李巧燕,譚子龍,靳元春,何 鑫,柳亦松,劉 偉
(1.湖南省郴州市資興市畜牧獸醫(yī)水產(chǎn)局,郴州 423400;2.易聯(lián)生物科技有限公司,廣州 510623;3.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,長沙 410128)
小吻對盲囊線蟲(Contracaecum osculatum)是屬于異尖科的寄生線蟲,其中間宿主可為多種甲殼類動物,主要寄生在目魚、鱈魚、海豚等海洋哺乳動物體內(nèi),同時也可感染其他捕食魚類(包括人類)的哺乳動物[1-3]。小吻對盲囊線蟲感染人的報道較少,以第三期幼蟲為主,通過寄生于人體消化道各部位,引發(fā)內(nèi)臟幼蟲移行癥,導(dǎo)致宿主胃腸不適,感染嚴(yán)重者表現(xiàn)為進食后數(shù)小時腹部突發(fā)劇痛,對人類健康具有潛在危害[4-5]。因此,正確鑒別小吻對盲囊線蟲,不僅具有重要學(xué)術(shù)價值,對該病的預(yù)防和社會公共衛(wèi)生也具有重要意義。
傳統(tǒng)的寄生蟲鑒定方法主要依據(jù)是形態(tài)學(xué)鑒定,但隨著時間的推移和生物種群的進化,形態(tài)學(xué)鑒定局限性愈加明顯,即難以對相似種和近緣物種進行準(zhǔn)確的鑒別[6]。隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,選擇合適的基因作為標(biāo)記可以更好的探究寄生蟲的遺傳變異情況,為此問題的解決開辟了新的途徑[7-8]。線粒體DNA(mtDNA)是一種核外遺傳物質(zhì),與核DNA相比,具有分子量小、結(jié)構(gòu)簡單、進化速率快、母系遺傳等優(yōu)點,近年來越來越多的被學(xué)者應(yīng)用于寄生蟲的種類鑒定和遺傳發(fā)育關(guān)系研究[9-10]。本研究以湖南省不同地區(qū)黑斑蛙體內(nèi)采集到的小吻對盲囊線蟲分離株為研究對象,利用PCR方法對其pcox1基因序列進行擴增和序列分析,從而明確小吻對盲囊線蟲線粒體pcox1基因序列能否成為理想的種間遺傳標(biāo)記,為小吻對盲囊線蟲的分類鑒別和分子流行病學(xué)調(diào)查等研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 蟲體樣品16個黑斑蛙小吻對盲囊線蟲樣品分別采自湖南省常德(CD1-2)、溆浦(XP1-2)、宜章(YZ1-2)、張家界(ZJJ1-2)、株洲(ZZ1-2)、耒陽(LY1-2)、長沙(CS1-2)、邵陽(SY1-2),所采集樣品均來自于黑斑蛙胃部。
1.2 主要試劑Taq酶及相關(guān)試劑購自TaKaRa公司,蛋白酶K購自Merck公司,WizardTMDNA Cleanup System試劑盒購自Promega公司,基因組DNA提取試劑盒(Wizard SV Genomic DNA Purification System)購自Promega公司。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司進行合成。
1.3 樣品保存及形態(tài)學(xué)鑒定取樣品放入0.9%生理鹽水中,讓蟲吐出食道中的殘余物。從所采取的蟲體中選擇幾條形態(tài)完整蟲體保存入甘油溶液中,其余的全部放入70%的酒精中保存?zhèn)溆?。完成線蟲乳酸甘油透明步驟,將制作好的標(biāo)本放在顯微鏡下進行觀察,根據(jù)蟲體的頭部、尾部形態(tài)來確定蟲的種類。參考相關(guān)文獻[11],進行初步形態(tài)學(xué)鑒定。
1.4 樣品DNA的制備每個成蟲截取蟲尾一小段,用ddH2O反復(fù)沖洗4次,分別置于1.5 mL離心管中,用滅菌的微型剪刀將蟲體剪碎,分別加入30 μL蛋白酶K(50 μg/μL)和270 μL SDS裂解液,混勻后置于55℃恒溫培養(yǎng)箱中過夜消化。用Promega公司的DNA抽提試劑盒提取蟲體DNA,置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.5 目的DNA片段擴增利用DNA提取試劑盒提取70%酒精保存的小吻對盲囊線蟲基因組DNA,以其為模板,按照文獻[12]等設(shè)計合成的1對引物(上游引物:5'-TTTTT TGGGC ATCCT GAGGT TTAT-3',下游引物:5'-TAAAG AAA GA ACATA ATGAA AATG-3')進行cox1基因片段的PCR擴增。反應(yīng)體系為50 μL;擴增條件:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s、55℃退火30 s、72℃延伸45 s,共35個循環(huán),72℃延伸5 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,預(yù)期擴增片段約為400 bp。
1.6 cox1基因片段序列測定和序列分析PCR擴增產(chǎn)物由生工生物工程(上海)股份有限公司直接測序,利用DNAStar 5.0軟件進行分析,并與GenBank中登錄的代表性小吻對盲囊線蟲cox1序列進行比較,利用Clustal X2.0及Mega 4.1軟件對擴增的cox1序列進行比對,并利用Mega 4.1程序中的臨接法(Neighbor-joining method,NJ)構(gòu)建種系發(fā)育樹。臨接法在軟件默認(rèn)設(shè)置下進行分析;同時利用DNAStar 5.0中的Megalign程序進行序列相似性分析。
2.1 形態(tài)學(xué)鑒定前唇瓣具雙叉的齒狀嵴,間唇付缺;食道具有長方形的腺質(zhì)的后端膨大,無膨大部的突起或盲腸;雄蟲尾部鈍圓、錐形,有許多肛前乳突和數(shù)對肛后乳突,交合刺等長或不等長;雌蟲陰門位于體前部,卵較小(圖1)。基于上述形態(tài)學(xué)特點,初步判定湖南省8個地區(qū)16個樣品為同一物種,初步定為小吻對盲囊線蟲。
圖1 小吻對盲囊線蟲形態(tài)學(xué)Fig.1 The morphology of Contracaecum osculatum
2.2 PCR擴增結(jié)果及序列分析對16個黑斑蛙小吻對盲囊線蟲樣品中8個代表性樣品均成功地擴增出約400 bp pcox1的條帶,與預(yù)期目的片段大小一致,且無非特異性條帶,陰性對照未擴增出條帶(圖2)。
圖2 小吻對盲囊線蟲線粒體pcox1 PCR擴增產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳分析Fig.2 Ampli fication of mtDNA pcox1 gene fragment from frog Contracaecum osculatum by PCR
擴增產(chǎn)物測序結(jié)果顯示,湖南省的16個分離株cox1基因擴增序列均為394 bp。樣品序列與GenBank中收錄的小吻對盲囊線蟲pcox1基因序列(GenBank登錄號:AJ405310.1)進行比較,相似性為92.1%~93.4%,其中樣品CD-1、CD-2、XP-1、XP-2、ZZ-1、ZZ-2、LY-1、LY-2與其相似度最高,為93.4%。與肝片吸蟲(GenBank登錄號:GU112485.1)、類圓線蟲(GenBank登錄號:AB526290.1)進行種間比較,相似度則較低,為32.1%~53.2%。
2.3 pcox1基因序列系統(tǒng)發(fā)生樹利用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(圖3),結(jié)果顯示,16個黑斑蛙小吻對盲囊線蟲分離株與GenBank上報道的小吻對盲囊線蟲(GenBank登錄號:AJ405310.1)位于同一支,小吻對盲囊線蟲分離株與其他線蟲所屬分支相隔較遠,能夠十分明顯的區(qū)分開來,系統(tǒng)發(fā)生樹中的Bootstrap值較高,得到了很好的鑒別。
圖3 基于pcox1基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹Fig.3 Bootstrap consensus phylogram of the stationary tree reconstructed by NJ using the pcox1 sequences
本研究通過對湖南省不同地區(qū)蛙體內(nèi)小吻對盲囊線蟲16個樣品的pcox1基因序列分析發(fā)現(xiàn),與已報道的小吻對盲囊線蟲序列的相似度為92.1%~93.4%;將小吻對盲囊線蟲的16個樣品的pcox1序列進行種內(nèi)比較,發(fā)現(xiàn)其種內(nèi)差異為6.6%~7.9%,而種間的差異為46.8%~67.9%;蛙體內(nèi)的小吻對盲囊線蟲mtDNAcox1基因序列的種間差異大于種內(nèi)差異。從以上結(jié)果可以初步判斷蛙小吻對盲囊線蟲線粒體pcox1基因序列可作為分子遺傳標(biāo)記用于其種(株)之間的分類和鑒定。
對所獲得的小吻對盲囊線蟲的序列進行了系統(tǒng)進化分析,發(fā)現(xiàn)湖南省黑斑蛙小吻對盲囊線蟲16株分離株與GenBank上報道的小吻對盲囊線蟲屬同一枝。從分子進化的角度看,與我們的形態(tài)學(xué)分類結(jié)果完全一致。同時也進一步說明mtDNAcox1基因序列可作為蛙小吻對盲囊線蟲(株)之間的分類和鑒定的分子遺傳標(biāo)記。
本試驗闡明湖南省8個地區(qū)黑斑蛙小吻對盲囊線蟲序列的進化與變異情況,填補了相關(guān)研究的空白,并利用計算機模型進行了差異性分析和系統(tǒng)進化分析,為下一步黑斑蛙寄生蟲病、分子遺傳學(xué)和診斷學(xué)研究奠定基礎(chǔ),同時也為其他寄生蟲病研究提供了方法學(xué)參考。