吳家園,賴天文,劉華鋒,潘振宇,李 筱,呂 軍 , 林挺葵* (. 廣東醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院,廣東湛江 5400;. 西安市兒童醫(yī)院,陜西西安 7000;. 青海衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學(xué)院,青海西寧 80000;4. 暨南大學(xué)附屬第一醫(yī)院,廣東廣州 5060)
2019新型冠狀病毒(2019-nCoV),因2019年武漢病毒性肺炎病例而被發(fā)現(xiàn),2020年1月12日被世界衛(wèi)生組織命名[1]。冠狀病毒是一個大型病毒家族,已知可引起感冒以及中東呼吸綜合征(MERS)和嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)等較嚴(yán)重疾病。新型冠狀病毒是以前從未在人體中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒新毒株[2]。國家衛(wèi)生健康委員會官方網(wǎng)站顯示:截至2020年2月14日24時(文中數(shù)據(jù)均截止于此日期),我國累計確診病例達66 492例,其中治愈8 096例,死亡1 523例[3]。自2020年1月22日起,各地相繼啟動了重大突發(fā)公共衛(wèi)生事件Ⅰ級響應(yīng),采取了一系列前所未有的嚴(yán)厲干預(yù)措施,如搜尋疑似/確診患者并隔離觀察或治療、出行限制和延長春節(jié)假期等。至2月中旬,全國各地區(qū)(除湖北以外)的疫情形勢總體出現(xiàn)了一些積極變化:(1)新增確診人數(shù)持續(xù)下降;(2)疑似病例低于確診病例;(3)治愈率提高,出院人數(shù)增多。然而,疫情依舊處在關(guān)鍵時刻,尚面臨諸多不確定的風(fēng)險和挑戰(zhàn)。
在傳染病動力學(xué)研究中,基本再生數(shù)(basic reproduction number,R0)是一個非常重要的指標(biāo),表示在無病平衡狀態(tài)時,引入一個新的感染者,在其平均染病周期內(nèi)所能感染的人數(shù)[4]。利用合適的模型來估算和預(yù)測R0,對于評估疾病傳播能力和預(yù)測疾病傳播發(fā)展趨勢具有重要意義。目前,廣東省湛江市人民對疫情防控及發(fā)展趨勢極為關(guān)注。疫情會被控制還是繼續(xù)蔓延? 何時能達到峰值? 疫情“拐點”何時出現(xiàn)? 何時復(fù)工復(fù)學(xué)?這些問題是人們最擔(dān)心的問題。為此,本研究通過廣東省衛(wèi)健委公布的新型冠狀病毒肺炎(Novel Coronavirus Pneumonia,NCP)疫情的相關(guān)數(shù)據(jù),構(gòu)建了疾病傳播的SIR(Susceptible Infected Recovered)模型,并對本次疫情的R0進行估計和預(yù)測,研究湛江市疫情的流行趨勢,為疫情防控和相關(guān)政策支持提供理論依據(jù)。
本文的數(shù)據(jù)來源于廣東省截至2020年2月14日24時的官方統(tǒng)計數(shù)據(jù)[5],所有數(shù)據(jù)均從廣東省衛(wèi)健委官方網(wǎng)站獲得。湛江市總?cè)丝跀?shù)來源于湛江市統(tǒng)計信息網(wǎng)[6],2018年末總?cè)丝跀?shù)為733萬人。
SIR模型又稱“倉室”模型,是最經(jīng)典、也是最基本的傳染病模型,于1927年由Kermack與Mckendrick提出,至今仍被廣泛應(yīng)用并不斷改良[7]。在SIR模型中,發(fā)病地區(qū)內(nèi)的人群被分成3類:(1)易感者(susceptible,S),指尚未染病,但容易受到感染的人群;(2)感染者(infective,I),表示已感染并可以傳播給他人的人群;(3)移出者(removal,R),代表感染后恢復(fù)且對該傳染病免疫,或已死亡的人群。這3類人群在易感狀態(tài)、傳播狀態(tài)和移出狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)換不僅依賴于自身的狀態(tài),同時也受到周圍人群所處狀態(tài)的影響。SIR模型基于以下4個基本假設(shè):(1)該地區(qū)的總?cè)丝跀?shù)保持恒定;(2)單位時間內(nèi),感染者所能感染的人數(shù)與易感者的人數(shù)成正比;(3)單位時間內(nèi),移出者人數(shù)的增加和感染者人數(shù)成正比;(4)移出者在疫情期間不會再次感染該病[8]。根據(jù)上述假設(shè),SIR模型可用一組微分方程表示:
S(t),I(t)和R(t)分別表示t時刻易感人群、感染人群和移出人群的數(shù)量,在初始時刻3類人群的數(shù)量(S0,I0,R0)>0;β表示感染強度,即感染者傳播疾病的效率;γ表示移出概率,即感染者康復(fù)的概率。此外,我們通過計算t時刻預(yù)測值與真實值之間的方差,即RSS(β,γ)=∑t(I(t)-?(t))2,并依據(jù)方差的最小值來選擇最優(yōu)模型,從而確保預(yù)測值和真實值相適應(yīng),并對R0進行更準(zhǔn)確的計算:R0=β/γ[9]。
在傳染病疫情中,一般是近期流行趨勢對現(xiàn)在的影響較大,而遠(yuǎn)期的趨勢影響較小[10]。指數(shù)平滑法是一種對數(shù)據(jù)進行預(yù)處理的方法,主要應(yīng)用于中短期的預(yù)測,現(xiàn)已成為預(yù)測傳染病流行趨勢的常用方法。其基本思想是通過序列以往實際觀測值的加權(quán)平均來預(yù)測未來的數(shù)值,對近期的觀測值賦予較大的權(quán)重,而給遠(yuǎn)期的實際值賦予較小的權(quán)重,使預(yù)測結(jié)果既反映最新的信息,又能反映歷史資料的信息,從而確保預(yù)測結(jié)果更加符合實際情況[11-12]。本研究在SIR模型結(jié)果的基礎(chǔ)上結(jié)合指數(shù)平滑法來預(yù)測湛江市NCP基本再生數(shù)基本再生數(shù)R0的未來趨勢。本研究的統(tǒng)計分析和模型構(gòu)建過程通過使用R語言(3.6.1版本)deSolve包和sweep包來完成。
截至2020年2月14日24時,湛江市新型冠狀病毒肺炎累計確診病例為22例,其中11例治愈,暫無死亡病例(圖1)。表1列出了從2020年1月25日至2月14日湛江市NCP疫情發(fā)展過程中R0的具體數(shù)據(jù)。其中,R0的最大值為1.91,見于1月25日,隨后R0呈現(xiàn)持續(xù)下降的趨勢,至2月14日,達到本研究觀察期內(nèi)的最小值1.28(圖2),說明該市在NCP疫情早期所實施的防控措施已經(jīng)起到了效果。
圖1 湛江市新型冠狀病毒肺炎疫情圖(截至2020年2月14日24時,數(shù)據(jù)來源于廣東省衛(wèi)生健康委員會、湛江新冠防控辦)
表1 2020年1月25日至2月14日湛江市NCP疫情的基本再生數(shù)
圖3展示指數(shù)平滑法對湛江市NCP基本再生數(shù)R0未來趨勢的預(yù)測結(jié)果。在流行病學(xué)中,R0>1 表示疾病將爆發(fā),R0<1 則表示疾病走向消亡。依據(jù)目前的數(shù)據(jù)的預(yù)測結(jié)果顯示,大約在2月下旬,湛江市NCP的基本再生數(shù)R0回落到低于1的水平,預(yù)示著疫情可能迎來“拐點”,該疾病可能已被控制。大約在3月底,基本再生數(shù)R0回落到低于0的水平,即疫情將走向消亡。
圖2 2020年1月25日至2月14日湛江市新型冠狀病毒肺炎基本再生數(shù)的變化趨勢
圖3 湛江市新型冠狀病毒肺炎基本再生數(shù)的變化與預(yù)測
本研究通過建立廣東省湛江市NCP疫情的SIR模型,對現(xiàn)階段疾病傳播和流行趨勢的關(guān)鍵參數(shù)—基本再生數(shù)R0進行了估計和預(yù)測。R0值反映傳染病爆發(fā)的潛力和嚴(yán)重程度,R0值越高表示疫情越嚴(yán)重。R0值主要取決于疾病的傳染率、人之間的接觸率及傳播時間[13]。在疫情早期,湛江市的基本再生數(shù)R0為1.91,低于武漢市同期的R0(2.8~3.9)[14],且隨著防控措施干預(yù)呈現(xiàn)波動下降趨勢。根據(jù)我們的預(yù)測結(jié)果,湛江市的NCP疫情可能在2月下旬迎來“拐點”,并在3月底走向消亡。與2003年在我國發(fā)生的“非典”疫情相比,本次疫情可能會更早結(jié)束。該結(jié)果與湛江市采取了快速有效的公共衛(wèi)生措施,民眾對疫情防范意識的提升,以及我國醫(yī)療健康事業(yè)的快速發(fā)展有關(guān)。
2020年1月20日,湛江市確診了首例輸入性新型冠狀病毒肺炎病例。僅4 d后,湛江市便啟動了重大突發(fā)公共衛(wèi)生事件一級響應(yīng),除了第一時間組織救治確診和疑似患者,還成立領(lǐng)導(dǎo)小組、防控工作小組、防控專家組和臨床救治專家組等,制定各項應(yīng)急措施和工作方案,表明了阻止疫情蔓延的決心。在武漢疫情爆發(fā)后,有大量來自湖北的人員滯留湛江,給湛江市的疫情防控帶來了嚴(yán)峻的考驗。湛江市政府為這些來自疫情發(fā)生地的無發(fā)熱癥狀人員實行集中健康觀察,并提供免費食宿和口罩,這不僅給湖北人員提供了棲身之所和解決溫飽問題,也能讓湛江市民減少擔(dān)憂,同時也成為了各地解決該問題的模范。針對春節(jié)后返工潮的到來,湛江市按照“輕重緩急、分類指導(dǎo)、分期分批”的原則,引導(dǎo)務(wù)工人員安全有序返湛返崗。湛江市所采取的這一系列“外防輸入”“內(nèi)防擴散”的防控措施有效遏制疫情蔓延勢頭,并取得了明顯階段性成效。因此,做好疫情宣傳工作,提高群眾對疫情的警惕性,嚴(yán)格隔離感染者,減少民眾外出和聚會,做好個人衛(wèi)生,定期消毒各類場所,切斷傳播途徑,同時及時積極治療確診患者,預(yù)防醫(yī)院內(nèi)感染等一系列防控措施,均能降低R0值,有效地控制NCP疫情。
此次NCP疫情對各個行業(yè)造成了巨大影響。廣東省作為經(jīng)濟發(fā)達省份,已于2020年2月10日開始陸續(xù)進入復(fù)工復(fù)產(chǎn)。復(fù)工復(fù)產(chǎn)有利于防控物資、生活物資的補充,能為疫情的防控提供堅實的后盾。因此,企業(yè)單位應(yīng)制定應(yīng)急處置方案、儲備疫情防控物資、嚴(yán)格落實醫(yī)學(xué)觀察措施、設(shè)置隔離觀察場所、對已經(jīng)發(fā)病或疑似人員及時隔離和上報。在疫情期間,還應(yīng)加強復(fù)工人員的健康管理,強化心理疏導(dǎo),防止恐慌,保障員工心理健康。
何時復(fù)學(xué)同樣是人們最為關(guān)注的問題。目前,疫情防控到了最關(guān)鍵階段。為防止二次爆發(fā),復(fù)學(xué)時間點應(yīng)在實際疫情走向消亡的基礎(chǔ)上,加入14 d的醫(yī)學(xué)觀察期限。因此,我們建議復(fù)學(xué)應(yīng)晚于3月底。此外,我們還建議:學(xué)校要錯峰、錯層次、錯區(qū)域開學(xué);學(xué)校要制定應(yīng)急處置方案,掌握校園風(fēng)險隱患;校內(nèi)實行網(wǎng)格化管理,將疫情防控任務(wù)分解落實到每個網(wǎng)格、每位網(wǎng)格員;做好疫情防控物資儲備工作及設(shè)置隔離觀察場所;加強宿舍、食堂及教室等區(qū)域消毒工作;及時隔離和上報已經(jīng)發(fā)病或疑似人員;強化心理疏導(dǎo),保障師生的心理健康。
本研究首次對湛江市NCP的發(fā)展趨勢進行了預(yù)測,但也存在一定的局限性。首先,需要強調(diào)的是,本研究是在數(shù)據(jù)比較缺乏的情況下進行的一個初步估計。準(zhǔn)確地預(yù)測NCP的傳播趨勢,需要充分考慮實際情形和掌握更準(zhǔn)確的關(guān)鍵參數(shù),如不同性別和年齡的人群易感性和接觸概率、醫(yī)院內(nèi)傳播和醫(yī)院外傳播、人口密度和人群流動性等,從而對模型進行修正,使之更符合實際。其次,本研究僅考慮了已確診的和有癥狀的感染者,未涵蓋無癥狀感染者的情況。最后,目前的結(jié)果是基于疫情爆發(fā)到2020年2月14 日24時的數(shù)據(jù)得出的,由于疫情的發(fā)展仍存在不確定性,如診斷標(biāo)準(zhǔn)的改變和潛伏期的不確定性等,其流行趨勢仍可能會發(fā)生較大的改變。
綜上所述,目前湛江市NCP疫情進展速度放緩,正在得到一定程度的控制。繼續(xù)采取及時有效的防控措施,控制人口流動規(guī)模,加強對返湛人員的檢測與管理,能加快控制和撲滅疫情。