周玉平,呂雪幼,楊 萍 ,溫晉鋒,王慶領,葉國良
(寧波大學 1醫(yī)學院附屬醫(yī)院,2消化疾病研究所,浙江寧波315020;3寧波衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學院,浙江寧波315100;4寧波大學醫(yī)學院,浙江寧波315211)
環(huán)狀 RNA(circular RNA,circRNA)是非編碼RNA研究領域的最新焦點之一,在闡明疾病發(fā)病機制及相關的診斷標志物及治療靶點方面,取得了重大進展[1]。本課題組通過基因芯片技術(shù)初步分析了肝纖維化模型小鼠肝臟的circRNA表達譜變化,顯示mmu_circ_42398的表達變化差異最大(模型組比正常組降低了11.74倍),此外,在小鼠肝星狀細胞(hepatic stellate cells,HSC)活化模型中,mmu-circ-42398表達也顯著降低的[2]。本研究擬在此基礎上,圍繞肝星狀細胞活化這一肝纖維化最核心的細胞生物學事件,探討mmu_circ_42398對HSC活化的影響,并初步探討其可能的細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導機制。
JS1小鼠肝星狀細胞株購自深圳豪地華拓生物公司。胎牛血清和細胞培養(yǎng)液購自Gibco;TRIzol購自Invitrogen;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒GoScript?Reverse Transcription Systemt和實時熒光定量PCR試劑盒GoTaq?qPCR Master Mix購自Promega;mmu_circ_42398過表達質(zhì)粒和對照空載質(zhì)粒由廣州吉賽生物科技公司提供;Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑盒購自Invitrogen;RIPA裂解液購自碧云天生物技術(shù)研究所;Protease Inhibitor Cocktail和Phosphatase Inhibitor Cocktail購自Selleck。BCA蛋白定量試劑盒購自Thermo;α-平滑肌肌動蛋白(α-smooth muscle actin,α-SMA)、I型膠原(collagen type I,Col I)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)抗體購自Proteintech;轉(zhuǎn)化生長因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、Smad2、Smad3、p-Smad2和p-Smad3抗體購自Abcam。PCR及測序用小鼠引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成,序列見表1。
表1 引物序列Table 1.The sequences of the primers
2.1 JS1細胞培養(yǎng)和實驗分組 JS1細胞用10%FBS-DMEM培養(yǎng)液,置于37℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。細胞培養(yǎng)至80%融合度傳代接種。細胞實驗時分成3組:正常對照組(control組)、空載體陰性對照組(vector組)和mmu_circ_42398過表達組(mmu_circ_42398組)。
2.2 過表達載體轉(zhuǎn)染JS1細胞 轉(zhuǎn)染前24 h,5×105個細胞接種在6孔板上,加入2 mL完全培養(yǎng)液培養(yǎng),轉(zhuǎn)染前細胞匯合達到70%~90%。在100 μL無血清培養(yǎng)液加入3 μg質(zhì)粒,柔和混勻。混勻Lipofectamine 2000試劑,用100 μL無血清培養(yǎng)液稀釋4 μL Lipofectamine 2000試劑,輕輕混勻,室溫放置5 min。將稀釋好的質(zhì)粒和Lipofectamine 2000試劑混合,輕柔混勻,室溫放置20 min。將200 μL質(zhì)粒-Lipofectamine 2000復合物加到含800 μL無血清培養(yǎng)液的細胞孔中,來回輕柔搖晃細胞培養(yǎng)板。細胞在37℃,5%CO2培養(yǎng)箱中,培養(yǎng)5~6 h后吸去轉(zhuǎn)染培養(yǎng)液,更換完全培養(yǎng)液。48 h后收集細胞。
2.3 RT-qPCR驗證mmu_circ_42398過表達 提取細胞樣品總RNA,逆轉(zhuǎn)錄后進行qPCR檢測,分別以GAPDH和mmu_circ_42398特異引物進行qPCR。PCR擴增反應體系為20 μL,條件設置為:95℃ 10 min;95℃10 s,60℃ 60 s,40個循環(huán)。采用2-ΔΔCt法計算目的基因的相對表達量。同時設計測序引物,PCR后回收條帶測序驗證環(huán)化位點接頭。每次設3個復孔,重復3次獨立實驗。
2.4 Western blot檢測蛋白表達 提取JS1細胞蛋白,BCA法定量,與SDS上樣緩沖液混合,95℃變性5 min。制膠,上樣,電泳,切膠,半干轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)PVDF膜。PBST洗膜3次,每次10 min,以5%BSA/PBS封閉1 h,加I抗(α-SMA、Col I、TGF-β1、Smad2、Smad3、p-Smad2、p-Smad3及 GAPDH),4℃輕搖孵育過夜,PBST洗膜3次,每次10 min,加II抗(1∶5 000稀釋),室溫輕搖孵育1 h。進行ECL化學發(fā)光顯影,獲取條帶后ImageJ軟件分析灰度值,以GAPDH為內(nèi)參照計算蛋白相對表達量。細胞實驗每次設3個復孔,重復3次獨立實驗。
采用SPSS 20.0軟件進行分析。數(shù)據(jù)以均數(shù)±標準差(mean±SD)表示,兩組間比較采用兩獨立樣本t檢驗,以P<0.05表示差異有統(tǒng)計學意義。
細胞轉(zhuǎn)染48 h后,熒光倒置顯微鏡下觀察,vector組和mmu_circ_42398過表達組見大部分JS1細胞內(nèi)有綠色熒光表達,兩組細胞形態(tài)無明顯異常,細胞轉(zhuǎn)染率達80%以上,見圖1。
Figure 1.The JS1 cell transfection rate 48 h after transfection(scale bar=200 μm).Most of JS1 cells had green fluorescent protein expression.圖1 熒光顯微鏡觀察mmu_circ_42398過表達載體的轉(zhuǎn)染效果
RT-qPCR檢測結(jié)果顯示,mmu-circ-42398過表達組mmu_circ_42398的表達較vector組顯著增加(P<0.01),見圖2A。將PCR產(chǎn)物進行一代測序,確定其環(huán)化位點(backsplice site),并將其序列信息與數(shù)據(jù)庫circBase中的序列信息對比,結(jié)果一致,見圖2B。這一結(jié)果證明該cicrRNA確實為環(huán)狀RNA結(jié)構(gòu),而非線性RNA結(jié)構(gòu)。
Figure 2.Verification of mmu_circ_42398 over expression.A:mmu_circ_42398 expression in JS1 cells was detected by RT-qPCR;B:the backsplice site of PCR products was verified by sequencing,and compared with that of circBase database.Mean±SD.n=3.##P<0.01 vs vector group.圖2 mmu_circ_42398的鑒定及過表達效果的驗證
Western blot結(jié)果顯示,mmu_circ_42398過表達組的α-SMA及Col I的蛋白表達較vector組顯著降低(P<0.01),見圖3。
Western blot結(jié)果顯示,與vector組比較,mmu_circ_42398過表達組的p-Smad2和p-Smad3蛋白水平顯著降低(P<0.01),TGF-β1、Smad2和Smad3蛋白表達量無顯著變化,見圖4。
肝纖維化是各種慢性肝病向肝硬化、肝癌、肝衰竭方向發(fā)展的共同病理階段,一直是肝病研究的重點領域。HSC的活化是促進肝纖維化持續(xù)發(fā)展的重要因素[3],抑制HSC的活化被認為是抗肝纖維化的有效途徑[4]。TGF-β1/Smads信號通路在HSC的激活、組織纖維化發(fā)生、發(fā)展過程中起到了關鍵性作用[5]。當TGF-β1與其位于HSC胞膜的受體(TGF-β1 receptor,TβR)結(jié)合并使TβR活化,與TβR結(jié)合的RSmads(包括Smad2和Smad3)就會被磷酸化而激活,Smad2/3是TβR-I受體的特異性信號轉(zhuǎn)導蛋白,磷酸化的R-Smads與Smad4形成多聚復合物,穿過核膜進入細胞核,在其他轉(zhuǎn)錄因子的協(xié)同下,參與不同目標基因的轉(zhuǎn)錄[6],Smad7是該信號通路中最重要的負反饋調(diào)節(jié)蛋白[7]。調(diào)控TGF-β1/Smads信號通路被認為是干預HSC活化和肝纖維化的重要策略。
circRNA是當前非編碼RNA研究領域的熱點,最近的兩項研究報道顯示,circRNA可能影響HSC的活化:Chen等[8]分析了放射線誘導的人肝星狀細胞株LX-2活化模型的circRNA差異表達譜,并進一步證實了hsa_circ_0071410可通過“miRNA海綿作用”結(jié)合miR-9-5p,從而影響HSC的活化;Wang等[9]的研究顯示患者血清CircMTO1表達水平與肝纖維化疾病進展顯著負相關,通過體外細胞模型進一步證實了CircMTO1可通過結(jié)合miR-17-5p,提高Smad7的表達水平,從而抑制肝纖維化進展。本課題組前期通過小鼠肝纖維化模型和肝細胞株JS1體外活化模型,篩選出mmu_circ_42398可能影響肝星狀細胞的活化。本研究通過構(gòu)建mmu_circ_42398過表達質(zhì)粒,并將其轉(zhuǎn)染到JS1細胞中,觀察到星狀細胞活化標志物即α-SMA及Col I蛋白表達顯著減少,說明mmu_circ_42398過表達能顯著抑制HSC的活化。課題組進一步從TGF-β1/Smads信號通路的角度探討了其可能的機制,結(jié)果顯示,mmu_circ_42398過表達組JS1細胞中p-Smad2和p-Smad3蛋白水平顯著降低,但TGF-β1、Smad2和Smad3蛋白表達量無顯著變化。上述結(jié)果提示,mmu_circ_42398過表達能顯著抑制R-Smads的磷酸化,從而抑制細胞內(nèi)TGF-β1/Smads信號通路的轉(zhuǎn)導,這是其抑制HSC活化的作用機制之一。
此前,我們通過生物信息學分析,顯示mmu_circ_42398表面存在miR-338-3p的反應元件(microRNA response element,MRE),能特異性結(jié)合miR-338-3p[10]。最近的一項雙螢光素酶報告基因?qū)嶒烇@示miR-338-3p能直接與骨成形蛋白-激活素膜結(jié)合阻斷因子(BMP and activin membrane-bound inhibitor,BAMBI)結(jié)合,降低 BAMBI活性,從而激活TGF-β/Smads信號通路[11]。BAMBI是 TGF-β/Smads信號轉(zhuǎn)導通路的偽受體,與TGF-βⅠ型受體結(jié)構(gòu)相似,但不具有同樣的活性,它可以競爭性地與TGF-βⅡ型受體結(jié)合,BAMBI由于缺乏胞內(nèi)區(qū)的絲氨酸/蘇氨酸激酶結(jié)構(gòu)域而不能磷酸化,導致胞質(zhì)區(qū)的Smad蛋白無法被磷酸化激活,從而阻斷TGF-β家族的信號轉(zhuǎn)導[12]。本實驗觀察到,mmu_circ_42398的過表達對TGF-β1本身表達并無影響,僅是降低了Smads蛋白的磷酸化水平,上述結(jié)果提示,mmu_circ_42398可能通過“miRNA海綿作用”靶向結(jié)合miR-338-3p,提高了BAMBI表達水平,從而進一步抑制Smads蛋白的磷酸化水平,最終抑制了HSC的活化。