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        南瓜熱激蛋白相關(guān)基因CmHSP70-5的 克隆和高溫脅迫下的表達(dá)分析

        2019-08-13 07:45:50胡艷平廖道龍朱白婢黃文楓云天海
        中國(guó)蔬菜 2019年8期
        關(guān)鍵詞:植物

        胡艷平 周 揚(yáng) 楊 春 廖道龍 朱白婢 王 敏 黃文楓 張 文 云天海*

        (1 海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,海南省蔬菜生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,海南省瓜菜育種工程技術(shù)研究中心,海南海口571100;2 海南大學(xué)園藝學(xué)院,海南海口570228;3 海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,海南???71100)

        海南省具有得天獨(dú)厚的生態(tài)優(yōu)勢(shì)和氣候條件,蔬菜栽培由來(lái)已久,是我國(guó)最主要的南菜北運(yùn)基地。隨著人民生活和消費(fèi)水平的不斷提高,迫切要求各種蔬菜作物實(shí)現(xiàn)周年生產(chǎn)和供應(yīng)。但蔬菜作物在生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中常常會(huì)受到各種非生物脅迫的影響,其中高溫脅迫是影響其生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量的重要因子之一。蔬菜作物對(duì)于高溫脅迫的響應(yīng)并非完全是被動(dòng)的,其體內(nèi)會(huì)產(chǎn)生相應(yīng)的適應(yīng)機(jī)制來(lái)降低脅迫造成的危害(韓笑冰 等,1997;葉陳亮 等,1997),以維持基本的代謝過(guò)程,甚至通過(guò)開(kāi)啟某些基因或者酶的表達(dá)來(lái)緩解高溫帶來(lái)的危害(秦俊 等,2001;田婧和郭世榮,2012;閆圓圓 等,2016)。因此,通過(guò)研究蔬菜作物的耐熱機(jī)理,可以有助于人們培育出耐高溫的蔬菜新品種。

        植物在進(jìn)化過(guò)程中形成了許多應(yīng)對(duì)高溫逆境的機(jī)制,包括基礎(chǔ)耐熱性和獲得耐熱性。當(dāng)植物受到高溫脅迫時(shí),一些基因被激活,從而導(dǎo)致一些代謝物和蛋白的含量增加,這些基因中有些可能會(huì)保護(hù)植物免受高溫脅迫的傷害,有些可能會(huì)激活某些特定基因的表達(dá)從而增強(qiáng)植物的耐熱性。目前已經(jīng)克隆的與植物耐熱性有關(guān)的基因主要分為熱激蛋白(HSPs,heat shock proteins)、熱激轉(zhuǎn)錄因子(HSFs,heat stress transcription factors)、與膜穩(wěn)定性、抗氧化和激素相關(guān)的基因等。熱激蛋白(HSPs)被認(rèn)為是熱脅迫誘導(dǎo)的一類(lèi)蛋白,其中包括:HSP100、HSP90、HSP70、HSP60、HSP40 和 small HSP(sHSP)(方麗平和李進(jìn)步,2007)。Katiyar-Agarwal 等(2003)將擬南芥的hsp101 基因?qū)胨?,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因株系的耐熱性有一定程度的提高且產(chǎn)量穩(wěn)定。將玉米ZmHSP22 基因轉(zhuǎn)化到擬南芥中,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因株系生育期縮短,同時(shí)耐熱性增強(qiáng)(Rhoads et al.,2005)。在擬南芥中過(guò)量表達(dá)菊花HSP70 基因可以增強(qiáng)植株對(duì)高溫脅迫的耐受性(Song et al.,2014)。將番茄熱激蛋白基因Lehsp100 反義敲除后,轉(zhuǎn)反義鏈的株系和對(duì)照相比耐熱性下降(Yang et al.,2006)。對(duì)海帶Sjhsp70 基因在溫度脅迫下的表達(dá)變化分析表明,高溫對(duì)Sjhsp70 的表達(dá)量具有顯著影響(袁艷敏 等,2018)。

        南瓜起源于中、南美洲,包括30 個(gè)種,其中有5 個(gè)栽培種:中國(guó)南瓜(Cucurbita moschata)、美洲南瓜(C. pepo)、印度南瓜(C. maxima)、灰籽南瓜(C. mixta)以及黑籽南瓜(C. f icifolia)。不同南瓜品種的耐熱性差異較大,不耐熱品種在高溫季節(jié)及溫室栽培下容易受到高溫傷害。一般認(rèn)為,中國(guó)南瓜廣泛種植于熱帶和亞熱帶地區(qū),生長(zhǎng)發(fā)育的適宜溫度一般為18~32 ℃,具有較好的高溫適應(yīng)性,但溫度超過(guò)35 ℃時(shí),雄花易變?yōu)閮尚曰?。海南地處熱帶邊緣,夏季太?yáng)輻射強(qiáng),平均氣溫在25 ℃以上,極端最高氣溫超過(guò)38 ℃,高溫嚴(yán)重制約著海南南瓜產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。因此,開(kāi)展南瓜對(duì)高溫脅迫的機(jī)理研究,對(duì)于篩選培育出耐熱的南瓜品種,豐富海南南瓜品種資源具有深遠(yuǎn)意義。本試驗(yàn)基于南瓜基因組的數(shù)據(jù),從南瓜中分離1 個(gè)熱激蛋白相關(guān)基因CmHSP70-5,對(duì)其在高溫脅迫下的表達(dá)進(jìn)行分析研究,以期為深入探討南瓜耐熱機(jī)理提供理論指導(dǎo)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料及處理

        于2018 年11 月選用海南地區(qū)廣泛種植的蜜本南瓜(Cucurbita moschata),將種子播種在裝滿(mǎn)基質(zhì)(泥炭土∶蛭石=1 V∶1 V)的花盆中,放置在培養(yǎng)箱中生長(zhǎng),待長(zhǎng)出3 片真葉后,進(jìn)行37 ℃和42 ℃持續(xù)高溫處理,分別在高溫處理后0、3、6、12、24、48 h 取南瓜幼苗的根、莖、葉,用超純水清洗,然后用液氮速凍后立即放入-80 ℃保存以備提取RNA。整個(gè)試驗(yàn)均在海南省瓜菜育種工程技術(shù)研究中心完成。

        1.2 RNA 提取及反轉(zhuǎn)錄

        采用天根生化科技(北京)有限公司的RNA提取試劑盒(RNAprep Pure Plant Kit,目錄號(hào):DP441)提取南瓜幼苗的RNA,采用寶生物工程(大連)有限公司的反轉(zhuǎn)錄試劑盒〔PrimeScript RT reagent kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time),目錄號(hào):DRR047A〕進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,具體操作步驟參照說(shuō)明書(shū)。

        1.3 基因克隆

        從南瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=Cucurbita+moschata) 中 獲得CmHSP70-5 基 因 的 序 列, 用Primer Premier 5.0 軟件設(shè)計(jì)引物,引物序列為HSP70-5-F:5′-ATGGCAGCGAAAACTGAAG-3′,HSP70-5-R: 5′-TCAATCAACCTCCTCGATCTTC-3′。以 南 瓜cDNA 為模板,采用Vazyme 公司的2×Taq Master Mix(目錄號(hào):P112)擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)純化后連接到pEASY-T1(北京全式金生物技術(shù)有限公司,目錄號(hào):CT101-01)載體上,挑取陽(yáng)性克隆送往上海生工生物工程有限公司測(cè)序。

        1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR

        用Primer Premier 5.0 軟 件 設(shè) 計(jì) 南 瓜CmHSP70-5 基因的熒光定量引物,內(nèi)標(biāo)基因選用文獻(xiàn)報(bào)道中的Actin 基因(王安君 等,2016)。 引物由上海生工生物工程有限公司 合 成, 引 物 序 列 為:CmHSP70-qRT-F:5′-CGTTGCTTATGGTGCTGCTGT-3′,CmHSP70-qRT-R:5′-CTGTTCTTTCTTTGTTGGGATTGTT-3′;CmActin-F:5′-CGGCCATTGAGAAAAGCTACGAA CT-3′,CmActin-R:5′-CCCACCACTGAGGACGAT GTTACCA-3′。用未經(jīng)高溫處理的根、莖、葉反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA 為模板進(jìn)行熒光定量PCR,研究CmHSP70-5 基因在不同組織中的表達(dá)差異;以高溫處理后不同時(shí)間的根、莖、葉cDNA 為模板進(jìn)行熒光定量PCR,研究CmHSP70-5 基因在高溫脅迫下的表達(dá)模式。熒光定量PCR 采用TaKaRa 公司SYBR Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)試劑盒(目錄號(hào):DRR820A),在ABI 7900HT Fast Real-Time PCR System 儀器上運(yùn)行,Real-Time PCR 反應(yīng)體系參照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。實(shí)時(shí)熒光定量PCR 反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性30 s;94 ℃變性5 s,60 ℃退火延伸30 s,45 個(gè)循環(huán);結(jié)束后讀取熒光信號(hào):95 ℃ 15 s,60 ℃ 15 s,95 ℃ 15 s,進(jìn)行熔解曲線分析。

        采用比較CT 法來(lái)計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量,目的基因的相對(duì)表達(dá)量=2-△△Ct,其中△△Ct=(Ct目的基因-Ct內(nèi)標(biāo)基因)實(shí)驗(yàn)組-(Ct目的基因-Ct內(nèi)標(biāo)基因)對(duì)照。試驗(yàn)結(jié)果設(shè)3 個(gè)重復(fù),取平均值進(jìn)行作圖分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 南瓜幼苗RNA 提取及反轉(zhuǎn)錄

        將南瓜幼苗經(jīng)過(guò)37 ℃和42 ℃高溫處理,分別在0、3、6、12、24、48 h 取其根、莖和葉片,用RNA 提取試劑盒提取各樣品的總RNA,經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)發(fā)現(xiàn)RNA 質(zhì)量較好,28S 和18S 較完整,且量較大(圖1)。按照說(shuō)明書(shū)的操作方法取適量的樣品進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA 用南瓜內(nèi)標(biāo)基因Actin 進(jìn)行PCR 檢測(cè),從圖2 中可以看出,內(nèi)標(biāo)基因的擴(kuò)增產(chǎn)物條帶單一,無(wú)雜帶,且亮度基本一致,說(shuō)明cDNA 質(zhì)量較好,可以進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。

        圖1 42 ℃高溫處理下根中的RNA

        圖2 42 ℃處理下根中的cDNA 擴(kuò)增產(chǎn)物

        2.2 CmHSP70-5 基因克隆

        從南瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得CmHSP70-5基因(XM_023065965)的序列,將反轉(zhuǎn)錄的cDNA 混合作為模板,設(shè)計(jì)基因全長(zhǎng)引物,擴(kuò)增CmHSP70-5 基因,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),得到大小約為2 000 bp 的片段(圖3),將PCR 產(chǎn)物連接到T 載體后,篩選陽(yáng)性克隆送往上海生工生物工程有限公司測(cè)序,確定CmHSP70-5 基因全長(zhǎng)1 953 bp,測(cè)序結(jié)果與南瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中查到的序列完全符合,說(shuō)明目的基因擴(kuò)增正確。

        圖3 CmHSP70-5 基因的克隆

        利用MEGA7.0 軟件將CmHSP70-5 基因編碼的氨基酸序列與擬南芥HSP70 蛋白家族成員進(jìn)行進(jìn)化關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)CmHSP70-5 蛋白與擬南芥AtHSP70-5 的親緣關(guān)系更近(圖4)。

        2.3 CmHSP70-5 基因在不同組織中的表達(dá)分析

        提取未經(jīng)高溫處理的南瓜幼苗根、莖和葉中的總RNA,采用熒光定量PCR 的方法研究這3 個(gè)組織中CmHSP70-5 基因的表達(dá)量。結(jié)果發(fā)現(xiàn),CmHSP70-5 基因在根中表達(dá)量最高,葉片中的表達(dá)量次之,約為根中表達(dá)量的42%;莖中表達(dá)量最少,約為根中表達(dá)量的11%(圖5)。

        圖4 CmHSP70-5 與擬南芥HSP70 家族蛋白的進(jìn)化分析

        圖5 CmHSP70-5 基因在南瓜幼苗不同組織中的表達(dá)

        2.4 不同溫度脅迫下CmHSP70-5 基因在不同組織中的表達(dá)分析

        2.4.1 不同溫度脅迫下根中CmHSP70-5 基因的表達(dá)模式分析 根中CmHSP70-5 基因在高溫脅迫下上調(diào)表達(dá),處理后3 h 表達(dá)量達(dá)到最高,37 ℃處理3 h 后的表達(dá)量約為起始表達(dá)量的10 倍,42 ℃處理3 h 后的表達(dá)量約為起始表達(dá)量的16 倍,此后表達(dá)量降低,逐漸恢復(fù)到起始水平(圖6)。

        2.4.2 不同溫度脅迫下莖中CmHSP70-5 基因的表達(dá)模式分析 雖然莖中CmHSP70-5 基因的起始表達(dá)量較低(圖7),但在高溫處理后,莖中CmHSP70-5 基因受高溫誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),從圖7 中可以看出,處理3 h 后基因的表達(dá)量達(dá)到最大,且在高溫處理后0~24 h 內(nèi)42 ℃處理的CmHSP70-5基因表達(dá)量要高于37 ℃同時(shí)期的基因表 達(dá)量。

        圖6 根中CmHSP70-5 基因在不同溫度脅迫下的表達(dá)

        圖7 莖中CmHSP70-5 基因在不同溫度脅迫下的表達(dá)

        2.4.3 不同溫度脅迫下葉中CmHSP70-5 基因的表達(dá)模式分析 與莖中基因表達(dá)量相似,葉片中CmHSP70-5 基因在高溫處理3 h 后的表達(dá)量達(dá)最高,分別為起始表達(dá)量的1 800 倍(37 ℃)和2 860 倍(42 ℃)(圖8),說(shuō)明葉片中CmHSP70-5基因的表達(dá)是一種高溫誘導(dǎo)模式。

        圖8 葉中CmHSP70-5 基因在不同溫度脅迫下的表達(dá)

        3 結(jié)論與討論

        植物生長(zhǎng)過(guò)程中,高溫是影響其生長(zhǎng)發(fā)育的一種重要非生物脅迫,而且溫室效應(yīng)導(dǎo)致全球氣溫升高,園藝植物生產(chǎn)面臨著嚴(yán)峻挑戰(zhàn)(范雙喜 等,2003)。因此研究植物耐熱性,培育耐熱植物新品種已經(jīng)成為一項(xiàng)亟待解決的工作。植物的耐熱性是一個(gè)復(fù)雜的生理現(xiàn)象,是一個(gè)由多基因控制的數(shù)量性狀,包括熱激蛋白HSPs、熱激轉(zhuǎn)錄因子HSFs、抗氧化和激素相關(guān)基因等。在高溫脅迫下,植物細(xì)胞中會(huì)表達(dá)和積累大量的HSPs,從而避免或減輕植物受到熱損傷,HSPs 的積累量是由HSFs 控制的,并在植物熱激反應(yīng)中發(fā)揮重要作用(Wang et al.,2004)。在所有的HSPs 中,HSP70家族蛋白是生物體內(nèi)分布最廣和研究最多的一類(lèi)。研究發(fā)現(xiàn),HSP70 在植物生長(zhǎng)發(fā)育和各類(lèi)植物脅迫響應(yīng)中至關(guān)重要(Sung et al.,2001;Swindell et al.,2007;Cho & Choi,2009;Zou et al.,2012;Kim et al.,2014)。擬南芥HSP70-1 定位于細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中,與植物的耐熱性相關(guān)(Sung et al.,2001;Cazale et al.,2009);缺 失HSP70-15 基 因的擬南芥突變體植株矮小、耐熱性下降(Jungkunz et al.,2011);高粱HSP70 蛋白參與了其雄性不育系在不同溫度下的育性轉(zhuǎn)換(Chen et al.,1998);葉用萵苣LsHsp70-2711 屬于Hsp70 基因家族,與葉用萵苣耐熱性相關(guān)(李雅博 等,2017);蠟梅HSP70-1 基因在42 ℃高溫處理后1 h 表達(dá)量達(dá)到最高,說(shuō)明其參與了高溫脅迫響應(yīng)過(guò)程(阮文進(jìn), 2015)。

        本試驗(yàn)從南瓜中克隆到1 個(gè)HSP70 基因,系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析發(fā)現(xiàn)其編碼的蛋白與擬南芥AtHSP70-5 蛋白的親緣關(guān)系較近,因此命名為CmHSP70-5。CmHSP70-5 基因在南瓜幼苗的各部位均有表達(dá),運(yùn)用熒光定量PCR 技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),CmHSP70-5 基因的表達(dá)受到高溫脅迫誘導(dǎo),在一段時(shí)間內(nèi),溫度越高,表達(dá)量越高,這與其他植物中HSP70 基因的表達(dá)模式相似(Sung et al.,2001;Jungkunz et al.,2011;陳二龍 等,2018)。本試驗(yàn)結(jié)果對(duì)開(kāi)展南瓜耐熱機(jī)制研究以及耐熱南瓜的選育有積極意義。

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