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        中外學(xué)者破譯香菜基因組序列并搭建數(shù)據(jù)共享平臺(tái)

        2020-01-20 06:22:01
        中國(guó)食品學(xué)報(bào) 2020年4期
        關(guān)鍵詞:傘形科學(xué)報(bào)基因組學(xué)

        記者4 月3 日從華北理工大學(xué)獲悉,該??蒲腥藛T與加拿大農(nóng)業(yè)與農(nóng)業(yè)食品部、美國(guó)佐治亞大學(xué)的研究人員合作,解析了國(guó)際上首個(gè)香菜基因組序列,相關(guān)論文發(fā)表在《植物生物技術(shù)期刊》。基于香菜、胡蘿卜等傘形科物種基因組序列,研究人員搭建了香菜等傘形科作物多組學(xué)數(shù)據(jù)共享及分析平臺(tái)(http://cgdb.bio2db.com/),相關(guān)論文4 月1 日刊登于《園藝研究》雜志。

        香菜,學(xué)名芫荽,是園藝類作物傘形科非常重要的一員,作為一種調(diào)味用的蔬菜類作物,在人們的日常生活中被廣泛食用。

        “每個(gè)人含有的嗅覺基因不同,基因?qū)θ╊愇镔|(zhì)非常敏感,而香菜中含有大量的醛類物質(zhì),因此造成了人們對(duì)香菜的喜好程度大相徑庭?!痹撜撐牡耐ㄓ嵶髡?、華北理工大學(xué)教授王希胤告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》。

        香菜還具有極其重要的藥用價(jià)值,美國(guó)加州大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),香菜中富含十二烯醛,該物質(zhì)能與鉀通道的特定部分結(jié)合并打開它們,進(jìn)而降低細(xì)胞的興奮性,揭示了民間自古以來使用香菜治療癲癇的分子機(jī)制。此外,研究表明香菜還具有抗癌、消炎、抗真菌細(xì)菌、保護(hù)心臟以及鎮(zhèn)痛等作用。除香菜外,傘形科還包括許多非常重要的蔬菜作物及中藥材,如胡蘿卜、芹菜、茴香、孜然、柴胡、當(dāng)歸和明黨參等。

        “搭建香菜等傘形科作物多組學(xué)數(shù)據(jù)共享及分析平臺(tái),是課題組在成功破譯香菜基因組后,在傘形科作物領(lǐng)域取得的又一重要研究成果?!蓖跸X犯嬖V《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,該平臺(tái)整合了大部分傘形科物種的基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組學(xué)數(shù)據(jù),提供了多個(gè)分析工具,以方便科研人員查詢、比對(duì)和下載數(shù)據(jù)。平臺(tái)可供研究人員免注冊(cè)使用,并且會(huì)持續(xù)更新。

        “該研究搭建的傘形科多組學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)具有非常重要的意義?!闭撐牡谝蛔髡咚涡∶鹘榻B,該平臺(tái)不僅為傘形科作物的進(jìn)化及比較基因組學(xué)研究提供了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)資源,而且也為傘形科作物的分子遺傳育種提供了豐富的基因資源,具有重要的理論指導(dǎo)意義和應(yīng)用價(jià)值。

        專家表示,傘形科含有許多重要的物種,為人類提供了豐富的食材和藥用成分,該研究將極大地推進(jìn)傘形科作物比較基因組學(xué)和功能基因組學(xué)的研究進(jìn)程。

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