亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        茯苓三萜類成分利水作用的虛擬篩選

        2019-06-06 01:59:36倪文娟俞松林張莉華劉福和崔明超陳少軍
        中國藥業(yè) 2019年11期
        關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)

        倪文娟,俞松林,張莉華,劉福和,崔明超,陳少軍

        (浙江醫(yī)藥高等專科學(xué)校,浙江 寧波 315100)

        茯苓為多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核,是利水滲濕之要藥,臨床用于治療各種水腫,其化學(xué)成分主要有多糖和三萜類成分,茯苓多糖具有抑制腫瘤、調(diào)節(jié)機(jī)體免疫等功能[1-2],但利水滲濕的有效成分還有待進(jìn)一步研究。水通道蛋白(aquaporins,AQPs)是一類對水具有高度選擇性的細(xì)胞膜通道蛋白,廣泛存在于各種機(jī)體組織中,對水的分泌吸收及組織內(nèi)外、細(xì)胞內(nèi)外水平衡具有重要作用[3-4]。中醫(yī)脾運(yùn)化水濕與水通道蛋白存在緊密聯(lián)系,在脾胃濕熱、寒濕困脾、脾虛濕困、胃陰不足等不同證型中AQPs基因表達(dá)有變化[5]。因此,推測AQPs可能也是茯苓利水健脾的靶蛋白。傳統(tǒng)藥理篩選方法費(fèi)時費(fèi)力,而計(jì)算機(jī)輔助虛擬篩選技術(shù)提供了新的手段,減少了尋找新藥的盲目性和偶然性。本研究中以AQPs為靶蛋白,利用計(jì)算機(jī)虛擬篩選茯苓三萜類成分中具有利水活性的有效成分,并探討其作用機(jī)制?,F(xiàn)報(bào)道如下。

        1 材料與方法

        1.1 受體結(jié)構(gòu)信息來源及處理

        蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)準(zhǔn)備:靶蛋白結(jié)構(gòu)從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PDB(http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)中 下 載。脾胃中主要存在AQP1,3,4,5亞型。因PDB庫中沒有AQP3亞型結(jié)構(gòu),故本研究中以AQP1,4,5為研究對象,其對應(yīng)的PDB文件號分別為1IH5,3GD8,3D9S。獲取結(jié)構(gòu)后,依次對靶蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行檢驗(yàn)、預(yù)處理,確定配體結(jié)合口袋等準(zhǔn)備工作。

        1.2 茯苓三萜類小分子化合物庫準(zhǔn)備

        目前,國內(nèi)外學(xué)者已從茯苓中分離鑒別出三萜類成分39個。根據(jù)化學(xué)結(jié)構(gòu)差異,其分類[6]見表1。采用ISIS-draw軟件繪制2D結(jié)構(gòu)圖,在線轉(zhuǎn)化為3D結(jié)構(gòu),建立配體三維結(jié)構(gòu)庫。并用虛擬篩選PyRx軟件的Open Babel模塊對庫中各個小分子進(jìn)行能量優(yōu)化,將其轉(zhuǎn)換成PyRx軟件認(rèn)可的pdbqt格式[6]。

        1.3 虛擬篩選

        茯苓三萜成分與靶蛋白的匹配情況采用PyRx軟件的autodock Vina模塊進(jìn)行虛擬篩選和分子對接,根據(jù)系統(tǒng)能量的大小打分[7]。

        1.4 數(shù)據(jù)分析與作圖

        采用分子模擬圖形界面軟件Discovery Studio Visualizer 3.5進(jìn)行對接結(jié)果分析及作圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 與AQP1的作用

        39個茯苓三萜小分子配體與AQP1進(jìn)行分子對接后,去氫松香酸甲酯與之的對接能最低,為-5 kJ/mol。去氫松香酸甲酯為三環(huán)二萜類,由圖1可見,其范德華力在對接中起主導(dǎo)作用;同時,195位Arg殘基、180位His殘基與去氫松香酸甲酯上的苯環(huán)形成了鹽橋,這是離子π-π相互作用,苯環(huán)中心由于四極-四極作用帶

        部分負(fù)電荷,His和Arg殘基電離后中心碳原子帶部分正電荷。195位Arg,76位Asn殘基與配體形成靜電作用力。

        表1 茯苓中的三萜類化合物

        圖1 AQP1與去氫松香酸甲酯分子對接效果圖

        圖2 AQP4與去氫松香酸甲酯分子對接效果圖

        圖3 AQP5與去氫松香酸甲酯分子對接效果圖

        2.2 與AQP4的作用

        39個茯苓三萜小分子配體與AQP4進(jìn)行分子對接后,去氫松香酸甲酯與之的對接能最低,為-5.5 kJ/mol。由圖2可見,靜電作用力在對接中起主導(dǎo)作用。同時,234位Trp殘基與去氫松香酸甲酯上的苯環(huán)形成了鹽橋。234位Trp殘基與配體形成靜電力相互作用。

        2.3 與AQP5的作用

        39個茯苓三萜小分子配體與AQP5進(jìn)行分子對接后,去氫松香酸甲酯與之的對接能最低,為-7.6 kJ/mol。由圖3可見,范德華力在對接中起主導(dǎo)作用。同時,27位Phe殘基、51位Leu殘基與去氫松香酸甲酯上的苯環(huán)形成了鹽橋。48位Ala殘基與配體形成靜電力相互作用。

        3 討論

        AQPs的正常表達(dá)可能是運(yùn)化水濕、津液輸布的分子生物學(xué)基礎(chǔ),AQPs失??赡苁菨癫⌒纬傻闹匾?。陳更新等[8]報(bào)道,脾胃濕熱證患者AQP4基因表達(dá)顯著升高。濕阻中焦證AQP1在胃賁門黏膜下組織和胃體中間黏膜表達(dá)減少,AQP1在胃賁門和小腸中段黏膜表達(dá)增加[9]。韋蒿等[10]報(bào)道,試驗(yàn)性脾胃濕熱證模型大鼠胃黏膜AQP3和AQP4的表達(dá)明顯升高,推測AQP3和AQP4基因表達(dá)增強(qiáng)是機(jī)體對胃黏膜炎癥損害的保護(hù)性反應(yīng)。

        茯苓等利水中藥對AQPs的調(diào)節(jié)也逐漸成為研究的熱點(diǎn)。茯苓和豬苓均可引起正常大鼠尿量增加和尿滲量降低,并在用藥早期可降低尿液中AQP2的排泄[11]。江月斐等[12]報(bào)道,脾陽虛泄瀉的大鼠胃體、回腸、結(jié)腸組織中AQP3表達(dá)減弱,提示脾主運(yùn)化水液功能減退,而用苓桂術(shù)甘湯治療可提高脾陽虛大鼠胃腸道AQP3的表達(dá)。175 mmol/L NaCl高滲溶液可促使IMCD-3細(xì)胞AQP2蛋白表達(dá)升高,而茯苓可通過抑制PKA通量來降低高滲誘導(dǎo)AQP2表達(dá),并具有抗凋亡作用[13]。

        茯苓作為滲濕健脾的要藥,可作用于脾胃的AQPs蛋白,達(dá)到利水滲濕作用。在39個茯苓三萜成分中,去氫松香酸甲酯與AQP1,AQP4,AQP5對接的結(jié)合能較低,說明其作用活性較好。水通道不同亞型AQP1,4,5都與去氫松香酸甲酯的活性是最強(qiáng)的,原因可能是:1)AQP1,4,5的基因結(jié)構(gòu)相似,相互氨基酸序列具有30%~50%的同源性,都屬AQP家族中的水選擇性通道亞家族[14-15]。2)去氫松香酸甲酯為三環(huán)二萜類,比其他38個茯苓三萜類都小。而AQPs為通道蛋白,通道有一定大小。去氫松香酸甲酯結(jié)構(gòu)相對較小,更易進(jìn)入通道內(nèi)部,也就更有利于與AQPs結(jié)合,這一點(diǎn)在圖2中得到了驗(yàn)證。去氫松香酸甲酯與AQP1,4,5對接的位點(diǎn)都不同。對于靶蛋白來說,是存在不同的結(jié)合位點(diǎn)。以AQP4為例,本研究中AQP4的PDB文件號是3GD8,該蛋白結(jié)構(gòu)就存在6種不同的配體結(jié)合位點(diǎn)。

        茯苓三萜類成分中氫松香酸甲酯與AQP1,4,5結(jié)合的活性較強(qiáng)。通過分析去氫松香酸甲酯與AQP1,4,5作用位點(diǎn)和作用力可進(jìn)一步了解茯苓利水滲濕機(jī)制,為臨床治療脾胃濕熱癥提供理論支持,并為后續(xù)活性成分研究和結(jié)構(gòu)修飾提供參考。

        猜你喜歡
        結(jié)構(gòu)
        DNA結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)
        《形而上學(xué)》△卷的結(jié)構(gòu)和位置
        論結(jié)構(gòu)
        中華詩詞(2019年7期)2019-11-25 01:43:04
        新型平衡塊結(jié)構(gòu)的應(yīng)用
        模具制造(2019年3期)2019-06-06 02:10:54
        循環(huán)結(jié)構(gòu)謹(jǐn)防“死循環(huán)”
        論《日出》的結(jié)構(gòu)
        縱向結(jié)構(gòu)
        縱向結(jié)構(gòu)
        我國社會結(jié)構(gòu)的重建
        人間(2015年21期)2015-03-11 15:23:21
        創(chuàng)新治理結(jié)構(gòu)促進(jìn)中小企業(yè)持續(xù)成長
        国产av自拍视频在线观看| 日本成人中文字幕亚洲一区| 亚洲人成网站77777在线观看| 欧美极品第一页| 日产精品一区二区三区| 亚洲每天色在线观看视频| 骚货人妻视频中文字幕| 亚洲av色福利天堂久久入口| 女优av一区二区三区| av中文字幕潮喷人妻系列| 国产av无码专区亚洲awww| 少妇厨房愉情理伦片bd在线观看| 夜夜被公侵犯的美人妻| 人妻少妇中文字幕久久69堂| 日本高清一区二区三区不卡| 自拍视频在线观看首页国产| 美女网站免费观看视频| 人妻丰满熟妇av无码区不卡| 内射后入在线观看一区| 久久精品亚洲中文无东京热| 中文字幕人妻少妇美臀| 亚洲成熟中老妇女视频| 国产亚洲精品97在线视频一| 无码人妻一区二区三区免费视频| 无套内射无矿码免费看黄| 无码国产亚洲日韩国精品视频一区二区三区 | 亚洲国产免费一区二区| 在线观看一区二区中文字幕| 久久久久亚洲精品无码蜜桃| 人妻无码中文专区久久五月婷 | 人妻av在线一区二区三区| 麻豆网神马久久人鬼片| 麻豆久久久9性大片| 在线无码国产精品亚洲а∨| 久久九九av久精品日产一区免费| 在线成人影院国产av| 77777_亚洲午夜久久多人| 国产黄在线观看免费观看不卡| 在线观看精品国产福利片100| 亚洲成熟中老妇女视频| 国产乱子伦|