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        蒽對3株靈芝菌株漆酶活性及其轉(zhuǎn)錄表達水平的影響

        2019-09-18 10:05:24胡楚霄雷善鈺秦艷平趙奕錦向泉桔
        生物技術(shù)通報 2019年9期
        關(guān)鍵詞:同工酶丙酮靈芝

        胡楚霄 雷善鈺 秦艷平 趙奕錦 向泉桔

        (四川農(nóng)業(yè)大學資源學院微生物系,成都 611130)

        多 環(huán) 芳 烴(Polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是一類稠環(huán)化合物,主要來源是化石燃料的不完全燃燒,具有較強的致癌、致畸和致突變能力,對于生物毒害較大[1]。由于難以被生物降解,是美國環(huán)境保護署“優(yōu)先控制”的持久性有機污染物[2]。我國土壤PAHs污染情況較為嚴重。Liu等[3]研究顯示北京市周邊土壤中,總PAHs含量可能達到887 μg/kg;Zheng等[4]研究顯示,以成都為代表的西部地區(qū)土壤中PAHs最高含量約75 431 ng/g,平均值為3 106 ng/g。因此PAHs污染治理受到人們的日益關(guān)注。蒽是多環(huán)芳烴中一類重要的污染物質(zhì),三環(huán)線性分子,水溶性極低,微生物降解難度大。

        漆酶(EC 1.10.3.2)最早由日本Yoshida于1883年在東南亞的漆樹中發(fā)現(xiàn)。進一步的研究發(fā)現(xiàn)其廣泛存在于植物、高等真菌以及少數(shù)細菌和昆蟲中[5]。1996年,Collins等[6]首次報道了漆酶對PAHs的降解作用。漆酶對于PAHs的降解具有高效性。Janikowski等[7]的研究顯示鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)分泌的漆酶對萘、菲和蒽的最高降解效率可達 98 mg/(L·h);Majcherczyk 等[8]的研究顯示,在介體HBT的作用下,云芝菌所產(chǎn)漆酶對于常見14種PAHs降解效率高,可降解50%芘、苯并芘[a]和蒽,完全降解苊、苊烯、芴等。在真菌之中,以靈芝為代表的白腐真菌屬受到格外關(guān)注,其胞外漆酶活性高,易于純化[9],且廣泛降解木質(zhì)素[10]。由于漆酶具有穩(wěn)定,無副產(chǎn)物等優(yōu)點,在造紙、環(huán)境保護、生物合成、食品加工和能源開發(fā)等行業(yè)中被大規(guī)模應(yīng)用[11-12]。

        靈芝是一種名貴的藥食兩用真菌,屬于擔子菌亞門,最早記錄于《本草綱目》中。其富含甾醇、萜類等生物活性物質(zhì),具有免疫調(diào)節(jié)、抗腫瘤、抗氧化等多種功效[13],在中國傳統(tǒng)中醫(yī)中具有重要作用,且近年來其商業(yè)價值被大規(guī)模開發(fā),日益受到重視[14]。常用的抗氧化劑對人體有潛在的危害,故開發(fā)新型無害抗氧化劑有重要的意義。靈芝是受到長期關(guān)注的潛在資源。孟歌等[15]的研究結(jié)果表明靈芝具有較強的抗氧化能力,可以作為天然抗氧化劑進一步開發(fā)利用。靈芝是真菌中主要產(chǎn)漆酶的種屬,不同靈芝產(chǎn)菌株產(chǎn)漆酶能力有較大的差異[16]。劉禹等[17]的研究結(jié)果顯示,有柄樹舌靈芝漆酶活性(均值1195.4 U/g)顯著高于其他菌種,靈芝S3、26A和甜靈芝的最大漆酶活性僅有其37%、27%和10%左右。而王書超等[18]對樹舌靈芝的進一步研究顯示,其產(chǎn)漆酶能力與碳源、氮源、溫度和pH等條件相關(guān),且影響程度依次減小,表明不同的環(huán)境因素對微生物產(chǎn)漆酶能力影響較大。

        活性與耐受力不足是現(xiàn)階段限制漆酶大規(guī)模工業(yè)化應(yīng)用的關(guān)鍵因素,因此提高胞外漆酶活性具有重要意義[19]。此前已有大量研究證實化合物種類及濃度[20-22]、復合培養(yǎng)基及誘導物粒子大小對于產(chǎn)漆酶能力及胞外漆酶活性的影響[23-24]。但蒽作為一種外源物質(zhì),對靈芝漆酶是否存在影響目前還鮮有研究。本研究以3株不同的靈芝菌株為實驗材料,分析在蒽的作用下,漆酶活性和漆酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平的響應(yīng)特征。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌種 3株靈芝菌株榮保1號、川芝和美芝,由四川農(nóng)業(yè)大學微生物系提供。

        1.1.2 主要試劑 馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA,北京奧博星生物技術(shù)有限責任公司);丙酮(成都市科隆化學品有限公司);蔥(純度99%,羅恩化學試劑公司);2,2'-連氮-雙(3-乙基苯并噻唑-6-磺酸)[2,2'-azinobis(3-ethylbenzthiazoline-6-sulphonic acid),ABTS](solarbio公 司 );M-MuLv第 一 鏈cDNA合成試劑盒(生工生物工程股份有限公司);SYBR Green Master Mix(Vazyme公司)。

        1.1.3 主要儀器 iQ5熒光定量PCR儀(美國Bio-Rad公司);V-1100D型分光光度計(美譜達)。

        1.2 方法

        1.2.1 菌種活化與培養(yǎng) 菌株保存與活化使用PDA固體培養(yǎng)基,菌株培養(yǎng)使用PDB培養(yǎng)基(土豆200 g,葡萄糖20 g,pH自然,定容至1 000 mL)。250 mL錐形瓶中加入50 mL PDB培養(yǎng)基,115℃滅菌30 min。每個錐形瓶接種3塊活化的菌絲體(直徑1 cm),30℃避光恒溫靜置培養(yǎng)。培養(yǎng)5 d后加入蔥(由丙酮配制成2.0 g/L母液,0.22 μm濾膜過濾除菌),使其終濃度為1.0 mg/L。同時設(shè)置兩組對照,一組加入等量丙酮,另外一組為空白對照。30℃避光恒溫靜置培養(yǎng),分別于1 h、3 h、6 h、9 h和24 h取樣,用于酶活和轉(zhuǎn)錄表達水平分析。每個處理3個重復。

        1.2.2 漆酶酶活性的測定 取1.0 mL發(fā)酵液,12 000 r/min離心5 min,上清液即為粗酶液,測定方法參照秦澎等[25]。測定反應(yīng)體系為2.7 mL 0.1 mol/L醋酸-醋酸鈉緩沖溶液(pH 4.5)、0.2 mL 0.5 mol/L ABTS和0.1 mL粗酶液。于波長420 nm處、30℃測定吸光度變化,計算漆酶活性。定義1 min氧化l μmol ABTS所需的酶量為一個酶活力單位(U/mL)。每個菌株3個重復,以煮沸滅活粗酶液為對照。

        1.2.3 總RNA提取、cDNA合成和qRT-PCR 取少量液氮保存的菌絲體,研磨成粉末狀,利用TRIzol法提取總RNA[26],通過1%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整性。檢測合格的RNA使用M-MuLv第一鏈cDNA合成試劑盒合成第一鏈cDNA。

        以合成的cDNA為模板,對相關(guān)靈芝漆酶基因進行轉(zhuǎn)錄表達水平分析。qRT-PCR在iQ5(Bio-Rad)儀器上進行。熒光定量PCR反應(yīng)體系共計10.0 μL:Green Master Mix 5.0 μL,Rox Reference Dye 0.2 μL,cDNA 1.0 μL,引物0.4 μL,加入ddH2O補足至10.0 μL。qRT-PCR分析具體程序依據(jù)Mix說明書進行:95℃ 5 min;95℃ 10 s;60℃ 30 s;重復40個循環(huán),60℃退火。以靈芝RPL4基因為內(nèi)參基因,所用引物序列參照文獻[27],通過熔解曲線判定引物的特異性,利用雙δ法計算基因的相對轉(zhuǎn)錄表達水平。

        1.2.4 數(shù)據(jù)分析 利用Excel進行數(shù)據(jù)整理計算制表,利用SPSS進行相關(guān)性分析,利用Origin作圖。

        2 結(jié)果

        2.1 不同處理條件下靈芝漆酶活性

        不同處理時間及條件下,3株靈芝菌株漆酶活性存在差異,總的趨勢為抑制,促進多發(fā)生在處理時間較長的條件下(圖1)。美芝在蒽(En+BT)短時間處理下,漆酶活性小幅下調(diào),但隨處理時間延長,漆酶活性不斷上升,當處理24 h時,漆酶活性達到22.93 U/mL,是對照(CK)和丙酮(BT)處理的1.29倍和1.43倍。榮保1號在3種處理條件下,漆酶活性均隨處理時間延長而上升。蒽(En+BT)處理3 h,漆酶活顯著上升,達到8.22 U/mL,是對照(CK)和丙酮(BT)的1.71和1.75倍;處理24 h時,丙酮(BT)和蒽(En+BT)處理下,漆酶活性達到最高,分別是對照(CK)的1.47和1.29倍。川芝在丙酮(BT)和蒽(En+BT)處理下,漆酶活性大幅降低至對照的一半左右。處理1 h后,分別為18.29 U/mL和17.31 U/mL,且隨著培養(yǎng)時間延長,漆酶活性無明顯變化。

        圖1 美芝(A)、榮保1號(B)和川芝(C)

        2.2 不同處理條件下靈芝漆酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平

        利用qRT-PCR分析蒽處理下3株靈芝菌株漆酶基因在轉(zhuǎn)錄表達水平上的差異。同時分析丙酮作用下漆酶基因的轉(zhuǎn)錄表達規(guī)律。結(jié)果顯示(表1-3),除在川芝中,未檢測到2個漆酶基因(Glac6和Glac12)的轉(zhuǎn)錄本,其余漆酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平存在差異性和特異性。

        美芝漆酶基因在蒽(En+BT)處理前期(1 h),所有漆酶基因均轉(zhuǎn)錄表達均被抑制,隨著培養(yǎng)時間的延長,部分漆酶基因的轉(zhuǎn)錄表達水平開始上升(表1)。3 h時,Glac15是對照的4.58倍;9 h時,Glac11是對照的8.80倍;在處理6 h后,Glac12轉(zhuǎn)錄表達水平一直上升,最高達到對照的33.92倍(24 h)。丙酮(BT)處理下,有5個漆酶基因(Glac1、3、5、12和15)的表達在不同處理發(fā)生了上調(diào),其余10個漆酶基因的表達被不同程度地抑制。丙酮(BT)與蒽(En+BT)處理下漆酶的表達規(guī)律相比較,有4個漆酶基因(Glac6、9、11和14)在蒽(En+BT)處理下發(fā)生了上調(diào)。

        表1 美芝漆酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平

        榮保1號在蒽(En+BT)處理下,大多數(shù)漆酶基因(Glac1、Glac3-5、Glac7、Glac10-15)的轉(zhuǎn)錄表達高峰出現(xiàn)在處理9 h。Glac15、Glac12和Glac10在蒽(En+BT)處理下轉(zhuǎn)錄表達水平上調(diào)最大,分別為對照的34.9、26.12和18.58倍。其余基因轉(zhuǎn)錄表達峰值出現(xiàn)在處理6 h,上調(diào)幅度最大為Glac8,僅為對照的3.54倍。處理全過程中,Glac6和Glac9顯示被抑制,Glac6被抑制幅度最大,最低表達僅為對照的0.02倍。丙酮(BT)處理下,7個漆酶基因(Glac1、Glac7、Glac10-13和Glac15)轉(zhuǎn)錄表達峰值出現(xiàn)在9 h,Glac15和Glac10轉(zhuǎn)錄表達上調(diào)幅度最大,分別為對照的57.72和21.14倍。丙酮(BT)處理下,未見被明顯抑制的基因(表2)。整體而言,相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄表達水平均圍繞對照小幅波動,均有一個轉(zhuǎn)錄表達水平的峰值。Glac10受到促進效果最明顯,Glac15轉(zhuǎn)錄表達水平波動最大。

        表2 榮保1號漆酶轉(zhuǎn)錄基因表達水平

        川芝在蒽(En+BT)處理下,除Glac2和Glac3外,其余基因轉(zhuǎn)錄表達水平均快速下降至被抑制。處理1 h,轉(zhuǎn)錄表達水平上調(diào)幅度大于1 000倍的有Glac4(17799.83 倍)、Glac8(2820.46 倍)和Glac11(1371.05倍)。處理24 h,僅有Glac10轉(zhuǎn)錄表達水平表現(xiàn)為促進(14.79倍),Glac15轉(zhuǎn)錄表達水平已經(jīng)低于對照的0.01倍。Glac2和Glac3轉(zhuǎn)錄表達水平則隨處理時間延長而緩慢上升。處理24 h,Glac2轉(zhuǎn)錄表達水平已為對照的9.38倍。丙酮(BT)處理下,表達水平變化規(guī)律與蒽(En+BT)處理下基本一致(表3)??傮w而言,兩種處理條件對于川芝漆酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平的影響一致,均為先促進后抑制。

        表3 川芝漆酶轉(zhuǎn)錄基因表達水平

        3 討論

        已有研究報道發(fā)現(xiàn),靈芝屬中不同菌株、冬菇不同菌株的產(chǎn)漆酶能力和規(guī)律存在較大的差異,與生長速度、培養(yǎng)條件等存在一定關(guān)聯(lián)[17,28]。本研究中,3株靈芝菌株的產(chǎn)漆酶能力存在差異,且在丙酮(BT)或蒽(En+BT)的脅迫下,漆酶活性的變化規(guī)律也存在差異,其中川芝漆酶活性一直被強烈抑制。3株菌株中,美芝在丙酮(BT)或蒽(En+BT)處理下,漆酶活性變化的幅度最小,暗示其耐受性較強,可作為蒽原位降解的候選微生物資源。

        漆酶大多以同工酶的形式存在于生物體,如白腐真菌中含有11個漆酶同工酶基因[29],靈芝中含有15個漆酶同工酶基因。在進化過程中,針對不同的環(huán)境脅迫,這些基因做出相應(yīng)的特征響應(yīng)。金屬Pb2+、Cd2+、Cu2+和Fe2+脅迫下,靈芝5個漆酶基因(Glac4、Glac6、Glac10、Glac11和Glac12)的轉(zhuǎn)錄表達水平發(fā)生上調(diào)[9]。丙酮或蒽作為一種外源物質(zhì),對靈芝漆酶的轉(zhuǎn)錄表達水平存在不同的作用,且在不同的菌株中,漆酶同工酶基因轉(zhuǎn)錄表達的響應(yīng)特征存在差異。菌株美芝相關(guān)基因表達差異較?。痪陿s保1號在丙酮(BT)處理下,漆酶基因Glac10的響應(yīng)較大,在蒽(En+BT)處理下,漆酶基因Glac10和Glac15的響應(yīng)較大;菌株川芝在丙酮(BT)處理下,漆酶基因Glac4和Glac10的響應(yīng)較大,在蒽(En+BT)處理下,漆酶基因Glac4、Glac9和Glac13的響應(yīng)較大。說明這些基因在靈芝菌株適應(yīng)丙酮(BT)和蒽(En+BT)的脅迫過程中可能發(fā)揮重要的作用。

        通過分析丙酮(BT)或蒽(En+BT)處理下,3株菌漆酶活性與15個漆酶同工酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平變化的相關(guān)性發(fā)現(xiàn),川芝中漆酶活性與較多的同工酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平顯著相關(guān)。兩種處理條件下,5個漆酶基因的轉(zhuǎn)錄表達水平與漆酶活性顯著相關(guān),其中Glac2[BT:-0.93;(En+BT):-0.75]和Glac3[BT:-0.87;(En+BT):-0.76]表達水平與活性負相關(guān),暗示這兩個漆酶在活性降低中可能起著主要作用。

        4 結(jié)論

        在1.0 mg/L蒽的處理下,3株靈芝菌株在漆酶活性和漆酶同工酶基因轉(zhuǎn)錄表達水平上表現(xiàn)出不同的響應(yīng)特征。川芝漆酶活性最高,在丙酮(BT)或蒽(En+BT)作用下,漆酶活性被抑制程度最強,相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄表達水平波動幅度也最大,表明川芝可能對丙酮(BT)或蒽(En+BT)脅迫較敏感。美芝漆酶活性和基因轉(zhuǎn)錄表達水平在丙酮(BT)或蒽(En+BT)存在情況下均受到抑制,但波動較小,暗示該菌株對這兩種物質(zhì)的耐受力較強,可作為原位降解蒽的一個微生物資源。榮保1號漆酶活性隨著丙酮(BT)或蒽(En+BT)脅迫時間的增加而不斷上升,但漆酶基因的轉(zhuǎn)錄表達水平未發(fā)生較大變化,顯示該菌株對丙酮或蒽(En+BT)有較強的適應(yīng)能力。

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