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        聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)建立巴爾通體的檢測鑒定方法 并用于診斷臨床疑似貓抓病合并雙側(cè)支氣管肺炎患者分析

        2020-06-08 15:50:18賈鵬霞程江

        賈鵬霞 程江

        【摘要】目的 探討用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)建立巴爾通體的檢測鑒定方法并用于診斷臨床疑似貓抓病合并雙側(cè)支氣管肺炎患者的價值。方法 依據(jù)16S-23SrRNA ITS基因序列長于其他細(xì)菌,且此段基因序列當(dāng)中的tRNAIle-tRNAAla基因間隔區(qū)的變異性高,而在巴爾通體屬當(dāng)中,tRNAIle、tRNAAla基因序列完全保守;此外,利用兩對引物對一例可疑貓抓病患者的全血基因組DNA進行直接擴增。結(jié)果 通過開展序列分析得知,設(shè)計引物TIle.455p~TAla.885n擴增產(chǎn)物核昔酸序列一致于巴爾通體一分離株對應(yīng)位置,同源性達到100%。結(jié)論 在血液中采用PCR技術(shù)實施直接擴增特異基因片段,能夠?qū)Π蜖柾w感染進行快速檢測。

        【關(guān)鍵詞】聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù);巴爾通體;貓抓病;雙側(cè)支氣管肺炎

        【中圖分類號】R446 【文獻標(biāo)識碼】A 【文章編號】ISSN.2095.6681.2020.8..01

        巴爾通體實為一群氧化酶呈陰性,革蘭染色呈陰性,其不僅能誘發(fā)戰(zhàn)壕熱病,還能引起巴爾通體?。–arrion)、貓抓?。–SD)等[1-2]。本文構(gòu)建基于聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)的巴爾通體感染檢測方法,對1例發(fā)熱肺炎患者的全血DNA進行檢測,并從中將巴爾通體特異基因片段擴增出來,現(xiàn)對此分析如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        患者,男,48歲,在此次發(fā)病前,有典型的貓抓傷史;咳嗽、發(fā)熱、胸痛為其典型臨床表現(xiàn);而經(jīng)查體得知,貓抓傷側(cè)的腋窩以及腹股溝淋巴結(jié)均存在腫大情況,且肝脾也存在腫大情況。

        1.2 陽性對照菌株

        本文所選用巴爾通體菌株TR222SM、RT221SM、RT225SM分離,都為鼠類動物血液,且均經(jīng)中國疾預(yù)防控制中心用PCR及測序技術(shù)明確為巴爾通體。

        1.3 提取全血DNA

        取600 ?L血,加入到濃度為1%的SDS中,蛋白酶K(20 mg/mL)濃度0.2 mg/mL,RNase濃度為57 ?g/mL,充分混勻,水?。?5℃),分別用氯仿、飽和酚進行數(shù)次抽提,取上清液,離心處理(12000 r/min),將管中液體舍去,利用1 mL濃度為70%的乙醇對DNA進行清洗,沉淀二次,再離心10分鐘,于-20℃保存。

        1.4 引物

        查找巴爾通體16S~23SrRNA基因間隔區(qū)(ITS)序列,借助DNAsis序列分析軟件,開展多序列比較,設(shè)計引物TIle.455p~TAla.885n擴增16S~23SrRNA ITSs當(dāng)中的tRNAIle與tRNAAla基因間隔區(qū)序列,擴增片段最小為300 bp,最大為500bp。

        1.5 PCR反應(yīng)及產(chǎn)物檢測

        在模板DNA中加入1?l的反應(yīng)體系,以及1.5 ?L的Taq DNA聚合酶、1 ?L的引物、2 ?L的dNTP,另將適量離子水加入,使總量達25 ?L,采用PCR基因擴增儀(Robocycler Gradient 40型)。取擴增產(chǎn)物5 ?L,將電泳載樣液1 ?L加入,另將瓊脂糖電泳(1%)加入,時間為40分鐘,紫外線燈照射,且進行拍照。

        2 結(jié) 果

        2.1 PCR結(jié)果

        將全血基因組DNA作為模板,三對引物都擴增出陽性產(chǎn)物,而對于陽性對照,都擴增出特異基因片段,另外,空白對照都沒有擴增帶。針對引物BhCS.781~bhCS.1137n,其擴增出gltA基因380 bp片段;而對于引物Bh.311p~Bh.452n而言,其擴增出16S~23SrRNA ITSN'末端163bp片段;在本次研究當(dāng)中,共擴增出片段451bp,與巴爾通體tRNAIle-tRNAAla基因間隔區(qū)預(yù)測帶的大小相符。

        2.2 核苷酸測序結(jié)果

        引物Tile.455p~TAla.885n PCR擴增產(chǎn)物測序結(jié)果為,序列的長度為451bp,其中,針對1~75bp,其實為3'-端tRNAIle基因序列;而對于76~410bp,其則為tRNAIle-tRNAAla基因序列。通過開展序列分析得知,設(shè)計引物TIle.455p~TAla.885n擴增產(chǎn)物核昔酸序列一致于巴爾通體一分離株對應(yīng)位置,同源性達到100%。

        3 討 論

        巴爾通體屬布魯氏菌、根瘤菌目、α亞群及變形菌綱等高同源性?,F(xiàn)階段,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)19種巴爾通體,其中,多達7種能夠引發(fā)人類疾病,如漢賽、五日熱、桿菌樣等[3]。伴隨當(dāng)今分子生物學(xué)及細(xì)菌分子遺傳學(xué)檢測方法的持續(xù)更新與完善,許多致病巴爾通體所造成的不良預(yù)后被發(fā)現(xiàn)且明確,人們對此種病原微生物所開展的研究日漸增多且深入。近年,伴隨序列測定技術(shù)及PCR技術(shù)的不斷發(fā)展,以及其在病原體檢測中的不斷應(yīng)用,其為致病微生物鑒定,提供了一種實用且高效的手段。針對引物引物BhCS.781-bhCS.1137n而言,其能夠擴增各種巴爾通體片段,而且還能實現(xiàn)與巴爾通體之間有較高同源性的根癌土壤桿菌等無擴增產(chǎn)物的擴增,因而是一種水平特異性。從本文研究結(jié)果可知,在血液中采用PCR技術(shù)實施直接擴增特異基因片段,可以對巴爾通體感染進行準(zhǔn)確且快速的檢測。

        參考文獻

        [1] 葉 曦,姚美琳,李國偉.巴爾通體實驗檢測技術(shù)簡介[J].中國人獸共患病學(xué)報,2017,23(11):1160-1162.

        [2] 王 琪.貓抓病2例臨床病理分析[J].中國基層醫(yī)藥,2017,16(9):1577-1578.

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