文/謝開飛 通訊員 歐陽桂蓮
在現(xiàn)代遺傳學中,反向遺傳學被認為是一種不可或缺的工具,它徹底改變了人們對病毒發(fā)病機制和疫苗研發(fā)的認識。近日,一項來自瑞士的研究使用這一工具,依靠已知新冠病毒基因序列,在酵母菌中快速構(gòu)建出了活的新冠病毒。
研究人員認為,快速構(gòu)建出活的新冠病毒,可以成為向衛(wèi)生部門和實驗室提供傳染性病毒毒株的替代方法,從而爭取時間對疫情暴發(fā)做出快速反應。該研究中所用的反向遺傳學技術(shù)是什么?在生物科技領(lǐng)域有哪些應用?這種重建病毒的最新研究如何改變對疫苗研發(fā)的認識?
“一直以來,科學家們研究相關(guān)基因的功能,都是通過雜交等手段,觀察表型性狀的變化,從而研究遺傳基因的存在與變化,這種由表及里的研究方法稱為正向遺傳學?!睆B門大學國家傳染病診斷試劑與疫苗工程技術(shù)研究中心副教授程通告訴記者,如在醫(yī)學領(lǐng)域,可以觀察臨床病人病理組織和正常組織的不同表現(xiàn),從而探究產(chǎn)生這種表現(xiàn)變化的內(nèi)在原因。
隨著分子遺傳學及相關(guān)實驗技術(shù)的發(fā)展,科研人員已經(jīng)能夠有目的地對DNA進行重組或者定點突變。于是,在現(xiàn)代遺傳學中,就出現(xiàn)了另一條由里及表的認知路線。研究人員直接從生物自身基因出發(fā),通過對特定基因進行敲除、定點突變等人工操作后,觀察突變體表型與性狀變化,從而反推基因功能。由于該路線與正向遺傳學正好相反,所以這個新的遺傳學分支被稱為反向遺傳學,包括基因剔除技術(shù)、基因改造等研究。
相較于正向遺傳學來說,反向遺傳學有其獨特的優(yōu)勢。
此前,美國哈佛—麻省理工博德研究所科學家塞克·凱斯利森及其同事,就采用反向遺傳學方法,對10503個生活在巴基斯坦的人基因編碼區(qū)進行測序分析,識別出了約50000個突變。這種反向推定的技術(shù)路線,相當于高效收集了正向敲除1317個基因找到的結(jié)果,相較于傳統(tǒng)正向遺傳方法,極大地提高了效率。
“與滅活疫苗、減毒疫苗等經(jīng)典疫苗研發(fā)方法相比,反向遺傳學操作還具有減毒途徑明確、效率高、毒力回復率低等優(yōu)點,是疫苗研制的新方向?!背掏ㄕf。
目前,科研人員利用反向遺傳學技術(shù),已證實登革熱病毒、脊髓灰質(zhì)炎病毒、委內(nèi)瑞拉馬腦炎病毒和乙型腦炎病毒等一系列病毒的毒力相關(guān)位點,通過基因突變、缺失、重排等方法,都有可能獲得理想的減毒株來研制疫苗。
據(jù)介紹,基于反向遺傳學技術(shù)的疫苗研究,還可以發(fā)現(xiàn)在經(jīng)典疫苗研發(fā)過程中難以發(fā)現(xiàn)的“特殊”保護性抗原,為傳染性疾病的疫苗研制,以及發(fā)展新型多價或廣譜疫苗提供新的方向和思路。
在新冠病毒感染者病例已經(jīng)大規(guī)模出現(xiàn)的情況下,科學家們?yōu)槭裁催€要對其進行人工重建?程通表示,重建病毒將有助于人類了解病毒復制途徑,找到其“弱點”和藥物作用靶點,是研制病毒相關(guān)疫苗與治療藥物不可或缺的技術(shù)手段。
雖然新冠肺炎病例已大規(guī)模出現(xiàn),但不同地域毒株常存在差異性,且出于生物安全的考慮,無法在全球范圍內(nèi)任意運輸,導致眾多科研機構(gòu)因缺乏新冠病毒資源而難以快速鑒定病毒、驗證相關(guān)疫苗或治療藥物的有效性。
“新冠病毒重建技術(shù)的突破,使得處于不同國家與地區(qū)的科學家,能夠在各自所處的高等級生物安全實驗室內(nèi),借助大腸桿菌、酵母菌等基因工程常用微生物,合成當前數(shù)據(jù)庫里具有完整基因組序列的新冠病毒活毒株。”程通說,這有助于解決相關(guān)藥物評價的關(guān)鍵資源問題,將加快針對新冠病毒的檢測、治療和預防手段的研發(fā)。
另一方面,重建病毒還為發(fā)現(xiàn)毒力位點與作用機制等提供了工具。通過對新冠病毒進行基因敲除、改變以及其他加工修飾,研究這些基因改造對其致病性的影響,有助于深入了解病毒致病機制,發(fā)現(xiàn)可用作藥物靶點的新型毒力基因。
此外,通過給病毒加上熒光蛋白等可視化標記,還可實現(xiàn)病毒感染實時監(jiān)控,從而優(yōu)化現(xiàn)有新冠病毒的細胞與動物感染模型,為相關(guān)疫苗與藥物高通量快速篩選進一步提供方便。
目前,國內(nèi)外科研機構(gòu)在重建病毒過程中,尚無法脫離反向遺傳學范疇??蒲腥藛T大都是基于在大腸桿菌或酵母菌等基因工程類微生物內(nèi),克隆與改造病毒遺傳物質(zhì),然后將提純的病毒基因組轉(zhuǎn)運到宿主細胞中進行活病毒的組裝生產(chǎn)。
《科學》雜志曾經(jīng)報道的脊髓灰質(zhì)炎病毒重建,由科研人員使用無細胞體外系統(tǒng)完成。由于需要基于該病毒的基因組序列信息來進行實驗,當時就將其歸屬于一種特殊的反向遺傳學操作方式。
當前,反向遺傳學技術(shù)不僅在不同種類病毒研究上得到非常普遍的應用,而且在疫苗和藥物研發(fā)上也展現(xiàn)出重要的應用價值。
程通舉例說,基于反向遺傳學技術(shù)改造減毒活疫苗的研究,已在包括2009甲型H1N1流感病毒、登革熱病毒、禽流感病毒、水痘—帶狀皰疹病毒、單純皰疹病毒、人巨細胞病毒等多種病毒中取得重要進展。
其中,2009甲型H1N1減毒活疫苗已上市并廣泛接種,水痘—帶狀皰疹病毒、單純皰疹病毒、人巨細胞病毒和登革熱病毒等病毒的反向遺傳改造減毒活疫苗,已進入臨床試驗階段。
此外,基于反向遺傳學技術(shù)合成的減毒病毒載體或溶瘤病毒類藥物,已廣泛用于基因治療與腫瘤治療臨床研究。2015年,美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準首個溶瘤病毒類藥物T-VEC用于治療晚期黑色素瘤;2017年,美國杜克大學研發(fā)的溶瘤脊髓灰質(zhì)炎病毒,獲得了FDA的批準,用于治療神經(jīng)膠質(zhì)瘤。
除了用于重建病毒,反向遺傳學技術(shù)在細菌等其他微生物,以及植物相關(guān)研究上也有廣泛應用,并取得了較大進展。
“在細菌研究方面,反向遺傳學技術(shù)在B群腦膜炎球菌疫苗、肺炎鏈球菌多價疫苗、肺炎衣原體疫苗、炭疽桿菌疫苗等多種細菌性疾病疫苗的研制中,獲得了成功應用?!背掏ㄕf。其中,B群腦膜炎球菌通用疫苗的成功研制是運用反向遺傳學技術(shù)研發(fā)細菌疫苗的經(jīng)典案例。
B群腦膜炎球菌是流行性腦脊髓膜炎的病原菌,可導致兒童與青少年患急性化膿性腦膜炎和敗血癥。然而長期以來,科學家們應用傳統(tǒng)技術(shù)研制有效和廣譜的預防疫苗,一直無法獲得成功。
隨著基因組學和蛋白質(zhì)組學技術(shù)的進步,瑞士諾華公司的研究人員應用反向遺傳學技術(shù),通過分析B群腦膜炎球菌的全基因組,并進一步通過基因組序列比較和動物模型測試篩選,研制出多價B群腦膜炎球菌通用疫苗。
2013年,諾華公司重組B群腦膜炎球菌疫苗獲得歐盟批準上市,成為歐洲第一個獲得批準的預防B群腦膜炎球菌病的疫苗,并在控制B群腦膜炎球菌流行中被證明安全有效。
“需要特別指出,通過反向遺傳學技術(shù)重建病毒,是推進相關(guān)科學研究的有力工具,但這些實驗操作必須受到嚴格的監(jiān)管,需符合科學倫理,并嚴格限定在合格的生物安全實驗室中開展。”程通說。