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        基于GC/MS的皮膚T細(xì)胞淋巴瘤(CTCL)異種移植小鼠血漿和皮膚組織的代謝組學(xué)分析

        2020-06-17 03:03:54曹宜青沈小雁康宏艷樂云辰郁韻秋
        關(guān)鍵詞:血漿小鼠差異

        曹宜青 沈小雁 曹 涵 康宏艷 樂云辰 梁 棟 郁韻秋△

        (1復(fù)旦大學(xué)藥學(xué)院藥物分析教研室 上海 201203;2上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院瑞金醫(yī)院皮膚科 上海 200025;3無錫生物制劑(上海)有限公司 上海 201203)

        皮膚T 細(xì)胞淋巴瘤(cutaneous T-cell lymphoma,CTCL)是一種由T 淋巴細(xì)胞克隆浸潤引起,以皮膚病變?yōu)橹饕憩F(xiàn)的非霍奇金淋巴瘤。臨床上CTCL常見的亞型有蕈樣肉芽腫、Sezdry 綜合征和原發(fā)性皮膚外周 T 細(xì)胞淋巴瘤[1]。CTCL 的發(fā)病機(jī)制尚不明確,其臨床表型與炎癥性皮膚病相似,早期診斷困難[2]。目前CTCL 的主要診斷方式是組織病理學(xué)活檢、分子分析和外周血染色體檢查,缺少非侵入性檢查手段[3]。

        代謝組學(xué)是“組學(xué)領(lǐng)域”的重要組成部分,通過對(duì)生物體內(nèi)代謝物的定性和定量分析來尋找代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系[4]。近年來,多組學(xué)技術(shù)已被用于CTCL 的診斷,比如利用基因組學(xué)分析 診 斷 CTCL[5-6]。 LC/MS 和 GC/MS 是代 謝 組 學(xué)分析中應(yīng)用最廣泛的兩種分析方法,兩者識(shí)別出的差異代謝物既有區(qū)別又有聯(lián)系。我們基于GC/MS和LC/MS 對(duì)CTCL 人血樣進(jìn)行研究,結(jié)果顯示CTCL 的發(fā)病機(jī)制與磷脂異常有關(guān)[7],進(jìn)一步考慮進(jìn)行皮膚組織樣本的分析,但由于人病變組織不易獲得,因此本研究采用CTCL 荷瘤鼠的血漿和腫瘤組織分別進(jìn)行GC/MS 的代謝組學(xué)分析,并對(duì)LC/MS[8]和 GC/MS 找出的差異代謝物進(jìn)行對(duì)比、分析和關(guān)聯(lián),從而為進(jìn)一步研究CTCL 提供依據(jù)。

        材料和方法

        試劑和細(xì)胞甲醇、乙腈(HPLC 級(jí))、肝素鈉購自上海國藥控股化學(xué)試劑有限公司;正庚烷購自阿拉丁生化科技有限公司(上海);十三酸、吡啶(HPLC 級(jí))、甲氧基胺鹽酸鹽、N-甲基-N-(三甲基硅烷基)三氟乙酰胺(MSTFA)、三甲基氯硅烷(TMCS)、RPMI 1640 培養(yǎng)基(ATCC 302001)、HH細(xì)胞(T cell Lymphoma ATCC CRL-2105)、青霉素-鏈霉素溶液(SV30010,10 000 U/mL 青霉素:10 000 U/mL鏈霉素)、胎牛血清(F2442-500 mL)和二甲亞砜(色譜純)購自美國SigmaAldrich 公司。

        CTCL 異種移植小鼠HH 細(xì)胞培養(yǎng)和CTCL異種移植小鼠模型與本課題組前期研究[8]相同。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)均符合復(fù)旦大學(xué)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)倫理標(biāo)準(zhǔn)要求。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物合格證號(hào):倫藥批第(2018-12-YF-YYQ-01)號(hào)。對(duì)照組:健康小鼠(n=5);實(shí)驗(yàn)組:CTCL 荷瘤鼠(n=16)。取小鼠眼眶血,加肝素鈉抗凝,1 600×g離心10 min,留取血漿。

        HH 細(xì)胞皮下注射于雌性裸鼠的右側(cè)腋下,小鼠皮膚組織分別取自對(duì)照組小鼠的右腋下皮膚,實(shí)驗(yàn)組小鼠皮膚腫瘤組織近端(荷瘤鼠右腋下)、腫瘤組織遠(yuǎn)端(荷瘤鼠左腋下)和腫瘤組織。

        血漿處理取血漿50 μL 至離心管,室溫下解凍 15 min,加 200 μL 的-20 ℃ 甲醇(含 40 μg/mL 十三烷酸),渦旋 5 min,靜置 10 min,12 000×g下離心15 min,取上清液40 ℃下氮?dú)獯蹈桑瑲堄辔镅苌?2 000 ×g下離心 5 min,上清液轉(zhuǎn)至 GC/MS 進(jìn)行分析。

        組織處理向EP 管加入-20 ℃甲醇和小鼠組織(1 mg∶50 μL),渦旋5 min,超聲10 min,電子組織勻漿器(60 Hz,300 s)中勻漿,12 000×g下離心15 min,取 600 μL 上清,加入 400 μL 甲醇(40 μg/mL十三烷酸),渦旋5 min,靜置10 min,12 000×g下離心 15 min,取 900 μL 上清液 40 ℃下氮?dú)獯蹈?,衍生? h,12 000×g下離心 5 min,上清液轉(zhuǎn)至 GC/MS進(jìn)行分析。

        GC/MS 分析Agilent 7890B 氣相色譜儀(含7693 自動(dòng)進(jìn)樣器)和5977A 四極質(zhì)量分析儀。色譜柱:DB-5 MS 熔融石英毛細(xì)管柱(30 m×250 μm×0.25 μm,美國 Agilent 公司)。程序升溫:初始 70 ℃保持 3 min,之后 5 ℃/min 升至 300 ℃保持 5 min。氦氣載氣流量:1.2 mL/min;進(jìn)樣體積:1 μL;分流比:2∶1;入口溫度:300 ℃;界面溫度:280 ℃;離子源溫度:230 ℃。

        數(shù)據(jù)采集及處理通過MassHunter定性分析軟件(B.06.00)將原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為mzData 格式,轉(zhuǎn)換后的數(shù)據(jù)上傳到XCMS-Online(https://xcmsonline.scripps.edu)進(jìn)行數(shù)據(jù)過濾,峰對(duì)齊和保留時(shí)間校正。峰強(qiáng)度校正后,使用“80%規(guī)則”篩選數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)預(yù)處理 后 用 SIMCA 13(Umetrics,Sweden)進(jìn) 行 統(tǒng) 計(jì)分析。

        將篩選出的代謝物上傳至NIST 數(shù)據(jù)庫和人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB,http://www.hmdb.ca)進(jìn)行比對(duì),部分采用標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行結(jié)構(gòu)驗(yàn)證。使用熱圖(GraphPad)分析以觀察不同組之間差異代謝物的變化。通過Medcalc 軟件構(gòu)建接受者操作特征曲線(ROC)以評(píng)估差異代謝物的靈敏度和特異性。采用 MetaboAnalyst 3.0(http://www.metaboanalyst.ca/)進(jìn)行差異代謝物的代謝通路分析。

        結(jié) 果

        原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制和TIC 圖所有血漿樣品和組織樣品的保留時(shí)間偏差分別為4 s 和1.2 s,說明所采用的分析方法(包括色譜條件)具有良好的重現(xiàn)性(圖1、2)。原始數(shù)據(jù)包括含有1 704 個(gè)特征離子的21 個(gè)血漿樣本,含有1 016 個(gè)特征離子的50 個(gè)組織樣本,數(shù)據(jù)過濾后,得到1 047 個(gè)和653 個(gè)特征離子。

        圖1 對(duì)照組與CTCL 組小鼠血漿樣品和組織樣品的保留時(shí)間偏差Fig 1 Retention time deviation plots of plasma and tissue samples of mice in control group and CTCL group

        圖2 CTCL 組小鼠血漿和組織樣品的重疊TICFig 2 The overlapping TICs of plasma and tissue samples in mice of CTCL group

        數(shù)據(jù)的多變量統(tǒng)計(jì)分析在血漿樣品的CTCL組和對(duì)照組間,PCA 分離不明顯,其R2X=0.474,Q2=0.204(圖 3A);PLS-DA 分離明顯,其 R2X=0.314,R2Y=0.944,Q2=0.576(圖 3B);OPLS-DA 分離 明顯,其 R2X=0.630,R2Y=1.000,Q2=0.672(圖 3C)。200 次交叉排列驗(yàn)證結(jié)果表明,PLS-DA 分析模型具有可靠的預(yù)測能力(R2:0,0.809;Q2:0,-0.003 73)(圖3D)。

        圖3 對(duì)照組與CTCL 組小鼠血漿PCA、PLS-DA 及OPLS-DA 分析Fig 3 PCA,PLS-DA and OPLS-DA analysis of plasma of mice in control group and CTCL group

        在組織樣品中,PCA 顯示腫瘤組和其他3 組間有顯著差異(R2X=0.868,Q2=0.721),但是對(duì)照組與腫瘤組織遠(yuǎn)端(荷瘤鼠左腋下)間差異不大。為消除小鼠的個(gè)體差異,進(jìn)一步觀察CTCL 小鼠自身的腫瘤組織和腫瘤組織遠(yuǎn)端(荷瘤鼠左腋下)。PCA(R2X=0.748,Q2=0.618)、PLS-DA(R2X=0.531,R2Y=0.955,Q2=0.916)和 OPLS-DA(R2X=0.613,R2Y=0.977,Q2=0.939)的得分圖和擬合參數(shù)均顯示出腫瘤組織遠(yuǎn)端組和腫瘤組有明顯分離(圖4)。對(duì) PLS-DA 進(jìn)行 200 次交叉檢驗(yàn)驗(yàn)證,R2(0,0.350)和Q2(0,-0.304)表明該模型無過度擬合(圖4)。

        血漿和組織樣品中差異代謝物的篩選與結(jié)構(gòu)驗(yàn)證根據(jù)OPLS-DA 模型中的VIP值,t檢驗(yàn)的P值和FC值(VIP≥1,P≤0.05 和FC≥1.5)選擇差異代謝物(表1、2)。在血漿樣品中共有29 種差異代謝物(其中兩種在HMDB 中不存在),21 種經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)品得以驗(yàn)證,在組織樣品中共有33 種差異代謝物(其中一種在HMDB 中不存在),25 種經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)品得以驗(yàn)證。其中13 種差異代謝物(L-纈氨酸,L-絲氨酸,L-亮氨酸,甘油,L-異亮氨酸,L-苯丙氨酸,3-磷酸甘油,D-葡萄糖,阿拉伯糖,肌醇,亞油酸,硬脂酸,膽固醇)同時(shí)存在于血漿和組織樣品中(圖5)。

        在血漿樣品中CTCL 組的乳酸和大部分氨基酸增加;油酸、硬脂酸、1-十六烷酸酯甘油和膽固醇明顯減少(圖6)。在組織樣品中腫瘤組的3-磷酸甘油,鄰磷酸乙醇胺和L-天冬氨酸顯著增加;大部分氨基酸含量減少(圖7)。

        血漿和組織樣品中差異代謝物的ROC 分析對(duì) 62 種差異代謝物作 ROC 分析(表3、4):在血漿樣品中,肉豆蔻酸的AUC 值為1,表明肉豆蔻酸具有最高的特異性和靈敏度(圖8);在組織樣品中,多種差異代謝物的AUC 值為1(圖9)。

        圖4 CTCL 小鼠自身的腫瘤組織和腫瘤組織遠(yuǎn)端的PCA、PLS-DA 及OPLS-DA 分析Fig 4 PCA,PLS-DA and OPLS-DA analysis of tumor tissue and tumor tissue distal end in CTCL mice

        圖5 CTCL 小鼠血漿樣品和腫瘤組織樣品中檢測到的差異代謝物數(shù)據(jù)的Venn 圖Fig 5 Venn diagrams presenting data for differential metabolites detected in plasma samples and tumor tissue samples of CTCL mice detected by GC/MS and LC/MS respectively

        血漿和組織樣品中差異代謝物的Pathway 分析支鏈氨基酸(BCAA)和甘油磷脂代謝被認(rèn)為是血漿和組織樣品中最相關(guān)的代謝途徑(圖10)。

        討 論

        多平臺(tái)多樣本數(shù)據(jù)相互補(bǔ)充和印證GC/MS和LC/MS 是目前代謝組學(xué)分析的主流技術(shù)平臺(tái)。本研究采用GC/MS 分析平臺(tái),對(duì)CTCL 荷瘤鼠的血漿和腫瘤組織樣品進(jìn)行代謝組學(xué)分析,并將研究結(jié)果和課題組之前的研究結(jié)果[8]進(jìn)行比較(圖5),結(jié)果表明:血漿中的膽固醇同時(shí)在LC/MS 和GC/MS中出現(xiàn),腫瘤組織中黃嘌呤和7 種氨基酸(L-天冬酰胺、L-賴氨酸、L-苯丙氨酸、L-酪氨酸、L-色氨酸、L-亮氨酸、L-谷氨酸)同時(shí)在 LC/MS 和 GC/MS 分析平臺(tái)中出現(xiàn)。LC/MS 和GC/MS 兩種分析平臺(tái)對(duì)該類差異代謝物的分析均能達(dá)到較高的靈敏度,表明這兩種分析方法不僅可以互補(bǔ),還可以進(jìn)行有效的相互驗(yàn)證。此外,由于代謝組學(xué)涉及的化合物性質(zhì)差異較大,不同的分析平臺(tái)檢出的種類不同,如GC/MS 可檢出乳酸和葡萄糖,LC/MS 可檢出PC類和MG 類,采用多平臺(tái)技術(shù)可以增加差異代謝物的覆蓋面,因此在以后的研究中可以考慮將兩種分析方法結(jié)合以獲得更多的信息。

        表1 通過GC/MS 篩選出對(duì)照組與CTCL 組小鼠血漿樣品中的差異代謝物Tab 1 Identification of differential metabolites among the plasma samples of mice in control group and CTCL group by GC/MS

        由于代謝途徑不同,在血漿和腫瘤組織中會(huì)出現(xiàn)不同的差異代謝物,我們又將血漿和腫瘤組織樣品的分析結(jié)果進(jìn)行了比較,共同差異代謝物有13種,分別占血漿差異代謝物和腫瘤組織差異代謝物的48.3% 和42.3%;涉及的共同通路有BCAA 代謝、半乳糖代謝、亞油酸通路和甘油磷脂代謝。說明血漿和腫瘤組織樣品不僅可以單獨(dú)反映CTCL的局部代謝,兩種樣品之間的差異代謝物還較為相關(guān)。不同樣本得到的差異代謝物在種類和數(shù)量上不完全相同,如在GC/MS 平臺(tái)中單甘脂和棕櫚酸等15 種差異代謝物只在血漿樣本中出現(xiàn),尿酸和磷酸乙醇胺等19 種差異代謝物只在腫瘤組織樣本中出現(xiàn)。

        表2 通過GC/MS 篩選出CTCL 小鼠自身的腫瘤組織和腫瘤組織遠(yuǎn)端樣品中的差異代謝物Tab 2 Identification of differential metabolites among tumor tissue samples and tumor tissue distal end samples in CTCL mice by GC/MS

        CTCL 小鼠血漿和腫瘤組織中BCAA 異常BCAA(包括纈氨酸,亮氨酸和異亮氨酸)在血漿中上調(diào)并在腫瘤組織中下調(diào),這表明BCAA 在CTCL的惡性T 細(xì)胞增殖過程中被轉(zhuǎn)運(yùn)和消耗,以適應(yīng)更高的蛋白質(zhì)合成速率。異常BCAA 是CTCL 小鼠血漿和腫瘤組織最重要的代謝特征。

        圖6 對(duì)照組與CTCL 組小鼠血漿樣品中代謝物的熱圖分析Fig 6 Heatmap of metabolites in plasma samples of mice in control group and CTCL group

        圖7 CTCL 小鼠自身的腫瘤組織和腫瘤組織遠(yuǎn)端組中代謝物的熱圖Fig 7 Heatmap of metabolites in tumor tissue group and tumor tissue distal end group in CTCL mice

        表3 對(duì)照組和CTCL 組小鼠血漿樣品中差異代謝物的ROC 數(shù)據(jù)Tab 3 ROC results for differential metabolites in plasma samples of mice in control group and CTCL group

        圖8 對(duì)照組與CTCL 組小鼠血漿樣品中部分AUC >0.9 的差異代謝物的ROCFig 8 The ROC of differential metabolites with AUC >0.9 in plasma samples of mice in control group and CTCL group

        圖9 CTCL 小鼠自身的腫瘤組織和腫瘤組織遠(yuǎn)端組樣品中部分AUC>0.9 的差異代謝物的ROCFig 9 The ROC of differential metabolites with AUC >0.9 in CTCL mice of tumor tissue and tumor tissue distal end

        BCAA(尤其是亮氨酸)可通過激活 mTORC1[9]刺激骨骼肌蛋白形成。同時(shí)亮氨酸會(huì)降低AMP 激酶(AMPK)活性,從而引發(fā)胰島素抵抗和癌癥[10]。在本研究中,亮氨酸在血漿中明顯升高,在組織中明顯減少,表明BCAA 可能激活mTORC1 并引發(fā)CTCL(圖11)。

        CTCL 小鼠血漿和腫瘤組織中3-磷酸甘油上調(diào)血漿和腫瘤組織中增加的3-磷酸甘油可能導(dǎo)致細(xì)胞膜降解或惡性T 細(xì)胞形態(tài)變化。小鼠血漿中3-磷酸甘油的升高與課題組之前的研究結(jié)果[8]相一致。

        CTCL 小鼠血漿中葡萄糖上調(diào)體內(nèi)葡萄糖含量也會(huì)影響mTORC1[10]的活性。血漿中葡萄糖的升高會(huì)抑制AMPK 通路,從而減輕TCS1/TSC2 復(fù)合物的抑制功能并激活mTORC1[11]。同樣,葡萄糖也可以通過降低亮氨酸等AMPK 激酶的活性來激活mTORC1[12]。在本研究中,血漿中葡萄糖含量增加,意味著葡萄糖激活mTORC1,同時(shí)參與癌細(xì)胞的Warburg 效應(yīng),而血漿中乳酸含量增加也驗(yàn)證了這一點(diǎn)[13];腫瘤組織中葡萄糖含量降低,可認(rèn)為葡萄糖通過糖酵解被消耗并轉(zhuǎn)化為乳酸(圖11)。

        圖11 基于CTCL 小鼠血漿和腫瘤組織中BCAA 異常假設(shè)的CTCL 小鼠代謝通路Fig 11 Hypothetical metabolic pathways based on BCAA abnormalities in plasma and tumor tissues of CTCL mice

        CTCL 小鼠血漿o-磷酸乙醇胺被降解我們之前的研究已顯示:組織中鞘氨醇-1-磷酸酯(S1P)增加會(huì)促使磷酸戊糖途徑與核苷酸代謝相互作用,且與CTCL 腫瘤組織大小顯著相關(guān)(Pearson 相關(guān)系數(shù)ρ=0.64)[8]。本研究顯示,血漿中 S1P 降解的 o-磷酸乙醇胺含量也增加,不同樣本(血漿和皮膚)的研究結(jié)果表明S1P 和o-磷酸乙醇胺的異??赡芘cCTCL關(guān)系密切。

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