徐國(guó)棟,張 丹
(天津市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,天津北辰區(qū)宜興埠北300402)
豬星狀病毒(Porcine astrovirus,PAstV)是星狀病毒科、哺乳動(dòng)物星狀病毒屬成員,目前已發(fā)現(xiàn)有5 種基因型(PAstV1-PAstV5),PAstV 是引起豬、尤其是哺乳仔豬腹瀉的病原之一[1-3]。在國(guó)內(nèi)豬群中,PAstV 的5 個(gè)基因型均可被檢測(cè)到,流行毒株主要是PAstV1 和PAstV2[1-2]。為了解國(guó)內(nèi)豬群中PAstV 的感染情況,筆者對(duì)國(guó)內(nèi)相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行了匯總?,F(xiàn)報(bào)告如下:
查閱國(guó)內(nèi)PAstV 的調(diào)查文獻(xiàn),剔除數(shù)據(jù)重復(fù)或反復(fù)使用的文獻(xiàn),按時(shí)間順序依次錄入病原學(xué)檢測(cè)樣品的相關(guān)信息,包括采樣時(shí)間、地點(diǎn)、樣品種類、檢測(cè)方法、樣品陽(yáng)性結(jié)果等。
用Microsoft Office Excel 工作表對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總統(tǒng)計(jì)。
表1 國(guó)內(nèi)星狀病毒調(diào)查匯總原始數(shù)據(jù)
共對(duì)8 篇PAstV 病原學(xué)調(diào)查文獻(xiàn)進(jìn)行了匯總,采樣時(shí)間在2008~2016年間,除商曉桂等[5]的采樣時(shí)間未明確外,其它調(diào)查者均明確了采樣的具體時(shí)段,因此調(diào)查結(jié)果能準(zhǔn)確地反映出當(dāng)時(shí)豬群中PAstV 的感染狀況;采樣地點(diǎn)包括廣西、上海、四川、江西、湖南、云南6 個(gè)?。ㄊ校?的12 個(gè)信息條中有7 條明確記錄了采樣豬群為腹瀉豬群,占全部采樣信息的58.33%(7/12),腹瀉豬群樣品占全部樣品的48.21%(874/1813);8 篇文獻(xiàn)中記載的樣品種類均包括糞便,檢測(cè)糞便的信息條為全部信息條的91.67%(11/12),包括糞便在內(nèi)的樣品數(shù)占全部樣品數(shù)的96.80%(1755/1813);單獨(dú)檢測(cè)糞便樣品的信息條占全部信息條的75.0%(9/12),單獨(dú)檢測(cè)糞便的樣品數(shù)占全部樣品數(shù)的82.57%(1497/1813);對(duì)腹瀉豬群均進(jìn)行了糞便樣品的檢測(cè),占全部樣品數(shù)的46.00%(834/1813);按信息條頻次排列的檢測(cè)方法依次是RT-nPCR、RT-PCR、多重RT-PCR、熒光PCR;全部樣品的陽(yáng)性率區(qū)間為11.91%(5/42)~95.46%(21/22),平均陽(yáng)性率為42.00%(761/1813)。
對(duì)同一時(shí)間節(jié)點(diǎn)(年)內(nèi)檢測(cè)的樣品檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行累加得到:2008年、2009年、2010年、2013~2014年、2014年、2015年和2016年7 個(gè)時(shí)間節(jié)點(diǎn)的樣品陽(yáng)性率分別為95.46%(21/22)、35.53%(124/349)、36.36%(16/44)、53.83%(387/719)、46.33%(101/218)、15.24%(16/105)和26.97%(96/356),除2008年樣品陽(yáng)性率偏高外,其它節(jié)點(diǎn)內(nèi)的陽(yáng)性率在15.24%~53.83%間,尤其2015年、2016年的樣品陽(yáng)性率呈緩慢的下降趨勢(shì)。
筆者匯總了7 篇2008~2016年間國(guó)內(nèi)豬群中PAstV 病原學(xué)調(diào)查文獻(xiàn)所載數(shù)據(jù),結(jié)果發(fā)現(xiàn):調(diào)查者采樣范圍不廣,僅限于廣西、上海、四川、江西、湖南、云南6 個(gè)?。ㄊ校┑呢i群樣品,累計(jì)被檢樣品總數(shù)偏少,僅為1813 份,調(diào)查者更多地關(guān)注了腹瀉豬群中糞便或腸道組織中PAstV 的存在情況,應(yīng)用核酸方法檢測(cè)全部樣品的陽(yáng)性率區(qū)間為11.91%(5/42)~95.46%(21/22),平均陽(yáng)性率為42.00%(761/1813),從各時(shí)間節(jié)點(diǎn)中樣品陽(yáng)性率看,國(guó)內(nèi)豬群中PAstV 的檢出率呈緩慢下降趨勢(shì)?;谝陨蠑?shù)據(jù),筆者推測(cè)期間國(guó)內(nèi)豬群中PAstV 的檢出率應(yīng)低于42.0%,但該病原廣泛存在于豬群中已成共識(shí)[1-3],因此,筆者期待有更具說(shuō)服力的大樣本流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù),以此為國(guó)內(nèi)豬病尤其是仔豬腹瀉的防治提供可靠依據(jù)。