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        TRIM25泛素化IGF2BP3后抑制食管癌EC109細胞的活力*

        2020-02-06 03:07:04溫劍虎王繼相
        中國病理生理雜志 2020年1期
        關(guān)鍵詞:實驗

        曾 濤,溫劍虎,王繼相

        (1 四川綿陽四○四醫(yī)院胸外科, 四川 綿陽 621000; 2重慶醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院胸心外科, 重慶 400016)

        泛素化是一種多翻譯后特異性修飾過程,其在多種細胞進程中發(fā)揮調(diào)控作用,包括細胞周期,細胞增殖,DNA復制和細胞凋亡等[1]。越來越多的證據(jù)表明,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(ubiquitin-proteasome system,UPS)在腫瘤的發(fā)展中起著重要作用[2]。在泛素化過程中,泛素連接酶能夠?qū)⒎核胤肿优c目的蛋白連接起來。泛素連接酶含三重基序蛋白25(tripartite motif-containing protein 25, TRIM25)被認為與多種腫瘤有關(guān),其可能通過泛素蛋白酶體系統(tǒng)靶向細胞周期來調(diào)控腫瘤細胞的生長[3]。值得注意的是,TRIM25在具有較低TRIM25表達的GC細胞系中的異位表達能夠顯著促進其遷移和侵襲。另一方面,已有報道顯示胰島素樣生長因子2 mRNA結(jié)合蛋白3(insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 3,IGF2BP3)也能通過局部翻譯IGF2BP3結(jié)合的轉(zhuǎn)錄物促進腫瘤細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移[4]。Choudhury等[5]通過免疫沉淀TRIM25后質(zhì)譜分析暗示了TRIM25和IGF2BP3可能存在相互作用。同時,食管癌中存在TRIM25低表達且IGF2BP3高表達的現(xiàn)象[6]。因此,為了探究TRIM23和IGF2BP3表達與食管癌EC109細胞活力的關(guān)系,我們進行了如下研究。

        材 料 和 方 法

        1 實驗材料

        人食管癌細胞系EC109購自中科院上海細胞庫(貨號 3111C0001CCC000246)。IGF2BP3和ubiquitin (UB)的質(zhì)粒購自北京中原公司(ADDGNE貨號 #19879和#74218);TRIM25的質(zhì)粒購自上海權(quán)陽生物有限公司(貨號TC07931);Lipofectamine 2000(貨號11668027)和胎牛血清(貨號10099-133)購自Thermo Fisher Scientific;RPMI-1640培養(yǎng)基購自GE Health(貨號SH30091);抗IGF2BP3、TRIM25、MYC和HA抗體購自CST(貨號 57145、13773、2276和3724);Protein A/G免疫沉淀磁珠(貨號B23201)和蛋白酶抑制劑Cocktail(不含EDTA,mini片劑)購自Bimake(貨號B14011);蛋白酶體抑制劑MG132購自SELLECK(貨號S2619);PBS購自生工生物工程(上海)股份有限公司(貨號E607008);青鏈霉素混合液(100×)購自北京索萊寶科技有限公司(貨號P1400);2×SDS 蛋白電泳上樣緩沖液購自北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責任公司(貨號WB-0081);蛋白裂解液購自碧云天生物技術(shù)有限公司(貨號P0013);TRIM25的siRNA序列為5’-AGGCUCUGUUCAAUCUCCUC-3’,IGF2BP3的siRNA序列為5’-CCAUAAAUUCUUCCCUGAGC-3’,由上海生工合成。

        Western blot裝置(Bio-Rad);酶標儀、細胞培養(yǎng)箱和生物安全柜(Thermo Fisher Scientific);微量加樣器(Gilson);冷凍離心機(Eppendorf);旋轉(zhuǎn)搖床(海門其林貝爾);脫色搖床(北京大龍)。

        2 實驗方法

        2.1細胞培養(yǎng)和藥物處理 將食管癌EC109細胞分為過表達TRIM25組、過表達IGF2BP3組、敲減TRIM25組和敲減IGF2BP3表達且過表達TRIM25組。食管癌EC109細胞維持在含有2 mmol/L L-谷氨酰胺、1×105U/L青霉素、100 mg/L鏈霉素和10%熱滅活FBS的RPMI-1640培養(yǎng)基中,并在潮濕氣氛(37 ℃、5% CO2)中培養(yǎng)。環(huán)己酰亞胺(cycloheximide,CHX)以終濃度40 mg/L處理EC109細胞;MG132以終濃度為5 μmol/L處理EC109細胞,8 h后收獲細胞。

        2.2細胞轉(zhuǎn)染 通過Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染EC109細胞。將含目的基因的質(zhì)粒與脂質(zhì)體混合靜止大約20 min后,緩緩滴入EC109細胞。于12孔板中實施劑量依賴性實驗。

        2.3Western blot實驗 進行10%或12%SDS-PAGE,然后轉(zhuǎn)移到Immobilon-P PVDF膜(0.45 μm孔徑)。將PVDF膜在室溫下用含有0.01%Tween-20和5%脫脂奶粉的Tris緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5,150 mmol/L NaCl)封閉1 h,然后在4 ℃下與目的蛋白的抗體溫育過夜。然后將膜在室溫下與綴合有HRP的相應(yīng) II 抗孵育1 h。觀察特定蛋白質(zhì)使用ECL Plus Western blot檢測系統(tǒng)。

        2.4免疫共沉淀實驗 EC109細胞在1 mL NP-40裂解緩沖液(20 mmol/L Tris-HCl,pH 7.4,150 mmol/L NaCl,1 mmol/L EDTA,1% Nonidet P-40, 10 mg/L抑肽酶,10 mg/L亮抑酶肽和1 mmol/L苯甲基磺酰氟)中裂解。在14 000×g,4 ℃條件下離心15 min,立即將上清液轉(zhuǎn)移到新管中。用PBS洗滌Protein A/G瓊脂糖珠2次,并制成50% Protein A/G瓊脂糖工作液(PBS中)。 在水平振蕩器上4 ℃振蕩10 min(此步驟旨在消除非特異性結(jié)合蛋白)。在14 000×g、4 ℃條件下離心15 s,將上清液轉(zhuǎn)移到新管中并丟棄Protein A/G瓊脂糖。加入適量的Ⅰ抗至總體積約500 μL。旋轉(zhuǎn)振蕩器上于4 ℃緩慢搖動過夜。在14 000×g、4 ℃條件下離心15 s,保持沉淀并用預(yù)先冷卻的洗滌緩沖液(或冷PBS)洗滌3次。加入15 μL SDS-loading buffer,100 ℃水浴5 min后取7 μL進行Western blot分析。

        2.5MTT實驗檢測細胞活力 第1天用胰蛋白酶消化EC109細胞,將EC109細胞稀釋至 7.5×107/L(使用完全培養(yǎng)基稀釋細胞)。向96孔板的每孔中加入100 μL細胞(總共7 500個細胞)并孵育過夜。第2天處理細胞,且最終每孔體積為100 μL。第3天,向每個孔中加入20 μL MTT(5 g/L),包括一組加入MTT但沒有細胞的孔(對照)。在培養(yǎng)箱中37 ℃孵育3.5 h。小心取出96孔板,加入150 μL DMSO,用錫箔覆蓋并在軌道振蕩器上攪拌細胞15 min。在酶標儀中讀取590 nm處的吸光度(A)值。

        2.6CCK-8實驗檢測細胞活力 在96孔板中分配100 μL EC109細胞懸浮液(每孔5 000個)。將板在潮濕的培養(yǎng)箱中預(yù)孵育24 h(37 ℃、5% CO2條件下)。將10 μL不同濃度的待測物質(zhì)加入板中。將培養(yǎng)板在培養(yǎng)箱中孵育適當?shù)臅r間(0 d、1 d、2 d、3 d和4 d)。向板的每個孔中加入10 μL CCK-8溶液。將培養(yǎng)板在培養(yǎng)箱中孵育4 h。使用酶標儀測量450 nm處的吸光度值。

        3 統(tǒng)計學處理

        使用library(VIM)中aggr(env, prop=T, numbers=T) 函數(shù)將信息缺失比例大于20%的無效信息可視化后手工剔除,用最高頻率或通過變量的相關(guān)關(guān)系填補缺失值后先錄入Epidata建立數(shù)據(jù)庫,再導入SPSS 23.0進行統(tǒng)計分析。計量數(shù)據(jù)用均數(shù)±標準差(mean±SD)表示。MTT和CCK-8實驗中組間比較使用三因素方差分析(three-way ANOVA);蛋白條帶通過ImageJ軟件定量后組間差異采用Student’st檢驗分析。計數(shù)數(shù)據(jù)用例數(shù)(n)表示。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        結(jié) 果

        1 過表達TRIM25抑制食管癌EC109細胞的活力

        MTT實驗結(jié)果顯示,與vector組相比,轉(zhuǎn)染0.5、1和2 μg HIS-TRIM25后,食管癌EC109細胞的活力在第2天和第3天受到明顯抑制;且隨著TRIM25表達量的升高,食管癌EC109細胞的活力抑制越明顯(P<0.01),見圖1。CCK-8實驗結(jié)果顯示,過表達TRIM25后EC109細胞的活力在第2天、第3天和第4天受到明顯抑制(P<0.05);而敲減TRIM25表達對EC109細胞的活力在第2天、第3天和第4天有明顯的促進效應(yīng)(P<0.05),見圖2。

        Figure 1. Over-expression of TRIM25 inhibited the viability of EC109 cells (measured by MTT assay). Mean±SD.n=3.*P<0.05vsvector group at the same time point.
        圖1 MTT法檢測過表達TRIM25對食管癌EC109細胞活力的抑制作用

        Figure 2. The changes of EC109 cell viability measured by CCK-8 assay. Mean±SD.n=3.*P<0.05vscontrol group at the same time point.
        圖2 CCK-8法檢測EC109細胞活力的變化

        2 過表達IGF2BP3促進食管癌細胞的活力

        MTT實驗結(jié)果顯示,與vector組相比,轉(zhuǎn)染0.5、1和2 μg MYC-IGF2BP3對食管癌EC109細胞的活力在第2天和第3天有明顯的促進效應(yīng),且隨著IGF2BP3表達量的升高,EC109細胞活力的增高越明顯(P<0.01),見圖3。CCK-8實驗結(jié)果顯示,過表達IGF2BP3后,EC109細胞的活力在第2天、第3天和第4天明顯增高(P<0.05);敲減IGF2BP3表達后,EC109細胞的活力在第2天、第3天和第4天受到明顯抑制(P<0.05),見圖4。

        Figure 3. Over-expression of TRIM25 promoted the viability of EC109 cells (measured by MTT assay). Mean±SD.n=3.*P<0.05vsvector group at the same time point.
        圖3 過表達TRIM25促進食管癌細胞的活力

        Figure 4. The changes of EC109 cell viability detected by CCK-8 assay. Mean±SD.n=3.*P<0.05vscontrol group at the same time point.
        圖4 CCK-8法檢測EC109細胞活力的變化

        3 敲減IGF2BP3表達和過表達TRIM25對食管癌EC109細胞的活力無明顯影響

        過表達TRIM25后EC109細胞的活力受到了抑制(P<0.05),與前面的結(jié)果相吻合; 敲減IGF2BP3表達抑制EC109細胞的活力(P<0.05),也與前面的結(jié)果相吻合;敲減IGF2BP3表達的同時過表達TRIM25可抑制EC109細胞的活力,但其抑制程度與單純敲減IGF2BP3表達的EC109細胞相比差異無統(tǒng)計學顯著性(P>0.05), 見圖5。

        Figure 5. No significant change in the viability of esophageal cancer EC109 cells when knock-down ofIGF2BP3expression and over-expression of TRIM25 measured by MTT assay. Mean±SD.n=3.*P<0.05vscontrol group.
        圖5 敲減IGF2BP3表達同時過表達TRIM25對食管癌細胞的活力無明顯影響

        4 過表達TRIM25導致IGF2BP3的表達量減少

        當梯度過表達TRIM25時,內(nèi)源IGF2BP3的表達量會梯度減少,提示泛素E3連接酶TRIM25會對 IGF2BP3進行泛素化修飾,且修飾后的IGF2BP3會被蛋白酶體降解,見圖6。

        Figure 6. Over-expression of TRIM25 resulted in reducing IGF2BP3 expression. Mean±SD.n=3.*P<0.05vsvector group.
        圖6 過表達TRIM25導致IGF2BP3的表達量減少

        5 過表達TRIM25后用MG132處理食管癌細胞,IGF2BP3的表達量無明顯變化

        當用蛋白酶體抑制劑MG132處理食管癌EC109細胞時,即使梯度過表達TRIM25,IGF2BP3的表達量也沒有減少,見圖7。這表明TRIM25對IGF2BP3表達量的影響是蛋白酶體依賴性的。

        Figure 7. The expression of IGF2BP3 in EC109 cells treated with MG132 after over-expression of TRIM25. Mean±SD.n=3.
        圖7 過表達TRIM25后用MG132處理食管癌細胞,IGF2BP3的表達量無明顯變化

        6 TRIM25與IGF2BP3存在相互作用

        在只轉(zhuǎn)染HIS-TRIM25和空載體的對照組中,未能檢測到TRIM25的存在,只有當MYC-IGF2BP3和HIS-TRIM25共轉(zhuǎn)染時才能檢測到HIS-TRIM25, 說明TRIM25與IGF2BP3存在相互作用,見圖8。

        Figure 8. TRIM25 interacted with IGF2BP3.
        圖8 TRIM25與IGF2BP3存在相互作用

        7 過表達TRIM25使IGF2BP3的泛素化程度增加

        當過表達TRIM25時,與未過表達TRIM25的對照組相比,免疫沉淀后的IGF2BP3多聚泛素化鏈明顯增加,而未過表達UB的陰性對照卻無此種現(xiàn)象,見圖9。這表明過表達TRIM25會使IGF2BP3的泛素化程度增加。

        Figure 9. Over-expression of TRIM25 increased the degree of ubiquitination of IGF2BP3.
        圖9 過表達TRIM25會使IGF2BP3的泛素化程度增加

        討 論

        泛素化過程中,泛素分子介導的信號傳導經(jīng)常在癌細胞中改變。幾種腫瘤抑制因子和癌基因與泛素-蛋白酶體途徑的相關(guān)酶存在相互作用,并在泛素綴合和解偶聯(lián)中起作用[7]。越來越多的證據(jù)表明,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)在腫瘤的發(fā)展中起著重要作用。在本研究中,IGF2BP3能被泛素分子修飾,并且經(jīng)UPS降解。

        含有三聯(lián)基序的TRIM25也被稱為雌激素反應(yīng)鋅指蛋白,是TRIM蛋白家族的成員[8]。TRIM25含有RING指結(jié)構(gòu)域,2個B-box結(jié)構(gòu)域和1個卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域,并起到泛素E3連接酶的作用[9]。已經(jīng)在TRIM25基因的3’非編碼區(qū)鑒定出雌激素反應(yīng)元件,且其表達由雌激素誘導[10]。據(jù)報道,TRIM25在乳腺癌和卵巢癌中過表達。但在子宮內(nèi)膜癌中,TRIM25表達下調(diào)[11-13]。在本研究中,當過表達TRIM25時,食管癌細胞的增殖受到抑制,而沉默TRIM25后,食管癌細胞的增殖和活力受到明顯促進。TRIM25在某些腫瘤中低表達而在另一些腫瘤中又是高表達,提示腫瘤中的TRIM25是一種雙向調(diào)節(jié)泛素E3連接酶。

        RNA結(jié)合蛋白參與RNA成熟,RNA轉(zhuǎn)換,蛋白質(zhì)翻譯,整個細胞中轉(zhuǎn)錄物的移動等多個方面[14]。IGF2BP1、IGF2BP2和IGF2BP3屬于RNA結(jié)合蛋白的保守家族[15]。編碼IGF2BP3的基因最初被鑒定為編碼含有KH結(jié)構(gòu)域的RNA結(jié)合蛋白的基因。IGF2BP3不存在于正常胰腺組織、胰腺良性病變或慢性胰腺炎中[16],但是該蛋白在胰腺導管腺癌中過表達。IGF2BP3能結(jié)合mRNA的3’非編碼區(qū)來防止HeLa細胞中CD44 mRNA的降解[17]。 IGF2BP3還可受IGF2的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)并通過PI3K/MAPK通路來誘導細胞增殖和侵襲[18-19]。在本研究中,過表達IGF2BP3可促進食管癌EC109細胞的活力,而敲減IGF2BP3表達使食管癌EC109細胞的活力受抑制;但敲減IGF2BP3表達的同時過表達TRIM25不會改變食管癌EC109細胞的活力;當過表達TRIM25時,IGF2BP3的表達量減少,但是用蛋白酶體抑制劑MG132處理可避免此效應(yīng)的產(chǎn)生;并且TRIM25與IGF2BP3存在相互作用。與此同時,過表達TRIM25增加IGF2BP3的泛素化程度?;诖耍茰y在食管癌細胞中,TRIM25通過泛素化修飾IGF2BP3后,IGF2BP3被蛋白酶體識別并被降解,細胞中IGF2BP3的蛋白水平減少,PI3K/MAPK通路受到抑制,進而最后影響食管癌細胞的活力。本研究發(fā)現(xiàn),IGF2BP3能夠被泛素蛋白酶體系統(tǒng)降解。泛素與目的蛋白的共價結(jié)合主要存在K6、K11、K27、K29、K33、K48和K63共7種形式,其中,泛素與目的蛋白通過K48的結(jié)合會被泛素蛋白酶體系統(tǒng)降解[20],提示TRIM25至少會對IGF2BP3進行K48的泛素化修飾。

        雖然本文就TRIM25、IGF2BP3表達與食管癌EC109細胞活力關(guān)系作出闡釋,但受研究時間和工作量的限制,本文未對TRIM25及IGF2BP3在食管癌瘤組織或細胞中的表達模式進行深入研究。下一步,我們擬擴大實驗規(guī)模,分析在TRIM25泛素化IGF2BP3使其被蛋白酶體降解以此抑制EC109細胞活力過程中的分子機制。

        綜上所述,TRIM25泛素化IGF2BP3使其被蛋白酶體降解,由此抑制食管癌EC109細胞的活力。

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