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        3 種非洲豬瘟病毒核酸檢測試劑盒的比較

        2020-05-21 08:02:48王金良于新友陳金龍沈志強
        今日畜牧獸醫(yī) 2020年4期
        關(guān)鍵詞:檢測

        王金良,于新友,陳金龍,沈志強,

        (1.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院 256600;2.山東綠都生物科技有限公司 256600)

        非洲豬瘟于1921 年首次發(fā)生于非洲肯尼亞, 是由非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)引起的一種烈性傳染病,其主要臨床癥狀表現(xiàn)為高熱、急性和高死亡率,剖檢主要變化為脾增大、淋巴組織壞死和出血、凝血不良等;在1957 年以前,該病一直在非洲中部和南部國家流行, 之后傳入歐洲的葡萄牙等國家,1970 年開始呈世界多地區(qū)流行, 包括意大利、 西班牙、巴西、 古巴等國家, 給世界各國的養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大經(jīng)濟損失。2018 年非洲豬瘟呈現(xiàn)全球大爆發(fā)、大流行態(tài)勢,新增疫情國家數(shù)同比上升30%,同年8 月ASF 傳入我國,截止2019 年7 月共發(fā)生疫情143 起,撲殺生豬116 萬頭,給我國的養(yǎng)豬業(yè)帶來沉重打擊。

        目前,ASF 尚無有效疫苗用于預防,防控主要依靠嚴格的生物安全措施, 輔以準確、 快速的病原檢測技術(shù)。 ASFV 為雙鏈DNA 病毒,也是蟲媒DNA 病毒,病毒直徑約200nm,正六邊形,依據(jù)病毒主要衣殼蛋白p72 基因序列,ASFV 可分為24 個不同基因型,同時p72 蛋白也是ASF 血清學檢測的主要應用抗原。為了更好防控非洲豬瘟的發(fā)生, 國內(nèi)外學者開展了非洲抗原抗體快速檢測技術(shù)的研究,包括免疫熒光、ELISA、免疫層析試紙條、PCR、熒光定量PCR、環(huán)介導等溫擴增等方法[1-3]。 本文選取了商品化的基于熒光定量PCR、 環(huán)介導等溫擴增技術(shù)的試劑盒進行了初步比較,旨在為產(chǎn)品的選擇使用提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        3 種商品化ASFV 核酸檢測試劑盒,ASFV 熒光PCR 檢測試劑盒 (試劑盒反應液為液體制劑) 為A 廠家產(chǎn)品、ASFV 熒光PCR 檢測試劑盒(反應液為凍干制劑)為B 廠家產(chǎn)品、非洲豬瘟病毒可視化DNA 檢測試劑盒(反應液為液體制劑)為C 廠家產(chǎn)品,檢測樣品為非洲豬瘟病毒B646L 基因質(zhì)粒標準物質(zhì)(標準物質(zhì)編號GBW(E) 091034);所用儀器為英國MyGo pro 熒光PCR儀。

        1.2 試驗方法

        將非洲豬瘟病毒B646L 基因質(zhì)粒標準物質(zhì)進行10 倍比稀釋(1 號樣品為6×102拷貝/μL、2 號樣品為6×101拷貝/μL、3 號樣品為6×100拷貝/μL、4 號樣品為6×10-1拷貝/μL、5 號樣品為6×10-2拷貝/μL、6 號樣品為6×10-3拷貝/μL、7 號樣品為6×10-4拷貝/μL),確定可檢出限并計算PCR 加樣體系中基因拷貝濃度;通過重復檢測3 次最低拷貝數(shù)的樣品,確定3 種商品化ASFV 核酸檢測試劑盒的批內(nèi)重復性。

        ASFV 熒光定量PCR 檢測試劑盒的加樣體系和反應程序:加樣體系均為20μL (反應液10μL、 引物混合物7.5μL、 模板2.5μL);反應程序:95℃、30 sec,95℃、5 sec,60℃、20 sec,35 個循環(huán)。

        ASFV 可視化DNA 檢測試劑盒的加樣體系和反應程序:加樣體系 (恒溫擴增反應液18μL、Bst DNA 聚合酶1μL、 模板1μL);反應程序:64℃反應50min。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 三種試劑盒敏感性比較

        從圖1 中可知,3 種試劑盒均具有較高的敏感性,試劑盒A敏感性最高,試劑盒B 敏感性次之,試劑盒C 的敏感性為最低,反應終體系模板拷貝數(shù)分別為0.75 拷貝/μL、7.5 拷貝/μL 和30拷貝/μL;試劑盒C 為目測法進行結(jié)果判定,而試劑盒A 和B 均借助儀器進行結(jié)果判讀, 判定方式的差異是試劑盒C 敏感性低的原因之一。

        圖1 三種試劑盒敏感性比較

        表1 3 種試劑盒批內(nèi)檢測穩(wěn)定性比較

        2.2 三種試劑盒重復性比較

        選取三種試劑盒的同一批次的3 個試劑盒, 分別進行試劑盒最低檢出量的樣品的檢測(試劑盒A 檢測3 號樣品、試劑盒B檢測2 號樣品、試劑盒C 檢測1 號樣品),結(jié)果表明這三種試劑盒重復試驗的結(jié)果均較好, 其中試劑盒A 和B 的批內(nèi)變異系數(shù)均小于1%,試劑盒C 均可通過肉眼進行陽性結(jié)果的判定。

        3 討論

        非洲豬瘟對養(yǎng)豬業(yè)的危害巨大,一旦發(fā)病,死亡率極高,嚴重影響世界各國的社會經(jīng)濟發(fā)展。 我國自非洲豬瘟暴發(fā)以來,各級政府高度重視疫情的防控工作, 希望在疫情發(fā)生的初期加以控制,最終推動非洲豬瘟的根除計劃。 目前,還沒有非常有效的非洲豬瘟疫苗,嚴格的生物安全防控,并結(jié)合快速、敏感的病毒檢測技術(shù)是控制非洲豬瘟發(fā)生、流行的主要方式[4,5]。

        依據(jù)本文比較研究結(jié)果,3 種商品化的試劑盒均有很好的可重復性,可用于非洲豬瘟病毒的核酸檢測。 三種試劑盒的設(shè)計各有不同,也導致了試劑盒的敏感性的略有差異,如果檢測樣品來源于具有臨床癥狀的豬, 由于被檢測樣本含有較高的病毒含量,3 種試劑盒檢測結(jié)果不會有差異,若是無臨床癥狀的豬,或病毒含量低的檢測樣品, 可視化的試劑盒C 則有可能出現(xiàn)假陰性的結(jié)果;目前,基于凍干技術(shù)的非洲豬瘟檢測試劑類的產(chǎn)品(如試劑盒B),生產(chǎn)工藝上得到很大的改進,由于預分裝并凍干,這在一定程度上減少了檢測用時,降低了運輸、儲藏條件,凍干過程對檢測用酶制劑有如何影響還未見有相關(guān)研究報道; 可視化DNA 檢測試劑盒因其對實驗室條件、 檢測人員技術(shù)水平要求相對不高,可以對臨床樣本進行快速診斷,得到越來越多的應用,如能結(jié)合儀器進行結(jié)果判斷,不但可以降低人為因素的誤判,也在一定程度上會提高檢測試劑盒的敏感性。 因此,隨著非洲豬瘟防控的不斷深入,將會有更多的新技術(shù)、新方法應用于非瘟病毒核酸的檢測,哪種產(chǎn)品或方法更為適合,最終要依據(jù)檢測的目標樣品。

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