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        一株聚丙烯酰胺降解菌的篩選及降解特性研究

        2019-09-18 10:05:36劉宇程邱戀梁晶晶李玲麗馬麗麗
        生物技術(shù)通報(bào) 2019年9期
        關(guān)鍵詞:生長(zhǎng)

        劉宇程 邱戀 梁晶晶 李玲麗 馬麗麗,2

        (1. 西南石油大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院,成都 610500;2. 南開大學(xué)環(huán)境污染過程與基準(zhǔn)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300350)

        聚丙烯酰胺(Polyacrylamide,PAM)以其相對(duì)高分子量、高黏度的特性,在石油工業(yè)、水處理、造紙業(yè)和化學(xué)工業(yè)等具有廣泛的應(yīng)用[1-3],其中石油行業(yè)是我國(guó)PAM使用量最大的領(lǐng)域[4]。PAM作為三次采油的驅(qū)油劑注入地下后,產(chǎn)生大量含有高濃度聚合物的產(chǎn)出水,嚴(yán)重影響了后續(xù)油水分離過程[5]。雖然PAM本身無毒,但其單體丙烯酰胺能損傷人和動(dòng)物神經(jīng)系統(tǒng)[6]。

        PAM在水環(huán)境中的遷移和積累對(duì)生物及人體健康具有潛在影響,因此亟待開展PAM的高效降解研究[7]。微生物降解是自然環(huán)境中有機(jī)污染物完全礦化的主要方法。微生物可通過利用或合成酶類、非蛋白質(zhì)類和胞外其他物質(zhì)等分解PAM[8-9]。PAM可作為氮源被微生物利用[10]。PAM也可作為碳源進(jìn)行微生物生長(zhǎng)[11-12]。本實(shí)驗(yàn)從受PAM污染的污泥中篩選出一株能以PAM作為唯一碳、氮源的降解菌株,研究了該菌株的降解特性,相關(guān)結(jié)果可以為受PAM污染環(huán)境的修復(fù)提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品及試劑 菌種來源:陜蒙交界地區(qū)的大牛地油田含聚丙烯酰胺污泥。聚丙烯酰胺:分析純,購(gòu)自成都科龍化工試劑廠,分子量3×103kD。

        1.1.2 培養(yǎng)基 營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基:酵母浸粉5 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化鈉5 g/L,調(diào)pH為7?;A(chǔ)培養(yǎng)基:聚丙烯酰胺,酵母浸粉0.05 g/L,氯化鈉0.5 g/L,磷酸氫二鉀1 g/L,七水合硫酸鎂0.2 g/L,瓊脂15 g/L(固體培養(yǎng)基),調(diào)pH為7。富集培養(yǎng)基:聚丙烯酰胺0.3 g/L,酵母浸粉5 g/L,胰蛋白胨10 g/L,氯化鈉10 g/L,瓊脂15 g/L(固體培養(yǎng)基),調(diào)pH為7。聚合物培養(yǎng)基:聚丙烯酰胺1.2 g/L,氯化鈉5 g/L,磷酸氫二鉀0.5 g/L,磷酸二氫鉀0.5 g/L,七水合硫酸鎂0.2 g/L,pH為7。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉膏3 g/L,蛋白胨10 g/L,氯化鈉5 g/L,瓊脂15 g/L(固體培養(yǎng)基),調(diào)pH為7。

        實(shí)驗(yàn)所用試劑均為分析純,購(gòu)自成都科龍化工試劑廠。

        1.2 方法

        1.2.1 降解菌株的馴化及分離 取3 g污泥樣品接種于100 mL營(yíng)養(yǎng)培養(yǎng)基中,在30℃、140 r/min的條件下培養(yǎng)48 h,富集污泥中微生物。后取5 mL菌液接種于100 mL基礎(chǔ)培養(yǎng)基中,其中PAM濃度按梯度依次為0.6 g/L、0.9 g/L、1.2 g/L、1.5 g/L、1.8 g/L和2.0 g/L逐漸增大,在相同條件下培養(yǎng)7 d后吸取5 mL馴化液轉(zhuǎn)接到新的基礎(chǔ)培養(yǎng)基培養(yǎng),馴化周期為7 d,連續(xù)馴化3個(gè)周期后,分別吸取1 mL菌液涂布到富集培養(yǎng)基平板上,30℃下倒置培養(yǎng)24 h-48 h,挑取平板上長(zhǎng)出的不同菌落進(jìn)行劃線純化,保存分離菌株。

        在基礎(chǔ)培養(yǎng)基的前提下,去掉酵母浸粉,分別加入葡萄糖、氯化銨和不加營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)配置出限制氮源培養(yǎng)基、限制碳源培養(yǎng)基、限制營(yíng)養(yǎng)源培養(yǎng)基。

        1.2.2 菌株鑒定 將純化后菌液均勻涂在牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基上恒溫培養(yǎng)24 h-48 h后,選擇分布適中的單菌落進(jìn)行觀察:大小與形狀、隆起、邊緣、表面、硬度、透明度等。

        使用TIANGEN細(xì)菌基因組DNA試劑盒提取菌株DNA,利用通用引物27F(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')和 1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGTTACGACTT-3')對(duì)細(xì)菌16S rDNA基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增條件為94℃下預(yù)變性4 min;94℃變性1 min,53℃退火90 s,72℃延伸2 min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工生物公司進(jìn)行測(cè)序,所得結(jié)果經(jīng)NBCI數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)后,挑選相關(guān)序列,采用MEGA 5.0 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.2.3 PAM濃度的影響 將聚合物培養(yǎng)基中PAM的濃度依次調(diào)整為 0.3 g/L、0.6 g/L、1.2 g/L、2.4 g/L、3.6 g/L、4.8 g/L、7.2 g/L和9.6 g/L。將挑選出的菌種接種至培養(yǎng)基中,放入搖床中(30℃,140 r/min)震蕩培養(yǎng)48 h后,分別測(cè)定細(xì)菌濃度和PAM降解率。利用淀粉-碘化鎘測(cè)定PAM濃度[13]。

        1.2.4 培養(yǎng)溫度的影響 將菌種接種至聚合物培養(yǎng)基中,分別在20、25、30、35和40℃水浴恒溫振蕩器中培養(yǎng),140 r/min,震蕩培養(yǎng)48 h后,分別測(cè)定細(xì)菌濃度和PAM降解率。

        1.2.5 培養(yǎng)基初始pH的影響 將聚合物培養(yǎng)基初始 pH 值分別調(diào)節(jié)為 3.5、4.5、5.5、6.8、7.5、8.5 和 9.5,并接種菌種至培養(yǎng)基中,放入搖床(35℃,140 r/min)震蕩培養(yǎng)48 h后,分別測(cè)定細(xì)菌濃度和PAM降解率。

        1.2.6 降解曲線的測(cè)定 在上述所測(cè)量的最適PAM初始濃度和pH基礎(chǔ)上,PCX接種到以PAM為唯一營(yíng)養(yǎng)源的培養(yǎng)基中,放入搖床(35℃,140 r/min)震蕩培養(yǎng)48 h后,分別測(cè)定細(xì)菌濃度和PAM降解率。

        1.2.7 PAM降解產(chǎn)物分析 將降解后的培養(yǎng)液6 000 r/min離心5 min,棄沉淀保留上清液,然后上清液和無水乙醇以1∶2體積比震蕩混合均勻,靜置10 min后以3 000 r/min離心15 min,收集沉淀。沉淀物真空干燥后即得待測(cè)樣品。凝膠滲透色譜測(cè)定降解產(chǎn)物的分子量,采用安捷倫PLGPC220色譜分析儀,以四氧呋喃(THF)為流動(dòng)相,測(cè)定樣品的分子量。利用傅里葉變換-紅外光譜儀對(duì)PAM及其降解產(chǎn)物進(jìn)行分析,分析波長(zhǎng)介于400-4 000 cm-1之間。本實(shí)驗(yàn)采用費(fèi)氏弧菌(Vibrio fischeri NRRL B-11177)測(cè)定聚丙烯酰胺降解產(chǎn)物的生物急性毒性,利用發(fā)光細(xì)菌分析儀BioFix?Lumi-10測(cè)定細(xì)菌光強(qiáng)度的變化,用SPSS軟件的Probit工具計(jì)算PAM降解產(chǎn)物的半數(shù)效應(yīng)濃度(EC50)。

        2 結(jié)果

        2.1 降解菌株的分離篩選

        從分離菌株中篩選出3株菌,分別命名為PCS、PCX、PW,為了研究3株菌對(duì)PAM的利用,將3種細(xì)菌的菌懸浮液分別接種到限制氮源培養(yǎng)基、限制碳源培養(yǎng)基、限制營(yíng)養(yǎng)源(碳源、氮源)培養(yǎng)基。當(dāng)PAM作為唯一氮源時(shí),如圖1所示,PCS、PCX、PW對(duì)PAM的降解率分別為42%、37%和31%,普遍高于PAM為碳源和PAM為唯一營(yíng)養(yǎng)源的降解效果;同時(shí)3株降解菌的細(xì)菌濃度分別為2.13×108CFU/mL、2.69×108CFU/mL、2.44×108CFU/mL,同樣高于PAM為碳源和PAM為唯一營(yíng)養(yǎng)源的培養(yǎng)基。當(dāng)PAM作為唯一碳源和唯一碳、氮源時(shí)僅剩菌株P(guān)CX生長(zhǎng)情況最好,細(xì)菌濃度大于108CFU/mL,對(duì)PAM的降解率仍大于30%,因此選擇PCX作為后期實(shí)驗(yàn)菌種。

        圖1 PAM為碳源、氮源、同時(shí)為碳氮源條件下3株菌的降解率

        2.2 優(yōu)勢(shì)降解菌PCX的鑒定

        由菌落形態(tài)和個(gè)體形態(tài)觀察發(fā)現(xiàn),該細(xì)菌菌落形態(tài)特性呈現(xiàn)為:圓形、乳白色、有光澤、整齊、光滑及不透明;個(gè)體形態(tài)特性為:短桿狀、革蘭氏染色G-、無芽孢和無莢膜。進(jìn)一步通過對(duì)PCX的16S rDNA檢 測(cè) 發(fā) 現(xiàn):PCX的16S r DNA序列(GenBank登錄號(hào) MK571603),與Klebsiellasp.NBRC 100048(登錄號(hào)AB681138.1)有99.9%的相似度;根據(jù)測(cè)序結(jié)果,利用NCBI提供的Blast工具,經(jīng)過16S rDNA測(cè)序及同源性對(duì)比,通過MEGA 5.5鄰接法(Neighbour-joiningmethod,NJ)構(gòu)建出系統(tǒng)發(fā)育樹如圖2所示,因此鑒定菌株P(guān)CX為克雷伯氏桿菌屬。

        圖2 降解菌PCX基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

        2.3 菌株P(guān)CX的降解特性

        2.3.1 PAM濃度對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響 如圖3所示,當(dāng)PAM初始濃度在1.2 g/L時(shí),培養(yǎng)48 h后,PCX對(duì)PAM的降解率最高,達(dá)到35%。但當(dāng)PAM 的濃度大于3 g/L時(shí),PAM的降解率受到抑制,基本低于20%。

        圖3 PAM濃度對(duì)菌株生長(zhǎng)和降解率的影響

        2.3.2 溫度對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響 培養(yǎng)溫度對(duì)降解效果和菌體的生長(zhǎng)的影響如圖4所示。在20-35℃條件下,隨著溫度的升高,PAM的降解率升高。在35℃時(shí),PCX生長(zhǎng)狀況和降解效率最好,分別達(dá)到了2.44×108CFU/mL和43%。因此選取35℃作為PCX的最適培養(yǎng)溫度。

        圖4 溫度對(duì)降解的影響

        2.3.3 培養(yǎng)基初始pH對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響 如圖5所示,初始pH值的不同對(duì)PAM溶液中的PCX的生長(zhǎng)產(chǎn)生了一定的影響,同時(shí)過高或過低的pH值都不利于PAM的降解,對(duì)于本實(shí)驗(yàn)的菌株P(guān)CX,適宜降解PAM的pH值范圍是5.0-7.0,最適pH為7.0。

        2.3.4 PAM的降解曲線 PCX接種到以PAM為唯一營(yíng)養(yǎng)源的培養(yǎng)基中,隨時(shí)間變化的生長(zhǎng)曲線和降解曲線,如圖6所示。PCX在接種后2 h進(jìn)入對(duì)數(shù)增長(zhǎng)期,菌體數(shù)量不斷增加,PAM降解率也隨之明顯升高,說明PCX能以PAM作為唯一營(yíng)養(yǎng)源生長(zhǎng),同時(shí)使得PAM發(fā)生降解。培養(yǎng)40 h后細(xì)菌進(jìn)入穩(wěn)定期,細(xì)菌代謝產(chǎn)物不斷積累,細(xì)菌繁殖速度下降,PAM降解率趨于平緩,降解率達(dá)43%左右。

        圖5 初始pH值對(duì)降解的影響

        圖6 降解菌PCX的降解曲線

        2.4 降解產(chǎn)物的分子量變化

        聚丙烯酰胺經(jīng)過降解菌PCX降解后的產(chǎn)物的凝膠色譜結(jié)果如表1所示,降解產(chǎn)物的數(shù)均分子量(Mn)、重均分子量(Mw)和峰位分子量(Mp)分別為0.602 kD、0.647 kD和0.619 kD。聚丙烯酰胺降解前的分子量為3×103kD,表明在微生物的作用下,PAM主碳鏈發(fā)生斷裂,被降解成為小分子物質(zhì)。

        2.5 降解產(chǎn)物的紅外光譜分析

        對(duì)微生物降解前后的PAM進(jìn)行了紅外光譜分析,如圖7所示,與生物降解前PAM樣品的光譜中的峰相比,生物降解后的PAM樣品的光譜中的C=O伸縮振動(dòng)峰由1 665 cm-1移動(dòng)到更高波數(shù)的位置1 672 cm-1處,2 925 cm-1為亞甲基反對(duì)稱伸縮振動(dòng)的特征吸收峰,2 854 cm-1為亞甲基對(duì)稱伸縮振動(dòng)的特征吸收峰。紅外光譜分析表明C-N伸縮振動(dòng)峰(降解前吸收峰在1 405 cm-1處)和N-H彎曲振動(dòng)(降解前吸收峰在1 452 cm-1處)消失,3 300-3 500 cm-1波長(zhǎng)范圍內(nèi)變成了一個(gè)寬大的吸收峰,表明PAM的酰胺基從PAM主鏈上剝落并被微生物利用,酰胺基通過微生物的降解完全轉(zhuǎn)化為羧基。

        表1 PAM降解產(chǎn)物的凝膠色譜測(cè)定結(jié)果

        圖7 PAM降解前后的紅外光譜圖

        2.6 PAM降解產(chǎn)物的生物急性毒性評(píng)價(jià)

        半數(shù)效應(yīng)濃度(EC50)是導(dǎo)致發(fā)光細(xì)菌發(fā)光強(qiáng)度產(chǎn)生50%變化時(shí)的測(cè)試樣品的濃度。用SPSS軟件計(jì)算PAM降解產(chǎn)物的生物急性毒性,軟件分析結(jié)果表明聚丙烯酰胺降解產(chǎn)物在30 min內(nèi)對(duì)費(fèi)希爾弧菌的EC50為106 mg/L,其95%置信區(qū)間為28-489。根據(jù)歐盟指令(Directive93/67/EEC)給出的化學(xué)品水生生物急性毒性分類規(guī)則,降解產(chǎn)物的半數(shù)致死濃度大于100 mg/g無毒性[14],可以判定克雷伯氏菌降解PAM的產(chǎn)物對(duì)水生生物無毒害作用,表明降解產(chǎn)物中可能無丙烯酰胺單體。

        3 討論

        從若干分離菌株中篩選出3株菌(PCS、PCX和PW),PAM作氮源時(shí),降解菌的生長(zhǎng)狀況和對(duì)PAM的降解率普遍優(yōu)于PAM做碳源和PAM為唯一營(yíng)養(yǎng)源時(shí);說明PAM更易于被微生物作為氮源利用。但對(duì)于PAM來說,只有當(dāng)它作為碳源被利用時(shí)才更有利于聚合物的解鏈和徹底降解。在本研究中當(dāng)菌株生長(zhǎng)在限制碳源和限制營(yíng)養(yǎng)源培養(yǎng)基中時(shí),菌株P(guān)CX生長(zhǎng)情況最好,細(xì)菌濃度大于108CFU/mL,對(duì)PAM的降解率仍大于30%,說明該菌株可以將PAM既作為氮源又作為碳源而進(jìn)行利用。

        PCX對(duì)PAM的適宜濃度是1.2-2.4 g/L,當(dāng)培養(yǎng)基中PAM濃度較高時(shí),體系的黏度也會(huì)上升,影響PCX菌體的擴(kuò)散,同時(shí)PAM自身的絮凝、架橋作用使得微生物更難利用[15-16]。在高PAM濃度下,PCX需要更長(zhǎng)的時(shí)間來適應(yīng)環(huán)境。相反地,當(dāng)PAM 的濃度低于1.2 g/L時(shí),PCX菌體的增殖速率略緩,最終菌體數(shù)量較低。溫度對(duì)PAM降解率的影響較大。隨著培養(yǎng)溫度上升使酶促反應(yīng)加快,有助于菌株P(guān)CX的代謝生長(zhǎng),利于微生物對(duì)底物PAM的降解[17]。不同的微生物在其不同的生長(zhǎng)階段和生理、生化過程中,最適宜的pH值也不同[18]。pH在5.0-7.0范圍內(nèi),還原酶、胞外酰胺酶活性最好,對(duì)于底物的利用率最高,從而對(duì)PAM的降解效果最好[19-20]。

        通過對(duì)PAM降解產(chǎn)物的生物急性毒性評(píng)價(jià)發(fā)現(xiàn),降解產(chǎn)物對(duì)水生生物無毒害作用。紅外光譜分析表明聚丙烯酰胺在降解菌PCX的作用下,酰胺基已經(jīng)轉(zhuǎn)化為羧基被PCX作為氮源利用。PAM可同時(shí)被降解菌PCX作為碳源和氮源加以利用,將其分解代謝為小分子物質(zhì)??死撞暇鷮僭诮到饩郾0肪酆衔锷暇哂幸欢ǖ膽?yīng)用前景,為后續(xù)處理難降解聚合物提供新的思路。

        4 結(jié)論

        本研究從聚丙烯酰胺污染的污泥中初步篩選出3株好氧的PAM降解菌種,其中PCX在限制碳源和氮源的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)情況最好,對(duì)PAM的降解率達(dá)到了43%。PCX的形態(tài)特征、生理生化鑒定和16S rDNA序列鑒定的結(jié)果表明,PCX為克雷伯氏菌屬,命名為Klebsiella sp. PCX。

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