亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        錫蘭鉤蟲TIMP基因的序列分析與原核表達(dá)

        2019-11-22 03:08:12顏欣欣杭建雄劉云秋冉榮坤劉菊玫李國清
        關(guān)鍵詞:分析

        顏欣欣,杭建雄,劉云秋,黃 岳,冉榮坤,趙 琪,何 龍,李 秀,劉菊玫,李國清

        (華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,廣東廣州510642)

        錫蘭鉤蟲(Ancylostoma ceylanicum)是寄生于犬、貓的常見鉤蟲,也是唯一能在人體內(nèi)發(fā)育為成蟲的動物源性鉤蟲,可以引起犬、貓和人的鉤蟲病,主要癥狀為缺鐵性貧血,感染嚴(yán)重時可導(dǎo)致死亡[1]。據(jù)最新的流行病學(xué)調(diào)查,錫蘭鉤蟲是導(dǎo)致人鉤蟲病的第二大病原,同時也是東南亞和西太平洋地區(qū)旅行者腹瀉的重要病原體[2-3],且犬、貓是重要的保蟲宿主[4-5]。目前,使用化學(xué)藥物驅(qū)蟲仍然是控制鉤蟲病的重要手段,但由于鉤蟲的耐藥性和重復(fù)感染,藥物防治未能取得良好效果[6]。因而,迫切需要尋找新的控制方法。

        金屬蛋白酶組織抑制劑(Tissue inhibitor of metalloproteinase,TIMP)是基質(zhì)金屬蛋白酶(Matrix metalloproteinase,MMP)的特異性抑制劑。TIMP 與MMP結(jié)合,抑制TIMP 的蛋白水解活性,調(diào)節(jié)細(xì)胞外基質(zhì)的降解,從而調(diào)節(jié)機(jī)體的生命活動[7]。迄今為止,已經(jīng)報道了人、果蠅、犬鉤蟲等生物的TIMP[8-12]。關(guān)于錫蘭鉤蟲TIMP(Ace-TIMP)雖有文獻(xiàn)提及[13],但未見對Ace-TIMP 的研究報道。本研究旨在對Ace-TIMP 基因進(jìn)行克隆、原核表達(dá)與序列分析,為進(jìn)一步研究Ace-TIMP 的生物學(xué)功能及其免疫潛能奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 蟲體、菌株及主要試劑本研究所用的錫蘭鉤蟲采自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)外科實(shí)驗(yàn)室的實(shí)驗(yàn)犬,經(jīng)蟲種鑒定后置于RNA 樣品保存液中-20 ℃保存。E.coliDH5α 感受態(tài)細(xì)胞和pMD18-T 載體、EcoRⅠ、HindⅢ、DL2000 DNA Marker 購自TaKaRa 公司;E.coliTransetta (DE3)感受態(tài)細(xì)胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;pET-32a 載體由本教研室保存。TRIzol試劑購自天根生化科技(北京)有限公司;RNA 樣品保存液購自廣州鼎國公司;蛋白Marker 購自美國Thermo Fisher Scientific 公司;鼠抗His 標(biāo)簽抗體和兔抗鼠IgG-HPR 抗體購自生工生物工程(上海)有限公司;His 標(biāo)簽純化試劑盒、明膠、考馬斯亮藍(lán)G-250 購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;人MMP-2 蛋白購自上海Novoprotein 公司。

        1.2 引物設(shè)計(jì)根據(jù)GenBank 登錄的Ace-TIMP 基因序列(ANCCEY-04405)設(shè)計(jì) 1 對引物,TIMP-AF:5'-CCGGAATTCATGCTCTTCCTTATAGTTTTC-3'(EcoR Ⅰ )/ TIMP-AR: 5'-CCCAAGCTTCTAGTCCAC GCTTTCCTCTT-3' (Hind Ⅲ )。 根 據(jù) Ace-TIMP 基 因測序結(jié)果設(shè)計(jì)1 對引物擴(kuò)增TIMP 成熟肽序列,TIMP-MP-AF:5'-CCGGAATTCGCATGCTCTTGCGA ACCGTAC-3'(EcoRⅠ)/ TIMP-MP-AR:5'-CCCAAGC TTGTCCACGCTTTCCTCTTCACT-3' (Hind Ⅲ)。引物均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。

        1.3 TIMP 基因的 RT-PCR 擴(kuò)增、克隆及測序TRIzol 法抽提錫蘭鉤蟲成蟲總RNA,以反轉(zhuǎn)錄合成的 cDNA 為模板。以 TIMP-AF/TIMP-AR 為引物,PCR 擴(kuò)增 Ace-TIMP 基因。PCR 反應(yīng)條件為:94 ℃3 min;94 ℃ 30 s、63 ℃ 30 s、72 ℃ 1 min,30 個循環(huán);72 ℃ 5 min。純化 PCR 產(chǎn)物,克隆于pMD18-T 載體中,轉(zhuǎn)化至E.coliDH5α 感受態(tài)細(xì)胞中,PCR 鑒定為陽性的菌落樣品由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序,命名為pMD18-T-TIMP。

        1.4 原核表達(dá)載體的構(gòu)建及誘導(dǎo)表達(dá)以TIMP-MP-AF/TIMP-MP-AR 為引物,pMD18-T-TIMP重組質(zhì)粒為模板,擴(kuò)增TIMP 成熟肽序列克隆至pET-32a 載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET-32a-TIMP-MP,雙酶切鑒定。陽性重組菌培養(yǎng)至OD600nm為0.4~0.6,加入終濃度為1 mmol/L IPTG 在28 ℃條件下誘導(dǎo)表達(dá)。表達(dá)產(chǎn)物離心后棄上清收集菌體,超聲破碎,收集上清與沉淀,用SDS-PAGE 分析重組蛋白的表達(dá)情況。

        1.5 Ace-TIMP 重組蛋白的純化與western blot 分析采用鎳柱純化法純化超聲破碎上清,獲取目的蛋白。在12 %聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行SDS-PAGE。以鼠抗His 標(biāo)簽抗體(1 ∶1 000)為一抗,以兔抗鼠IgG-HPR (1∶20 000)為二抗,western blot 檢測表達(dá)產(chǎn)物和純化產(chǎn)物的特異性。

        1.6 Ace-TIMP 重組蛋白對MMP-2 的抑制活性檢測采用底物酶譜法[14]分析Ace-TIMP 對MMP-2 蛋白的抑制活性,配制含有1 %明膠與1 %人MMP-2蛋白的SDS-PAGE 凝膠進(jìn)行非變性凝膠電泳,考馬斯亮藍(lán)G-250 染色、脫色,拍照保存結(jié)果。

        1.7 TIMP 基因的序列分析利用DNAMAN 軟件翻譯TIMP 基因的氨基酸序列并對其進(jìn)行多重比對;利用MEGA 5.0 軟件構(gòu)建TIMP 氨基酸序列遺傳進(jìn)化樹。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 TIMP 基因的擴(kuò)增與鑒定以犬源錫蘭鉤蟲cDNA 為模板,利用引物 TIMP-AF/TIMP-AR 進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,獲得一條約650 bp 的條帶,與預(yù)期片段大小一致(圖1)?;厥?PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,克隆于pMD18-T 載體,經(jīng)菌液PCR 鑒定為陽性。表明,正確擴(kuò)增了犬源Ace-TIMP 基因。

        圖1 Ace-TIMP 基因的 PCR 擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of Ace-TIMP gene

        2.2 重組表達(dá)質(zhì)粒的鑒定、表達(dá)與重組蛋白活性的分析EcoRⅠ和HindⅢ雙酶切鑒定重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a-Ace-TIMP-MP,電泳結(jié)果顯示在約597 bp處有目的條帶(圖2A),與預(yù)期片段大小一致。經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)表達(dá),SDS-PAGE 分析上清與沉淀,結(jié)果顯示在42 ku 處(pET-32a 載體標(biāo)簽蛋白約為20 ku)可見特異性條帶(圖2B),與目的蛋白大小相符。Western blot 分析pET-32a-Ace-TIMP-MP 的表達(dá)產(chǎn)物與純化產(chǎn)物,結(jié)果顯示在約42 ku 處可見特異性條帶(圖2C、2D),與預(yù)期蛋白分子質(zhì)量一致。底物酶譜法分析Ace-TIMP 重組蛋白對MMP-2 的抑制活性,結(jié)果顯示在約42 ku 處可見藍(lán)色條帶(圖2E)。表明,正確構(gòu)建了Ace-TIMP 基因的原核表達(dá)載體,該重組蛋白的分子質(zhì)量為42 ku,主要在上清中表達(dá),為可溶性融合蛋白,且該蛋白可以抑制MMP-2的活性。

        2.3 TIMP 基因的序列分析測序結(jié)果顯示Ace-TIMP 基因的ORF 全長為648 bp,編碼215 個氨基酸。其信號肽序列為48 bp,編碼16 個氨基酸;成熟肽序列為597 bp,編碼199 個氨基酸;終止密碼子為TAG。氨基酸序列比對結(jié)果顯示,Ace-TIMP與犬鉤蟲TMP-2 (Ac-TMP-2)的相似性為56.8 %,具有 TIMP 家族 Cys-X-Cys (18Cys-19Ser-20Cys)特征性序列,且在N 末端結(jié)構(gòu)域中擁有4 個保守的Cys 殘基,2 個保守的 Gly 殘基,1 個保守的 Pro、Val、Tyr 殘基。對不同物種TIMP 蛋白的氨基酸序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,結(jié)果顯示Ace-TIMP 與Ac-TMP-2 處于同一進(jìn)化分支(圖3)。表明Ace-TIMP 與Ac-TMP-2的遺傳進(jìn)化關(guān)系較近。

        圖2 重組質(zhì)粒的鑒定(A)、表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE 分析(B)、表達(dá)產(chǎn)物(C)與純化產(chǎn)物(D)的western blot 分析以及Ace-TIMP蛋白對MMP-2 的抑制活性檢測結(jié)果(E)Fig.2 Double enzyme digestion identification of recombinant plasmid (A), SDS-PAGE analysis of expression product (B), western blot analysis of expressed products (C)and purified products (D), and the inhibitory activity of Ace-TIMP protein to human MMP-2 (E)

        圖3 TIMP 遺傳進(jìn)化分析Fig.3 Genetic and evolutionary analysis of TIMP

        TIMP 是MMP 的特異性抑制劑,廣泛存在于脊椎動物與無脊椎動物體內(nèi)。目前,對TIMP 的研究多集中于脊椎動物,對無脊椎動物尤其是寄生蟲TIMP 的研究甚少。在鉤蟲中僅報道犬鉤蟲(Ancylostoma caninum)的 2 個 TIMP, 即 Ac-TMP-1[10]與Ac-TMP-2[12]。研究表明 Ac-TMP-1 與 Ac-TMP-2 具有典型的Cys-X-Cys 功能位點(diǎn),缺乏與哺乳動物TIMP對應(yīng)的C 末端結(jié)構(gòu)域[10-12]。本研究擴(kuò)增了犬源錫蘭鉤蟲Ace-TIMP 基因,通過序列比對分析顯示Ace-TIMP 與 Ac-TMP-2 的相似性最高(56.8 %),含有TIMP 家族特有的Cys-X-Cys 功能位點(diǎn),缺乏C末端結(jié)構(gòu)域,這與犬鉤蟲TIMP 的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)相符[10-12]。系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,來自人、鼠、犬與黑腹果蠅的TIMP 聚為一支,錫蘭鉤蟲TIMP 與犬鉤蟲的TMP-2聚為一支,這與Brew 和Nagase 關(guān)于哺乳動物的TIMP 家族起源于黑腹果蠅以及單一結(jié)構(gòu)域TIMP 分子可能由雙結(jié)構(gòu)域TIMP 缺失一個結(jié)構(gòu)域進(jìn)化而來的推論相符[8]。底物酶譜法分析表明Ace-TIMP 蛋白可以抑制MMP-2 的活性。

        本研究首次從犬源錫蘭鉤蟲成蟲中克隆TIMP基因,構(gòu)建其原核表達(dá)載體并進(jìn)行體外表達(dá),對其序列進(jìn)行了多重比對和遺傳進(jìn)化分析,并驗(yàn)證了其抑制MMP 活性的功能,為深入研究錫蘭鉤蟲TIMP的生物學(xué)功能及其免疫潛能奠定了基礎(chǔ)。

        猜你喜歡
        分析
        禽大腸桿菌病的分析、診斷和防治
        隱蔽失效適航要求符合性驗(yàn)證分析
        電力系統(tǒng)不平衡分析
        電子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
        電力系統(tǒng)及其自動化發(fā)展趨勢分析
        經(jīng)濟(jì)危機(jī)下的均衡與非均衡分析
        對計(jì)劃生育必要性以及其貫徹實(shí)施的分析
        GB/T 7714-2015 與GB/T 7714-2005對比分析
        出版與印刷(2016年3期)2016-02-02 01:20:11
        網(wǎng)購中不良現(xiàn)象分析與應(yīng)對
        中西醫(yī)結(jié)合治療抑郁癥100例分析
        偽造有價證券罪立法比較分析
        日本高清人妻一区二区| 熟女中文字幕一区二区三区| 夜夜高潮夜夜爽免费观看| 亚洲精品久久激情国产片| 久久久久无码国产精品一区| 精品久久久久成人码免费动漫| 亚洲熟妇无码av不卡在线播放| 欧美日韩色| 在线国产视频精品视频| 国产激情一区二区三区在线蜜臀| 亚洲综合网中文字幕在线| 免费一区二区高清不卡av| 国产精品无码久久久久久| 日本一本久道| 国产成人自拍视频在线观看网站 | 国产麻豆剧传媒精品国产av| 蜜臀亚洲av无码精品国产午夜.| 中文字幕欧美人妻精品一区| 99热免费观看| 久久这里都是精品一区| 国产精品视频白浆免费看| 国产精品亚洲一区二区麻豆| 国产成年女人毛片80s网站| 人与嘼av免费| 日韩狼人精品在线观看| 亚洲国产综合精品一区| 亚洲精品一区久久久久一品av| 97无码免费人妻超级碰碰夜夜| 久久精品国产www456c0m| 国产欧美VA欧美VA香蕉在| 成在线人免费无码高潮喷水| 中文字幕精品亚洲字幕| 一夲道无码人妻精品一区二区| 日本污视频| 蜜桃一区二区三区自拍视频| 日本在线观看三级视频| 国产肥熟女免费一区二区| 尤物网址在线观看| 免费国产黄线在线播放| 国产成人综合久久大片| 久久久噜噜噜久久|