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        煙草BELL基因家族鑒定及其溫室條件下的表達(dá)模式分析

        2020-02-08 08:45:04宋衛(wèi)娜趙森森武明珠王根發(fā)羅朝鵬李澤鋒
        煙草科技 2020年1期
        關(guān)鍵詞:內(nèi)含子外顯子擬南芥

        宋衛(wèi)娜,趙森森,武明珠,王根發(fā),羅朝鵬,王 晨,李澤鋒,楊 軍,王 中*

        1.中國(guó)煙草總公司鄭州煙草研究院,鄭州高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)楓楊街2號(hào) 450001

        2.鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,鄭州高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)科學(xué)大道100號(hào) 450001

        3.河南中煙工業(yè)有限責(zé)任公司技術(shù)中心,鄭州市經(jīng)濟(jì)技術(shù)開(kāi)發(fā)區(qū)第三大街9號(hào) 450000

        植物TALE(Three amino-acid loop extension)基因家族編碼一類包含同源異型盒結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,其DNA結(jié)合域由63個(gè)氨基酸組成,形成2個(gè)螺旋與3個(gè)額外氨基酸(P-Y-P)的非典型結(jié)構(gòu)[1-2]。根據(jù)序列和進(jìn)化上的差異,植物TALE基因家族可進(jìn)一步被分為BELL(BEL1-like homeodomain)和KNOX(KNOTTED1-like homeobox)兩個(gè)亞家族。KNOX基因主要參與細(xì)胞分化和莖尖分生組織的維持[3-4],而B(niǎo)ELL基因在胚珠發(fā)育、葉狀體發(fā)育、干細(xì)胞維持和分化中起著重要作用[5-7]。

        BELL基因家族存在于所有生物體中,但不同植物中該基因家族成員數(shù)目不同。例如,苔蘚基因組中有 4個(gè)BELLs基因[8],擬南芥有13個(gè)[5],玉米有15個(gè)[9],而水稻和土豆各有14個(gè)[10-11]。雖然BELL基因家族的數(shù)目不同,但其編碼的蛋白在結(jié)構(gòu)上具有高度保守性,都包含SKY、BEL和HD功能域[12]。這3個(gè)功能域的高度保守對(duì)維持植物BELL的功能具有重要意義。研究表明,SKY和BEL功能域能夠與KNOX蛋白的MEINOX結(jié)構(gòu)域進(jìn)行特異性識(shí)別和結(jié)合,從而形成BELL-KNOX異源二聚體蛋白[13],這種結(jié)合對(duì)兩種轉(zhuǎn)錄因子蛋白的核定位和結(jié)合靶基因序列的活性至關(guān)重要[14-16]。BELL-KNOX二聚體形成后會(huì)從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核中,隨后兩個(gè)蛋白的HD功能域識(shí)別并特異結(jié)合到各自的靶基因序列上,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)下游靶基因表達(dá)水平的調(diào)控[2,17]。與此同時(shí),BELL-KNOX二聚體蛋白還能與其他轉(zhuǎn)錄因子互作。例如,與MADS-Box轉(zhuǎn)錄因子和SPOROCYTELESS蛋白結(jié)合,共同調(diào)控胚珠的發(fā)育[18-19];與OVATE蛋白結(jié)合后,BELL-KNOX二聚體蛋白能夠從細(xì)胞核反向轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)中[20]。多種具有不同活性的異源BELL-KNOX二聚體組合參與調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育,包括莖尖分生組織及其邊界的維持、葉片發(fā)育、開(kāi)花等[20-23]。在擬南芥中,BELL家族的BLH1蛋白能夠與KNOX家族的KNAT3蛋白結(jié)合形成BLH1-KNAT3二聚體,通過(guò)調(diào)控脫落酸(ABA)信號(hào)通路相關(guān)基因的表達(dá)而影響種子的發(fā)芽和生長(zhǎng)[14,20]。BELL 家族的ATH1蛋白與 KNOX 家族STM蛋白形成的二聚體能夠調(diào)控植物頂端分生組織的發(fā)育[15],而ATH1蛋白和KNAT2蛋白形成的二聚體則調(diào)控植物花序組織的發(fā)育[24]。

        雖然已在多種植物中鑒定出了BELL基因,但大多數(shù)基因的功能仍未十分明確。目前,關(guān)于BELL基因功能的研究主要集中在模式植物擬南芥中,鮮見(jiàn)煙草BELL(NtBELL)基因的報(bào)道。根據(jù)煙草基因組數(shù)據(jù)庫(kù),利用生物信息學(xué)的方法,通過(guò)檢索SKY、BEL和HD功能域鑒定出煙草基因組中的BELL基因后,對(duì)煙草BELL家族成員的序列特征、進(jìn)化關(guān)系和表達(dá)模式進(jìn)行分析,以期為進(jìn)一步研究煙草BELL基因的功能奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料、試劑和儀器

        供試材料為普通栽培煙草紅花大金元(Nicotiana tabacum L.)。煙草種子于2017年3月播種于MS培養(yǎng)基上,待幼苗長(zhǎng)至4片真葉時(shí),移栽到小盆缽中。移栽后的幼苗種植在國(guó)家煙草基因研究中心溫室,溫室條件為28℃光照16 h,23℃黑暗8 h。待煙苗長(zhǎng)至盛花期,分別收集根、莖、葉、頂芽、花蕾和花等樣品,經(jīng)液氮速凍后于-80℃保存。

        TransTaq?高保真Taq酶試劑盒(北京全式金生物技術(shù)有限公司);反轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京康潤(rùn)誠(chéng)業(yè)生物科技有限公司);植物多酚RNA提取試劑盒、實(shí)時(shí)熒光定量試劑盒和凝膠回收試劑盒(北京艾德萊生物科技有限公司);限制性內(nèi)切酶(大連寶生物工程有限責(zé)任公司)。引物由北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司合成;其他常規(guī)試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?/p>

        MM400混合型碾磨儀(德國(guó)Retsch公司);Nanodrop 2000超微量分光光度計(jì)(美國(guó)Thermo公司);C1000TMThermal Cycler熒光定量PCR儀(美國(guó)BIO-RAD公司)。

        1.2 方法

        1.2.1 干旱和鹽脅迫處理

        煙草幼苗在MS培養(yǎng)基上長(zhǎng)至4片真葉時(shí),選取長(zhǎng)勢(shì)一致的幼苗分別移入含有0、1%和3%(質(zhì)量體積比)NaCl的MS培養(yǎng)基上。正常條件下繼續(xù)培養(yǎng)1周,收取全株幼苗,液氮速凍后用于總RNA的提取。將幼苗從MS培養(yǎng)基移栽到盆缽中,溫室中生長(zhǎng),每周澆2次水,每次300 mL。待煙苗長(zhǎng)至8片真葉時(shí)進(jìn)行干旱處理,分別采集斷水后0、2、4和6 d的煙草葉片[25-26],液氮速凍后用于總RNA的提取。

        1.2.2 RNA提取和反轉(zhuǎn)錄

        采用植物多酚RNA提取試劑盒提取煙草各組織RNA,實(shí)驗(yàn)操作嚴(yán)格按照產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。在提取過(guò)程中,加入RNase-free DNase I消化可能殘留的基因組DNA。提取完成后,各RNA樣品的濃度和質(zhì)量分別用Nanodrop 2000和瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。選擇質(zhì)量檢測(cè)合格且濃度較高的RNA樣品用于cDNA第一鏈的合成,合成過(guò)程參照Gene Star M-MLV反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)。cDNA樣品的濃度經(jīng)Nanodrop 2000檢測(cè)后,用ddH2O統(tǒng)一稀釋至40 ng/μL,-20 ℃保存。

        1.2.3 生物信息學(xué)分析

        以BEL1-like homeodomain protein為關(guān)鍵詞在中國(guó)煙草基因組數(shù)據(jù)庫(kù)V4.0中進(jìn)行檢索,獲得所有普通煙草中的候選BELLs基因。隨后將所有候選基因編碼的蛋白序列導(dǎo)入到Pfam軟件(http://pfam.xfam.org/search)中進(jìn)行功能域分析,選擇同時(shí)包含SKY、BEL和HD功能域的基因作為煙草BELL家族基因。提取各NtBELLs基因的序列、染色體位置、外顯子個(gè)數(shù)、核苷酸長(zhǎng)度、蛋白質(zhì)長(zhǎng)度、蛋白分子量、等電點(diǎn)等信息。利用DNAMAN V6.0比對(duì)煙草BELLs基因編碼蛋白的氨基酸序列,再利用 MEME 軟件(http://meme-suite.org/)確定煙草BELLs基因3個(gè)保守功能域的氨基酸序列,用GSDS軟件(http://gsds.cbi.p-ku.edu.cn/)分析基因的外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu),并繪圖。

        根據(jù)NtBELLs基因在煙草染色體上的位置信息,利用MapInsect軟件進(jìn)行染色體定位和圖譜的繪制。用Clustal X軟件比對(duì)不同物種中BELLs基因編碼的氨基酸序列,比對(duì)完成后將結(jié)果導(dǎo)入MEGA5軟件中,用Neighbor-joining方法構(gòu)建BELLs基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。本研究中,用到其他物種的BELLs基因分別來(lái)自擬南芥(AtBEL10/AT1G19700、AtBLH5/AT2G27220、AtBLH3/AT1G75410、tBLH6/AT4G34610、AtBLH7/AT2G16400、AtBLH11/AT1G 75430、AtBEL1/AT5G41410、AtBLH4/AT2G23760、AtBLH2/AT4G36870、AtBLH1/AT2G35940、AtBLH8/AT2G27990、AtBLH9/AT5G02030、AtATH1/AT4G32 980)和馬鈴薯(StBLH5/PGSC0003DMP400010515、StBEL29/PGSC0003DMP400036956、StBEL11/PGSC 0003DMP400034115、StBEL13/PGSC0003DMP4000 17878、StBEL14/PGSC0003DMP400021824、StBEL22/PGSC0003DMP400038077、StBEL30/PGSC0003DMP 400053924、StBEL32/PGSC0003DMP400006695、StBE L33/PGSC0003DMP400041981、StBEL34/PGSC0003 DMP400014183、StBEL35/PGSC0003DMP400033253、StBEL6/PGSC0003DMP400052181、StBEL31/PGSC 0003DMP400006694)。

        1.2.4 基因表達(dá)分析

        利用熒光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技術(shù)檢測(cè)煙草NtBELLs基因在根、莖、葉等不同組織和脅迫條件下的表達(dá),引物見(jiàn)表1。在冰上配制qRT-PCR反應(yīng)體系:10 μL 2×SYBR Green Master、3 μL cDNA 模板(40 ng/μL)、上 下 游 引 物(10 μmol/L) 各 1 μL、5 μLddH2O,充分混勻后瞬時(shí)離心。qRT-PCR反應(yīng)程序采用兩步法,即95℃ 3 min;95℃ 10 s,60℃30 s,信號(hào)采集,45個(gè)循環(huán)。反應(yīng)結(jié)束后運(yùn)行溶解曲線程序(65~95℃)。以3株長(zhǎng)勢(shì)相近的煙草葉片作為1個(gè)獨(dú)立的生物學(xué)重復(fù),每個(gè)組織共設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù)。qRT-PCR反應(yīng)結(jié)束后,采用2-ΔCT或 2-ΔΔCT方法計(jì)算NtBELLs基因的相對(duì)表達(dá)量[27]。

        表1 NtBELLs基因引物Tab.1 Primers of NtBELL genes

        2 結(jié)果與分析

        2.1 煙草BELLs基因的鑒定

        在中國(guó)煙草基因組數(shù)據(jù)庫(kù)V4.0中,用BEL1-like homeodomain protein作為關(guān)鍵字進(jìn)行檢索后,共獲得28個(gè)可能的BELLs基因。通過(guò)Pfam功能域分析發(fā)現(xiàn),28個(gè)煙草BELLs基因均包含典型的SKY、BEL和HD結(jié)構(gòu)域,屬于BELL基因家族成員。由表2可知,NtBELLs基因含有3~8個(gè)外顯子,大多數(shù)含有4個(gè)。NtBELL基因的編碼區(qū)在1 299~2 289 bp之間,編碼432~762個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子量在48.81~82.99 kDa之間,等電點(diǎn)為4.88~9.15。

        兩兩比對(duì)NtBELLs基因編碼區(qū)序列和氨基酸序列的相似性(表3),根據(jù)相似性的高低,將NtBELLs基因分為15組,分別命名為NtBELL1~NtBELL15。其中,NtBELL7和NtBELL15各有1個(gè)拷貝,而其他NtBELLs基因都有兩個(gè)相似性很高的拷貝。

        2.2 煙草NtBELLs基因的染色體定位及進(jìn)化分析

        由圖1可知,除3個(gè)定位在scaffold上的NtBELLs基因(Ntab0312290、Ntab0471080和 Ntab0547850)外,其余25個(gè)煙草NtBELLs基因分別分布在15條不同的染色體上。其中,7和22號(hào)染色體上分布的BELLs基因最多,各有3個(gè)。NtBELL8基因的兩個(gè)拷貝(Ntab0734150和Ntab0815520)都分布在10號(hào)染色體上,而且二者序列相似性為100%,推測(cè)可能由染色體復(fù)制產(chǎn)生。NtBELL4和NtBELL5基因的兩個(gè)拷貝都分別分布在5和22號(hào)染色體上,且相鄰在一起,表明二者之間可能存在一定的連鎖性。

        表2 普通煙草中BELLs的基因信息Tab.2 Information of BELL genes in Nicotiana tabacum

        圖1 NtBELLs基因在染色體上的分布Fig.1 Chromosome location of NtBELL genes

        為進(jìn)一步明確煙草BELL基因家族成員的進(jìn)化關(guān)系和可能的生物學(xué)功能,根據(jù)煙草、擬南芥和馬鈴薯BELLs基因編碼的氨基酸序列,構(gòu)建BELL基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。由圖2可知,BELL基因家族被分為4個(gè)組,即BELL-Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ。煙草NtBELL基因在4個(gè)組上的分布較為均勻,如BELL-Ⅰ和Ⅲ各有6個(gè)NtBELLs基因,BELL-Ⅱ有9個(gè),BELL-Ⅳ有7個(gè)。擬南芥、馬鈴薯已有的BELLs基因功能研究結(jié)果表明,不同組的BELLs基因可能具有不同的生物學(xué)功能[11,13-15]。推測(cè) BELL-Ⅰ組中的NtBELL1、NtBELL4和NtBELL5蛋白可能主要作為OVATE家族蛋白的伴侶發(fā)揮功能;BELL-Ⅱ組中NtBELL2、NtBELL3、NtBELL6、NtBELL7和 NtBE LL8蛋白主要參與根的生長(zhǎng);BELL-Ⅲ組中的BELLs蛋白主要參與分生組織的發(fā)育;BELL-Ⅳ組中的NtBELL14和NtBELL15蛋白可能參與調(diào)控胚珠的形態(tài)發(fā)育,而NtBELL11和NtBELL12蛋白則可能參與葉片的形態(tài)發(fā)育[1,11,15,28-29]。

        2.3 煙草NtBELLs基因的結(jié)構(gòu)及蛋白結(jié)構(gòu)域分析

        圖2 BELL基因家族系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.2 Phylogenetic analysis of BELL gene families in plants

        煙草28個(gè)NtBELLs基因的長(zhǎng)度差異非常大,最長(zhǎng)的基因(Ntab0312290)有11 259 bp,而最短的基因(Ntab0844240)只有1 786 bp,大多數(shù)基因的長(zhǎng)度在3~5 kb之間(圖3)。典型的煙草NtBELLs基因由3個(gè)內(nèi)含子和4個(gè)外顯子組成,且外顯子的長(zhǎng)度(尤其是第2和第3個(gè)外顯子)比較保守。NtBELL1、NtBELL2、NtBELL5、NtBELL8~NtBELL13 基因均包含4個(gè)外顯子,其中第2個(gè)外顯子的長(zhǎng)度在322~400 bp之間,第3個(gè)外顯子長(zhǎng)度在61 bp左右。其他NtBELLs基因的結(jié)構(gòu)則是在此基礎(chǔ)上發(fā)生了內(nèi)含子的插入,形成更多的內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)。例如,NtBELL3基因的第1、2和4號(hào)外顯子中間分別插入了1個(gè)內(nèi)含子,形成了6個(gè)內(nèi)含子和7個(gè)外顯子的結(jié)構(gòu)。不同NtBELLs基因同一內(nèi)含子的長(zhǎng)度差異很大,同一NtBELL基因的不同內(nèi)含子長(zhǎng)度也有較大的差異。不同NtBELLs基因中,第1個(gè)內(nèi)含子的長(zhǎng)度為300~3 000 bp;NtBELL14基因所有內(nèi)含子的長(zhǎng)度在92~4 700 bp之間。NtBELLs基因內(nèi)含子長(zhǎng)度的差異可能與基因的選擇性剪切有關(guān)。

        比對(duì)煙草NtBELLs蛋白的氨基酸序列后發(fā)現(xiàn),有兩個(gè)保守性很高的區(qū)域(圖4A),分析發(fā)現(xiàn)其分別包含BELLs蛋白的3個(gè)典型功能域,即SKY、BEL和HD。用MEME軟件進(jìn)一步分析這3個(gè)功能域在所有煙草NtBELLs蛋白中的保守氨基酸(圖4B),發(fā)現(xiàn)保守性最高的是HD功能域。3個(gè)功能域在NtBELLs基因上的分布位置也非常保守,SKY分布在第1和第2個(gè)外顯子上,BEL和HD功能域連在一起,分布在第2、3和4個(gè)外顯子上。

        2.4 煙草NtBELLs基因的表達(dá)模式分析

        檢測(cè)了NtBELLs基因在普通煙草盛花期根、莖、葉、花蕾、花和果實(shí)中的表達(dá)水平(圖5)。幾乎每個(gè)NtBELLs基因都有兩個(gè)拷貝(除NtBELL7和NtBELL15),引物設(shè)計(jì)時(shí)很難將同一基因的不同拷貝區(qū)分開(kāi),因此選擇在基因保守區(qū)段設(shè)計(jì)兩個(gè)拷貝的通用引物。在煙草根、莖、葉、花蕾、花和果實(shí)等組織中都能檢測(cè)到NtBELLs基因的表達(dá),但是不同組織中NtBELLs基因的表達(dá)量有明顯差異。在根中,NtBELL2、NtBELL3和NtBELL7基因的表達(dá)水平明顯高于其他NtBELLs基因;在莖中,表達(dá)量最高是 NtBELL1、NtBELL2、NtBELL8和 NtBELL13基因;在葉中表達(dá)量最高的是NtBELL11和NtBELL12基因;在花中,NtBELL5、NtBELL6、NtBELL11 和NtBELL12基因的表達(dá)水平均較高;而在果實(shí)中表達(dá)水平最高的是NtBELL14和NtBELL15基因?;虮磉_(dá)水平的巨大差異預(yù)示著不同的NtBELLs基因可能在煙草各個(gè)組織發(fā)育中發(fā)揮著不同的生物學(xué)功能。

        圖3 煙草NtBELLs基因的外顯子和內(nèi)含子Fig.3 Exons and introns of NtBELL genes

        圖4 煙草NtBELLs蛋白功能域分析Fig.4 Functional domain analysis of NtBELL proteins

        圖5 不同組織中NtBELLs基因的表達(dá)水平Fig.5 Expression levels of NtBELL genes in different tobacco tissues

        為探究NtBELLs基因在煙草抵御環(huán)境脅迫過(guò)程中的功能,分別檢測(cè)了NtBELLs基因在干旱和鹽脅迫處理?xiàng)l件下的表達(dá)水平。如圖6所示,大多數(shù)NtBELLs基因的表達(dá)水平在干旱條件下沒(méi)有明顯變化。與0 d相比,NtBELL2基因的表達(dá)水平在干旱處理2 d時(shí)升高了兩倍,隨后一直保持在兩倍以 上 的 水 平 。 NtBELL4、NtBELL8、NtBELL10和NtBELL13基因的表達(dá)水平都是在干旱處理4 d時(shí)開(kāi)始升高,6 d時(shí)達(dá)到更高的水平。其中,NtBELL8基因的表達(dá)水平在6 d升高了3倍,是所有基因中變化量最大的。干旱脅迫誘導(dǎo)NtBELL8基因的表達(dá)水平顯著上調(diào),表明其可能參與了煙草的抗旱過(guò)程。

        NaCl脅迫處理實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),不同濃度NaCl對(duì)煙草NtBELLs基因表達(dá)水平的影響不同。1%NaCl脅迫處理下,所有NtBELLs基因的表達(dá)水平都沒(méi)有明 顯 變 化 ,但 是 NtBELL2、NtBELL3、NtBELL6、NtBELL13和NtBELL15基因的表達(dá)水平在3%NaCl處理?xiàng)l件下被明顯上調(diào)(圖7),尤其是NtBELL6基因的表達(dá)水平被上調(diào)了3倍。

        3 討論

        圖6 干旱條件下煙草NtBELLs基因的表達(dá)水平Fig.6 Expression levels of NtBELL genes under drought treatment

        圖7 NaCl脅迫下煙草NtBELL基因的表達(dá)水平Fig.7 Expression levels of NtBELL genes under NaCl stress

        研究表明,多基因家族各成員之間的功能往往會(huì)發(fā)生明顯的分化,系統(tǒng)分析基因家族各成員的序列特征、進(jìn)化關(guān)系、表達(dá)模式等可為研究其功能提供指導(dǎo)[30-32]。AtBELLs各成員分別參與了不同組織器官的分化。如AtBLH2(AT4G36870)和AtBLH4(AT2G23760)在擬南芥的葉片、莖、花藥等多個(gè)組織中表達(dá),在atblh2atblh4的雙突變體中,KNOX家族的BP(BREVIPEDICELLUS)基因異位表達(dá),導(dǎo)致突變體葉片呈現(xiàn)卷曲的鋸齒狀[5,33]。而AtBLH8(AT2G27990)和AtBLH9基因(AT5G02030)的突變體表現(xiàn)出花序節(jié)間異常,角果畸形簇生,表明二者能夠調(diào)控?cái)M南芥花序原基的生長(zhǎng)[17,34]。根據(jù)擬南芥[13-15]、玉米[9]、馬鈴薯[11]等已有的同源基因研究信息,本研究中對(duì)煙草NtBELLs各成員的功能進(jìn)行了初步的劃分(圖2)。NtBELL9、NtBELL10和NtBELL13基因與擬南芥AtBLH8和AtBLH9基因的親緣關(guān)系較近,推測(cè)NtBELL9、NtBELL10和NtBELL13基因可能參與調(diào)控?zé)煵莘稚M織;NtBELL11和NtBELL12基因與AtBLH2和AtBLH4基因聚類在一起,表明可能與煙草葉片發(fā)育有關(guān);NtBELL2、NtBELL3、NtBELL6、NtBELL7和 NtBELL8基因與ATBLH、StBELL5、StBELL11等基因的同源性較高,表明可能參與根的生長(zhǎng)及通過(guò)調(diào)控ABA信號(hào)影響種子萌發(fā)和幼苗的形態(tài)建成[11,14];NtBELL14和NtBELL15基因與擬南芥AtBEL1基因的親緣關(guān)系很近,后者被證實(shí)能夠通過(guò)調(diào)控激素信號(hào)影響擬南芥胚珠的發(fā)育[19,35]。隨后,基因的表達(dá)模式分析也在一定程度上證實(shí)了NtBELLs基因功能的同源預(yù)測(cè)。例如,與葉片發(fā)育有關(guān)的NtBELL11和NtBELL12基因在葉片中的表達(dá)水平最高,與根生長(zhǎng)相關(guān)的NtBELL2、NtBELL3和NtBELL7基因在根中的表達(dá)水平明顯高于其他基因,而與胚珠發(fā)育相關(guān)的NtBELL14和NtBELL15基因則只在果實(shí)中有較高表達(dá)。因此,結(jié)合同源基因比較和基因表達(dá)模式分析,初步確定了煙草各NtBELLs基因的功能,為后續(xù)研究NtBELLs調(diào)控?zé)煵葜仓臧l(fā)育提供參考和依據(jù)。

        同時(shí),還發(fā)現(xiàn)干旱和NaCl脅迫能夠顯著誘導(dǎo)部分NtBELLs基因的表達(dá),表明該基因家族可能參與了植物抵御非生物脅迫的過(guò)程。研究發(fā)現(xiàn),玉米中一些脅迫響應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)可能分別受多個(gè)ZmBELLs的調(diào)控[9],但目前尚沒(méi)有BELLs基因改變植物抗性的報(bào)道。因此,NtBELLs基因調(diào)控?zé)煵萁M織發(fā)育和抗性還需進(jìn)一步驗(yàn)證。

        4 結(jié)論

        通過(guò)同源比對(duì)和功能域分析,從普通煙草基因組中共鑒定出28個(gè)BELLs基因,根據(jù)其序列相似性及進(jìn)化關(guān)系,分別將其命名為NtBELL1~NtBELL15。所有NtBELLs基因編碼的蛋白都包含SKY、BEL和HD功能域,3個(gè)功能域的序列及在基因上的分布位置都高度保守。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,煙草NtBELLs基因被明顯分為4組,每組中的NtBELLs參與了煙草不同的發(fā)育過(guò)程。NtBELLs基因在不同煙草組織中的表達(dá)模式與基因功能預(yù)測(cè)基本一致。部分NtBELLs基因的表達(dá)水平受干旱和NaCl脅迫誘導(dǎo),表明BELL基因家族可能在煙草抵御非生物脅迫過(guò)程中發(fā)揮重要作用。

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