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        國(guó)內(nèi)豬丁型冠狀病毒的感染狀況匯總(2012—2017 年)

        2019-08-06 05:54:14徐國(guó)棟王磊
        中國(guó)動(dòng)物保健 2019年4期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        徐國(guó)棟,王磊

        (天津市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心 天津 300402)

        國(guó)內(nèi)新生仔豬腹瀉是近10 年來(lái)導(dǎo)致仔豬成活率偏低的最主要原因之一[1,2]。在對(duì)腹瀉原因的探究中,流行性腹瀉成為最受業(yè)界關(guān)注的病因[2],但免疫后仍不能有效控制新生仔豬劇烈腹瀉的情況時(shí)有發(fā)生,因此認(rèn)為除疫苗免疫效果不理想外,仍可能存在其它潛在致病因子[3,4]。在眾多被關(guān)注的致腹瀉病原中包括豬丁型冠狀病毒(Porcine detla coronavirus,PDCoV,又稱(chēng)豬德?tīng)査跔畈《荆?014 年2 月11 日美國(guó)學(xué)者曾自腹瀉豬糞便和小腸樣品中檢測(cè)到PDCoV[5],2015 年賀東生等[6]首次在國(guó)內(nèi)患嚴(yán)重腹瀉的新生仔豬小腸病料中檢測(cè)到PDCoV,且有證據(jù)顯示2004 年前國(guó)內(nèi)不同地區(qū)的豬群中就有PDCoV 存在[7]。為了解國(guó)內(nèi)豬群中PDCoV 的整體感染狀況,筆者對(duì)相關(guān)調(diào)查文獻(xiàn)進(jìn)行了匯總。

        1 匯總方法

        查閱PDCoV 的相關(guān)調(diào)查文獻(xiàn),剔除內(nèi)容重復(fù)的文獻(xiàn),按時(shí)間順序依次錄入被檢樣品相關(guān)信息,包括采樣時(shí)間、地點(diǎn)、豬群是否腹瀉、樣品種類(lèi)、檢測(cè)方法、樣品陽(yáng)性結(jié)果。

        用Excel 工作表對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總統(tǒng)計(jì)。

        2 匯總結(jié)果

        2.1 原始數(shù)據(jù)匯總結(jié)果

        匯總結(jié)果見(jiàn)表1、2,特殊符號(hào)代表意義如下:①采樣時(shí)間欄中,凡標(biāo)記“*”的是將文獻(xiàn)投稿時(shí)間(或發(fā)表時(shí)間)假定為采樣時(shí)間。②地點(diǎn)欄中,Ad1:江蘇、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龍江、山東和上海;Ad2:陜西、廣東和湖北;Ad3:天津和河北。匯總的病原學(xué)、血清學(xué)原始調(diào)查數(shù)據(jù)分別見(jiàn)表1 和2。

        2.1.2 病原學(xué)匯總結(jié)果

        共對(duì)7 篇文獻(xiàn)所載病原學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)進(jìn)行了匯總,調(diào)查者應(yīng)用不同的核酸檢測(cè)方法對(duì)PDCoV M 基因、N 基因等進(jìn)行了檢測(cè),被檢樣品來(lái)自江蘇、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龍江、山東、上海、陜西、廣東、湖北、天津、廣西共15 個(gè)省(市)豬群,取自腹瀉豬群的樣品占全部樣品的95.42%(1,333/1,397),樣品種類(lèi)全部為糞便或小腸,累計(jì)檢測(cè)1,397 份,陽(yáng)性數(shù)224 份,陽(yáng)性率區(qū)間為4.33%~33.71%,平均陽(yáng)性率為16.03%。

        2.1.2 血清學(xué)匯總結(jié)果

        共對(duì)3 篇文獻(xiàn)所載血清學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)進(jìn)行了匯總,調(diào)查者應(yīng)用ELISA 方法對(duì)PDCoV M 蛋白、N 蛋白或S1 蛋白血清抗體進(jìn)行了檢測(cè),血清

        采自江蘇、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龍江、山東和上海等?。ㄊ校┑母篂a或非腹瀉豬群,累計(jì)檢測(cè)血清1,028份,陽(yáng)性數(shù)355 份,陽(yáng)性率區(qū)間為3.3%~54.05%,平均陽(yáng)性率為34.53%。

        表1 PDCoV 病原學(xué)檢測(cè)匯總表

        表2 PDCoV 血清學(xué)檢測(cè)匯總表

        2.2 不同時(shí)間節(jié)點(diǎn)樣品陽(yáng)性結(jié)果匯總

        若針對(duì)同一時(shí)間節(jié)點(diǎn)內(nèi)樣品檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行累加,可得到“時(shí)間-陽(yáng)性率”相關(guān)數(shù)據(jù),其中病原學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)中,因“2012—2015*”的時(shí)間節(jié)點(diǎn)跨度較大,未列入被累加數(shù)據(jù)。由此可以得到:2014—2015、2015、2016、2016—2017 和2017 年病原學(xué)檢測(cè)合并后的陽(yáng)性率分別為9.84%(25/254)、11.81%(15/127)、6.01%(28/466)、16.92%(22/130) 和28.13%(18/64),平 均 陽(yáng) 性 率 為10.38%(108/1,041);2014、2014—2015、2015、2015—2016 和2016 年血清學(xué)檢測(cè)結(jié)果合并后的陽(yáng)性率分別為50%(13/26)、11.60%(37/319)、43.24%(16/37)、44.17%(269/609) 和54.05%(20/37), 平 均 陽(yáng) 性 率 為34.53%(355/1,028)。

        可以看出:①在不同時(shí)間節(jié)點(diǎn)中,病原學(xué)檢測(cè)的陽(yáng)性率在6.01%~28.13%,平均陽(yáng)性率為10.38%。②在不同時(shí)間節(jié)點(diǎn)中,血清學(xué)檢測(cè)的陽(yáng)性率在11.6%~54.05%,平均陽(yáng)性率為34.53%。③血清學(xué)檢測(cè)的平均陽(yáng)性率明顯高于病原學(xué)檢測(cè)的平均陽(yáng)性率。④以時(shí)間為序的病原學(xué)和血清學(xué)陽(yáng)性率總體上均呈緩慢升高趨勢(shì)。

        3 結(jié)論

        PDCoV 是套式病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒亞科成員,該病毒可以感染豬小腸組織的任何腸段,尤其是空腸和回腸。對(duì)國(guó)內(nèi)調(diào)查文獻(xiàn)匯總后得出:①關(guān)于國(guó)內(nèi)豬群中PDCoV 的調(diào)查文獻(xiàn)偏少,未見(jiàn)有針對(duì)某一特定豬亞群(如發(fā)生劇烈腹瀉哺乳仔豬群)的大樣本調(diào)查。同時(shí),所涉及的采樣省份及其頻次均偏少,期望今后能有較系統(tǒng)的調(diào)查報(bào)告。②PDCoV 病原學(xué)檢測(cè)陽(yáng)性率區(qū)間為4.33%~33.71%,血清學(xué)檢測(cè)抗體陽(yáng)性率區(qū)間為3.3%~54.05%,陽(yáng)性率數(shù)值區(qū)域的跨度均較大,暗示國(guó)內(nèi)豬群中PDCoV 的感染率并不均一。③血清學(xué)平均陽(yáng)性率(34.53%)明顯高于病原學(xué)平均陽(yáng)性率(10.38%),因此盡管病原學(xué)檢測(cè)樣品多源于腹瀉豬群,仍推測(cè)調(diào)查期間國(guó)內(nèi)豬群中PDCoV 的實(shí)際感染率應(yīng)高于10.38%。④以時(shí)間為序的病原學(xué)和血清學(xué)陽(yáng)性率均呈現(xiàn)緩慢升高趨勢(shì),提示國(guó)內(nèi)豬群中PDCoV 的感染率有隨時(shí)間變化升高的趨勢(shì)。

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