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        基于密度泛函的吲哚美辛外場(chǎng)下的解離特性

        2020-08-08 07:31:36葛浩然王方原李桂琴汪杰君王新強(qiáng)
        光譜學(xué)與光譜分析 2020年8期
        關(guān)鍵詞:振動(dòng)

        葛浩然, 王方原, 李桂琴, 葉 松, 汪杰君, 李 樹(shù), 王新強(qiáng)*

        1. 桂林電子科技大學(xué)電子工程與自動(dòng)化學(xué)院,廣西 桂林 541004 2. 清華大學(xué)物理系,北京 100084 3. 廣西光電信息處理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西 桂林 541004

        引 言

        吲哚美辛是一種廣泛使用的抗炎藥,具有解熱、 治療炎癥性腸病、 抗腫瘤、 消腫止痛、 調(diào)節(jié)胰腺癌細(xì)胞中的增殖和侵襲、 改善藥物腸道通透性等藥用功效[1-6]。雖然吲哚美辛有很好的藥用功效,但其存在不易溶于水,難降解,生物利用度低的問(wèn)題[7-8]。

        傳統(tǒng)污水處理廠中的藥物降解是一項(xiàng)挑戰(zhàn),因?yàn)槌鞘形鬯歪t(yī)院污水中會(huì)含有低濃度的頑固藥物,污水處理廠不能有效去除藥物。所以,未被降解的藥物化合物最終會(huì)進(jìn)入環(huán)境成為污染物,存在于天然水飲用水和城市廢水中。醫(yī)院污水中會(huì)含有低濃度的藥物,包括吲哚美辛,當(dāng)這些藥物進(jìn)入環(huán)境會(huì)成為污染物,進(jìn)而嚴(yán)重污染自然生態(tài)系統(tǒng)。吲哚美辛不易溶于水,難降解使得污水中的藥物降解成為一項(xiàng)挑戰(zhàn)[9]。基于這些難題,近年來(lái),國(guó)內(nèi)外不斷有人研究有效降解吲哚美辛的方法,其中有微生物解離法,光降解法,活性炭吸附法,臭氧氧化法等。例如通過(guò)電氧化與生物系統(tǒng)共同作用去除廢水中頑固藥物[9];通過(guò)模擬在水溶液中太陽(yáng)光催化降解吲哚美辛[10];用高鐵酸鹽氧化吲哚美辛,分析反應(yīng)產(chǎn)物和毒性變化[11]。而關(guān)于吲哚美辛在EEF下的解離特性和紅外光譜(infrared spectroscopy, IR)還未見(jiàn)報(bào)道。

        由于IR較強(qiáng)的特征性,IR被廣泛應(yīng)用于量子場(chǎng)論的IR射線與物質(zhì)相互作用領(lǐng)域,即提供了一種準(zhǔn)確的方法識(shí)別各種化學(xué)物質(zhì)。人們發(fā)現(xiàn)在EEF下,物質(zhì)會(huì)發(fā)生許多新的物理和化學(xué)變化,例如改變分子的IR、 化學(xué)鍵和電離能[12-13]等。針對(duì)目前吲哚美辛難降解的問(wèn)題,探究EEF下物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)和IR的變化情況,可以為EEF解離方法研究降解吲哚美辛,以便為降解污水中藥物化合物提供理論指導(dǎo)。本工作選用密度泛函理論(density function theory, DFT),分析了EEF作用下吲哚美辛分子的基態(tài)總能量、 鍵長(zhǎng)、 偶極矩(dipole moment, DM)、 能隙和IR的藍(lán)移(blue shift, BS)和紅移(red shift, RS),其變化情況能分析出吲哚美辛在EEF下解離的難易程度。

        1 理論和計(jì)算方法

        考慮EEF的作用, 分子體系哈密頓量H的公式[12]

        H=H0+Hint

        (1)

        式(1)中,H0和Hint是分子分別在無(wú)EEF時(shí)和存在EEF的環(huán)境下同時(shí)作用的哈密頓量。在偶極近似下,EEF與分子體系的相互作用能為[12]

        Hint=-μF

        (2)

        式(2)中,μ是分子電DM,F為外電場(chǎng)。

        (3)

        式(3)中,μ0為分子永久電DM,α是偶極極化率,β是一階超極化率,γ是二階超極化率等。

        (4)

        式(4)中, 能量在EEF沿著i=x,y或z方向的表達(dá)式。

        EG=(EL-EH)×27.2 eV

        (5)

        式(5)中,能隙EG的求法,EL為L(zhǎng)UMO能量和EH為HOMO能量。式(1)—式(5)為在EEF下分子結(jié)構(gòu)及其運(yùn)動(dòng)變化提供理論依據(jù)。

        吲哚美辛的理論計(jì)算是在Gaussian16[14]軟件中進(jìn)行: 首先設(shè)置DFT/B3LYP/6-31+G(d, p)的方法, 同時(shí)沿Y軸(N15-C16)方向施以EEF(0~0.025 a.u.),得到不同EEF下吲哚美辛分子的各個(gè)基態(tài)物理參數(shù)和IR。探討了隨著EEF的改變,吲哚美辛的各個(gè)參數(shù)和IR的改變情況。吲哚美辛在EEF作用下解離的難易程度可以從這些改變情況看出。

        無(wú)EEF作用時(shí)對(duì)吲哚美辛分子優(yōu)化后得到的基態(tài)結(jié)構(gòu)如圖1(a)所示, 此優(yōu)化結(jié)構(gòu)與文獻(xiàn)[15]里的結(jié)果一致。C2與C17間的單鍵優(yōu)化成了苯環(huán)間的雙鍵, 鍵長(zhǎng)也明顯縮短(由1.816 ?縮短為1.445 ?), 分析認(rèn)為C2與C17間的成鍵鍵型由σ鍵變成π鍵,電子云密度變大,所以優(yōu)化后鍵長(zhǎng)縮短。使得N15的孤立電子對(duì)結(jié)合C16與C17的電子,它們和苯環(huán)構(gòu)成一個(gè)牢固的共軛體系,使吲哚美辛分子能量降到最低,形成最穩(wěn)定的構(gòu)型。二面角D(29, 34, 40, 15)為38.58°。圖1(b)和(c)分別顯示了最低未占分子軌道(LUMO)和最高占據(jù)分子軌道(HOMO)的前線軌道。從圖1可以觀察到,LUMO主要分布在苯環(huán)β,而HOMO主要聚在五元環(huán)和苯環(huán)α。從HOMO-LUMO的電子云中,可以得出五元環(huán)軌道雜交的結(jié)論。

        圖1 未施加EEF的圖(a):吲哚美辛分子優(yōu)化結(jié)構(gòu);(b):前線軌道LUMO;(c):前線軌道HOMOFig.1 Figures without EEF(a):Optimized molecular structure of indometacin without EEF;(b):Frontier orbital LUMO without EEF;(c):Frontier orbital HOMO

        2 結(jié)果與討論

        2.1 不同EEF下吲哚美辛分子的幾何結(jié)構(gòu)

        采用DFT/B3LYP/6-31+G(d, p)方法, 在EEF(0~0.025 a.u.)作用下進(jìn)行基態(tài)優(yōu)化。從圖2可以看出, 當(dāng)沿N15-C16方向的EEF強(qiáng)度逐漸增大時(shí), 基態(tài)總能量在EEF(0~0.015 a.u.)下緩慢下降, 隨后快速下降,DM的改變則與此相反。DM與能量的變化情況可以用式(3)和式(4)來(lái)解釋。

        圖2 分子在EEF作用下的基態(tài)能量與偶極矩變化Fig.2 Ground state energy and dipole moment of indometacin under different EEF

        當(dāng)F=0 a.u.時(shí),E=-1 549.827 55 Hartree,μ=1.615 9 Debye。隨著EEF的增強(qiáng), 當(dāng)F=0.025 a.u.,E=-1 549.959 71 Hartree,μ=24.550 5 Debye,且E和μ在F=0.015 a.u.有明顯的拐點(diǎn)。在F=0.015 a.u.時(shí)突然出現(xiàn)的拐點(diǎn),在其他物理參數(shù)的變化也有明顯的體現(xiàn)。

        ΔR是有EEF與無(wú)EEF情況下的鍵長(zhǎng)之差, 即鍵長(zhǎng)的改變值,如圖3和圖6(a)所示,ΔR<0,表明鍵長(zhǎng)縮短,反之則被拉長(zhǎng)。文獻(xiàn)[10-11]中表明吲哚美辛分子的C3-C4,C3-N15,C5-C6,O10-C11和N15-C16鍵易被氧化斷裂進(jìn)而分解。在圖3中,隨著EEF的增強(qiáng), 這些鍵的ΔR>0,特別是當(dāng)F≥0.015 a.u.,ΔR明顯變大。當(dāng)F=0.025 a.u.,O10-C11與 C3-N15的ΔR分別是0.061 7和0.032 8 ?,表明在EEF作用下,O10-C11,C3-N15和N15-C16易斷裂進(jìn)而使吲哚美辛分解,與參考文獻(xiàn)[10-11]的結(jié)果相吻合。

        圖3 分子部分鍵長(zhǎng)變化值隨EEF變化的關(guān)系Fig.3 Partial results of several bond lengths change value under different EEF

        C6-O10,C16-C17,C16-C18,N15-C40和C25=O26的ΔR與IR吸收有關(guān),如圖6(a)所示,ΔR與IR吸收峰的BS和RS相對(duì)應(yīng)。2.3節(jié)將給出詳細(xì)的鍵的振動(dòng)和IR峰位移。從圖6(a)可以看出,隨著EEF增加,ΔR(C6-O10)不斷減小,當(dāng)F=0.015 a.u.,減小速度加快,當(dāng)F=0.025 a.u.,ΔR為-0.061 4;與之相反,C25=O26 一直被拉長(zhǎng);C16-C17和C16-C18的ΔR先變大后變小,且F=0.015 a.u.時(shí)是明顯的轉(zhuǎn)折點(diǎn);N15-C40的ΔR基本沒(méi)有變化。

        分子內(nèi)部電子隨著外部施以的EEF發(fā)生局部轉(zhuǎn)移,其內(nèi)電場(chǎng)隨之發(fā)生變化,在內(nèi)外電場(chǎng)的相互作用下,鍵長(zhǎng)出現(xiàn)不同的伸縮現(xiàn)象[10]。由于C3-C4,C3-N15,C5-C6,O10-C11與N15-C16內(nèi)部電子的轉(zhuǎn)移,使內(nèi)電場(chǎng)衰弱,導(dǎo)致其ΔR>0,表明該化學(xué)鍵隨EEF的增加逐漸變得脆弱而易發(fā)生斷裂;相似的,N15-C16,N15-C40在內(nèi)外場(chǎng)強(qiáng)作用下,內(nèi)電場(chǎng)先變強(qiáng)后減弱,R(15, 16),R(25, 26)的ΔR先變小后變大;N15-C40內(nèi)沒(méi)有電子云的移動(dòng), EEF對(duì)其鍵長(zhǎng)沒(méi)有影響,因此其ΔR基本沒(méi)有變化。當(dāng)F=0.015 a.u.,C3-N15,N15-C16,C16-C17,C16-C18 和C6-O10的ΔR有一個(gè)突然的改變,這與電子狀態(tài)的變化有關(guān),在參考文獻(xiàn)[16]中的雙原子也有類似變化的情況??傊?,在EEF,O10-C11,C3-N15和N15-C16的ΔR變化劇烈,最易斷裂,表明吲哚美辛分子在EEF下會(huì)變得不穩(wěn)定進(jìn)而被分解。

        2.2 EEF對(duì)前線軌道的影響

        在2.1節(jié)方法的基礎(chǔ)上, 計(jì)算分子能量。圖4為能隙EG的變化曲線,具體求解見(jiàn)式(5)。在EEF下EG大幅下降,表明在EEF下吲哚美辛分子的電子易過(guò)渡到高能級(jí),使分子更易處于不穩(wěn)定的激發(fā)態(tài)而發(fā)生化學(xué)反應(yīng),如化學(xué)鍵的斷裂等。當(dāng)F=0.015 a.u.時(shí),EG曲線呈現(xiàn)出明顯的連續(xù)下坡,這種明顯的變化在圖2和圖3中也有所體現(xiàn)。

        圖4 不同EEF下能隙EG變化Fig.4 Energy gaps EG under different EEF

        2.3 EEF對(duì)紅外光譜的影響

        無(wú)EEF作用吲哚美辛的IR如圖5所示, IR的譜峰是由吲哚美辛分子中各個(gè)化學(xué)鍵的不同振動(dòng)所致。未施以EEF時(shí)化學(xué)鍵的振動(dòng)產(chǎn)生的IR, 與文獻(xiàn)[17]的實(shí)驗(yàn)結(jié)果能很好地吻合。圖5僅列出部分較強(qiáng)IR吸收峰,用(1)—(8)進(jìn)行標(biāo)識(shí)。607 cm-1表征羧基w(COOH);1 102 cm-1表征C16-C18 的v(C-C), 以及C24所連乙基間的w(C2H5);頻率為1 264 cm-1表征C6-O10的v(C-O)以及O21-H28的w(O-H);1 354 cm-1表征N15-C40的v(N-C);C16=C17的v(C=C)出現(xiàn)在1 633 cm-1處;1 822 cm-1屬于C25=O26的v(C=O);C11所連甲基的vas(CH3)出現(xiàn)在3 055 cm-1處;3 748 cm-1對(duì)應(yīng)的是羧基的O27-H28的v(O-H)。

        當(dāng)施加不同EEF時(shí)的頻譜移動(dòng)情況如圖6(b)所示。圖6(b)的標(biāo)注中標(biāo)明了化學(xué)鍵振動(dòng)產(chǎn)生的1峰—8峰與圖5的吸收峰(1)—(8)一一對(duì)應(yīng),圖中Δf是8個(gè)較強(qiáng)吸收峰的頻率改變值,Δf>0,表示發(fā)生BS,反之則發(fā)生RS,Δf的變化表明吲哚美辛分子隨著EEF的增強(qiáng), 有很強(qiáng)的振動(dòng)斯塔克效應(yīng)。顯著的BS體現(xiàn)在1, 3, 8峰上,隨著EEF的增加,1峰的BS整體呈減小趨勢(shì),而8峰的BS逐漸增加;3峰在EEF(0~0.015 a.u.)未出現(xiàn)BS,但在F≥0.02 a.u.,出現(xiàn)強(qiáng)烈的BS,當(dāng)F=0.025 a.u.,頻率增加56 cm-1。5峰和6峰出現(xiàn)RS,6峰的RS最為劇烈,頻率降低了86 cm-1;5峰在F=0.015 a.u.時(shí),RS最強(qiáng)烈,頻率降低了18 cm-1。2峰未發(fā)生頻譜移動(dòng),4峰先RS后BS,7峰先BS后RS。總之,相對(duì)較強(qiáng)的4,5,6和7吸收峰隨EEF的增強(qiáng)都會(huì)發(fā)生RS,這是因?yàn)榛瘜W(xué)鍵的斷裂程度發(fā)生了改變,影響了鍵的振動(dòng)頻率。

        圖5 無(wú)EEF時(shí)吲哚美辛分子IRFig.5 IR spectrum of indometacin molecules without EEF

        圖6(a)是與IR吸收峰有關(guān)的部分化學(xué)鍵的ΔR。當(dāng)ΔR>0, 由于能級(jí)差減小,頻率減小,會(huì)發(fā)生RS;同理,ΔR<0,會(huì)發(fā)生BS。N15-C40的ΔR基本未發(fā)生改變, 但其IR吸收峰先RS后BS,且F=0.015 a.u.是拐點(diǎn)。ΔR(C16-C18)先變大后減小, 但2峰的Δf基本不變。從N15-C40,C16-C18的ΔR與Δf的變化可以看出,Δf不僅與能級(jí)有關(guān),還與其他因素有關(guān),例如分子軌道配置和DM的變化。

        在EEF下, 伴隨著各個(gè)峰出現(xiàn)不同的RS和BS現(xiàn)象, 各個(gè)譜峰強(qiáng)度也發(fā)生了復(fù)雜的變化,這是由于EEF下分子構(gòu)型發(fā)生了變化,如鍵長(zhǎng)、 鍵角的改變等都會(huì)重新分配紅外光譜的振子強(qiáng)度,其中(4),(5),(6)和(7)峰的振動(dòng)強(qiáng)度增強(qiáng),說(shuō)明對(duì)應(yīng)的化學(xué)鍵(N5-C40,C16-C17,C25=O26和C11所連甲基)變得脆弱,而易發(fā)生斷裂。

        3 結(jié) 論

        通過(guò)DFT/B3LYP/6-31+G(d, p)方法, 沿Y軸(N15-C16)方向加以EEF(0~0.025 a.u.),優(yōu)化吲哚美辛分子的基態(tài)結(jié)構(gòu), 計(jì)算出各個(gè)物理參數(shù)和IR,同時(shí)分析了分子總能量、 DM、 鍵長(zhǎng)、EL,EH、 能隙、 IR的變化情況。結(jié)果如下:

        (1) 基態(tài)總能量在EEF(0~0.015 a.u.)下緩慢下降, 隨后快速下降, 在F=0.015 a.u時(shí)呈現(xiàn)顯著變化; DM的變化情況則與此相反。當(dāng)EEF變大時(shí), 能隙不斷降低, 使分子處于不穩(wěn)定的激發(fā)態(tài)而發(fā)生化學(xué)反應(yīng)。

        圖6 (a)不同EEF下與吸收峰相關(guān)的化學(xué)鍵的變化值ΔR;(b)不同EEF下8個(gè)較強(qiáng)吸收峰頻率的變化值Fig.6 (a) The change value of the chemical bond related to the absorption peak under different EEF;(b) The change value of eight strong absorption peak frequencies under different EEF

        (2)不同的鍵長(zhǎng)變化不同。隨著EEF的增強(qiáng)C3-C4,C3-N15,C5-C6,O10-C11與N15-C16的ΔR>0,其中O10-C11,C3-N15和N15-C16的ΔR變化劇烈,最易斷裂進(jìn)而使吲哚美辛分解。

        (3)在EEF下,不同的化學(xué)鍵振動(dòng)引起的IR頻譜移動(dòng)也發(fā)生了顯著的變化。當(dāng)ΔR>0, 由于能級(jí)差減小,頻率減小,導(dǎo)致RS,但是N15-C40,C16-C18的ΔR與Δf的對(duì)應(yīng)關(guān)系表明Δf不僅與能級(jí)有關(guān),還與其他因素有關(guān),例如分子軌道配置和DM的變化。4, 5, 6, 7峰的振動(dòng)強(qiáng)度增強(qiáng),說(shuō)明對(duì)應(yīng)的化學(xué)鍵變得脆弱,而易發(fā)生斷裂,使吲哚美辛分子處于不穩(wěn)定的狀態(tài)。

        綜上可知,吲哚美辛在EEF下的分子結(jié)構(gòu)和IR都發(fā)生了明顯的變化,在不同EEF下,鍵長(zhǎng)、 鍵角的改變會(huì)導(dǎo)致分子構(gòu)型發(fā)生變化,進(jìn)而影響鍵振動(dòng)頻率和振動(dòng)強(qiáng)度,即IR會(huì)出現(xiàn)有不同的頻移。隨著EEF的增強(qiáng),能隙不斷減小、 部分化學(xué)鍵被拉伸逐漸變得脆弱,這會(huì)使IR發(fā)生紅移,這些現(xiàn)象說(shuō)明吲哚美辛分子隨著EEF的增強(qiáng),變得不穩(wěn)定,易發(fā)生解離??梢詾殡妶?chǎng)解離方法研究降解吲哚美辛,以便為污水中的頑固藥物降解提供理論指導(dǎo)。

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