生命樹是一個概括所有現(xiàn)生生物之間的進化歷程和親緣關系的簡化比喻。自從150 多年前的達爾文時代,學者們就在構(gòu)建生命之樹。近期,研究者利用公共數(shù)據(jù)庫中4000 多個物種的完整或近完整的基因組序列,構(gòu)建了全蛋白質(zhì)組生命樹。圖中顯示了簡化的全蛋白質(zhì)組生命樹的最深部,所有現(xiàn)生生物可歸為五個"大類",五個列對應于古細菌,細菌,真菌,植物和動物,以及一個并系的原生生物"大類"(由三個粗的紅色虛線框代表,對應三類原生生物,分別標記為PR-1~5,PR-P 和PR-A,其中P 代表" 植物姊妹群",A 代表" 動物姊妹群")。右方的寬箭頭示意性地顯示了六個" 大類" 的所有" 創(chuàng)立者"在進化進展標尺的0.01 至0.20 的非常短的累積基因組信息差異范圍內(nèi)出現(xiàn)了深部爆發(fā)。
(PNAS 2020,117:3678-3686)