周潔靜
(崇左市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,遼寧崇左 532200)
β-丙氨酸是非蛋白氨基酸[1],不僅是一種醫(yī)藥中間體,可以作為維生素B5、泛酸鈣、胍基丙酸和肌肽等藥物的原材料,還可以作為食品添加劑,改善食物味道,提高產(chǎn)品質(zhì)量。β-丙氨酸在機(jī)體的糖酵解過程中參與輔酶A的合成,而輔酶A在機(jī)體中能夠起到激活機(jī)體免疫力的功能[2],促進(jìn)機(jī)體結(jié)締組織的修復(fù)和形成。β-丙氨酸一般采用化學(xué)方法合成,但這種方法生產(chǎn)的β-丙氨酸中含有大量的無機(jī)鹽雜質(zhì),純度低,純化后去掉雜質(zhì)產(chǎn)量更低[3]。
β-丙氨酸的合成專利在國外,國內(nèi)使用β-丙氨酸時(shí)需要負(fù)擔(dān)一部分專利費(fèi)用,在大量使用的情況下成本投入也高,運(yùn)用構(gòu)建工程菌的方式生產(chǎn)β-丙氨酸,能夠降低污染,降低成本,雖前期構(gòu)建工程菌用時(shí)長,但工程菌構(gòu)建成功后,后期只需投入細(xì)菌生長所需要的營養(yǎng),憑借細(xì)菌生命周期短但繁殖速度快的特點(diǎn),就能夠得到源源不斷的目的產(chǎn)物。根據(jù)工程菌種的不斷優(yōu)化應(yīng)用,隨著產(chǎn)能的不斷提升,經(jīng)濟(jì)效益也能進(jìn)一步的提高。
基因工程菌生產(chǎn)氨基酸有較多的優(yōu)勢,比如目的性強(qiáng),工作量小,局限性不多。具體應(yīng)用時(shí)是利用DNA重組技術(shù),對(duì)基因進(jìn)行定向誘變,然后選擇和培育我們需要的基因工程菌。就目前來說,可以利用基因工程菌合成L-色氨酸及其衍生物, L-蘇氨酸, L-異亮氨酸等。
枯草芽孢桿菌可以在特定條件下產(chǎn)生芽孢,是革蘭氏陽性菌,菌落表面粗糙,繁殖速度快,具有鞭毛,顯微鏡下觀察有活動(dòng)能力[4]。因?yàn)榭莶菅挎邨U菌可以在極端條件下,誘導(dǎo)產(chǎn)生芽孢,抗逆性很強(qiáng),而且芽孢可以表達(dá)許多酶類和生長因子等多種蛋白,所以可應(yīng)用在基因工程菌方面。其作為基因工程受體菌,可表達(dá)出近200種原核和真核生物來源的蛋白基因,所以應(yīng)用比較廣泛。
枯草芽孢桿菌,歐科拜克生物科技股份有限公司;大腸桿菌,上海魯微科技有限公司;質(zhì)粒,愛迪基因;載體和引物為自行設(shè)計(jì),由上海生物工程公司合成發(fā)回;限制性核酸內(nèi)切酶,上海聯(lián)邁生物工程有限公司生產(chǎn);熱穩(wěn)定性DNA聚合酶,威海同豐海洋生物科技有限公司生產(chǎn);T4DNA連接酶,北京百奧萊博科技有限公司;膠回收試劑盒,北京索萊寶科技有限公司;PCR產(chǎn)物回收試劑盒Maker蛋白Maker和DNA檢測Maker,上海代軒生物科技有限公司;DNA提取試劑盒、buffer(Mg2+)和DNTp,上海生物工程公司生產(chǎn);蛋白胨、營養(yǎng)瓊脂,分析純,廣東環(huán)凱微生物工程有限公司;酵母膏,分析純,北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司;NaCl,分析純,天津市鼎盛鑫化工有限公司;蒸餾水。
蛋白胨10 g、酵母膏5 g、氯化鈉10 g、瓊脂20 g,用可溶性淀粉調(diào)節(jié)溶液pH至7.0,蒸餾水定容至1000 mL。
0.1 ~2.5 μL移液槍、0.5~10 μL移液槍,Eppendorf;ULPHW-I型ULPHW超低有機(jī)物(TOC)超純水機(jī),四川優(yōu)普超純科技有限公司;LDZM-40KCS型高壓滅菌鍋,上海申安醫(yī)療器械廠;veriti96PCR儀,美國ABI;DYCZ-24KF型四板垂直電泳儀,北京六一生物科技有限公司;HH-2恒溫水浴鍋,上海力辰邦西儀器科技有限公司;S-450D型細(xì)胞超聲波破碎儀,美國BRANSON;VM200型漩渦振蕩儀,托摩根生物科技有限公司;DCW-3510臥式低溫恒溫槽,上海左樂儀器有限公司。
用primer5.0設(shè)計(jì)能夠擴(kuò)增出panD基因的引物,用細(xì)菌DNA提取試劑盒提取枯草芽孢桿菌基因組DNA,反應(yīng)體系50 μL:模板2 μL、上下引物各1.5 μL、10 倍 Buffer(Mg2+)5.5 μL、dNTPs 2 μL、Taq 酶 0.5 μL、超純水 37 μL。
將混合體系放入PCR擴(kuò)增儀中進(jìn)行擴(kuò)增,溫度設(shè)置為:預(yù)變性95℃,5min;變形94 ℃,30 s;退火58 ℃,30 s,30個(gè)循環(huán);延伸72 ℃,30 s;終延伸72 ℃,10 min;保存 4 ℃;
進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,用膠回收試劑盒回收panD片段,將回收的片段與3種載體分別連接,并制備好大腸桿菌的感受態(tài)細(xì)胞。為了將3種重組構(gòu)建載體和片段的連接物成功轉(zhuǎn)移至大腸桿菌內(nèi),需提前制備好LB培養(yǎng)基滅菌冷卻后,在無菌條件下最大程度上接種2%的菌液,經(jīng)過培養(yǎng)箱培養(yǎng)后通過藍(lán)白斑篩選法篩選出成功轉(zhuǎn)化的大腸桿菌菌落,挑取菌落,再次進(jìn)行PCR驗(yàn)證,用試劑盒提取其中的質(zhì)粒進(jìn)行測序[5]。
實(shí)驗(yàn)中選取Hind Ⅲ和EcoR I兩個(gè)酶切位點(diǎn)分別對(duì)質(zhì)粒和表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切,使表達(dá)載體和細(xì)菌質(zhì)粒具有相同的末端,并用T4噬菌體連接酶連接[6]。將構(gòu)建好的基因表達(dá)載體導(dǎo)入大腸桿菌內(nèi),得到能夠產(chǎn)生β-丙氨酸蛋白的工程菌。
對(duì)枯草芽孢桿菌中提取的目的基因進(jìn)行優(yōu)化,主要針對(duì)其密碼子panD進(jìn)行序列優(yōu)化,提高目的片段和大腸桿菌的融合度[7]。相應(yīng)提升目的基因的表達(dá)和擴(kuò)增速度,PCR擴(kuò)增時(shí)設(shè)計(jì)程序由40 s改為30 s,隨著試劑和儀器的更新,縮短反應(yīng)體系時(shí)間也不會(huì)對(duì)反映效果造成影響[8]。一套反應(yīng)結(jié)束能有15 min的結(jié)余,節(jié)省了時(shí)間,提高了工作效率。
得到工程菌后應(yīng)立即檢驗(yàn)β-丙氨酸是否能夠進(jìn)行正常表達(dá),菌液接種培養(yǎng)基后,37 ℃條件下,設(shè)置搖床以180 r/min的速度對(duì)菌液進(jìn)行搖床震蕩培養(yǎng)。每隔一段時(shí)間對(duì)菌液進(jìn)行檢測,當(dāng)菌液檢測OD值達(dá)到0.5左右時(shí)停止培養(yǎng),向培養(yǎng)基中加入IPTG誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)隔夜。收集繁殖后的菌體,用超聲破碎儀進(jìn)行細(xì)菌的細(xì)胞破碎,隨后通過超速離心得到上清液和沉淀物,用SDS-PAGE進(jìn)行目的蛋白的檢測。也可以選擇將重組菌液直接接種于自動(dòng)誘導(dǎo)培養(yǎng)基中,30 ℃左右培養(yǎng)過夜。經(jīng)過誘導(dǎo)之后的菌液中加入10 mL L型天冬氨酸在相同的條件下進(jìn)行培養(yǎng)和全細(xì)胞轉(zhuǎn)化,1 h后取1 mL菌樣加入1 mol/L的氫氧化鈉溶液0.1 mL終止反應(yīng)。
取800 μL樣品,根據(jù)試劑說明書要求,加入A、B衍生劑,旋渦震蕩儀震蕩3 min,靜置45~60 min,用等體積的正丁醇對(duì)轉(zhuǎn)化的菌液進(jìn)行萃取,萃取后的液體用HPLC的方法檢測β-丙氨酸。
本實(shí)驗(yàn)通過上述方法一共構(gòu)建了3種工程菌,3種工程菌進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳后發(fā)現(xiàn)一號(hào)重組工程菌的表達(dá)量最差,可溶性最低;2號(hào)重組工程菌可溶性最好,表達(dá)量較差;3號(hào)工程菌可溶性一般,表達(dá)量最高。從三種工程菌的表達(dá)量和可溶性的差異性來分析原因可能是:(1)不同載體和枯草芽孢桿菌的目的基因親和力有差異。(2)某些載體上自帶的蛋白標(biāo)簽對(duì)重組蛋白的表達(dá)途徑產(chǎn)生阻礙作用。(3)工程菌受體和構(gòu)建的基因表達(dá)載體融合度不夠,導(dǎo)致表達(dá)量較少。
本實(shí)驗(yàn)對(duì)工程菌的最初構(gòu)造目的就是能夠得到大量的β-丙氨酸,故在做篩選時(shí)目的蛋白的表達(dá)量是首要考量,雖然3號(hào)菌種的可溶性稍差一些,但是綜合考量下,目前情況下第三種工程菌為最優(yōu)選擇。
本實(shí)驗(yàn)通過構(gòu)建工程菌的方式來生產(chǎn)β-丙氨酸,在降低了污染,保護(hù)了環(huán)境的同時(shí)也降低了投入成本。雖然前期構(gòu)建工程菌時(shí)的篩選選育等過程用時(shí)長,但工程菌構(gòu)建成功后,后期只需投入細(xì)菌生長所需要的營養(yǎng),憑借細(xì)菌生命周期短但繁殖速度快的特點(diǎn),就能夠得到源源不斷的目的產(chǎn)物。這種產(chǎn)能方式能夠與機(jī)械化流程相結(jié)合,節(jié)省人工成本,高效獲得目的產(chǎn)物,根據(jù)工程菌種的不斷優(yōu)化應(yīng)用,產(chǎn)能不斷提升,經(jīng)濟(jì)效益能夠有進(jìn)一步的提高。