李秀坤,許冬清
南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 農(nóng)學(xué)院 作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南京 210095
太陽光是植物能量的主要來源。除此之外,光還作為一個(gè)重要的環(huán)境信號因子影響和調(diào)控植物的諸多生長發(fā)育和生理過程。自20世紀(jì)90年代以來,植物光生物學(xué)家借助分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的發(fā)展和各種新的技術(shù)方法,對植物光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)進(jìn)行研究并有突破性的進(jìn)展。植物接受光信號并傳遞至下游,進(jìn)而作出適時(shí)的應(yīng)答反應(yīng),以適應(yīng)時(shí)刻變化的光環(huán)境。植物是固生生物,從種子落地發(fā)芽開始,就會在一個(gè)固定的地點(diǎn)完成整個(gè)生命周期。但是,植物并不像我們看到的那樣靜止不動,在微觀層面上可謂是瞬息萬變。不同光環(huán)境下,植物啟動精密的光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)以應(yīng)對不同的光質(zhì)、光強(qiáng)、光照時(shí)間和方向,確保其自身的健康生長。
陽光普照一切生物,為大自然帶來生機(jī)。所謂 大海航行靠舵手,萬物生長靠太陽 。自1906年美國科學(xué)家Garner和Allard發(fā)現(xiàn)光對植物生長發(fā)育的影響開始,全世界的科學(xué)家就從未停止過光對植物作用的研究。
在數(shù)萬年的進(jìn)化過程中,植物為了感知和識別光信號已經(jīng)進(jìn)化出幾類不同的光受體。它們是識別280~315 nm 的 UV-B 信號的紫外光受體 UVR8[1-2]、吸收波段為315~500 nm 的 UV-A和藍(lán)光受體隱花色素 1 和 2(CRY1和CRY2)以及向光素 1 和 2(Phot1和Phot2)[3-5],而光敏色素(PHYA~PHYE)主要吸收600~750 nm的紅光和遠(yuǎn)紅光[6](圖1)。其中PHYA是吸收遠(yuǎn)紅光信號的主要光受體,PHYB是識別紅光信號的主要光受體。光敏色素在吸收波長為670 nm的紅光后可以轉(zhuǎn)化成有活性的光受體Pfr,而在吸收730 nm的遠(yuǎn)紅光后轉(zhuǎn)換成無生物學(xué)活性的Pr狀態(tài)[7]。這些光受體的發(fā)現(xiàn),對于植物光生物學(xué)的發(fā)展具有里程碑意義。全世界多家致力于光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究的實(shí)驗(yàn)室,協(xié)同參與了這些重要的研究項(xiàng)目。斯坦福大學(xué)的Winslow Briggs院士發(fā)現(xiàn)向光素,并解釋了植物的向光性現(xiàn)象[3]。加州大學(xué)伯克利分校的Peter Quail院士克隆了第一個(gè)光敏色素[6]。賓夕法尼亞大學(xué)的 Anthony R. Cashmore院士和加州大學(xué)洛杉磯分校的林辰濤教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)分別克隆了隱花色素CRY1和CRY2[4-5]。UV-B受體由瑞士日內(nèi)瓦大學(xué)Roman Ulm教授實(shí)驗(yàn)室首先發(fā)現(xiàn)[1]。有人會問:為什么沒有識別500~600 nm波段的光受體?答案是:這一波段為綠光,在植物體內(nèi)是沒有綠光受體的。綠光可以在紅光受體和藍(lán)光受體的介導(dǎo)下,參與植物生長發(fā)育的過程,如向光性反應(yīng)、莖的伸長、葉的生長、氣孔的開閉和其他器官的生長等。人類肉眼只能看到可見光部分,一般為400~760 nm之間。由此看來,植物比人類感受光的能力要更強(qiáng)。這些光受體在識別不同波長的光信號后,迅速地在植物細(xì)胞內(nèi)啟動不同的生物學(xué)事件,將信號傳遞至下游,并通過影響大量基因的表達(dá)而調(diào)控不同的生理和生長發(fā)育過程。
圖1 模式植物擬南芥中的光受體
植物通過這些光受體精確分辨太陽光不同的波長、方向、強(qiáng)度和周期等信息變化,經(jīng)由復(fù)雜的信號感受、傳遞和響應(yīng),完成信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。一方面植物利用光能進(jìn)行光合作用,將光能轉(zhuǎn)化成有機(jī)能;另一方面,通過一系列光調(diào)節(jié)基因來調(diào)控種子的萌發(fā)、幼苗的光形態(tài)建成、避蔭性、葉綠體和小葉的運(yùn)動、開花的誘導(dǎo)以及很多細(xì)胞核內(nèi)和葉綠體內(nèi)基因的表達(dá)等。為了揭示其中的奧秘,植物光生物學(xué)家做了很多有意思的研究,以期揭示這個(gè)光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和植物響應(yīng)光的分子機(jī)理。最終科學(xué)家們通過遺傳篩選和表型鑒定獲得了cop/det/fus這樣一組對光信號具有多效性的突變體[8](圖2)。這些突變體在黑暗下都表現(xiàn)出組成型光形態(tài)建成的表型,即這些基因單獨(dú)的功能缺失均可以導(dǎo)致植物幼苗在黑暗下就模擬光下生長的過程。COP1是COP/DET/FUS系統(tǒng)中一個(gè)典型的代表,是光形態(tài)建成的核心抑制因子。它實(shí)際上是將光形態(tài)建成的促進(jìn)因子進(jìn)行降解而行使抑制光形態(tài)建成的機(jī)制,通過多泛素化光形態(tài)建成核心促進(jìn)因子HY5、HYH、PHYA、BBX21、BBX22、HFR1、PIL1、PAR1和PAR2等,而促進(jìn)它們通過26S蛋白水解酶體降解[8-9]。在光照條件下,一方面有活性的光敏色素受體從細(xì)胞質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞核后會與 COP1 或者 SPAs 等蛋白互作來解離 COP1-SPAs 復(fù)合體,進(jìn)而抑制COP1的E3泛素連接酶活性,而它的活性降低就會使得植物表現(xiàn)出光形態(tài)建成的表型;另一方面大部分 COP1 以目前還不太清楚的機(jī)制出核,最終使得細(xì)胞核內(nèi)光形態(tài)促進(jìn)因子迅速積累,進(jìn)而促使幼苗進(jìn)行光形態(tài)建成[10-11]。DET是Deetiolation的簡稱,也就是去黃化。植物在黑暗下生長,會出現(xiàn)黃化苗,見光以后則會合成葉綠素轉(zhuǎn)為綠色。 FUS 則是Fusca的簡稱。Fusca是拉丁語,深紫色的意思,主要是因?yàn)檫@些突變體的種子中花青素大量積累,而呈現(xiàn)出深紫色。其中cop系列的突變體和det系列的突變體最后都被定位是相應(yīng)的fusca系列突變體的等位基因,如cop1與fusca1是等位的,det1與fusca2是等位的。COP/ DET/ FUS 位于光受體的下游,處在光信號通路的中心,它們主要通過調(diào)節(jié)下游的光形態(tài)建成促進(jìn)因子的蛋白水平來調(diào)節(jié)幼苗的光形態(tài)建成。
COP1是其中一直較為受關(guān)注的成員。作為E3 泛素化連接酶,其通過降解參與植物光形態(tài)建成的促進(jìn)因子以及調(diào)節(jié)開花和生物鐘節(jié)律的一系列調(diào)控因子等,來參與植物生長發(fā)育的諸多過程。1991年鄧興旺(后來當(dāng)選為美國科學(xué)院院士)首先鑒定了擬南芥cop1突變體[12]。次年,他成功地克隆了擬南芥COP1基因,這一研究成果發(fā)表在《細(xì)胞》(Cell)雜志上[13]。隨后,鄧興旺教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)通過系統(tǒng)性的遺傳和生物化學(xué)研究鑒定和證明了CP/DET/FUS 所組成的3個(gè)E3泛素化連接酶復(fù)合體位于光受體下游,并處于光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的核心位置。這三大復(fù)合體在黑暗下位于細(xì)胞核內(nèi)并具有高度的生物學(xué)活性,降解了大量的蛋白底物,從而確保植物下胚軸或莖迅速伸長,以及雙子葉植物子葉閉合并形成彎鉤;而見光以后,這些復(fù)合體的活性被多種不同分子調(diào)控機(jī)制所抑制,使得下游底物在細(xì)胞核內(nèi)得以積累并促進(jìn)幼苗生長[8-9]。這些有趣的發(fā)現(xiàn),不僅完善了人們對植物光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的理解,也推動了針對這一調(diào)控系統(tǒng)在動物和人類中的研究。這是因?yàn)镃OP/DET/FUS系統(tǒng)在動物和人類中也具有E3泛素化連接酶活性,參與和調(diào)控腫瘤發(fā)生等諸多生理和病理的發(fā)生和調(diào)控過程。
圖2 野生型和cop1突變體在黑暗下和光下生長的表型
光信號影響植物體內(nèi)將近3 000多個(gè)基因的表達(dá),而直接控制這些基因表達(dá)的主要是一類受光調(diào)控的轉(zhuǎn)錄因子,其中HY5是這一途徑最為關(guān)鍵和最具有代表性的一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。HY5可以直接或者間接地結(jié)合在植物體內(nèi)約1/3基因的啟動子區(qū)域而調(diào)控它們的表達(dá)[14]。這些基因的改變直接影響著植物受光調(diào)控的生長發(fā)育過程,其中就包括光形態(tài)建成。在黑暗下,HY5是被COP1所泛素化而降解的;而在光下,積累的HY5就具有調(diào)控下游目的基因表達(dá)的能力[15]。在轉(zhuǎn)錄和蛋白水平,HY5受到光受體和COP/DET/FUS 的調(diào)控,證明HY5位于這一調(diào)控體系的下游,也就是說光信號-光受體-COP/DET/FUS系統(tǒng)通過調(diào)控HY5而影響植物體內(nèi)大量基因的表達(dá),從而最終調(diào)控植物的光形態(tài)建成。hy5突變體最初也是在鄧興旺教授的實(shí)驗(yàn)室通過遺傳篩選獲得[16]。隨后,植物光生物學(xué)家借助于分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的技術(shù)手段,闡明HY5在植物光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中詳細(xì)的工作機(jī)制,并確立它在這一轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的重要位置。
擬南芥幼苗利用光受體感受光信號后,主要通過影響蛋白與蛋白的互作、蛋白的核質(zhì)定位和蛋白的穩(wěn)定性等生物學(xué)事件將信號傳遞下去。在光信號通路中,光影響蛋白與蛋白互作比較常見,如光敏色素被激活入核后可與 PIFs 和SPAs 等蛋白互作,受藍(lán)光激活的 CRY2 與 CIB1和 SPAs 可以相互作用,以及紫外光照后二聚的UVR8 解離成 UVR8 單體后能夠與 COP1/SPAs復(fù)合體相互作用等[10]。
在黑暗條件下,沒有活性的光敏色素受體位于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),而細(xì)胞核里的 PIFs蛋白則以同源或者異源二聚體的形式結(jié)合在光調(diào)控基因的啟動子上,并調(diào)控這些基因的表達(dá),進(jìn)而抑制植物的光形態(tài)建成。另外,位于細(xì)胞核內(nèi)的COP1 能夠降解光形態(tài)建成的促進(jìn)因子如 HY5、 LAF1、HFR1、PAP1和PAP2等。HY5是光形態(tài)建成的正向調(diào)節(jié)子,HFR1參與避蔭反應(yīng),PAP1和PAP2是花青素生物合成的正調(diào)控因子,而CO是光周期介導(dǎo)的促進(jìn)開花的關(guān)鍵因子。這些關(guān)鍵因子控制了植物體內(nèi)大約1/3基因的表達(dá)[10]。光受體PHYA、PHYB和CRY2也被COP1/SPA蛋白復(fù)合體降解,抑制光形態(tài)建成,表明COP1反饋調(diào)控光受體。在光照條件下,光敏色素遷移至細(xì)胞核里,能夠與PIFs相互作用,并以一種未知的方式磷酸化PIFs而被降解[17];同時(shí),光敏色素從細(xì)胞質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞核后會與 COP1 或者 SPAs 等蛋白形成異聚體來解離 COP1-SPAs 復(fù)合體,進(jìn)而抑制COP1-SPAs活性[10-11]。在長時(shí)間的光照下,大部分 COP1 以目前還不太清楚的機(jī)制遷移出細(xì)胞核,最終使得細(xì)胞核內(nèi)光形態(tài)促進(jìn)因子迅速積累,進(jìn)而促使植物體內(nèi)1/3基因的正常表達(dá)而促進(jìn)光形態(tài)建成。因此,光受體-E3泛素化連接酶復(fù)合體-轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控體系是植物光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)中的核心調(diào)控開關(guān)。
不同類別的光受體和COP/DET/FUS的發(fā)現(xiàn)和鑒定極大地加深了人們對光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)的認(rèn)識,并且繪制了一個(gè)類似線性的光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。COP/DET/FUS組成了3個(gè)不同的E3泛素連接酶復(fù)合體,降解諸多的下游底物。這些調(diào)控因子在包括人類在內(nèi)的其他真核生物中也是保守的,并且具有類似的生物化學(xué)活性。除了調(diào)控光形態(tài)發(fā)生外,COP/DET/FUS蛋白在許多其他生物學(xué)過程中也起著關(guān)鍵作用,其在植物或者哺乳動物中的功能完全喪失,均導(dǎo)致致死的表型?;诤诎迪碌焦庀轮参镉酌缧螒B(tài)建成的分子機(jī)理研究,已經(jīng)揭示了一個(gè)較為清晰的光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,但是光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)如何在調(diào)控植物其他的生長發(fā)育過程(例如氣孔發(fā)育、成株形成等)中行使作用,以及與其他環(huán)境因子和不同植物激素信號途徑的整合調(diào)控,將是植物光生物學(xué)家需要持續(xù)付諸努力的研究領(lǐng)域和方向。