揭芳芳,李 金,陳 濤*
(南昌大學(xué)a.理學(xué)院,江西 南昌 330031;b.第二附屬醫(yī)院,江西 南昌 330006)
華法林是目前世界上應(yīng)用最廣泛的一線口服抗凝藥[1-2],據(jù)統(tǒng)計(jì),在美國(guó),每年有200萬左右人口開始使用華法林預(yù)防和治療血栓栓塞性疾病,華法林在臨床上可應(yīng)用于靜脈血栓栓塞、房顫、肺栓塞、急性心肌梗死等疾病的預(yù)防和治療,但華法林在臨床應(yīng)用中存在很多局限性[3],主要表現(xiàn)在藥物濃度太低無法產(chǎn)生治療效果,濃度太高容易引發(fā)副作用?;颊邔?duì)華法林劑量的個(gè)體差異較大,并且華法林治療效果受藥物相互作用影響嚴(yán)重,為加強(qiáng)華法林藥物利用效果,提高患者治療機(jī)率,減少不良事件的發(fā)生,故需對(duì)華法林穩(wěn)定劑量進(jìn)行研究。
目前國(guó)內(nèi)對(duì)華法林的研究主要還是停留在醫(yī)學(xué)方面或不同基因型等對(duì)華法林劑量的影響,如劉艷麗等[4]在基因多態(tài)性的基礎(chǔ)上研究了腎功能不全患者對(duì)華法林劑量的需求情況;李曉琪[5]通過藥物基因組學(xué)劑量預(yù)測(cè)模型對(duì)華法林個(gè)體抗凝治療進(jìn)行了臨床研究;P.S.Wells[6]主要研究了不同CYP2C9、CYP4F2和VKORC1基因?qū)θA法林藥物臨床劑量的需求。
本文創(chuàng)新之處在于,利用數(shù)理統(tǒng)計(jì)的方法,從數(shù)學(xué)角度出發(fā),根據(jù)以往所收集的數(shù)據(jù),分析數(shù)據(jù)[7-8],現(xiàn)擬結(jié)合相關(guān)基因(如VKORC1、CYP2C9、CYP4F2、GGCX等[9])多位點(diǎn)變異建立精準(zhǔn)用藥數(shù)學(xué)模型,同時(shí)考慮同一位點(diǎn)不同基因型之間的相互聯(lián)系,建立華法林藥物劑量與所研究對(duì)象的關(guān)系。
數(shù)理統(tǒng)計(jì)學(xué)[10]是統(tǒng)計(jì)學(xué)分支學(xué)科。它是以概率論為理論基礎(chǔ),對(duì)受隨機(jī)因素影響的不確定性現(xiàn)象進(jìn)行大量的觀測(cè)或試驗(yàn),以有效的方法獲取樣本、提取信息,進(jìn)而對(duì)隨機(jī)現(xiàn)象的統(tǒng)計(jì)規(guī)律(如參數(shù)、分布、相關(guān)性等)做出推斷。本文通過收集南昌市295名患者華法林臨床穩(wěn)定劑量,運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)分析華法林穩(wěn)定劑量與人體其他因素之間的關(guān)聯(lián),從而建立華法林穩(wěn)定劑量預(yù)測(cè)模型,并對(duì)模型的準(zhǔn)確性進(jìn)行驗(yàn)證,更好地控制華法林臨床用藥劑量范圍,從而達(dá)到醫(yī)療效果。
通過收集南昌大學(xué)附屬醫(yī)院正在服用華法林藥物的患者信息,征求到295名患者相關(guān)醫(yī)療信息,為提高華法林穩(wěn)定劑量預(yù)測(cè)模型的準(zhǔn)確性,對(duì)295名患者進(jìn)行等距抽樣將其中245名患者作為建模組,剩余50名患者作為驗(yàn)證組,使我們模型是基于較多數(shù)據(jù)的前提下建立的,提高模型的準(zhǔn)確性。
3.1.1 數(shù)據(jù)處理
對(duì)所收集的數(shù)據(jù)進(jìn)行符號(hào)處理,處理結(jié)果如表1。
表1 符號(hào)說明
同時(shí)對(duì)所有臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)描述,年齡、體重、身高表示為:mean±SD,描述結(jié)果如表2所示。
表2 所選患者臨床資料
由于存在兩個(gè)或兩個(gè)以上基因座位的等位基因同時(shí)出現(xiàn)在一條染色體上的情況,從而會(huì)導(dǎo)致重組后部分基因型概率高于隨機(jī)出現(xiàn)的概率,這種現(xiàn)象在基因?qū)W上稱為L(zhǎng)inkage Disequilibrium(連鎖不平衡)[14-16],在本文研究的8個(gè)基因位點(diǎn)中rs1057910屬于CYP2C9基因,rs2069514屬于CYP1A1基因,rs887829屬于VGT1A1基因,rs699664屬于GGCX,而rs9923231、rs9934438、rs7196161、rs7294位點(diǎn)同屬于VKORC1基因,故需判斷以上4個(gè)位點(diǎn)是否存在LD現(xiàn)象,在本研究中所選患者人群的4個(gè)位點(diǎn)基因的分布情況如表3所示。
表3 患者VKORC1基因位點(diǎn)等位基因分布表
根據(jù)LD計(jì)算公式:
D=P(AB)-P(A)P(B)
注:假設(shè)基因A的等位為A,a;基因B的等位為B,b。則P(AB)表示單倍型AB出現(xiàn)的實(shí)際概率;P(A)P(B)表示單倍型AB出現(xiàn)的理論概率。
以rs9923231、rs9934438為例,將數(shù)據(jù)帶入上式得出r2>0.9,說明rs9923231與rs9934438之間存在強(qiáng)烈的連鎖不平衡現(xiàn)象,同理得出rs7196161、rs7294與rs9934438之間一樣存在強(qiáng)烈的連鎖不平衡。也故以下研究?jī)H考慮VKORC1基因rs9923231位點(diǎn)對(duì)華法林劑量的影響。
3.1.2 各因素對(duì)華法林劑量的影響
利用Pearson及Spearman相關(guān)性及單因素線性回歸分析性別、年齡、體重等17個(gè)自變量與華法林劑量之間的關(guān)系,得出結(jié)果如表4所示。
由上述分析知:VKORC1(rs9923231)、CYP2C9(rs1057910)、GGCX(rs699664)、胺碘酮、年齡、體重、身高、BSA等因素對(duì)華法林劑量的穩(wěn)定性的影響具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而血栓史、倍他樂克、ACEI等對(duì)華法林劑量穩(wěn)定性的影響沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
VKORC1(rs9923231)、CYP2C9(rs1057910)、GGCX(rs699664)各基因型間華法林穩(wěn)定劑量如表5所示。
根據(jù)以上數(shù)據(jù),可得出在不考慮其他因素的影響下,VKORC1(rs9923231)AA組華法林日穩(wěn)定劑量為2.438±0.452 mg,明顯低于A/G組3.323±0.749和GG組5.163±0.477 mg;CYP2C9(rs1057910)GG組華法林日穩(wěn)定劑量為0.750 mg,明顯低于A/G組2.076±0.391 mg和AA組2.658±0.634 mg,且每攜帶一個(gè)A等位基因,華法林劑量需求增加28%。此外,GGCX(rs699664)GG組華法林日穩(wěn)定劑量2.671±0.640 mg也要高于AA組2.330±0.400 mg。
各基因型間華法林穩(wěn)定劑量箱圖[17]如圖1~3所示。
表4 各變量與華法林穩(wěn)定劑量之間關(guān)系
表5 患者3個(gè)基因型位點(diǎn)華法林穩(wěn)定劑量表
3.1.3 華法林預(yù)測(cè)模型建立
為提高模型的準(zhǔn)確性,將所收集數(shù)據(jù)的5/6作為建模組,另外的1/6作為驗(yàn)證組去驗(yàn)證模型的準(zhǔn)確性,以使得我們的模型是基于較多數(shù)據(jù)而建立的,從而達(dá)到更好的預(yù)測(cè)效果,模型建立思路如圖4所示。
建模組及驗(yàn)證組臨床信息如表6所示,通過單因素線性回歸得到可能影響到華法林穩(wěn)定劑量的因素,對(duì)建模組中245名患者,使用逐步線性回歸[18],得到方程系數(shù)表如表7所示。
表6 建模組與驗(yàn)證組患者基本信息
表7 多元線性回歸結(jié)果
據(jù)上述表格,得到華法林劑量預(yù)測(cè)模型為:
華法林穩(wěn)定劑量(mg)=2.534-0.771×VKORC1(rs9923231)AA+0.024×體重-0.512×CYP2C9(rs1057910)GG+1.526×VKORC1(rs9923231)GG-0.012×年齡
注:
VKORC1(rs9923231)AA:AA=1,AG=0;
VKORC1(rs9923231)GG:GG=1,AG=0;
CYP2C9(rs1057910)GG:GG=1,AG=0。
本文所建立的華法林穩(wěn)定劑量預(yù)測(cè)模型,可解釋61%華法林穩(wěn)定劑量的個(gè)體差異,對(duì)變量進(jìn)行逐步線性回歸時(shí)發(fā)現(xiàn),基因遺傳因素對(duì)華法林穩(wěn)定劑量差異的影響最大,在本模型中,常量及VKORC1(rs9923231)AA和GG可解釋36.4%個(gè)體劑量差異,而CYP2C9(rs1057910)GG在回歸過程中為0.053,說明CYP2C9(rs1057910)基因多態(tài)性在本模型中能解5.3%的個(gè)體差異,體重、年齡分別能解釋15.6%及3.7%的個(gè)體差異,在單因素線性回歸中,身高、胺碘酮、GGCX(rs699664)、BSA等雖然對(duì)華法林穩(wěn)定劑量也有影響,但在逐步線性回歸過程中由于影響不顯著未能進(jìn)入最終模型。
預(yù)測(cè)模型驗(yàn)證[19]:
對(duì)比驗(yàn)證組患者預(yù)測(cè)劑量及實(shí)際劑量,與實(shí)際預(yù)測(cè)劑量相差20%以內(nèi)視為理想預(yù)測(cè)劑量;低于實(shí)際預(yù)測(cè)劑量20%視為偏低預(yù)測(cè)劑量;高于實(shí)際預(yù)測(cè)劑量20%視為偏高預(yù)測(cè)劑量。結(jié)果如表8所示。
表8 驗(yàn)證組實(shí)際劑量與預(yù)測(cè)劑量
其中驗(yàn)證組實(shí)際劑量與預(yù)測(cè)劑量對(duì)比圖如圖5所示。
本驗(yàn)證結(jié)果,顯示驗(yàn)證組中14%的患者預(yù)測(cè)劑量偏低,68%的患者預(yù)測(cè)劑量理想,18%的患者預(yù)測(cè)劑量偏高,即本模型在本研究中的準(zhǔn)確率在68%左右,本文從基本的醫(yī)學(xué)角度收集數(shù)據(jù),通過統(tǒng)計(jì)學(xué)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,得出變量之間的聯(lián)系,此研究結(jié)果可以幫助醫(yī)師指導(dǎo)患者更好的實(shí)現(xiàn)安全用藥,但本研究所建立的數(shù)據(jù)樣本區(qū)域性較強(qiáng),故需進(jìn)一步擴(kuò)大樣本容量,為指導(dǎo)臨床用藥提供更準(zhǔn)確的方法。
1.VKORC1和CYP2C9基因多態(tài)性可作為預(yù)測(cè)患病人群華法林穩(wěn)定劑量的標(biāo)記。
2.VKORC1基因多態(tài)性對(duì)患者華法林穩(wěn)定劑量的影響大于CYP2C9基因多態(tài)性。
3.CYPA1、VG71A1及CCGX基因多態(tài)性不影響患者華法林穩(wěn)定劑量。
4.由于個(gè)體存在差異性,預(yù)測(cè)患者實(shí)際藥物用量具有一定難度,經(jīng)過模型驗(yàn)證,本研究所建立的模型大概可預(yù)測(cè)68%左右人群華法林穩(wěn)定劑量。