蔣 敏, 李 恒, 李 會(huì), 史勁松
(江南大學(xué)藥學(xué)院,江蘇無(wú)錫214000)
微生物實(shí)驗(yàn)是我院制藥工程專(zhuān)業(yè)本科教學(xué)的核心基礎(chǔ)課程之一,在本專(zhuān)業(yè)技能培養(yǎng)中具有極其重要的意義[1]。目前,開(kāi)設(shè)的常規(guī)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)可以有效地保證學(xué)生掌握微生物學(xué)基本實(shí)驗(yàn)技能,但要培養(yǎng)出雙“一流”高校人才,還需注重培養(yǎng)學(xué)習(xí)興趣和創(chuàng)新思維,重點(diǎn)提升分析解決問(wèn)題的綜合能力,因此有必要緊密結(jié)合前沿性科研成果,圍繞微生物基本實(shí)驗(yàn)核心點(diǎn),輻射發(fā)散至藥理學(xué)、藥物分析等多個(gè)實(shí)驗(yàn)方向,對(duì)實(shí)驗(yàn)教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行擴(kuò)充,形成輻射狀的綜合性教學(xué)模式,提升本科教學(xué)實(shí)驗(yàn)的縱橫向飽滿度。
隨著分子生物學(xué)、腸道微生學(xué)等學(xué)科的迅速發(fā)展,腸道微生態(tài)與機(jī)體健康的研究也已經(jīng)普及到食品[2]、化工[3]、醫(yī)藥[4]等多個(gè)領(lǐng)域,其作用也日益受到人們的關(guān)注與重視[5],可以認(rèn)為研究微生物/微生物群與其宿主的關(guān)系已成為現(xiàn)代應(yīng)用微生物學(xué)的重要發(fā)展方向之一。因此開(kāi)設(shè)圍繞“健康”為主旨的微生物學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)在制藥工程專(zhuān)業(yè)教學(xué)工作中具有一定的意義。
本綜合性實(shí)驗(yàn)依托于學(xué)院腸道微生態(tài)的研究成果[6-12],以一株前期分離得到的安全有效的益生菌[13-14]—羅伊氏乳桿菌為研究對(duì)象,由學(xué)生進(jìn)行菌株觀察與鑒定,應(yīng)用腸道厭氧發(fā)酵模擬器-氣相色譜對(duì)該菌株腸道“益生”作用進(jìn)行定量評(píng)價(jià),在小鼠腸道菌群失調(diào)模型上進(jìn)行宏觀考察。通過(guò)開(kāi)設(shè)此綜合性實(shí)驗(yàn),不僅可以促進(jìn)學(xué)生鞏固經(jīng)典微生物基本操作,掌握分子生物學(xué)、藥物分析、藥理學(xué)實(shí)驗(yàn)技能,還可提高學(xué)生創(chuàng)新思維和科研熱情。
MRS培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,牛肉膏10 g,酵母提取物5 g,葡萄糖20 g,檸檬酸二銨2 g,乙酸鈉5 g,K2HPO42 g,MnSO4·4H2O 0.25 g(MnSO4·H2O 0.19 g),MgSO4·7H2O 0.58 g,吐溫80 1 mL,蒸餾水1 L,121℃滅菌20 min。
發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L):KMOS 8.0、胰蛋白胨3.0、蛋白胨3.0、酵母提取物4.5、膽鹽3 號(hào)0.4、L-半胱氨酸鹽酸鹽0.8、氯化鐵血紅素0.05、NaCl 4.5、KCl 2.5、MgCl2·6H2O 0.45、CaCl2·6H2O 0.2、KH2PO40.4、Tween80 1.0、微量元素(MgSO4·7H2O 3.0、MnCl2·4H2O 0.32、FeSO4·7H2O 0.1、CoSO4·7H2O 0.18、CaCl2·2H2O 0.1、ZnSO4·7H2O 0.18、CuSO4·5H2O 0.01、NiCl2·6H2O 0.092)2.0,pH 6.5,121 ℃濕熱滅菌20 min。
10名健康志愿者糞便;羅伊氏乳桿菌為本實(shí)驗(yàn)室保存菌株;本實(shí)驗(yàn)中使用的細(xì)菌基因組提取試劑盒、PCR產(chǎn)物純化試劑盒等均購(gòu)上海生工;PCR過(guò)程中所用引物購(gòu)于上海生工,PCR過(guò)程中所用酶及試劑均購(gòu)自索萊寶生物;乙酸、丙酸、丁酸、戊酸(GC,純度≥99.5%)購(gòu)自阿拉丁試劑有限公司;其他試劑:分析純,上海國(guó)藥集團(tuán)。
顯微鏡;酶標(biāo)儀;PCR擴(kuò)增儀;低速離心機(jī);厭氧工作站(37℃,80% 二氧化碳,10% 氫氣,10% 氮?dú)猓?;酸度?jì);渦旋儀;高壓蒸汽滅菌鍋;金屬??;氣相色譜儀;切片機(jī);pH自動(dòng)控制加液機(jī)。
BALB/c小鼠,雌雄各半,體重18~22 g,由上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物責(zé)任有限公司提供,飼養(yǎng)溫度(23±2)℃,相對(duì)濕度(50±5)%,自由進(jìn)食和飲水,適應(yīng)性飼養(yǎng)1周。
菌株活化后接入MRS培養(yǎng)基,37℃靜置培養(yǎng)24 h,取少量菌液并適當(dāng)稀釋?zhuān)坎糓RS平板,37℃厭氧培養(yǎng)48 h,于顯微鏡下觀察細(xì)胞形態(tài)、生理生化鑒定。
用DNA提取試劑盒提取基因組DNA,采用細(xì)菌通用引物進(jìn)行16 S rDNA的PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系為25 μL:10 × PCR Buffer 2.5 μL,dNTPs 2.0 μL,上下游引物各0.5 μL,模板DNA 1.0 μL,ExTaq 酶0.25 μL,ddH2O 18.25 μL。PCR 反應(yīng)條件:95 ℃ 預(yù)變性,2 min;循環(huán)過(guò)程為95℃變45 s,退火溫度56℃,45 s,72℃延伸90 s,共進(jìn)行30個(gè)循環(huán);72℃終延伸10 min,4℃保持,共30個(gè)循環(huán)。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳后回收純化,送上海生工有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果在GenBank中進(jìn)行BLAST比對(duì),確定種屬類(lèi)別。
2.3.1 腸道發(fā)酵器的搭建與穩(wěn)定性評(píng)價(jià)
文獻(xiàn)[15]方法:結(jié)合實(shí)際研究搭建模擬腸道發(fā)酵器(見(jiàn)圖1),按照配方配置發(fā)酵培養(yǎng)基,高溫滅菌后向系統(tǒng)中通入高純氮?dú)?,控制系統(tǒng)的溫度、攪拌速度、pH等,使其保持穩(wěn)定。取新鮮的健康捐獻(xiàn)者的糞便樣品5 g,滅菌PBS制成20%(w/v)菌懸液,震蕩混勻,離心(8 000 r/min,1 min)取上清,將上清液通過(guò)補(bǔ)料口接種到已經(jīng)預(yù)運(yùn)行48 h的發(fā)酵罐中,調(diào)節(jié)蠕動(dòng)泵以輸送新鮮培養(yǎng)基和廢液,使發(fā)酵罐的液位恒定。PCRDGGE檢測(cè)證明連續(xù)發(fā)酵的前期(0~8 d),系統(tǒng)中菌群波動(dòng)較大,處于不穩(wěn)定狀態(tài),當(dāng)發(fā)酵進(jìn)入第9、10 d后,DGGE圖譜上條帶相似度高,種類(lèi)及豐富度基本沒(méi)有變化,說(shuō)明此時(shí)發(fā)酵器內(nèi)的菌群處于穩(wěn)定狀態(tài),UPGMA相似性聚類(lèi)分析結(jié)果基本與DGGE結(jié)果一致。因此,本實(shí)驗(yàn)選擇經(jīng)發(fā)酵器連續(xù)厭氧發(fā)酵10 d后的穩(wěn)定的腸道微生物群落為研究對(duì)象,研究羅伊氏乳桿菌的腸道調(diào)節(jié)作用。
2.3.2 實(shí)驗(yàn)組設(shè)計(jì)
以穩(wěn)定恒化器中的腸道微生物菌群作為發(fā)酵系統(tǒng),設(shè)置兩組實(shí)驗(yàn):對(duì)照組與羅伊氏乳桿菌組(接種量為1%),厭氧條件下連續(xù)培養(yǎng)36 h,取樣檢測(cè)。
2.3.3 SCFA 檢測(cè)
圖1 模擬腸道發(fā)酵器
文獻(xiàn)[16-17]方法:取1 mL培養(yǎng)液,4℃,12 000 r/min下離心10 min除菌體。取500 μL上清,離心去除沉淀,加入1 mL乙醚萃取15 min,低溫離心分離,取上清進(jìn)樣。精密稱(chēng)取乙酸、丙酸、丁酸、戊酸適量,加乙醚制成儲(chǔ)備液,加入內(nèi)標(biāo)物(50 μg/mL),待進(jìn)樣。以標(biāo)準(zhǔn)物和內(nèi)標(biāo)物濃度比為橫坐標(biāo),對(duì)應(yīng)峰面積為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,用于計(jì)算待測(cè)物濃度。采用氣相色譜法檢測(cè)短鏈脂肪酸(Short Chain Fatty Acid,SCFA)含量,色譜柱:DB-WAX 30M(I.D.0.32 mm,5 μm);升溫程序:50℃保持3 min,以6℃/min升至120℃,保持0.5 min,以6℃/min升至220℃,保持5 min;載氣(N2)流速3 mL/min,載氣(H2)流速47 mL/min;空氣流量400 mL/min;進(jìn)樣量1.0 μL;分流比1∶3。數(shù)據(jù)采用Origin 8軟件作圖,結(jié)果以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)表示。
2.4.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型
1周的適應(yīng)期后,小鼠隨機(jī)分成3組,每組8只,取兩組小鼠,連續(xù)7 d灌胃頭孢曲松鈉生理鹽水溶液(1.25 mg/g bw)造模。將模型小鼠平均分為模型組和羅伊氏乳桿菌組兩組,其中羅伊氏乳桿菌組連續(xù)15 d灌胃羅伊氏乳桿菌菌液(濃度為0.5×1010CFU/g bw)。模型組和對(duì)照組連續(xù)15 d灌胃等體積生理鹽水。
2.4.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及樣品處理方法
實(shí)驗(yàn)定期進(jìn)行稱(chēng)重并監(jiān)測(cè)小鼠的攝食量,飲水量,記錄數(shù)據(jù),灌胃結(jié)束后將小鼠頸椎脫位處死,腹部75%乙醇消毒,解剖,取盲腸內(nèi)容物測(cè)定SCFA,盲腸內(nèi)容物取出后,PBS沖洗,4%多聚甲醛固定,75%乙醇脫水、石蠟包埋、切片、染色,顯微鏡下觀察。
顯微鏡下菌落為乳白色,不透明,濕潤(rùn),中心不凸起,屬于細(xì)菌。參照《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》對(duì)菌株分別進(jìn)行生理生化鑒定,結(jié)果如表1所示。進(jìn)一步分析生理生化鑒定結(jié)果可知,該菌株均能利用糖類(lèi)物質(zhì)生長(zhǎng),同時(shí)產(chǎn)酸,且大部分菌株對(duì)膽鹽的耐受能力較強(qiáng)。以菌株的基因組為模板,PCR擴(kuò)增長(zhǎng)度為1.5 kb,該片段提交至GenBank中,與已報(bào)道的序列進(jìn)行BLAST比對(duì),比對(duì)結(jié)果最終確定本實(shí)驗(yàn)的試驗(yàn)菌為羅伊氏乳桿菌。
表1 菌株生理生化特征
SCFA是含1~6個(gè)碳原子的有機(jī)羧酸,是目前最常用的腸道微生態(tài)研究指標(biāo)之一,其主要包含乙酸、丙酸、丁酸和戊酸[18]?,F(xiàn)代藥理學(xué)與臨床研究表明,SCFA參與腸上皮細(xì)胞的能量供應(yīng),不僅可影響腸腔pH和電解質(zhì)平衡、腸黏膜屏障的通透性、腸道高敏感和腸動(dòng)力的調(diào)節(jié),還與抗炎、抗腫瘤等密切相關(guān)。已有研究表明,不同種類(lèi)SCFA的生理功能各有特點(diǎn),如丁酸為腸道上皮細(xì)胞的主要能量來(lái)源,可通過(guò)激活氯離子/丁酸通道、促進(jìn)鈉離子/氫離子交換等途徑促進(jìn)腸道水與離子的吸收,改善腹瀉情況[19-20],此外,丁酸還可通過(guò)抑制組蛋白去乙酰化酶,抑制端粒酶活動(dòng),發(fā)揮抗腫瘤效應(yīng)[21];丙酸有助于保護(hù)腸黏膜屏障,通過(guò)STAT3信號(hào)通路減少炎癥與氧化損傷[22]等。
不同組SCFA檢測(cè)結(jié)果如表2所示。數(shù)據(jù)可見(jiàn),外源添加羅伊氏乳桿菌對(duì)腸道SCFA產(chǎn)生的種類(lèi)沒(méi)有影響,但對(duì)含量有顯著影響。相較于對(duì)照組,添加了羅伊氏乳桿菌后,丙酸、丁酸、戊酸含量分別顯著增加了25.9、3及9倍,而乙酸未發(fā)生顯著變化。體外實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,羅伊氏乳桿菌可影響腸道SCFA結(jié)構(gòu),從而發(fā)揮益生作用。
3.3.1 體重檢測(cè)結(jié)果
實(shí)驗(yàn)期間無(wú)小鼠死亡,各組小鼠飲水量與采食量無(wú)顯著差異。對(duì)照組小鼠體重在實(shí)驗(yàn)期間無(wú)顯著變化,而模型組和羅伊氏乳桿菌組小鼠在造模后體重均有所下降,經(jīng)過(guò)15 d灌胃處理后兩組體重均有所回升,但與對(duì)照組無(wú)顯著差異。
表2 不同組SCFA的產(chǎn)生量
3.3.2 SCFA 檢測(cè)結(jié)果
不同組小鼠腸道內(nèi)SCFA含量檢測(cè)結(jié)果如表3所示。數(shù)據(jù)可見(jiàn),模型組小鼠腸道內(nèi)SCFA含量顯著降低,其中總酸含量從(68.15 ± 6.5)mmol/L 下降至(16.27 ±0.79)mmol/L,其中乙酸含量從(32.56 ±2.32)mmol/L 顯著下降至(12.02 ±0.42)mmol/L,丁酸含量從(27.15 ±4.98)mmol/L 顯著下降至(4.25 ±1.22)mmol/L,而丙酸與戊酸幾乎檢測(cè)不出。而與模型組相比,羅伊氏乳桿菌組小鼠腸道內(nèi)總酸含量[(98.55 ±3.23)mmol/L]顯著高于模型組[(16.27 ±0.79)mmol/L],其中乙酸、丁酸、戊酸分別為(35.93±0.99),(26.07 ±4.08),(0.49 ± 0.10)mmol/L,與對(duì)照組無(wú)顯著差異;與體外結(jié)果相一致的是丙酸含量增加最明顯,為(36.05 ±4.41)mmol/L,顯著高于對(duì)照組。分析可見(jiàn),抗生素干擾小鼠腸道菌群平衡,造成了SCFA顯著下降,而羅伊氏乳桿菌能夠顯著改善腸道環(huán)境,提高SCA的產(chǎn)量,但體內(nèi)與體外的SCFA趨勢(shì)結(jié)果不完全一致,這可能是由于體外只能實(shí)現(xiàn)小部分腸道微生物的培養(yǎng),導(dǎo)致了體內(nèi)外微生物菌群的差異。
表3 盲腸內(nèi)容物SCFA含量 mmol/L
3.3.3 腸道組織形態(tài)觀察
圖2所示為隨機(jī)抽取的盲腸組織切片光鏡圖,由圖可見(jiàn),對(duì)照組小鼠腸道上皮細(xì)胞完整,絨毛排列整齊,模型組腸上皮細(xì)胞破壞嚴(yán)重,腸絨毛缺損明顯,排列紊亂,而經(jīng)過(guò)羅伊氏乳桿菌干擾的小鼠腸上皮結(jié)構(gòu)與對(duì)照組相近,腸絨毛排列整齊且致密。
圖2 小鼠盲腸縱切面200×
表4所示為各組腸絨毛高度,數(shù)據(jù)顯示模型組小鼠腸絨毛高度[(76.4 ±7.5)μm]相較于對(duì)照組[(149.7 ±4.5)μm]顯著降低(P <0.05),經(jīng)過(guò)羅伊氏乳桿菌干預(yù)的小鼠腸絨毛高度[(165.9±5.1)μm]較模型組甚至空白對(duì)照組都有顯著增長(zhǎng)(P<0.05)。結(jié)果表明,羅伊氏乳桿菌能夠在抗生素失調(diào)模型小鼠中發(fā)揮腸道保護(hù)作用。這可能是由于羅伊氏乳桿菌能夠通過(guò)調(diào)節(jié)腸道SCFA的數(shù)量與結(jié)構(gòu),改善抗生素引起的腸黏膜損傷,促進(jìn)腸絨毛的增長(zhǎng)等[23]。
表4 各組小鼠盲腸絨毛高度
(1)菌株的培養(yǎng)鑒定實(shí)驗(yàn)可進(jìn)一步鞏固學(xué)生微生物的基本操作技能,在此基礎(chǔ)上增加了常規(guī)的分子操作,拓寬了傳統(tǒng)微生物實(shí)驗(yàn)課的視野,為學(xué)生進(jìn)一步從事相關(guān)科研工作奠定了基礎(chǔ)。
(2)以SCFA為定量指標(biāo),搭建了體外腸道模擬發(fā)酵器,提高微生物實(shí)驗(yàn)課堂的趣味性,該實(shí)驗(yàn)單元著重培養(yǎng)了學(xué)生對(duì)氣相色譜、PCR等科研型儀器的操作能力。
(3)藥理學(xué)技術(shù)等已在多學(xué)科領(lǐng)域得到全面普及,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)單元要求學(xué)生熟練掌握解剖、取樣等技能以獲取樣本,進(jìn)行關(guān)鍵性指標(biāo)檢測(cè)及常規(guī)病理切片,對(duì)培養(yǎng)學(xué)生綜合實(shí)驗(yàn)技能和提高科研素養(yǎng)具有重要的意義。
(4)通過(guò)本實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的實(shí)施,有助于學(xué)生掌握精準(zhǔn)化腸道微生態(tài)營(yíng)養(yǎng)產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)與研究的一般方法與科研思路,為未來(lái)從事藥學(xué)、食品、微生物學(xué)等領(lǐng)域相關(guān)工作奠定基礎(chǔ)。