(fā)生相互作用,因此FAM的熒光不能被有效猝滅,因此可以通過(guò)傳感器的熒光增強(qiáng)程度對(duì)體系中加入的Ag+進(jìn)行定量檢測(cè)[27]。
將本研究結(jié)果與利用納米材料和富C堿基DNA探針檢測(cè)Ag+的部分已報(bào)道研究進(jìn)行對(duì)比,結(jié)果如表1所示。可以看出,本實(shí)驗(yàn)方法的線性范圍和檢出限與其他方法相比各有優(yōu)劣,與同樣使用氧化石墨烯的方法相比,本研究所建立的核酸傳感器對(duì)Ag+的檢測(cè)線性范圍更大。
圖7 利用GO和SSO-FAM檢測(cè)Ag+的原理示意圖
本實(shí)驗(yàn)基于核酸適配體錯(cuò)配反應(yīng)的原理,利用SSO-FAM和GO建立了一種對(duì)Ag+檢測(cè)的方法。使用本方法,在150-400 nmol/L范圍內(nèi)Ag+濃度和熒光強(qiáng)度檢測(cè)值呈線性關(guān)系,Ag+的檢測(cè)限可達(dá)23nmol/L。該方法在飲用水的實(shí)驗(yàn)樣品中Ag+加標(biāo)檢測(cè)的回收率達(dá)到96.6%,對(duì)飲用水中Ag+含量的檢測(cè)具有一定的指導(dǎo)意義。但是該方法線性范圍較窄,并未達(dá)到預(yù)期結(jié)果,在方法設(shè)計(jì)和實(shí)際檢測(cè)方面還有待進(jìn)一步的改進(jìn)。
表1 本研究方法與其他方法的性能對(duì)比