景曉冉,聶 堯,徐 巖,2
(1.江南大學(xué) 生物工程學(xué)院工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn),江蘇無錫214122;2.江南大學(xué)食品科學(xué)與技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇無錫214122)
反式-4-羥基-L-脯氨酸(trans-4-Hpro)是藥物合成中一種重要的中間體[1-3],可以用來合成碳青霉烯類抗生素類高附加值藥物[4-5],同時(shí)在材料化工、食品營(yíng)養(yǎng)和護(hù)膚美容方面也具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值[6-7]。目前,隨著生物技術(shù)的快速發(fā)展,生物合成trans-4-Hpro的研究引起人們的廣泛關(guān)注。
1995年,Serizawa等[8]發(fā)現(xiàn)一株可被命名為ClonostachyscylindrosporaSANK 14591的菌株,外源添加L-脯氨酸(L-Pro)可以合成13.8 mg/L的trans-4-Hpro。1996年,Lawrence等[9]從StreptomycesgriseoviridusP8648 中純化出脯氨酸4-羥化酶,并對(duì)該酶的特性進(jìn)行了初步研究,每毫克蛋白每分鐘的羥脯氨酸產(chǎn)量?jī)H為907 pmol/L。2000年,Shibasaki等通過全細(xì)胞酶活測(cè)定篩選出來源于Dactylosporangiumsp. RH1活性最高的P4H[10],以Escherichiacoli(E.coli)W1485 作為宿主菌進(jìn)行重組表達(dá),并以E.coliW1485 pTrS2-4OH為菌株進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),在發(fā)酵罐中外源添加L-Pro獲得了15 g/L的trans-4-Hpro[11]。2006年,Bontoux等[12]在反應(yīng)體系中添加10 mmol/L的L-Pro為底物,在250株野生菌中篩選出5株可轉(zhuǎn)化生成trans-4-Hpro,產(chǎn)率均在5%~10%。2013年,劉合棟等[13]將優(yōu)化后的P4H基因插入含有色氨酸串聯(lián)啟動(dòng)子的pUC19 質(zhì)粒,并導(dǎo)入E.coliBL21(DE3)中,在搖瓶水平添加200 mmol/L L-Pro為底物發(fā)酵8 h,可積累0.492 g/L 的trans-4-Hpro。2017年,周海巖等[14]將源于BradyrhizobiumjaponicumUSDA 6的脯氨酸4-羥化酶在E.coliBL21(DE3)中進(jìn)行重組構(gòu)建,采用全細(xì)胞催化反應(yīng)體系,經(jīng)過體系的優(yōu)化,trans-4-Hpro的合成量達(dá)到34.86 mg/L。
雖然目前已有許多生物催化轉(zhuǎn)化羥基脯氨酸研究的相關(guān)報(bào)道,但能夠高效羥基化L-Pro的酶資源仍然有限。微生物合成法生產(chǎn)trans-4-Hpro的過程中,菌體生長(zhǎng)緩慢,很難達(dá)到高密度發(fā)酵,L-Pro的有效轉(zhuǎn)化率較低,從而造成生產(chǎn)原料的浪費(fèi)。本研究中,筆者利用功能酶基因探礦方法挖掘獲得羥基化L-Pro的新型Fe(II)/2-酮戊二酸(2-OG)依賴型雙加氧酶KaPH1,對(duì)羥基化酶表達(dá)和反應(yīng)耦聯(lián)過程進(jìn)行調(diào)控,通過監(jiān)測(cè)體系中菌體生長(zhǎng)、蛋白表達(dá)及底物轉(zhuǎn)化進(jìn)程,以期實(shí)現(xiàn)在不添加共底物2-OG的情況下L-Pro的高效轉(zhuǎn)化,為生物合成trans-4-Hpro高效轉(zhuǎn)化體系的建立提供理論和實(shí)踐基礎(chǔ)。
Kutzneriaalbida(白色庫(kù)茨涅爾氏菌),中國(guó)普通微生物菌種保藏中心(CGMCC);E.coliJM109和E.coliBL21(DE3)保存于本實(shí)驗(yàn)室;表達(dá)載體pET-28a,Novagen公司;克隆載體pMD-19T、限制性內(nèi)切酶和連接酶,TaKaRa公司;PCR純化試劑盒、DNA回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒,OMEGA生物科技公司;E.colipET-28a-KaPH1(E.coliKaPH1)、E.colipET-28a-P4H(E.coliP4H)本研究中構(gòu)建;標(biāo)準(zhǔn)品L-Pro、trans-4-Hpro、順式-4-羥基-L-脯氨酸(cis-4-Hpro),美國(guó)Sigma 公司;卡那霉素、IPTG,上海生工生物技術(shù)有限公司;其他分析純?cè)噭?,?guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;PCR引物、P4H的基因序列由上海睿迪生物科技有限公司合成。
Mastercycler nexus X2型PCR儀,Eppendorf公司;GelDoc 2000型凝膠成像系統(tǒng),Bio-Rad公司;酶標(biāo)儀,Thermo公司;pH計(jì),美國(guó)Mettler Toledo公司;Waters 2695型高效液相色譜儀,沃特世科技有限公司;Waters ACQUITY UPLC-MS/MS液質(zhì)聯(lián)用儀,沃特世科技有限公司;Avance 400型核磁共振波譜儀,Bruker公司;JY-IIN型超聲波細(xì)胞粉碎機(jī),寧波新芝生物公司;UV-3102PC型分光光度儀,美國(guó)UNIC公司;Avanti J-E型冷凍高速離心機(jī),Beckman Coulter公司。
1.2.1 目的基因片段的獲得
參照大腸桿菌密碼子偏好性、GC含量,對(duì)來源于Dactylosporangiumsp.的脯氨酸4-羥基化酶基因(P4H,GenBank No.BAA20094.1)進(jìn)行序列的優(yōu)化和設(shè)計(jì),將合成的基因片段連接到表達(dá)載體pET-28a中。
利用基因挖掘工具,將已報(bào)道的P4H在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中通過BLAST進(jìn)行同源序列比對(duì)后,選取與其序列同源性為51%的基因作為候選基因進(jìn)行重組克隆表達(dá)。以Kutzneriaalbida的全基因組為模板,以KaPH1-F-NdeⅠ(5’-T ̄G ̄C ̄A ̄T ̄C ̄A ̄T ̄A ̄T ̄G ̄C ̄T ̄C ̄A ̄C ̄C ̄G ̄A ̄T ̄T ̄C ̄G ̄C ̄A ̄G ̄T-3)和KaPH1-R-HindⅢ(5’-T ̄T ̄A ̄A ̄G ̄C ̄T ̄T ̄T ̄C ̄A ̄T ̄G ̄C ̄G ̄C ̄C ̄C ̄A ̄G ̄G ̄C-3’)為引物,擴(kuò)增目的片段KaPH1。PCR反應(yīng)體系:ddH2O 22 μL,引物F(50 pmol/μL) 1 μL,引物R(50 pmol/μL) 1 μL,基因組DNA 1 μL,PrimeSTAR Max Premix(2×)25 μL。PCR反應(yīng)過程:95 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃ 10 s,47 ℃ 5 s,72 ℃ 45 s,循環(huán)30次;72 ℃延伸10 min。用PCR純化試劑盒純化DNA片段,將獲得的基因片段連接到克隆載體pMD-19T中。
1.2.2 重組菌株的構(gòu)建
用限制性內(nèi)切酶NdeⅠ、HindⅢ對(duì)克隆載體pMD-19T-KaPH1和表達(dá)載體pET-28a分別進(jìn)行雙酶切,回收目的片段用T4 DNA連接酶于20 ℃過夜連接,轉(zhuǎn)化E.coliJM109 感受態(tài)細(xì)胞中,涂布含50 μg/mL 卡那霉素的LB平板,37 ℃培養(yǎng)12 h;挑取陽性克隆子,經(jīng)菌落PCR和DNA測(cè)序驗(yàn)證正確后,將重組質(zhì)粒pET-28a-P4H、pET-28a-KaPH1分別轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,構(gòu)建重組菌E.coliP4H和E.coliKaPH1。
1.2.3 重組大腸桿菌的培養(yǎng)和誘導(dǎo)表達(dá)
挑取重組大腸桿菌單菌落接種至5 mL含50 mg/L卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,于37 ℃、200 r/min 培養(yǎng)過夜,并以2%的接種量轉(zhuǎn)接至50 mL 含50 mg/L卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,于37 ℃、200 r/min 振蕩培養(yǎng)至OD600為0.6~0.8,為了探究重組菌株目的蛋白最優(yōu)的表達(dá)條件,設(shè)置添加的IPTG濃度為0.1、0.5和1.0 mmol/L,并將誘導(dǎo)溫度分別設(shè)置為20、25和30 ℃,于200 r/min 下誘導(dǎo)培養(yǎng)12 h后通過SDS-PAGE檢驗(yàn)蛋白可溶性表達(dá)情況[15]。
1.2.4 全細(xì)胞酶活測(cè)定方法
酶活測(cè)定體系(mmol/L):葡萄糖20,L-Pro 20,L-抗壞血酸5,2-OG 20,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.5,MgSO47H2O 2,CaCl20.5;加入一定量的全細(xì)胞,在28 ℃、200 r/min條件下反應(yīng)30 min,測(cè)定體系中trans-4-Hpro的生成量。
酶活定義:在28 ℃下,1 min生成1 mmol/Ltrans-4-Hpro所需要的全細(xì)胞的量定義為一個(gè)酶活單位(U)。
1.2.5E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化合成trans-4-Hpro
全細(xì)胞反應(yīng)體系(mmol/L):葡萄糖20,L-Pro 20,L-抗壞血酸5,2-OG 20,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.5,MgSO4·7H2O 2,CaCl20.5,菌體質(zhì)量分?jǐn)?shù)5%,初始 pH 7.0。將經(jīng)過誘導(dǎo)培養(yǎng)后的發(fā)酵液離心,稱取濕菌體質(zhì)量,然后用MES緩沖液將細(xì)胞沖洗懸浮后,在28 ℃搖床中200 r/min培養(yǎng)24 h,然后在沸水中加熱2 min,滅活菌體,終止酶反應(yīng),測(cè)定體系中trans-4-Hpro產(chǎn)量[16]。
分別在不同溫度梯度(20、25、30、35、40和50 ℃)和pH梯度下測(cè)定重組菌E.coliKaPH1全細(xì)胞活性,探究反應(yīng)體系的溫度和pH對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。不同pH梯度的反應(yīng)體系分別采用100 mmol/L MES-Tris緩沖液(pH 3.5~7)和100 mmol/L Tris-HCl緩沖液(pH 7~9)。
分別在不同2-OG濃度梯度(0~45 mmol/L)、Fe2+濃度梯度(0~3.5 mmol/L)和L-抗壞血酸濃度梯度(0~30 mmol/L)下測(cè)定重組菌E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化體系中trans-4-Hpro產(chǎn)量,探究轉(zhuǎn)化體系中共底物和輔因子對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。
考察轉(zhuǎn)化體系中的葡萄糖濃度(0~50 mmol/L)和CaCl2濃度(0~4 mmol/L)對(duì)重組菌E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化L-Pro活性的影響。
1.2.6 表達(dá)和反應(yīng)耦聯(lián)合成trans-4-Hpro的過程調(diào)控
取重組大腸桿菌單菌落接種至5 mL含50 mg/L卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,于37 ℃、200 r/min 培養(yǎng)過夜,并以6%的接種量轉(zhuǎn)接至50 mL 含50 mg/L卡那霉素的自誘導(dǎo)液體培養(yǎng)基(添加一定濃度的L-Pro)的500 mL擋板錐形瓶中,于37 ℃、225 r/min 振蕩培養(yǎng)3 h后,于20 ℃、225 r/min培養(yǎng)80 h,將發(fā)酵液離心,測(cè)定發(fā)酵上清中trans-4-Hpro的產(chǎn)量[16]。
對(duì)體系中產(chǎn)酶和催化耦聯(lián)過程進(jìn)行溫度階段性調(diào)控,在誘導(dǎo)培養(yǎng)時(shí)分別控制表達(dá)和轉(zhuǎn)化最適溫度條件的時(shí)間,確定最優(yōu)調(diào)控途徑。
在不同誘導(dǎo)劑濃度(10~30 mmol/L乳糖)下測(cè)定trans-4-Hpro的產(chǎn)量及全細(xì)胞的酶活,考察乳糖濃度對(duì)重組菌株E.coliKaPH1合成trans-4-Hpro的影響。
對(duì)耦聯(lián)轉(zhuǎn)化體系中底物 L-Pro設(shè)置濃度梯度(20~100 mmol/L),考察體系中trans-4-Hpro的產(chǎn)量和生物量(OD600)的變化,以分析底物濃度的增加對(duì)重組菌株E.coliKaPH1生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)化L-Pro活性的影響。
1.2.7 底物和產(chǎn)物的分析
使用芴甲氧羰酰氯(Fmoc-Cl)柱前試劑對(duì)樣品進(jìn)行衍生化反應(yīng)[17],終止反應(yīng)后用于HPLC 檢測(cè)。底產(chǎn)物的分析方法:Diomansil C18 柱(250 mm×4.6 mm),紫外檢測(cè)波長(zhǎng)263 nm,流動(dòng)相A 為(0.05 mol/L NaAc-HAc緩沖液(pH 4.2)與乙腈的體積比90∶ 10),流動(dòng)相B 為(0.05 mol/L NaAc-HAc緩沖液(pH 4.2)與乙腈的體積比20∶ 80),流動(dòng)相A和流動(dòng)相B采用梯度洗脫程序,流速1.0 mL/min。
1.2.8 產(chǎn)物結(jié)構(gòu)鑒定
采用液相色譜-質(zhì)譜( LC-MS)聯(lián)用技術(shù)及核磁共振儀(NMR) 對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行結(jié)構(gòu)表征。LC-MS 條件:采用液質(zhì)聯(lián)用儀Waters ACQUITY UPLC-MS/MS系統(tǒng),色譜柱為Waters ACQUITY UPLC HSS C18反相色譜柱(1.8 μm)。流動(dòng)相A為0.02 mol/L NH4Ac-HAc緩沖液(pH 4.2),流動(dòng)相B為乙腈,進(jìn)行梯度洗脫。流速200 μL/min,柱溫 25 ℃,進(jìn)樣量 5 μL。將10 mg的產(chǎn)物粉末溶于600 μL D2O后,轉(zhuǎn)移至直徑為5 mmol/L核磁管。由核磁共振波譜儀測(cè)定核磁共振氫譜(1H NMR)和碳譜(13C NMR)[18],反應(yīng)產(chǎn)物核磁數(shù)據(jù)如表1所示。
表1 化合物的核磁共振氫譜及碳譜分析
在前期研究工作中,筆者利用基因挖掘工具基于已報(bào)道的P4H序列通過同源序列比對(duì)獲得K.albida來源的新型羥基化酶KaPH1(GenBank No.WP_030110684.1),并對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了測(cè)定[19]。功能性驗(yàn)證試驗(yàn)表明KaPH1可將L-Pro高效地立體選擇性羥基化形成trans-4-Hpro,KaPH1純化后的蛋白條帶大小約為2.9×104,其最適pH為6.5,最適溫度為30 ℃;以L-Pro為底物,其Km和kcat值分別為1.07 mmol/L和 0.54 s-1[19]。在本研究中,筆者進(jìn)一步對(duì)重組菌E.coliKaPH1的表達(dá)條件進(jìn)行探究,結(jié)果如圖1所示。由圖1可見,E.coliKaPH1在分子量3×104處發(fā)現(xiàn)一條明顯的條帶,與目標(biāo)條帶分子量大小一致。通過對(duì)E.coliKaPH1表達(dá)條件優(yōu)化,結(jié)果表明:KaPH1在25和30 ℃條件下蛋白的總表達(dá)量較高,但是在上清中無法觀察到明顯目的條帶,大部分呈現(xiàn)為包涵體的形式;相比之下,KaPH1在20 ℃條件下雖然蛋白的總表達(dá)量較少,但可溶性表達(dá)效果最好。在考察的IPTG濃度(0.1、0.5、1 mmol/L)下,E.coliKaPH1均可表達(dá)可溶性的KaPH1,0.5和1 mmol/L IPTG條件下誘導(dǎo)的蛋白表達(dá)量一致且明顯高于0.1 mmol/L IPTG濃度下的蛋白表達(dá)量。由此確定E.coliKaPH1最適表達(dá)條件:20 ℃、0.5 mmol/L IPTG。
(a) M—標(biāo)準(zhǔn)蛋白;1、2—在20 ℃條件下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白;3、4—在25 ℃條件下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白;5、6—在30 ℃條件下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白;(b) 1′、2′—0.1 mmol/L IPTG濃度下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白;3′、4′—0.5 mmol/L IPTG濃度下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白;5′、6′—1 mmol/L IPTG濃度下KaPH1的總蛋白及可溶性蛋白圖1 重組大腸桿菌E.coli KaPH1在不同溫度(a)和IPTG濃度(b)誘導(dǎo)下的異源表達(dá)情況Fig.1 Heterologous expression of E.coli KaPH1 induced at different temperature (a) and IPTG concentration (b)
L-Pro的羥基化過程需要分子氧、2-OG和Fe2+等輔因子和共底物的協(xié)同作用[11],L-Pro的羥基化過程與共底物2-OG的脫羧反應(yīng)耦聯(lián)進(jìn)行。本研究采用E.coliKaPH1全細(xì)胞轉(zhuǎn)化體系,通過外源添加底物、共底物和輔因子等,對(duì)重組菌轉(zhuǎn)化L-Pro的活性進(jìn)行比較分析。
在全細(xì)胞體系中加入20 mmol/L的L-Pro作為底物,通過檢測(cè)反應(yīng)體系中trans-4-Hpro的產(chǎn)量來比較重組菌株E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化L-Pro的活性,結(jié)果如圖2所示。由圖2可知,在反應(yīng)前期階段,E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化體系中trans-4-Hpro迅速積累,在反應(yīng)12 h后臨近反應(yīng)終點(diǎn),體系中trans-4-Hpro的產(chǎn)量最終達(dá)到1 051 mg/L,轉(zhuǎn)化率為40.1%;與此同時(shí),對(duì)照E.coliP4H菌株反應(yīng)體系中trans-4-Hpro的積累量也達(dá)到825 mg/L,轉(zhuǎn)化率為31.4%。全細(xì)胞反應(yīng)轉(zhuǎn)化結(jié)果表明,在相同菌體濃度(質(zhì)量分?jǐn)?shù)5%)下,重組菌株E.coliKaPH1展現(xiàn)出很高的L-Pro轉(zhuǎn)化活性。在接下來的研究中,筆者將對(duì)E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化體系中影響trans-4-Hpro合成的因素進(jìn)行探究,并對(duì)產(chǎn)酶和催化耦聯(lián)過程進(jìn)行調(diào)控。
圖2 E.coli KaPH1轉(zhuǎn)化合成trans-4-Hpro的活性驗(yàn)證Fig.2 Catalytic activity of E.coli KaPH1 for trans-4-Hpro synthesis
為探究轉(zhuǎn)化合成trans-4-Hpro過程中的影響因素,通過對(duì)反應(yīng)條件及轉(zhuǎn)化體系中各組分的濃度進(jìn)行調(diào)控,檢測(cè)E.coliKaPH1活性或體系中trans-4-Hpro產(chǎn)量的變化。
2.2.1 溫度和pH對(duì)E.coliKaPH1 活性的影響
為了考察反應(yīng)溫度及pH對(duì)E.coliKaPH1活性的影響,在其他因素不變的條件下,分別設(shè)置溫度梯度(20、25、30、35、40和50 ℃)及pH梯度(MES緩沖液pH 3.5~7,Tris-HCl緩沖液pH 7~9),結(jié)果如圖3所示。由圖3可知,在25~40 ℃溫度范圍內(nèi),E.coliKaPH1活性維持在75%以上,并在30 ℃時(shí)達(dá)到最高值。在溫度低于30 ℃時(shí),E.coliKaPH1活性隨著溫度的升高逐漸升高;在溫度高于30 ℃時(shí),E.coliKaPH1的活性逐步降低,在50 ℃時(shí),E.coliKaPH1活性損失超過了50%。
在pH 3.5~5.0范圍內(nèi),E.coliKaPH1活性很低維持在25%以下,E.coliKaPH1活性在pH 5.5時(shí)迅速上升,并在pH 6.5時(shí)達(dá)到最高;在pH 7.0~9.0范圍內(nèi),E.coliKaPH1活性下降,且活性測(cè)定體系的顏色發(fā)生變化(Fe2+在堿性環(huán)境下發(fā)生反應(yīng))。綜上,本研究選擇30 ℃和pH 6.5為接下來單步轉(zhuǎn)化體系的反應(yīng)條件。
2.2.2E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化體系各組分對(duì)trans-4-Hpro合成的影響
圖3 溫度(a)和pH(b)對(duì)E.coli KaPH1 活性的影響Fig.3 Effect of temperature (a) and pH (b) on E.coli KaPH1 activity
1)2-OG對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。Trans-4-Hpro合成是由酶促羥基化反應(yīng)與2-OG氧化脫羧反應(yīng)相耦聯(lián)[20],通過改變反應(yīng)體系中2-OG的添加量探究其對(duì)重組菌的轉(zhuǎn)化活性及trans-4-Hpro合成的影響。由于2-OG具有極大的酸性,使用Tris將2-OG母液的pH調(diào)至7.0再添加至體系中,結(jié)果如圖4(a)所示。由圖4(a)可知,當(dāng)2-OG的濃度在0~30 mmol/L變化時(shí),2-OG對(duì)trans-4-Hpro的產(chǎn)生具有顯著的促進(jìn)作用,在20 mmol/L處產(chǎn)量達(dá)到最高,為1 220 mg/L。隨著2-OG濃度的繼續(xù)增加,trans-4-Hpro的產(chǎn)量增長(zhǎng)趨勢(shì)不明顯,反應(yīng)體系的pH上升至8.6~8.9,這是由于2-OG在反應(yīng)過程中不斷被消耗,對(duì)反應(yīng)體系的緩沖影響很大,造成體系pH的變化,從而影響了重組酶KaPH1的活性。
2)Fe2+對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。Fe2+是2-OG依賴的雙加氧酶的金屬中心與底物相互作用的輔因子,所以Fe2+濃度會(huì)對(duì)重組酶的活性和羥基化反應(yīng)有很大的影響[21]。針對(duì)全細(xì)胞催化系統(tǒng)(底物添加濃度20 mmol/L),考察反應(yīng)體系中Fe2+濃度對(duì)重組菌轉(zhuǎn)化活性的影響,結(jié)果如圖4(b)所示。由圖4(b)可知,F(xiàn)e2+濃度在0~1.5 mmol/L變化時(shí),對(duì)trans-4-Hpro的產(chǎn)生沒有很大影響。隨著Fe2+濃度的繼續(xù)增加,羥脯氨酸的產(chǎn)量逐步上升,在2.5 mmol/L處達(dá)到最大產(chǎn)量為1 246 mg/L。因此,F(xiàn)e2+最適添加濃度為2.5 mmol/L。
圖4 E.coli KaPH1轉(zhuǎn)化體系各組分對(duì)L-Pro羥基化的影響Fig.4 Optimization of components in E.coli KaPH1 transformation system for L-proline hydroxylation
3)L-抗壞血酸對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。Fe2+在水溶液中極易容易被氧化,在針對(duì)Fe(II)/2-OG 依賴型雙加氧酶催化機(jī)制的研究發(fā)現(xiàn)[21],該反應(yīng)過程在某些情況下與抗壞血酸的氧化耦聯(lián),在體外系統(tǒng)中添加抗壞血酸或其他還原劑對(duì)Fe(II)/2-OG 依賴型雙加氧酶具有一定的激活作用[22]。在考察反應(yīng)體系中L-抗壞血酸濃度對(duì)重組菌催化活性的影響時(shí),將L-抗壞血酸濃度設(shè)定為0~30 mmol/L。由圖4(c)發(fā)現(xiàn):添加L-抗壞血酸更有利于trans-4-Hpro的合成;添加10 mmol/L抗壞血酸時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量達(dá)到最高水平(1 158 mg/L)。隨著L-抗壞血酸濃度的持續(xù)增加,它對(duì)轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的緩沖體系也造成很大影響,因此,將L-抗壞血酸濃度設(shè)定為10 mmol/L。
4)CaCl2對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。CaCl2雖然并未直接參與L-Pro的羥基化反應(yīng),但CaCl2與菌株細(xì)胞膜的通透性有關(guān),從而影響到產(chǎn)物的釋放,避免產(chǎn)物抑制。對(duì)轉(zhuǎn)化體系中的 CaCl2設(shè)置 0.5~4.0 mmol/L濃度梯度,所得數(shù)據(jù)結(jié)果如圖4(d)所示。由圖4(d)可知,較低濃度的CaCl2對(duì)trans-4-Hpro酸的產(chǎn)量有一定程度的提高,在0.5 mmol/L達(dá)到最高水平(1 182 mg /L)。
5)葡萄糖對(duì)trans-4-Hpro合成的影響。葡萄糖經(jīng)TCA循環(huán)化生成中間代謝產(chǎn)物2-OG[23],2-OG氧化脫羧反應(yīng)與L-Pro的羥基化反應(yīng)相耦聯(lián),葡萄糖含量會(huì)對(duì)trans-4-Hpro的合成有一定影響,因此對(duì)轉(zhuǎn)化體系的葡萄糖設(shè)濃度梯度,結(jié)果如圖4(e)所示。由圖4(e)可知,在添加濃度為0~30 mmol/L的范圍內(nèi),葡萄糖濃度的升高對(duì)L-Pro的羥基化反應(yīng)較為有利,在30 mmol/L時(shí)trans-4-Hpro產(chǎn)量達(dá)到最高水平(1 112 mg/L)。但過高的葡萄糖濃度會(huì)急劇減少trans-4-Hpro的產(chǎn)生,是因?yàn)槠咸烟菨舛冗^高,導(dǎo)致重組菌的代謝副產(chǎn)物乙酸濃度增加[24],從而對(duì)重組菌的轉(zhuǎn)化活性產(chǎn)生影響。
Studier[25]針對(duì)表達(dá)型質(zhì)粒自發(fā)誘導(dǎo)問題建立了自誘導(dǎo)表達(dá)系統(tǒng),解決了原核生物高效表達(dá)過程中存在的問題。本研究中,筆者采用自誘導(dǎo)培養(yǎng)基進(jìn)行產(chǎn)酶表達(dá),在體系中加入L-Pro和其他輔因子,目的是將產(chǎn)酶表達(dá)和催化過程進(jìn)行耦聯(lián),并對(duì)體系進(jìn)行調(diào)控以建立高效發(fā)酵轉(zhuǎn)化體系(圖5)。
圖5 酶表達(dá)與反應(yīng)耦聯(lián)合成trans-4-HproFig.5 Enzyme expression and reaction coupling system for the synthesis of trans-4-Hpro
2.3.1 表達(dá)和反應(yīng)耦聯(lián)過程的溫度調(diào)控
重組酶KaPH1在20 ℃的條件下可溶性表達(dá)最好,同時(shí)通過全細(xì)胞酶活測(cè)定確定最適反應(yīng)溫度為30 ℃?,F(xiàn)在對(duì)整個(gè)反應(yīng)過程進(jìn)行階段性溫度調(diào)控,設(shè)置底物初始添加濃度為20 mmol/L,然后將反應(yīng)時(shí)間設(shè)為80 h,轉(zhuǎn)化結(jié)果如圖6所示。由圖6可知:在溫度調(diào)控途徑一條件下,trans-4-Hpro的產(chǎn)量為1 662 mg/L,產(chǎn)率為63.4%;在溫度調(diào)控途徑二條件下,trans-4-Hpro為2 165 mg/L,產(chǎn)率82.6%;在溫度調(diào)控途徑三條件下,trans-4-Hpro的產(chǎn)量為2 512 mg/L,產(chǎn)率95.8%;在溫度調(diào)控途徑四條件下,trans-4-Hpro的產(chǎn)量為2 450 mg/L,產(chǎn)率92%。
圖6 耦聯(lián)體系合成trans-4-Hpro的溫度調(diào)控Fig.6 Temperature gradient-based regulation of coupling- system for the synthesis of trans-4-Hpro
(a)溫度調(diào)控途徑一:將E.coliKaPH1接入耦聯(lián)體系37 ℃培養(yǎng)3 h后,變溫為20 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)20 h,將溫度轉(zhuǎn)為30 ℃反應(yīng)60 h。(b)溫度調(diào)控途徑二:將E.coliKaPH1接入耦聯(lián)體系37 ℃培養(yǎng)3 h后,變溫為20 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)40 h,將溫度轉(zhuǎn)為30 ℃反應(yīng)40 h。(c)溫度調(diào)控途徑三:將E.coliKaPH1接入耦聯(lián)體系37 ℃培養(yǎng)3 h后,變溫為20℃誘導(dǎo)培養(yǎng)60 h,將溫度轉(zhuǎn)為30 ℃反應(yīng)20 h。(d)溫度調(diào)控途徑四:將E.coliKaPH1接入耦聯(lián)體系37 ℃培養(yǎng)3 h后,變溫為20℃誘導(dǎo)培養(yǎng)80 h。
由圖6結(jié)果可知,溫度調(diào)控對(duì)OD600的積累沒有太大影響,轉(zhuǎn)化過程中E.coliKaPH1最高OD600均達(dá)到15左右。同時(shí),溫度的改變對(duì)細(xì)胞活性影響很大,其中途徑一、二體系在變溫之后,全細(xì)胞活性迅速下降。而在途徑三中,將E.coliKaPH1接入耦聯(lián)體系37 ℃培養(yǎng)3 h,變溫為20 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)60 h后全細(xì)胞比酶活仍保持在0.55 U/g,最終將溫度轉(zhuǎn)為30 ℃反應(yīng)20 h,產(chǎn)率可達(dá)到95.8%。綜上,溫度調(diào)控途徑三為有利于trans-4-Hpro的合成。
2.3.2 乳糖濃度對(duì)表達(dá)和反應(yīng)耦聯(lián)合成trans-4-Hpro的影響
重組菌株高密度生長(zhǎng)表達(dá)異源蛋白,以乳糖作為誘導(dǎo)劑可以提高蛋白表達(dá)量,降低生產(chǎn)成本[26]??疾烊樘菨舛葘?duì)表達(dá)和反應(yīng)耦聯(lián)合成trans-4-Hpro的影響,結(jié)果如圖7所示。由圖7可見,在乳糖為5 g/L時(shí),體系中trans-4-Hpro的產(chǎn)量?jī)H2 802 mg/L,產(chǎn)率為53%。在5~20 g/L的范圍內(nèi),隨著乳糖濃度的提高,體系中trans-4-Hpro的合成速率及生物量有增長(zhǎng)的趨勢(shì),酶活在36 h時(shí)達(dá)到最高。當(dāng)乳糖為15 g/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量達(dá)到最高為3 782 mg/L,產(chǎn)率為72%;當(dāng)乳糖提高至25 g/L時(shí),產(chǎn)量、E.coliKaPH1 OD600及比酶活均有所降低。高濃度的乳糖雖然會(huì)加快trans-4-Hpro的前期合成速率,但是由于乳糖分解生成的半乳糖無法被大腸桿菌所利用,會(huì)造成原料的浪費(fèi)。綜上,筆者選擇在體系中添加15 g/L的乳糖濃度來誘導(dǎo)合成trans-4-Hpro。
圖7 乳糖濃度對(duì)生物合成trans-4-Hpro的影響Fig.7 Effects of lactose concentration on the synthesis of trans-4-Hpro
2.3.3 底物濃度對(duì)E.coliKaPH1合成trans-4-Hpro的影響
為進(jìn)一步探究底物濃度對(duì)耦聯(lián)轉(zhuǎn)化過程的影響,保證體系中其他因素不變的情況下提高L-pro的濃度,檢測(cè)體系中trans-4-Hpro的變化,結(jié)果如圖8所示。由圖8可知:L-Pro濃度為20 mmol/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量為2 223 mg/L,OD600達(dá)到20.89,產(chǎn)率為84.8%;L-Pro濃度為40 mmol/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量為3 960 mg/L,OD600達(dá)到22.14,產(chǎn)率為75.5%;L-Pro濃度為60 mmol/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量為4 871 mg/L,OD600達(dá)到21.12,產(chǎn)率為60.3%;L-Pro濃度為80 mmol/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量為6 007 mg/L,OD600達(dá)到23.16,產(chǎn)率56.4%;在培養(yǎng)基中L-Pro濃度為100 mmol/L時(shí),trans-4-Hpro的產(chǎn)量為7 860 mg/L,OD600達(dá)到22.82,產(chǎn)率為59.9%。在不同的底物濃度下,耦聯(lián)轉(zhuǎn)化體系反應(yīng)過程中中生物量的積累量變化不明顯,隨著底物濃度的升高,OD600有一定的提高。反應(yīng)終點(diǎn)時(shí),筆者發(fā)現(xiàn)在不同的底物濃度下體系中L-Pro均無剩余,但隨著底物濃度的提高,L-Pro有效轉(zhuǎn)化率逐步下降。針對(duì)E.coliKaPH1高底物濃度下有效轉(zhuǎn)化率降低和底物的異常消耗現(xiàn)象[27],還需從代謝角度分析并對(duì)菌株進(jìn)行進(jìn)一步的工程改造,以滿足工業(yè)化生產(chǎn)需求。
圖8 底物濃度對(duì)trans-4-Hpro的合成及生物量的影響Fig.8 Effects of substrate concentration on the synthesis of trans-4-Hpro and biomass
基于已報(bào)道的P4H的基因序列,采用功能酶基因探礦方法,挖掘獲得可以高效羥基化L-Pro的新型羥基化酶KaPH1,對(duì)E.coliKaPH1轉(zhuǎn)化體系合成trans-4-Hpro進(jìn)行過程優(yōu)化,將產(chǎn)量提高了18.5%。為了拓展新酶KaPH1的高效利用,將產(chǎn)酶和催化過程耦聯(lián)并調(diào)控,添加100 mmol/L的L-Pro作為底物,有效轉(zhuǎn)化率可達(dá)到60%,OD600可達(dá)到20以上。通過過程調(diào)控,提高了新酶資源的高效利用,為生物合成trans-4-Hpro高效轉(zhuǎn)化體系的建立提供理論和實(shí)踐基礎(chǔ)。