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        生物有機肥中微生物的分離鑒定及液體菌劑的構(gòu)建

        2019-07-05 10:52:54陳揚波卞杰松劉彩霞湯鑫鑫
        廣東農(nóng)業(yè)科學 2019年5期
        關(guān)鍵詞:枯草菌劑芽孢

        陳揚波,卞杰松,劉彩霞,湯鑫鑫

        (1.湘南學院化學生物與環(huán)境工程學院/湘南稀貴金屬化合物及其應(yīng)用湖南省重點實驗室,湖南 郴州 423000)

        【研究意義】化肥的廣泛使用在一定程度上促進了作物的生長,但是不應(yīng)該低估對土壤和環(huán)境的危害,化肥的大量使用導致土壤板結(jié),減少了土壤有機質(zhì)含量和有益微生物數(shù)量[1],導致農(nóng)作物產(chǎn)量減少,又因為化肥中氮含量過高,使得農(nóng)作物中NO3-、NO2-等離子濃度增加,對人畜會產(chǎn)生很大的毒害作用[2]。而生物有機肥是將家禽糞便、植物秸稈等通過無公害處理再往其中加入各種微生物菌種,因此微生物是生物有機肥的核心部分,微生物肥料具有增加微生物的數(shù)量,提升土壤中有機質(zhì)的含量,提高土壤營養(yǎng)成分等優(yōu)點[3];許多功能微生物能顯著改善土壤理化性質(zhì),調(diào)節(jié)生態(tài)平衡[4];微生物的一些代謝產(chǎn)物也能增強作物對惡劣環(huán)境的適應(yīng)性,微生物產(chǎn)生的抗生素能夠?qū)Υ蠖鄶?shù)有害菌產(chǎn)生拮抗作用[5];使得最終的農(nóng)作物風味也會得到極大的改善[6]。通過實驗研究了解生物有機肥中具體成分,完善生物肥料的作用機制,為生物有機肥的發(fā)展提供部分理論基礎(chǔ)。

        【前人研究進展】微生物肥料已經(jīng)有百余年歷史,國際上最早使用的是由根瘤菌組成的生物肥料,我國在20世紀40年代才開始研究微生物肥料,最初都是在肥料中加入根瘤菌而成[7];50年代早期逐漸在其中加入更多菌種,如固氮菌、磷細菌等;60年代開始使用添加了放線菌的“5406”微生物菌肥;70年代中期開始研發(fā)泡囊-叢枝菌根(AM菌根)[8]??梢?,我國微生物肥料經(jīng)歷了3次發(fā)展,但都沒有延續(xù)過長的時間,由于當時缺乏這方面的監(jiān)管,各品種良莠不齊,沒有一個適合的標準[9]。在20世紀90年代和21世紀初,當時化肥大量使用,導致環(huán)境破壞嚴重,大家又重新將目光放到生物肥料上來?!颈狙芯壳腥朦c】目前微生物肥料發(fā)展迅速,所能添加的微生物已有數(shù)十種,生物有機肥逐漸從單一變得復雜,其功能也越來越多[10],現(xiàn)在我國提倡發(fā)展綠色農(nóng)業(yè),而生物肥正是安全,無污染的肥料,我國幅員遼闊,耕地面積廣,今后生物肥料必定會有廣闊的前景[11]?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究主要從3個部分進行,分別為微生物分離與鑒定、探究菌種間的拮抗實驗、各菌種都適合生長的液體培養(yǎng)基的配制。希望通過此次對生物有機肥的研究,能為后續(xù)微生物肥料的發(fā)展提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        試驗于2018年10月至2019年1月在湘南學院化學生物與環(huán)境工程學院實驗樓進行。

        1.1.1 供試菌種 供試各菌種都分離自生物有機肥肥料,生物有機肥購自郴州市同興南生物技術(shù)有限公司。

        1.1.2 培養(yǎng)基 固體培養(yǎng)基(牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基):牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,瓊脂18.0 g,水1 000 mL,pH 7.2~7.5。液體培養(yǎng)基(牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基):牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,水1 000 mL。兩種培養(yǎng)基均經(jīng)過高壓蒸汽滅菌30 min后使用。

        1.1.3 主要設(shè)備 分析天平、超凈工作臺、電熱鼓風干燥箱、光學顯微鏡、可見分光光度計、酶標儀、高壓蒸汽滅菌鍋、高速冷凍離心機,pH酸度計、恒溫搖床、打孔器、培養(yǎng)皿、冰箱、電磁爐。

        1.2 細菌鑒定

        1.2.1 形態(tài)觀察 將生物有機肥樣品進行梯度稀釋后涂布到平板培養(yǎng)基上,37 ℃培養(yǎng)48 h,得到4種菌落,將其編號為CZ1、CZ2、CZ3、CZ4。挑取單個菌落進行純化,然后采用平板劃線法觀察單個菌落形態(tài)[12]。菌體形態(tài)觀察采用革蘭氏染色法,參照文獻[13]的步驟。

        1.2.2 分子生物學鑒定 DNA提取參照文獻[14]的步驟。PCR擴增:以提取出來的細菌基因組DNA為模板,采用引物R-F(AGAGTTTGATCCTGGCTCAG)和R-R(TACGGCTACCTTGTTACGACGACTT)進行特異性擴增。引物購買于武漢擎科測序公司,所用的50 μL PCR反應(yīng)體系包括:基因組DNA 2 μL;引物R-F(10 μmol/L)2 μL;引物R-R(10 μmol/L)2 μL;TaqDNA 聚合酶 25 μL;加 H2O 至 50 μL。

        PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性2 min,94 ℃變性30s,57 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,30個循環(huán);最后72 ℃延伸2 min。PCR完成后將PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測[15]。

        PCR產(chǎn)物鑒定:將電泳檢測后的PCR產(chǎn)物進行測序,獲得16SrDNA基因序列,測序結(jié)果在美國國家生物技術(shù)信息中心(National Center of Biotechnology Information, NCBI)進行分析比對,根據(jù)同源序列搜索結(jié)果,導出相關(guān)菌株的16SrDNA基因序列,與實驗菌株一起用MEGA7構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[16]。

        1.3 拮抗試驗

        研究菌種間的拮抗關(guān)系采用菌餅法[17],具體操作步驟如下:用接種環(huán)分別制作上述4種菌懸液,然后用移液管分別吸取0.5 mL于相應(yīng)的固體培養(yǎng)基上并用涂布器涂抹均勻,置于37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2 d,然后用1 cm的打孔器在已培養(yǎng)2 d的4種培養(yǎng)基上制取多塊菌餅,然后將該菌餅放置在剛涂布有另一種菌的平板上,放置3塊,并在培養(yǎng)基上放一塊無菌餅塊作對照[18]。試驗設(shè)計見表1。

        表1 各菌種間拮抗實驗設(shè)計Table 1 Experimental design of antagonism among various strains

        1.4 液體菌劑構(gòu)建

        將牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基的初始pH調(diào)節(jié)為6.0、6.5、7.0、7.5、8.0,并將4種菌按1∶1∶1∶1的比例分別接種于不同pH的液體培養(yǎng)基中,置于37℃恒溫培養(yǎng)振蕩器中培養(yǎng)48 h,然后通過稀釋涂布平板法測定有效活菌數(shù)。選擇菌種長勢較好的pH值作為該混合菌種的最適pH值[19]。

        圖1 各菌種菌落形態(tài)Fig.1 Colony morphology of various stains

        圖2 各菌種菌體形態(tài)Fig.2 Morphology of various stains

        2 結(jié)果與分析

        2.1 細菌鑒定

        2.1.1 形態(tài)觀察 通過平板劃線法觀察到單個的菌落,其形態(tài)特征如下:CZ1,菌落粗糙,不透明,粘著,擴展,邊緣粗糙;CZ2,菌落表面粗糙,不透明,污白色或微黃色,邊緣整齊;CZ3,菌落呈白色或微黃色,表面光滑,邊緣整齊;CZ4,菌落凸起,微白色,濕潤,邊緣整齊,菌落背面為黃色(圖1)。

        菌體形態(tài)通過革蘭氏染色法以及顯微鏡觀察,結(jié)果見圖2。在油鏡下觀察到的菌體形態(tài)特征如下:CZ1,有芽孢,無莢膜,不成鏈能運動,革蘭氏染色呈紫色,細胞直徑為0.6~0.9 μm×1.0~1.5 μm;CZ2,有芽孢,無莢膜,周生鞭毛,能運動,革蘭氏染色呈紫色,細胞直徑為0.7~0.8 μm×2~3 μm;CZ3,有芽孢,菌體末端圓,單個或呈短鏈排列,革蘭氏染色呈紫色,細胞直徑為 1.2~1.5 μm×2.0~4.0 μm;CZ4,無芽孢,菌體形態(tài)呈直或彎的桿狀單個、成對或呈鏈狀排列,革蘭氏染色呈紫色,細胞直徑為0.9~1.2 μm×3.0~8.0 μm。鏡檢發(fā)現(xiàn)4種細菌的顏色都為紫色,說明4種菌均為革蘭氏陽性菌。

        2.1.2 分子生物學鑒定 通過16SrDNA基因序列同源性比對,構(gòu)建4種細菌的系統(tǒng)發(fā)育進化樹見圖3。從圖3可以看出,CZ1與地衣芽孢桿菌屬(B.licheniformis)同源性達100%,CZ2與枯草芽孢桿菌屬(B.subtilis)同源性達100%,CZ3與巨大芽孢桿菌屬(B.megaterium)同源性達100%,CZ4與植物乳桿菌屬(L.plantarum)同源性達100%。因此可以確定CZ1為地衣芽孢桿菌,CZ2為枯草芽孢桿菌,CZ3為巨大芽孢桿菌,CZ4為植物乳桿菌。

        圖3 4種菌的16SrDNA序列系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 Phylogenetic tree for 16SrDNA sequences of four species of bacteria

        2.2 各菌種間的拮抗作用

        試驗采用C值表示抑菌作用的大小,C值是指抑菌圈直徑與菌餅直徑的比值,地衣芽孢桿菌對枯草芽孢桿菌和植物乳桿菌有拮抗作用,它們的C值分別為1.18和1.15;枯草芽孢桿菌對巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌有拮抗作用,它們的C值分別為1.12和1.19;巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌對其他菌種均無拮抗作用。

        由圖4可知,地衣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌和植物乳桿菌均用同一種培養(yǎng)基培養(yǎng),對營養(yǎng)物質(zhì)需求基本一致,但由于試驗中地衣芽孢桿菌已先在培養(yǎng)基培養(yǎng)2 d,因此數(shù)量上會有一定的優(yōu)勢,在營養(yǎng)物質(zhì)和生存空間等的競爭上會占據(jù)一定的優(yōu)勢,從而對枯草芽孢桿菌和植物乳桿菌產(chǎn)生一定的抑制作用;同樣的,枯草芽孢桿菌已先在培養(yǎng)皿中培養(yǎng)2 d,因此枯草芽孢桿菌的數(shù)量會比巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌多一些,在營養(yǎng)物質(zhì)、生長空間等的競爭中取得一定的優(yōu)勢,從而對巨大芽孢桿菌和枯草植物乳桿菌的生長產(chǎn)生一定的抑制效果,而且對于植物乳桿菌而言,枯草芽孢桿菌對其抑制作用較大,可能是因為枯草芽孢桿菌的代謝產(chǎn)物對植物乳桿菌的生長產(chǎn)生一定的抑制作用;其他菌種之間均無拮抗作用,因為C值均為1,它們可以共同生長。

        圖4 各菌種拮抗試驗結(jié)果Fig.4 Result of antagonistic test of various strains

        2.3 液體菌劑的構(gòu)建

        2.3.1 pH對混合菌種生長的影響 按地衣芽孢桿菌∶枯草芽孢桿菌∶巨大芽孢桿菌∶植物乳桿菌=1∶1∶1∶1的比例混合接種在不同pH的液體培養(yǎng)基中,用稀釋涂布平板法測定有效活菌數(shù),結(jié)果見表2。從表2可以看出,當培養(yǎng)基pH為7.0時,各菌種均生長良好,有效活菌數(shù)比其他pH下明顯要多,說明該混合菌劑的最適pH為7.0。因此,使用牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基,將pH調(diào)至7.0,從而得到一種高效的液體菌劑。

        表2 不同pH液體培養(yǎng)基中的有效活菌數(shù)(×108個/mL)Table 2 Number of effective living bacteria in liquid media with different pH (×108 cell/ mL)

        3 討論

        生物有機肥為當下較熱門的問題,搞清楚其中的菌種刻不容緩。本試驗經(jīng)過菌體、菌落、分子手段三方面的鑒定,力求能做到精確,在清楚其中菌種類型之后,考慮到可以配置液體菌劑,且這種菌劑比固體生物有機肥有益生菌數(shù)量多、效力強等優(yōu)點,通過拮抗實驗檢測各菌種之間的共存關(guān)系,表明這4種菌之間均無拮抗作用,可以共同生長,這為構(gòu)建液體菌劑提供了一個極好的理論基礎(chǔ)。液體菌劑要求菌種數(shù)量要足夠多,同時也需要各菌種較均衡,不能一枝獨秀,由于這4種菌都屬于細菌,因此選擇牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基作為實驗環(huán)境。影響液體菌劑構(gòu)建的因素包括pH、營養(yǎng)成分、菌種初始比例等,本試驗中牛肉膏蛋白胨的成分是一致的,而不同菌種的最適pH不同,混合培養(yǎng)時的最適pH更加值得探究,因此pH是最主要的一個影響因素,在牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基中添加其他營養(yǎng)成分對混合微生物生長的影響會在今后的試驗中加以研究。通過菌餅法證實沒有拮抗,因此采用地衣芽孢桿菌∶枯草芽孢桿菌∶巨大芽孢桿菌∶植物乳桿菌=1∶1∶1∶1的比例進行最適pH的測定。對各菌懸液進行吸光度測試,保證初始菌種數(shù)量基本一致,避免因某種菌數(shù)量過多而影響其他菌生長發(fā)育。生物有機肥的具體作用機制目前尚未明朗,可以肯定其具有巨大的發(fā)展前景,應(yīng)更深入其作用機理研究,完善科研手段和科研設(shè)備,增加微生物肥料的種類,更大限度提高農(nóng)作物產(chǎn)量。

        4 結(jié)論

        本試驗從生物有機肥中分離出4種菌,經(jīng)鑒定分別為地衣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌。通過菌餅法和平板涂布法對各菌種之間的拮抗作用以及培養(yǎng)條件進行研究,表明這4種菌之間均無拮抗作用,雖然地衣芽孢桿菌對枯草芽孢桿菌和植物乳桿菌有拮抗作用(C值分別為1.18和1.15),枯草芽孢桿菌對巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌也有拮抗作用(C值分別為1.12和1.19),但C值均小于1.2,因此將它們之間的拮抗忽略不計,因為菌餅上的菌已培養(yǎng)生長了2 d,在數(shù)量上有一定的優(yōu)勢,會由于數(shù)量的差異而產(chǎn)生一定的抑菌作用,所以忽略不計。巨大芽孢桿菌和植物乳桿菌對其他菌種均無拮抗作用。

        由于這4種菌之間均無拮抗作用,將地衣芽孢桿菌∶枯草芽孢桿菌∶巨大芽孢桿菌∶植物乳桿菌按1∶1∶1∶1添加到不同pH的牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基液體培養(yǎng)基中進行培養(yǎng),并用稀釋涂布平板法測定有效活菌數(shù),最終得到最適pH為7.0,即使用牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基,將pH調(diào)至7.0時各菌種都能很好的的生長,由此可得到一種高效的液體菌劑。

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