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        伯氏疏螺旋體套式PCR檢測方法建立及應(yīng)用

        2020-06-08 03:33:20王婭劉麗婭謝彩云馬曉菁葉鋒谷文喜馬俊杰鐘旗易新萍
        畜牧與獸醫(yī) 2020年6期
        關(guān)鍵詞:新疆標(biāo)準(zhǔn)檢測

        王婭,劉麗婭,謝彩云,馬曉菁,葉鋒,谷文喜,馬俊杰,鐘旗,易新萍*

        (1. 新疆畜牧科學(xué)院獸醫(yī)研究所/新疆畜牧科學(xué)院動(dòng)物臨床醫(yī)學(xué)研究中心,新疆 烏魯木齊 830000;2. 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,新疆 烏魯木齊 830000)

        萊姆病是一種由伯氏疏螺旋體(Borreliaburgdorferi)感染引起,經(jīng)硬蜱叮咬吸血時(shí)進(jìn)行傳播的自然疫源性人畜共患病[1]??汕趾θ梭w多系統(tǒng)及臟器,臨床表現(xiàn)多樣化。該病分布廣、傳播快、致殘率高,近年來疫源地及發(fā)病率均呈現(xiàn)出擴(kuò)大和上升趨勢,已成為嚴(yán)重的世界性公共衛(wèi)生問題[2-3]。

        收稿日期:2019-08-29;修回日期:2020-04-07

        基金項(xiàng)目:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2017YFC1200500)

        第一作者:王婭(1997-),女,碩士研究生;劉麗婭(1984-),女,碩士,副研究員。#共同第一作者

        *通信作者:易新萍,研究員,研究方向?yàn)閯?dòng)物傳染病,E-mail:821489803@qq.com。

        新疆的氣候條件、植被資源為蜱蟲的孕育及蜱傳疫病的傳播提供了良好的生態(tài)條件,是我國萊姆病的重要疫區(qū)[4]。據(jù)報(bào)道至少能在 35 種蜱和少數(shù)吸血蚊、蠅、虻、螨、蚤類體內(nèi)分離到萊姆病螺旋體,但具有保持和傳播萊姆病螺旋體能力的只有硬蜱類[5]。本研究選擇伯氏疏螺旋體5S-23S rRNA基因間隔區(qū)設(shè)計(jì)特異性引物,建立萊姆病套式PCR檢測方法,對2018—2019年采集的硬蜱樣本進(jìn)行檢測,以此來了解新疆北疆地區(qū)硬蜱攜帶伯氏疏螺旋體的流行現(xiàn)狀,以期為疫病的防控提供數(shù)據(jù)參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株

        伯氏疏螺旋體B31標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC35210)、大腸桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(CVCC1531)、沙門菌標(biāo)準(zhǔn)株(CVCC3762)、鉤端螺線體基因組DNA(DSM21537)均由新疆畜牧科學(xué)院獸醫(yī)研究所保存。

        1.1.2 試劑

        PCR Mix,北京莊盟生物技術(shù)有限公司;1×PBS稀釋液、TE稀釋液、DNA Marker,上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,天根生化科技有限公司;BSK培養(yǎng)基,美國Sigma公司;LB培養(yǎng)基,北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司。

        1.2 方法

        1.2.1 對照樣品DNA的提取

        將伯氏疏螺旋體B31標(biāo)準(zhǔn)株、金黃色葡萄球菌、大腸桿菌進(jìn)行培養(yǎng)后,按細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒操作說明分別提取DNA。

        1.2.2 套氏PCR檢測方法

        1.2.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成

        在伯氏疏螺旋體5S-23S rRNA基因(GenBank登錄號(hào)JX564636.1)間隔區(qū)設(shè)計(jì)套式PCR引物,并委托昆泰銳生物技術(shù)有限責(zé)任公司合成,引物序列見表1。

        表1 5S-23S rRNA間隔區(qū)套式PCR引物序列

        名稱引物序列(5'→3')退火溫度/℃片段大小/bp23SN1ACCATAGACTCTTACTTTGAC23SC1TAAGCTGACTAATACTAATTACCC5538023SN2ACCATAGACTCTTATTACTTTGACCA5SCBGAGAGTAGGTTATTGCCAGGG62225

        1.2.2.2 反應(yīng)體系

        進(jìn)行2輪PCR反應(yīng),每輪體系均為25 μL:包括2×TaqMasterMix 12.5 μL,上下游引物(10 μmol/L)各1 μL,雙蒸水8.5 μL,第1輪模板為2 μL,第2輪模板為第1輪PCR產(chǎn)物2 μL。

        1.2.2.3 反應(yīng)條件

        第1輪PCR使用引物為23SN1和23SC1,擴(kuò)增程序如下:94 ℃預(yù)變性10 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);再72 ℃延伸10 min,16 ℃終止反應(yīng)。第2輪PCR使用引物為23SN2和5SCB,擴(kuò)增程序如下:94 ℃預(yù)變性10 min;94 ℃變性30 s,62 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,40個(gè)循環(huán);再72 ℃延伸10 min,16 ℃終止反應(yīng)。

        1.2.2.4 產(chǎn)物檢測

        用TAE電泳稀釋液配置1%瓊脂凝膠,取5 μL套式PCR擴(kuò)增產(chǎn)物分別加入樣品孔,以100 V恒壓電泳,采用凝膠成像系統(tǒng)拍照,陽性可見約為225 bp左右的條帶。

        1.2.2.5 敏感性試驗(yàn)

        將提取的伯氏疏螺旋體B31標(biāo)準(zhǔn)株DNA應(yīng)用分光光度計(jì)進(jìn)行含量測定,稀釋至1 ng/μL后進(jìn)行10倍系列稀釋,濃度分別為10-1、10-2、10-3、10-4ng/μL,取2 μL為模板進(jìn)行套式PCR 擴(kuò)增,以檢測其敏感性。

        1.2.2.6 特異性試驗(yàn)

        以金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、鉤端螺旋體、伯氏疏螺旋體B31標(biāo)準(zhǔn)株DNA為模板,進(jìn)行套式 PCR 擴(kuò)增以檢測其特異性。

        1.2.3 檢測蜱蟲樣本DNA提取

        在新疆伊犁地區(qū)、阿拉山口、呼圖壁縣、青河縣、福??h和五家渠縣采集游離蜱和吸血蜱共534只。將蜱浸泡于75%酒精中15 min,再用1×PBS稀釋液或生理鹽水清洗3次,放置于干凈的濾紙上吸水干燥。干燥后用鑷子將蜱夾放在無菌載玻片上縱切,加適量TE進(jìn)行研磨,煮沸10 min,8 000 r/min離心5 min后取上清,保存于-20 ℃用于檢測。

        2 結(jié)果

        2.1 套氏PCR敏感性及特異性

        2.1.1 敏感性

        應(yīng)用建立的套式PCR檢測方法,對稀釋后的伯氏疏螺旋體B31標(biāo)準(zhǔn)株DNA進(jìn)行擴(kuò)增,電泳后檢測,其檢測限約為1.0×10-3ng/μL,結(jié)果如圖1所示。

        2.1.2 特異性

        應(yīng)用建立的套式PCR檢測方法,以伯氏疏螺旋體標(biāo)準(zhǔn)菌株B31和金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、鉤端螺旋體的DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,電泳后顯示,除伯氏疏螺旋體標(biāo)準(zhǔn)菌株B31擴(kuò)增出225 bp大小的目的條帶,其他未見條帶,結(jié)果如圖2所示。

        2.2 螺旋體的檢測

        應(yīng)用建立的套式PCR檢測方法,對在新疆北疆6個(gè)地區(qū)采集的534只硬蜱進(jìn)行檢測,共檢出81份陽性,總陽性率為15.17%。其中青河縣檢測蜱110只,陽性26只,陽性率最高為23.64%;福海縣檢測蜱18只,全為陰性;其余地區(qū)陽性率由高到低依次為呼圖壁縣22.73%、阿拉山口市18.06%、伊犁地區(qū)17.75%、五家渠縣2.5%,具體結(jié)果見表2、圖3。

        M.DL2000 DNA Marker;1.陰性對照;2~7.伯氏疏螺旋體標(biāo)準(zhǔn)菌株B31陽性質(zhì)粒陽性對照(1 ng/μL)、100、10-1、10-2、10-3、10-4ng/μL

        圖1 套式PCR敏感性檢測

        M. DL2000 DNA Marker;1.伯氏疏螺旋體標(biāo)準(zhǔn)菌株B31;2.金黃色葡萄球菌;3.大腸桿菌;4.沙門菌;5.鉤端螺旋體

        圖2 套式PCR特異性檢測

        表2 蜱樣本巢氏PCR 檢測結(jié)果

        采樣地檢測數(shù)陽性數(shù)陽性率/%伊犁地區(qū)4縣市1602213.75阿拉山口市1442618.06呼圖壁縣22522.73青河縣1102623.64福海縣1800.00五家渠縣8022.50總 計(jì)5348115.17

        M. DL2000 DNA Marker;1.伯氏疏螺旋體標(biāo)準(zhǔn)菌株B31;2.陰性對照;3~17.檢測蜱樣本

        圖3 部分蜱樣本套式PCR檢測結(jié)果

        3 討論

        萊姆病診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”是從樣本中分離出伯氏疏螺旋體,但其體外分離培養(yǎng)難度大,耗時(shí)長、成本高、易污染,且分離率較低。血清學(xué)檢測方法敏感性和靈敏性又不高,因而分子生物學(xué)檢測方法越來越多的被應(yīng)用于萊姆病的檢測。套式PCR(Nested-PCR)是一種普通PCR的優(yōu)化模式,原理是設(shè)計(jì)2對引物,第2對引物在第1對引物的內(nèi)部,將第1輪PCR的產(chǎn)物作為第2輪PCR的模板進(jìn)行擴(kuò)增[6]。其敏感度和特異性均高于普通PCR,被認(rèn)為是臨床檢測螺旋體菌屬最敏感的方法之一[7]。本研究選擇伯氏疏螺旋體5S-23S rRNA基因間隔區(qū)成功設(shè)計(jì)嵌套式引物,以此為基礎(chǔ)建立了套式PCR檢測體系,評估了該方法的敏感性和特異性,并成功應(yīng)用于檢測臨床樣本。

        自1987年以來,新疆已先后被證實(shí)存在多個(gè)萊姆病自然疫源地[8-10]。萊姆病通過蜱作為媒介進(jìn)行傳播,要深入地探討萊姆病的發(fā)生與傳播的機(jī)制,首先需要了解各地蜱伯氏疏螺旋體的帶菌情況。本研究對新疆北疆6個(gè)地區(qū)采集的硬蜱攜帶伯氏疏螺旋體流行現(xiàn)狀進(jìn)行調(diào)查,結(jié)果顯示6個(gè)地區(qū)硬蜱伯氏疏螺旋體平均攜帶率為15.17%。其中青河縣最高,達(dá)23.64%,福海縣未檢測到。不同地區(qū)間存在差別,與采集的樣本數(shù)量有關(guān),也可能與采集區(qū)域是否是疫源地或萊姆病高發(fā)區(qū)有關(guān)[11]。

        牛、羊、犬、兔、鹿和鼠等動(dòng)物均可感染萊姆病,又通過蜱叮咬后傳播給人,該病對人類健康和畜牧業(yè)發(fā)展已構(gòu)成極大危害。鑒于此次調(diào)查得知新疆北疆地區(qū)蜱萊姆病伯氏疏螺旋體攜帶率較高,應(yīng)加強(qiáng)萊姆病的防控工作,長期開展蜱蟲分布及蜱傳疫病檢測監(jiān)測,了解其傳播和流行風(fēng)險(xiǎn),及時(shí)預(yù)警預(yù)報(bào)。同時(shí),應(yīng)做好滅蜱工作,對長期在野外、戶外及蜱棲息地、萊姆病疫源地停留的人員,要加強(qiáng)萊姆病防控知識(shí)的科普宣傳,提高自我防護(hù)意識(shí)。

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