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        2010~2017 年國(guó)內(nèi)豬嵴病毒感染情況調(diào)查匯總

        2020-07-22 10:30:00杜淑清徐國(guó)棟
        中獸醫(yī)學(xué)雜志 2020年1期
        關(guān)鍵詞:匯總原始數(shù)據(jù)豬群

        杜淑清 ,徐國(guó)棟 ,李 志 ,趙 斌

        (1.天津市農(nóng)業(yè)發(fā)展服務(wù)中心,天津300061;2.天津市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,天津300402;3.山東一起耕云農(nóng)業(yè)服務(wù)有限公司,山東濟(jì)南250101)

        嵴病毒(Kobuvirus, Kobu)屬小 RNA 病毒科嵴病毒屬,因病毒粒子在電鏡下呈崎嶇不平的嵴狀而得名,多種動(dòng)物中均可檢測(cè)到嵴病毒,自不同種類宿主分離的病毒被冠以不同的命名,豬嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)最初于2007 年在匈牙利健康豬糞便中被檢測(cè)到,2008 年首次證實(shí)國(guó)內(nèi)豬群糞便中存在PKV[1-4]。 筆者期望通過(guò)相關(guān)文獻(xiàn)的匯總統(tǒng)計(jì),明確國(guó)內(nèi)豬群中PKV 感染狀況。

        1 方法

        1.1 數(shù)據(jù)錄入方法

        下載中國(guó)知網(wǎng)中關(guān)于國(guó)內(nèi)豬群中PKV 核酸檢測(cè)的調(diào)查文獻(xiàn),剔除內(nèi)容重復(fù)的文獻(xiàn),按時(shí)間順序依次錄入被檢樣品相關(guān)信息:采樣時(shí)間(年份)、采樣地點(diǎn)(省份)、被檢豬群種類、被調(diào)查豬群是否腹瀉、被檢樣品種類、檢測(cè)方法、擴(kuò)增的目的基因、被檢樣品數(shù)量、樣品陽(yáng)性率。

        1.2 統(tǒng)計(jì)方法

        用Microsoft Office Excel 工作表錄入對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總,并匯總樣品陽(yáng)性結(jié)果、樣品相關(guān)信息頻次,對(duì)腹瀉豬和非腹瀉豬樣品累積陽(yáng)性率進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)差異比較。

        2 結(jié)果

        2.1 原始數(shù)據(jù)匯總結(jié)果

        共對(duì)遴選的 2010~2017 年間 19 篇[5-23]文獻(xiàn)進(jìn)行了原始數(shù)據(jù)整理,匯總得到35 條相關(guān)信息。

        2.2 被檢樣品屬性統(tǒng)計(jì)結(jié)果

        在 2010 ~2017 年的 11 個(gè)時(shí)間段中,以2011~2012 年、2012 年的檢測(cè)頻次較高,分別為28.57%(10/35)、14.29%(5/35),在時(shí)間上對(duì) PKV較高頻次的關(guān)注,恰恰與當(dāng)時(shí)全國(guó)范圍內(nèi)高病死率新生仔豬腹瀉的發(fā)生時(shí)間相吻合;除2 個(gè)信息條中采樣地點(diǎn)較模糊外,采樣頻次較高的省份有川(36.36% ;12/33)、 蘇(18.18% ;6/33)、 滬(15.15%;5/33)等;調(diào)查者多采用 RT-PCR(頻次為 77.14%,27/35)方法對(duì) PKV 3D 基因(85.71%,30/35)進(jìn)行檢測(cè),被檢樣品多采自腹瀉(頻次為82.86%,29/35)豬群,被檢豬群多為仔豬群(頻次為60%,21/35),被檢樣品以糞便、腸道和糞混合物(頻次為88.57%,31/35)所占頻次最高。

        2.3 陽(yáng)性樣品的統(tǒng)計(jì)

        2.3.1 樣品陽(yáng)性率的統(tǒng)計(jì)

        35 條信息中,樣品總體陽(yáng)性率區(qū)間在14.29%(1/7)~95.65%(22/23)間,總體平均陽(yáng)性率為 46.00%(2149/4672)。 表 1 匯總了各時(shí)間段內(nèi)被檢樣品數(shù)、陽(yáng)性樣品數(shù)及其陽(yáng)性率,在去除“2010-2012 年”時(shí)間段內(nèi)陽(yáng)性率數(shù)據(jù)后(因時(shí)間跨度大),10 個(gè)時(shí)間段內(nèi)的累積陽(yáng)性率區(qū)間在25.81%~73.43%間,平均陽(yáng)性率為 42.96%(1851/4309),除 2013-2014 年、2016-2017 年陽(yáng)性率較高外,總體趨勢(shì)在陽(yáng)性率40%上下波動(dòng),此外并無(wú)其它規(guī)律可循。

        2.3.2 腹瀉豬群和健康豬群樣品陽(yáng)性結(jié)果的差異比較

        因被檢樣品的5 類信息(豬群、是否腹瀉、樣品種類、檢測(cè)方法、擴(kuò)增基因)同質(zhì)性較高,故對(duì)采自腹瀉豬群、健康豬群的陽(yáng)性樣品是否存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異進(jìn)行卡方檢驗(yàn),原始數(shù)據(jù)見(jiàn)表2,經(jīng)檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量得 X2=7.05,由 EXCEL 函數(shù)“=CHIDIST(7.05,1)”得 P=0.008,因 P≤0.01,則腹瀉組和健康組的樣品陽(yáng)性存在極顯著差異,即取自腹瀉豬的樣品出現(xiàn)陽(yáng)性結(jié)果的可能性較大,與健康豬的陽(yáng)性率差別為9.64%。

        表1 各時(shí)間段內(nèi)被檢樣品的陽(yáng)性率匯總

        表2 腹瀉組和健康組樣品陽(yáng)性的實(shí)際觀察頻數(shù)

        3 討論

        2010~2017 年間,國(guó)內(nèi)豬群中采集的樣品總體平均陽(yáng)性率為46.00%(2149/4672),期間的10個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)中樣品累計(jì)陽(yáng)性率始終在40%上下,期間PKV 在豬群中的感染狀態(tài)較穩(wěn)定。 因腹瀉仔豬群樣品在累積樣品數(shù)量中所占比例較大(94.87%,3584/3778),推測(cè)國(guó)內(nèi)豬群中 PKV 的實(shí)際感染率應(yīng)低于46.00%。

        姬郭彪等[7]發(fā)現(xiàn)病豬樣品的陽(yáng)性率(80.0%,120/150) 低于健康豬樣品的陽(yáng)性率(95.7%,22/23),但多數(shù)調(diào)查者的調(diào)查結(jié)論是腹瀉豬樣品陽(yáng)性率高于健康豬樣品陽(yáng)性率,例如:王長(zhǎng)松[5]發(fā)現(xiàn)腹瀉仔豬樣品陽(yáng)性率為64.8%(59/91),而健康仔豬樣品陽(yáng)性率為19.8%(25/126),兩者存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;陳蕾[9]發(fā)現(xiàn)腹瀉豬樣品陽(yáng)性率為53.4%(87/163),而無(wú)腹瀉豬樣品陽(yáng)性率為 29.4%(15/51),兩者存在極顯著差異;梁丹潔[15]發(fā)現(xiàn)2012 年、2013 年間腹瀉豬樣品陽(yáng)性率分別為83.5%和 81.25%,高于非腹瀉豬的 17.3%和16.6%,但統(tǒng)計(jì)學(xué)差異不顯著;單玉平[16]也發(fā)現(xiàn)腹瀉豬樣品陽(yáng)性率(46.25%,296/640)高于非腹瀉豬(22.5%,72/320)。本文匯總統(tǒng)計(jì)的結(jié)果發(fā)現(xiàn):通過(guò)累加得到的腹瀉豬樣品陽(yáng)性率為49.33%(1768/3594),健 康 豬 的 樣 品 陽(yáng) 率 為 39.69%(77/194),陽(yáng)性率相差9.6%,統(tǒng)計(jì)學(xué)差異極顯著。多數(shù)研究結(jié)果認(rèn)為PKV 與新生仔豬腹瀉相關(guān),但國(guó)內(nèi)關(guān)于PKV 的調(diào)查較零散、省份范圍和樣品數(shù)量偏少,期望今后能有大樣本橫斷面調(diào)查結(jié)果,以指導(dǎo)養(yǎng)殖實(shí)踐。

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