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        miRNA-34a 靶向調(diào)控叉頭框蛋白P1對活化B細胞樣彌漫性大B細胞淋巴瘤細胞凋亡的影響

        2020-07-28 07:30:48武君梁艷張森森王娟尚念梅杜忠海
        癌癥進展 2020年12期
        關鍵詞:差異檢測研究

        武君,梁艷,張森森,王娟,尚念梅,杜忠海

        濰坊市中醫(yī)院腫瘤中心腫瘤科,山東 濰坊 261041

        彌漫性大B細胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是一種具有高度異質(zhì)性和高度侵襲性的非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL),是發(fā)病率最高的NHL亞型,約占30%~40%,而在亞洲國家所占比例高達50%[1-2]。Alizadeh等[3]根據(jù)基因表達譜(gene expression profiling,GEP)技術將DLBCL分為生發(fā)中心B細胞樣(germinal center B cell-like,GCB)和活化B細胞樣(activated B cell-like,ABC)亞型。研究顯示,ABCDLBCL患者的預后比GCB-DLBCL差,仍有30%~40%的ABC-DLBCL患者接受現(xiàn)有的方案治療,無法得到持續(xù)緩解[4-5]。因此,研究DLBCL發(fā)生發(fā)展的生物學異質(zhì)性,尋找新的生物治療靶點對DLBCL的臨床診斷和治療有積極意義。近年來研究發(fā)現(xiàn),微小RNA(microRNA,miRNA)在人類腫瘤、胚胎發(fā)育及代謝疾病等多種疾病中都發(fā)揮重要作用[6-7]。其中miRNA-34a作為抑癌基因p53的下游基因,與多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關[8-11]。miRNA-34a轉錄受p53蛋白的正調(diào)控,引起細胞周期變化或細胞凋亡等,在p53作用通路中發(fā)揮重要作用[12-14]。研究表明,miRNA-34a在包括DLBCL在內(nèi)的多種惡性腫瘤中低表達[15],提示miRNA-34a可能是潛在的抑癌因子。已有研究表明,miRNA-34a可以促進DLBCL細胞凋亡從而抑制DLBCL的發(fā)展[16]。叉頭框蛋白 P1(forkhead box protein 1,F(xiàn)OXP1)是FOXP亞家族轉錄因子成員,廣泛表達于各個組織并發(fā)揮多種生理功能,在不同的腫瘤組織中發(fā)揮不同的生物學作用[17]。FOXP1是B細胞發(fā)育過程中的關鍵轉錄調(diào)節(jié)因子,表達異常時容易產(chǎn)生B細胞淋巴瘤[18]。FOXP1蛋白在ABC-DLBCL中高表達,提示FOXP1可能作為癌基因參與了DLBCL的發(fā)生發(fā)展[19]。Cerna等[20]研究發(fā)現(xiàn),在慢性淋巴細胞性白血病中,F(xiàn)OXP1可能作為miRNA-34a的靶點,通過負調(diào)控FOXP1蛋白的表達來限制B細胞受體信號通路。但miRNA-34a引起DLBCL細胞凋亡的具體機制目前尚不明確。因此,本研究探討miRNA-34a和FOXP1的表達變化對ABC-DLBCL細胞增殖和凋亡的影響,探討相關分子作用機制,現(xiàn)報道如下。

        1 材料及方法

        1.1 細胞、主要試劑和儀器

        人胚腎細胞株293T、ABC-DLBCL細胞株SUDHL-2均購自上海澤葉生物科技有限公司。胎牛血清、RPMI-1640培養(yǎng)基、流式檢測試劑盒均購自美國Thermo Fisher公司,脂質(zhì)體LipofectamineTM2000、Trizol試劑均購自美國Invitrogen公司,F(xiàn)OXP13'非翻譯區(qū)(3'-untranslated region,3'-UTR)野生型、突變型報告基因載體及其空載體均購自上海吉滿生物科技有限公司,miRNA-34a mimics購自美國Invitrogen公司,F(xiàn)OXP1siRNA購自美國Sigma-Aldrich公司,逆轉錄試劑、實時熒光定量逆轉錄聚合酶鏈反應(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)試劑盒均購自德國Qiagen公司,Bradford蛋白濃度檢測試劑盒購自上海碧云天生物技術有限公司,抗FOXP1抗體、抗甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)抗體、辣根過氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)偶聯(lián)二抗均購自美國CST公司,聚偏二氟乙烯(polyvinylidene fluoride,PVDF)膜購自美國Pharrnacai公司,雙熒光素酶報告基因試劑盒購自美國Promega公司,熒光定量PCR檢測引物由上海生工生物工程有限公司合成。

        1.2 實驗方法

        1.2.1 細胞培養(yǎng)、轉染及分組 人胚腎細胞株293T、ABC-DLBCL細胞株SU-DHL-2分別在5%CO2、37℃條件下,于含10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)基中培養(yǎng)。將細胞以1×105/孔接種于24孔板,當細胞的生長密度為60%左右時開始進行轉染。按照LipofectamineTM2000試劑說明書中步驟及試劑使用量進行常規(guī)轉染:將6 μl脂質(zhì)體及20 pmol的復合物分別稀釋于250 μl的無血清培養(yǎng)基中,室溫靜置5 min后輕柔混勻,室溫靜置15 min后分別均勻加入各組培養(yǎng)板中,使復合物的終濃度為10 nmol/L,37℃溫箱中培養(yǎng)6 h后換為完全培養(yǎng)基常規(guī)培養(yǎng)。根據(jù)SU-DHL-2細胞不同處理因素進行分組,其中未經(jīng)轉染處理的細胞作為Blank組,轉染miRNA-34a mimics的細胞作為miRNA-34a過表達組,轉染FOXP1siRNA的細胞作為FOXP1基因沉默組,轉染一段無義序列的細胞作為陰性對照NC組,轉染后常規(guī)培養(yǎng)48 h。

        1.2.2 雙熒光素酶報告基因實驗 通過Targetscan、miRanda和miRDB生物信息數(shù)據(jù)庫分析和既往相關研究報道提示FOXP1的3'-UTR區(qū)是miRNA-34a結合靶位點之一。因此,本研究通過雙熒光素酶報告基因實驗驗證miRNA-34a對FOXP1野生型3'-UTR特異性結合的作用,將人胚腎細胞株293T根據(jù)實驗設計進行轉染分組,組1,轉染FOXP13'-UTR無義序列+miRNA無義序列;組2,轉染FOXP13'-UTR無義序列+miRNA-34a mimics;組3,轉染FOXP13'-UTR野生報告質(zhì)粒+miRNA無義序列;組4,轉染FOXP13'-UTR野生報告質(zhì)粒+miRNA-34a mimics;組5,轉染FOXP13'-UTR突變報告質(zhì)粒+miRNA無義序列;組6,轉染FOXP13'-UTR突變報告質(zhì)粒+miRNA-34a mimics。轉染后分別常規(guī)培養(yǎng)24 h,然后按照雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒(Promega)說明書步驟處理細胞,在多功能微孔板檢測儀上測定并分析結果。

        1.2.3 RT-PCR檢測miRNA-34a和FOXP1mRNA的相對表達量 分別取Blank組、NC組、50 nmol/L miRNA-34a過表達組、100 nmol/L miRNA-34a過表達組、50 nmol/LFOXP1基因沉默組、100 nmol/LFOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞。采用Trizol法分別提取各組細胞總RNA,并檢測其濃度及純度;按照逆轉錄試劑盒說明書反轉錄成cDNA,并以此為模板于ABI PRISM 7900HT型熒光定量PCR儀上行實時PCR反應,以U6和GAPDH為內(nèi)參。PCR反應體系4 μl,反應條件:95 ℃ 5 min,95 ℃10 s,60 ℃ 20 s,50個循環(huán);95 ℃ 10 s,60 ℃ 10 s,40 ℃ 30 s。采用2-ΔΔCt法檢測各組細胞miRNA-34a和FOXP1mRNA的相對表達量,實驗重復3次。引物序列見表1。

        表1 引物序列

        1.2.4 蛋白質(zhì)印跡法(Western blot)檢測FOXP1蛋白的相對表達量 分別取Blank組、NC組、50 nmol/L miRNA-34a過表達組、100 nmol/L miRNA-34a過表達組、50 nmol/LFOXP1基因沉默組、100 nmol/LFOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞。加入適量的放射免疫沉淀(radio-immunoprecipitation assay,RIPA)裂解液,提取總蛋白,Bradford法檢測蛋白濃度。取50 ng蛋白置于離心管中加入適量十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白,轉移至PVDF膜,TBST洗膜3次,5%脫脂牛奶封閉2 h,加入一抗(稀釋濃度為1∶1000)4℃過夜;TBST洗滌3次,加入二抗,室溫孵育2 h;化學發(fā)光顯色法顯影,以GAPDH為內(nèi)參,檢測各組細胞FOXP1蛋白的相對表達量,實驗重復3次。

        1.2.5 CCK8法檢測細胞增殖能力 選取Blank組、NC組及相對表達量較高的100 nmol/L miRNA-34a過表達組和FOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞進行檢測。以3×103/孔接種于96孔板,分別在0、24、48、72、96 h時加入10 μl的CCK8溶液,每組設置6個重復孔;37℃培養(yǎng)2 h后,使用多功能微孔板檢測儀檢測450 nm處各孔吸光度(optical density,OD)值,記錄結果并繪制細胞生長曲線。實驗重復3次。

        1.2.6 流式細胞儀檢測細胞凋亡情況 同增殖實驗選取Blank組、NC組及相對表達量較高的100 nmol/L miRNA-34a過表達組和FOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞進行檢測。采用預冷磷酸鹽緩沖液洗滌2次,加入結合緩沖液制成細胞懸液;按試劑盒說明書中建議的試劑體系用量依次加入膜聯(lián)蛋白V(AnnexinⅤ)、碘化丙啶(propidium iodide,PI)后輕輕混勻,室溫避光處孵育15 min,流式細胞儀檢測細胞凋亡情況,Cell Quest軟件進行結果分析。實驗重復3次。

        1.3 統(tǒng)計學方法

        采用SPSS 21.0軟件對所有數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,計量資料以均數(shù)±標準差(±s)表示,多組間比較采用單因素方差分析,兩組間比較采用t檢驗;以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 miRNA-34a的相對表達量的比較

        NC組和Blank組細胞中miRNA-34a相對表達量比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。50 nmol/L miRNA-34a過表達組和100 nmol/L miRNA-34a過表達組SU-DHL-2細胞中miRNA-34a的相對表達量均明顯高于Blank組和NC組細胞,其中100 nmol/L miRNA-34a過表達組SU-DHL-2細胞中miRNA-34a的相對表達量明顯高于50 nmol/L miRNA-34a過表達組細胞,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.01)。(表2)

        表2 各組SU-DHL-2細胞miRNA-34a相對表達量的比較(±s)

        表2 各組SU-DHL-2細胞miRNA-34a相對表達量的比較(±s)

        注:a與Blank組比較,P<0.01;b與NC組比較,P<0.01;c與50 nmol/L miRNA-34a過表達組比較,P<0.01

        組別Blank組NC組50 nmol/L miRNA-34a過表達組100 nmol/L miRNA-34a過表達組1.00±0.09 1.13±0.10 4.81±0.15a b 10.67±0.17a b c miRNA-34a相對表達量

        2.2 miRNA-34a過表達對SU-DHL-2細胞增殖和凋亡的影響

        研究發(fā)現(xiàn)隨著轉染時間的延長,miRNA-34a過表達組、NC組和Blank組SU-DHL-2細胞OD均逐漸升高,但轉染同一時間點3組SU-DHL-2細胞OD值比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)(表3)。miRNA-34a過表達組SU-DHL-2細胞凋亡率(32.76±0.19)%,明顯高于NC組細胞的(20.87±0.14)%,差異有統(tǒng)計學意義(t=81.597,P=0.000)(圖1)。

        表3 不同轉染時間各組SU-DHL-2細胞的OD值(±s)

        表3 不同轉染時間各組SU-DHL-2細胞的OD值(±s)

        轉染時間0 h 24 h 48 h 72 h 96 h 0.185±0.03 0.384±0.06 0.585±0.06 0.705±0.06 0.868±0.07 0.195±0.04 0.379±0.05 0.576±0.05 0.695±0.06 0.858±0.07 0.187±0.02 0.403±0.07 0.689±0.08 0.787±0.08 0.997±0.09 Blank組NC組miRNA-34a過表達組

        圖1 流式細胞儀檢測miRNA-34a過表達對SU-DHL-2細胞凋亡的影響

        2.3 miRNA-34a過表達對FOXP1mRNA和FOXP1蛋白表達的影響

        Blank組和NC組SU-DHL-2細胞中FOXP1mRNA和FOXP1蛋白相對表達量比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。miRNA-34a過表達組細胞FOXP1mRNA和FOXP1蛋白的相對表達量均明顯低于Blank組和NC組細胞,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.01)。(表4)

        表4 miRNA-34a過表達對FOXP1 mRNA和FOXP1蛋白表達的影響(±s)

        表4 miRNA-34a過表達對FOXP1 mRNA和FOXP1蛋白表達的影響(±s)

        注:a與Blank組比較,P<0.01;b與NC組比較,P<0.01

        組別Blank組NC組miRNA-34a過表達組1.00±0.08 0.98±0.08 0.25±0.06a b 1.02±0.10 0.94±0.09 0.18±0.04a b FOXP1 mRNA FOXP1蛋白

        2.4 雙熒光素酶報告基因檢測結果

        雙熒光素酶報告基因實驗驗證miRNA-34a對FOXP1野生型3'-UTR特異性結合的作用,結果顯示,組1的熒光素酶活性值為(1.00±0.03)與組2的(0.98±0.02)比較,差異無統(tǒng)計學差異(t=0.961,P=0.196);組3的熒光素酶活性值為(0.95±0.09),高于組 4的(0.28±0.02),差異有統(tǒng)計學意義(t=12.587,P=0.000);組5的熒光素酶活性值為(0.93±0.04)與組6的(0.99±0.04)比較,差異無統(tǒng)計學意義(t=1.837,P=0.070)。(圖2)

        圖2 FOXP13'-UTR 野生型熒光素酶質(zhì)粒轉染293T細胞圖(×200)

        2.5 FOXP1siRNA對FOXP1mRNA和FOXP1蛋白表達水平的影響

        Blank組與NC組細胞FOXP1mRNA及FOXP1蛋白的相對表達量比較,差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。50 nmol/LFOXP1基因沉默組和100 nmol/LFOXP1基因沉默組細胞FOXP1mRNA及FOXP1蛋白的相對表達量均明顯低于Blank組和NC組細胞,其中100 nmol/LFOXP1基因沉默組FOXP1mRNA及FOXP1蛋白的相對表達量,均明顯低于50 nmol/LFOXP1基因沉默組細胞,差異均有統(tǒng)計學意義(P<0.01)。(表5)

        2.6 FOXP1基因沉默對SU-DHL-2細胞增殖和凋亡的影響

        隨著轉染時間的延長,Blank組、NC組及FOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞OD值均逐漸升高,但相同轉染時間點3組細胞OD值比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)(表6);FOXP1基因沉默組SU-DHL-2細胞凋亡率(35.18±0.22)%,明顯高于NC組細胞的(21.98±0.16)%,差異有統(tǒng)計學意義(t=84.046,P=0.000)(圖3)。

        表5 FOXP1 siRNA對FOXP1 mRNA和FOXP1蛋白表達水平的影響(±s)

        表5 FOXP1 siRNA對FOXP1 mRNA和FOXP1蛋白表達水平的影響(±s)

        注:a與Blank組比較,P<0.01;b與NC組比較,P<0.01;c與50 nmol/L FOXP1基因沉默組比較,P<0.01

        組別Blank組NC組50 nmol/L FOXP1基因沉默組100 nmol/L FOXP1基因沉默組1.00±0.03 1.01±0.05 0.40±0.03a b 0.09±0.01a b c 0.98±0.03 0.87±0.05 0.31±0.06a b 0.13±0.04a b c FOXP1 mRNA FOXP1蛋白

        表6 CCK8法檢測轉染FOXP1 siRNA后SU-DHL-2細胞增殖情況(±s)

        表6 CCK8法檢測轉染FOXP1 siRNA后SU-DHL-2細胞增殖情況(±s)

        Blank組0.185±0.03 0.395±0.04 0.605±0.03 0.753±0.03 0.918±0.02 0 h 24 h 48 h 72 h 96 h 0.195±0.03 0.390±0.03 0.598±0.02 0.747±0.04 0.911±0.04 0.184±0.04 0.377±0.02 0.567±0.08 0.739±0.05 0.898±0.02轉染時間NC組FOXP1基因沉默組

        圖3 流式細胞儀檢測FOXP1siRNA對SU-DHL-2細胞凋亡的影響

        3 討論

        研究表明,細胞發(fā)生了非正常的增殖和凋亡是導致腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要原因之一[21]。由于DLBCL是一類在分子病理學、細胞遺傳學、臨床表現(xiàn)及預后等多個方面都具有高度異質(zhì)性的惡性腫瘤,多種因素、多種基因交互參與其中,因此,DLBCL發(fā)生發(fā)展過程中所涉及的分子機制仍不完全明確,有待于進行更深入的研究[22]。因此,進一步探索與DLBCL發(fā)生發(fā)展、臨床療效或預后相關的新的分子標志物、開發(fā)特異性治療靶點、優(yōu)化臨床治療策略,對患者進行預后分層及個體化治療,對改善臨床療效,提高患者的生存率有重要意義。

        既往研究表明,miRNA常通過與染色體脆性位點或與腫瘤相關的基因組區(qū)結合,起到調(diào)節(jié)靶基因轉錄后表達水平的作用[23]。Yu和Li[24]研究發(fā)現(xiàn),淋巴瘤患者存在明顯的miRNA表達失調(diào),表明miRNA對淋巴瘤的發(fā)生發(fā)展可能有重要作用。多項研究結果表明,miRNA-17-92、miRNA-21、miRNA-155等在DLBCL中高表達,直接參與了DLBCL的發(fā)生和發(fā)展過程[25-27]。miRNA可能作為分子標志物及個體化治療的潛在靶點,將對DLBCL的治療和預后評估產(chǎn)生重要影響。經(jīng)典抑癌基因p53的直接下游靶標miRNA-34a在ABC-DLBCL細胞中相對表達量很低,人為上調(diào)miRNA-34a的表達后可以誘導細胞凋亡和細胞周期停滯,但具體的分子機制仍不明確[28-29]。本研究將miRNA-34a mimics轉染至SU-DHL-2細胞,觀察miRNA-34a過表達對SU-DHL-2細胞增殖和凋亡的影響,結果顯示,miRNA-34a過表達組細胞的凋亡率高于NC組,人為上調(diào)miRNA-34a的表達后對SU-DHL-2細胞的增殖能力沒有影響,與以上結論相符。

        本研究結合既往研究結果及Targetscan、mi-Randa和miRDB三個生物學數(shù)據(jù)庫篩選出FOXP1作為進一步研究對象。Gascoyne和Banham[30]研究結果顯示,F(xiàn)OXP1基因表達失調(diào)在DLBCL的發(fā)病機制中可能發(fā)揮重要作用。但目前關于FOXP1在DLBCL中作用機制的研究報道較少。本研究通過雙熒光素酶報告基因檢測結果顯示,組3(轉染FOXP13'-UTR野生報告質(zhì)粒+miRNA無義序列)熒光素酶活性值高于組4(轉染FOXP1 3'-UTR野生報告質(zhì)粒+miRNA-34a mimics),差異有統(tǒng)計學意義(P<0.01),表明miRNA-34a過表達與FOXP13'-UTR(野生型)能夠特異性結合從而降低熒光素酶活性值,F(xiàn)OXP1是miRNA-34a直接調(diào)控的靶基因。通過進一步的RT-PCR和Western blot實驗結果顯示,與Blank組和NC組比較,miRNA-34a過表達組中FOXP1mRNA及FOXP1蛋白相對表達量均受到明顯抑制,表明miRNA-34a對FOXP1起到負調(diào)控作用,miRNA-34a過表達明顯抑制了SUDHL-2細胞FOXP1轉錄后的表達水平;這與其他多項研究結果相一致[20,31-33]。在進一步FOXP1基因沉默對SU-DHL-2細胞增殖和凋亡影響的研究中發(fā)現(xiàn),F(xiàn)OXP1基因沉默對SU-DHL-2細胞凋亡有明顯的促進作用,認為miRNA-34a可能通過負調(diào)控FOXP1的表達來促進SU-DHL-2細胞的凋亡,因此,敲除FOXP1可促進SU-DHL-2細胞的凋亡;而FOXP1基因沉默對SU-DHL-2細胞增殖無明顯影響。

        綜上所述,miRNA-34a抑制ABC-DLBCL細胞的發(fā)生發(fā)展可能與miRNA-34a通過結合FOXP13'-UTR有效抑制FOXP1蛋白表達進而促進細胞凋亡有關。本研究為DLBCL的基因個體化治療策略提供新的思路和方法,miRNA-34a或FOXP1相互作用可能成為治療DLBCL的新靶點。

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