姜春旭,高 峰,佟 華,楊曉翠,叢建民,王佐成
(1.白城師范學院 理論計算中心,吉林 白城 137000; 2.白城師范學院 傳媒學院,吉林 白城 137000; 3.白城師范學院 物理學院,吉林 白城 137000; 4.白城師范學院 生命科學學院,吉林 白城 137000)
根據(jù)旋光性不同,α-丙氨酸(α-Ala)分為左旋體(S-α-Ala)和右旋體(R-α-Ala).在生命體內(nèi)S-α-Ala具有活性,S-α-Ala具有預(yù)防腎結(jié)石和緩和低血糖的作用,R-α-Ala可以抑菌并使皮膚保濕.由于丙氨酸有重要作用,很多學者對其做了比較廣泛的研究.文獻[1]報道了水環(huán)境下α-Ala分子的兩性離子結(jié)構(gòu)、振動圓二色性和偏振拉曼散射強度.文獻[2]用基于密度泛函的B3LYP方法,優(yōu)化計算了α-Ala分子的最穩(wěn)幾何構(gòu)象與紅外和拉曼光譜.文獻[3]的實驗研究,確認了α-Ala在295K和60K時手性對映體的幾何構(gòu)象以及S-α-Ala可以旋光異構(gòu).文獻[4-5]報道了有微量的α-Ala右旋體存在于生命體,并猜測其部分來源是α-Ala左旋體的旋光異構(gòu).文獻[6-8]的理論研究發(fā)現(xiàn): 氣相α-Ala分子的旋光異構(gòu)可以在4個通道實現(xiàn),決速步內(nèi)稟能壘分別是266.1kJ·mol-1、326.6kJ·mol-1、316.3kJ·mol-1和337.4kJ·mol-1.文獻[9]的研究表明,水溶劑環(huán)境下,2個和3個水分子簇催化的α-Ala分子旋光異構(gòu)反應(yīng)在優(yōu)勢通道上的決速能壘分別是138.6和122.5kJ·mol-1.文獻[10]的研究表明,扶手椅型單臂氮化硼納米管(5,5)對α-Ala分子的旋光異構(gòu)具有明顯的限域催化作用,優(yōu)勢通道決速步能壘為48.1kJ·mol-1(201.1kJ·mol-1).文獻[11-12]的研究表明,扶手椅型單臂碳納米管(9,9)和扶手椅型單臂氮化硼納米管(9,9)與水的復(fù)合環(huán)境使α-Ala 旋光異構(gòu)的能壘明顯降低,優(yōu)勢通道決速步能壘均為150.0kJ·mol-1左右.
依據(jù)文獻[10-12]的研究可知,小孔徑納米管或大孔徑納米管與水的復(fù)合環(huán)境可用作實現(xiàn)α-Ala旋光異構(gòu)的納米反應(yīng)器,但納米管昂貴,且能壘依然較高,導(dǎo)致納米管對α-Ala限域催化實驗工作的開展面臨困難.分子篩價格低廉且綠色環(huán)保,研究它對α-Ala的限域催化更具現(xiàn)實意義.文獻[13]的研究表明,MOR分子篩對α-Ala分子的旋光異構(gòu)具有限域催化作用,但不是十分顯著.文獻[14]的研究表明,MOR分子篩對水分子催化的賴氨酸旋光異構(gòu)具有一定的限域催化作用.基于文獻[10-14]的研究經(jīng)驗,并考慮到富水的生命體內(nèi)可能存在相似于MOR分子篩的納米級生物空穴,本工作研究了標題反應(yīng),期望為實驗上實現(xiàn)α-Ala的旋光異構(gòu)提供一個新途徑,并給生命體內(nèi)存在右旋α-Ala一個較為合理的解釋.
α-Ala分子(線度0.252nm×0.381nm×0.453nm)只能被MOR分子篩的12元環(huán)孔道(孔徑為0.650nm×0.700nm)組裝.采用周期性模型把含12元環(huán)孔道的分子篩骨架都包括進來,用含126T的簇模型代表MOR分子篩結(jié)構(gòu),如圖1(a)所示.
采用量子力學與分子力學組合的ONIOM方法[15]對標題反應(yīng)進行研究.將分子篩與駐點分子分為兩層: 內(nèi)層QM區(qū)為分子篩內(nèi)的物種,考慮到分子篩與駐點分子相互間的長程作用,采用長程校正泛函的CAM-B3LYP[16]方法處理;外層MM區(qū)分子篩,采用分子力學的UFF力場[17]處理,內(nèi)層放松外層固定,在ONIOM(CAM-B3LYP/6-31G(d,p): UFF)水平全參數(shù)優(yōu)化穩(wěn)定點和過渡態(tài)[18].MOR分子篩與水復(fù)合環(huán)境分為MOR分子篩與水汽相和水液相(水溶劑)復(fù)合環(huán)境兩種情況.水汽相,對于H遷移的分子構(gòu)象過程,把水視為離散介質(zhì),計算水分子作H遷移媒介的駐點結(jié)構(gòu),對沒有H遷移的分子構(gòu)型異構(gòu)過程,水汽環(huán)境視為孤立環(huán)境.水液相,用水汽環(huán)境下的駐點構(gòu)象,采用自洽反應(yīng)場(SCRF)理論的smd模型[19]方法和二階微擾論MP2[20]方法,在ONIOM(MP2/6-311++G(2df,pd): UFF)水平下計算駐點包結(jié)物分子的水溶劑化單點能(ESP).吉布斯自由能熱校正(Gtc)和單點能相加作為總吉布斯自由能(Gtotal),描繪反應(yīng)的勢能面.通過內(nèi)稟反應(yīng)坐標(IRC)計算[21]確認過渡態(tài).限域在MOR內(nèi)的S型α-Ala分子與1個水分子的氫鍵絡(luò)合物記為S-α-Ala·1H2O@MOR,若它們處在水溶劑環(huán)境下則記為α-Ala@MOR@water,其他駐點用類似方法標記.本工作的計算由Gaussian 09軟件包[22]完成.
MOR分子篩126T簇模型見圖1(a),α-Ala分子的S與R型穩(wěn)定幾何構(gòu)象見圖1(b)和(c).
圖1 (a)126T的MOR分子篩簇模型,(b)和(c)穩(wěn)定的S與R型α-Ala分子幾何構(gòu)象Fig.1 Cluster model of MOR zeolite of 126T (a), geometries of S-type(b) and R-type(c) of α-Ala molecules
研究發(fā)現(xiàn): 限域在MOR內(nèi),水分子做質(zhì)子遷移媒介的α-Ala分子旋光異構(gòu)能在3個通道a、b和c實現(xiàn),分別是α-氫以氨基氮、順次以羰基氧和氨基氮以及只以羰基氧為橋梁,從手性碳(α-碳)的一側(cè)遷移到另一側(cè).下面分別進行討論:
計算表明,a通道是主反應(yīng)通道,對此通道給予詳細討論.限域在MOR分子篩12元環(huán)孔道,以1個水分子、2個水分子簇以及3個水分子簇作為H遷移媒介,S-α-Ala分子在a通道的旋光異構(gòu)反應(yīng)過程見圖2(第258~259頁),反應(yīng)的吉布斯自由能勢能面見圖3(第259頁).水溶劑環(huán)境下反應(yīng)的吉布斯自由能勢能面見圖4(第259頁).
第1基元反應(yīng): S-α-Ala與MOR的12圓環(huán)孔道物理吸附,形成反應(yīng)物包結(jié)物S-Ala@MOR,其經(jīng)353H和354H在紙面里外翻轉(zhuǎn)的過渡態(tài)a_S-TS1@MOR,異構(gòu)成353H和354H在紙面里的中間體產(chǎn)物a_S-INT1@MOR.此過程二面角H353-N352-C347-H354從119.84°變?yōu)?119.78°,氨基團對稱異構(gòu).此時352N的靠近讀者的一面負電荷密度大,易于接受正電荷.二面角N352-C347-C350-C355從120.87°變?yōu)?20.46°,活性中心骨架結(jié)構(gòu)沒變,非骨架原子的旋轉(zhuǎn)所需要的能量很小,a_TS1@MOR產(chǎn)生的能壘只有10.2kJ·mol-1,水溶劑化效應(yīng)使該能壘升高,變?yōu)?7.8kJ·mol-1.
圖2 水汽環(huán)境下限域在MOR分子篩內(nèi)的α-Ala在a通道的旋光異構(gòu)歷程Fig.2 Optical isomerism process of α-Ala confined in the MOR zeolite in channel a in water gas-phase environment
圖3 水汽環(huán)境下限域在MOR分子篩內(nèi)的α-Ala在a通道旋光異構(gòu)的吉布斯自由能勢能面Fig.3 Gibbs energy surface of optical isomerism reaction of α-Ala confined in the MOR zeolite in channel a in water
圖4 水溶劑環(huán)境下限域在MOR分子篩內(nèi)的α-Ala在a通道旋光異構(gòu)反應(yīng)的吉布斯自由能勢能面Fig.4 Gibbs energy surface of optical isomerism reaction of α-Ala confined in the MOR zeolite in channel a in aqueous solvent environment
第2基元反應(yīng),359H向352N遷移,a_S-INT1與氨基和手性碳前面的1個、2個以及3個水分子通過氫鍵作用形成的中間體a_S-INT1·1H2O@MOR、a_S-INT1·2H2O@MOR和a_S-INT1·3H2O@MOR,經(jīng)過渡態(tài)a_TS2·1H2O@MOR、a_TS2·2H2O@MOR和a_TS2·3H2O@MOR,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物包結(jié)物a_INT2·1H2O(m)@MOR.a_INT2可以與不同位置的水分子通過氫鍵結(jié)合,這里(m)表示aINT2與氨基和手性碳前面的水分子以氫鍵結(jié)合.a_INT2·2H2O(m)@MOR和a_INT2·3H2O(m)@MOR,實現(xiàn)了H以水分子媒介從手性碳向氨基氮的遷移.
對于2個和3個水分子簇催化的此基元反應(yīng)過程,表1的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)表明,過渡態(tài)a_TS2·2H2O@MOR和a_TS2·3H2O@MOR的氫鍵鍵角都接近平角,氫鍵較強,他們的7元環(huán)和9元環(huán)結(jié)構(gòu)偏離平面的程度較小,這些過渡態(tài)較穩(wěn)定.結(jié)構(gòu)分析表明,從a_S-INT1·2H2O@MOR到a_TS2·2H2O@MOR和a_S-INT1·3H2O@MOR到a_TS2·3H2O@MOR過程,反應(yīng)活性中心骨架二面角352N-347C-350C-355C分別從125.00°和124.33°變?yōu)?24.65°和124.07°;347C-352N鍵長分別從0.14646nm和0.14662nm變?yōu)?.14992nm和0.14950nm,骨架結(jié)構(gòu)基本沒變.而裸反應(yīng)的活性中心骨架二面角352N-347C-350C-355C從121.42°變?yōu)?37.08°,347C-352N鍵長從0.14593nm變?yōu)?.15751nm[8],骨架結(jié)構(gòu)明顯形變;并且,裸反應(yīng)的3元環(huán)過渡態(tài)a_TS2不穩(wěn)定[8].因此,從a_S-INT1·2H2O@MOR到a_TS2·2H2O@MOR和a_S-INT1·3H2O@MOR到a_TS2·3H2O@MOR過程,需要越過的能壘會遠低于裸反應(yīng)的情形.但由于從a_S-INT1·2H2O@MOR到a_TS2·2H2O@MOR過程,反應(yīng)活性中心的C347-H359、O360-H363和O364-H361鍵長分別從0.10996nm、0.09805nm和0.09927nm改變?yōu)?.13341nm、0.13880nm和0.15011nm,伸長量分別為0.02345nm、0.04047nm和0.05084nm,均有較大的伸長.從a_S-INT1·3H2O@MOR到a_TS2·3H2O@MOR過程,相關(guān)數(shù)據(jù)也大致如此.
表1 a_TS2·1H2O@MOR、a_TS2·2H2O@MOR和a_TS2·3H2O@MOR的主要結(jié)構(gòu)參數(shù)
因此,從a_S-INT1·2H2O@MOR越過a_TS2·2H2O@MOR和從a_S-INT1·3H2O@MOR越過a_TS2·3H2O@MOR需要一定的能量,這兩個能壘分別是133.5kJ·mol-1和134.0kJ·mol-1.水溶劑效應(yīng)使這兩個能壘分別降為116.1kJ·mol-1和111.2kJ·mol-1,說明水溶劑有助催化作用.
對于1個水分子催化的此基元反應(yīng),5元環(huán)結(jié)構(gòu)過渡態(tài)a_TS2·1H2O@MOR的氫鍵鍵角(見表1)偏離平角較大,導(dǎo)致其穩(wěn)定性差,并且從a_S-INT1·1H2O@MOR到a_TS2·1H2O@MOR過程,反應(yīng)活性中心骨架二面角352N-347C-350C-355C從120.56°變?yōu)?28.75°,347C-352N鍵長從0.14595nm拉伸到0.15038nm,相對于2個和3個水分子簇催化的此過程,347C-352N鍵長伸長增加.因此,從a_S-INT1·1H2O@MOR到a_TS2·1H2O@MOR過程需要的形變能稍大,a_TS2·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘稍高些,是176.3kJ·mol-1.水溶劑效應(yīng)使其下降到171.3kJ·mol-1,說明水溶劑化效應(yīng)對此基元反應(yīng)助催化作用不明顯.
任何一種改變開頭都是困難的,曾經(jīng)養(yǎng)成的習慣,他都得一件件改,首先要變的就是他那大嗓門,其次要壓制他時刻躥上來的沖動,再則要學會換位思考尊重別人……
第3基元反應(yīng),aINT2的質(zhì)子化氨基上紙面里側(cè)的H在紙面里向手性碳遷移.此過程相似于前面第2基元的逆反應(yīng),aINT2與紙面里側(cè)的1個、2個以及3個水分子通過氫鍵作用形成的中間體反應(yīng)物a_INT2·1H2O(n)@MOR、a_INT2·2H2O(n)@MOR和a_INT2·3H2O(n)@MOR((n)表示aINT2與氨基和手性碳后面的水分子以氫鍵結(jié)合),分別經(jīng)過不同的過渡態(tài)a_TS3·1H2O@MOR、a_TS3·2H2O@MOR和a_TS3·3H2O@MOR,實現(xiàn)了質(zhì)子化氨基上的H以水分子為媒介在紙面里向手性碳遷移,異構(gòu)成中間體a_R-INT3·1H2O@MOR、a_R-INT3·2H2O@MOR和a_R-INT3·3H2O@MOR,實現(xiàn)旋光異構(gòu),R表示INT3是右旋體.與第2基元反應(yīng)相似,相對于裸反應(yīng),這些過渡態(tài)都具有較強的氫鍵,并且從中間體反應(yīng)物到過渡態(tài)的構(gòu)象形變都很小,因此,這些過渡態(tài)產(chǎn)生的能壘不會很高.對于2個水分子簇催化的此基元反應(yīng),結(jié)構(gòu)分析表明,從a_INT2·2H2O(n)@MOR到a_TS3·2H2O@MOR過程,N352-H361、O364-H363和O360-H359鍵長分別從0.10490nm、0.09959nm和0.10098nm改變?yōu)?.11012nm、0.10818nm和0.12824nm,伸長量較小,分別為0.00522nm、0.00859nm和0.02726nm;352N-347C從0.14874nm變?yōu)?.14956nm,伸長量極小,僅為0.00082nm.因此,此基元反應(yīng)的能壘不高,只有18.8kJ·mol-1.水溶劑效應(yīng)使其下降到15.0kJ·mol-1.對于1個水分子和3個水分子簇催化的此基元反應(yīng),機理相似于2個水分子簇催化的情形,篇幅所限,不進行詳細討論.水汽環(huán)境的反應(yīng)能壘分別是34.1kJ·mol-1和14.9kJ·mol-1,在水溶劑環(huán)境下,這些能壘分別升高和降低到42.4和9.5kJ·mol-1.
最后,a_R-INT3經(jīng)與第一基元反應(yīng)相似的過渡態(tài)a_R-TS4@MOR,實現(xiàn)H353和H354從紙面外向紙面里的翻轉(zhuǎn),異構(gòu)成產(chǎn)物a_R-Ala@MOR.此基元反應(yīng)骨架結(jié)構(gòu)基本沒變,只是非骨架原子翻轉(zhuǎn),所需要的形變能量較小,活化能壘只有13.1kJ·mol-1,水溶劑環(huán)境下變?yōu)?0.2kJ·mol-1.
整個反應(yīng)過程,從S-Ala@MOR到a_R-Ala@MOR,二面角H353-N352-C347-H354從119.84°變?yōu)?120.37°,實現(xiàn)了氨基的對稱異構(gòu);二面角N352-C347-C350-C355從120.87°變?yōu)?121.14°,實現(xiàn)了骨架結(jié)構(gòu)的對稱異構(gòu);二面角C350-C347-H359-C355從120.99°變?yōu)?119.14°,S-Ala實現(xiàn)手性對映體轉(zhuǎn)變.
從圖3和圖4可以看出,水分子作質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介的反應(yīng),決速步都是第2基元反應(yīng),以2個和3個水分子構(gòu)成的鏈作氫遷移媒介并考慮水溶劑效應(yīng),決速步自由能壘被降到116.1和112.3kJ·mol-1,比此通道裸反應(yīng)的決速步能壘266.1kJ·mol-1[8]和只是在MOR分子篩12元環(huán)孔道的決速步能壘264.7kJ·mol-1[13]都大幅降低,比水環(huán)境此通道的決速步能壘138.6和122.5kJ·mol-1[9]也明顯降低.說明MOR分子篩與水的復(fù)合環(huán)境對α-Ala的旋光異構(gòu)具有很好的共催化作用.116.1和112.3kJ·mol-1已經(jīng)遠低于質(zhì)子遷移的“極限能壘”167.0kJ·mol-1[23],又MOR分子篩價格低廉并環(huán)保,因此,水溶劑環(huán)境下用MOR分子篩作為納米反應(yīng)器實現(xiàn)α-Ala的旋光異構(gòu)可行,同時說明生命體內(nèi)的α-Ala在類似于MOR分子篩與水的復(fù)合納米環(huán)境下可以旋光異構(gòu).
從圖3可知,a_TS2·3H2O@MOR與a_TS2·2H2O@MOR產(chǎn)生的能壘比a_TS2·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘顯著降低.a_TS2·3H2O@MOR產(chǎn)生的能壘比a_TS2·2H2O@MOR產(chǎn)生的能壘微高.為從過渡態(tài)和反應(yīng)物的幾何結(jié)構(gòu)上對此現(xiàn)象加以解釋,將3個過渡態(tài)環(huán)形結(jié)構(gòu)的氫鍵鍵角和二面角列于表1.3個過渡態(tài)對應(yīng)的反應(yīng)物a_S-INT1·1H2O@MOR、a_S-INT1·2H2O@MOR和a_S-INT1·3H2O@MOR的參與H遷移反應(yīng)的主要原子間距列于表2.
表2 a_S-INT1·1H2O@MOR、a_S-INT1·2H2O@MOR和a_S-INT1·3H2O@MOR的主要結(jié)構(gòu)參數(shù)
從表1可以看出,7元環(huán)過渡態(tài)a_TS2·2H2O@MOR和9元環(huán)過渡態(tài)a_TS2·3H2O@MOR的氫鍵鍵角比5元環(huán)過渡態(tài)a_TS2·1H2O@MOR的氫鍵鍵角大許多,接近平角,氫鍵強許多.因此,7元環(huán)a_TS2·2H2O@MOR和9元環(huán)a_TS2·3H2O@MOR結(jié)構(gòu)會比5元環(huán)過渡態(tài)a_TS2·1H2O@MOR穩(wěn)定許多.
從表2的2、3和4行第2列可以看出: 隨著與S-INT1通過氫鍵結(jié)合的水分子個數(shù)的增加,決定a_S-INT1經(jīng)a_TS2向a_INT2異構(gòu)反應(yīng)難易程度的347C-359H鍵長逐漸增加,說明α-H與手性C之間的化學鍵變得越來越松弛;361H-352N的距離迅速減小,說明氨基N與其要接受的H的靜電力會迅速增大,亦即氨基N接受H能力越來越大.從表2的2、3和4行第3和4列可以看出: 手性碳上的氫359H距離其要遷移的目標氧原子360O越來越近,360O對359H的靜電引力越來越大,亦即360O對359H的接受能力越來越強;對于即將前往氨基N的361H,是距離與其連接的氧360O和364O越來越遠,亦即與其連接的氧360O和364O之間的化學鍵越來越弱;a_S-INT1·2H2O@MOR中的360O-363H比a_S-INT1·1H2O@MOR中的360O-361H相對也大很多,360O-363H鍵也比360O-361H鍵弱.從表2的2、3和4行第3、4和5列可以看出: a_S-INT1·1H2O、a_S-INT1·2H2O和a_S-INT1·3H2O的水分子鏈部分,水分子上將要遷移的H距離其要遠離的O之間的鍵長逐漸增大,而離其要前往的目標O之間的距離逐漸減小,這說明水鏈上的H遷移需要斷的O-H鍵越來越松弛,氫遷移越來越容易實現(xiàn).另外,前面已討論過,從a_S-INT1·1H2O@MOR到a_TS2·1H2O@MOR過程,347C-352N鍵長的伸長大于從a_S-INT1·2H2O@MOR到a_TS2·2H2O@MOR和從a_S-INT1·3H2O@MOR到a_TS2·3H2O@MOR過程.
前面對不同的過渡態(tài)和反應(yīng)物構(gòu)象幾何參數(shù)的分析,共同說明了a_TS2·1H2O@MOR、a_TS2·2H2O@MOR和a_TS2·3H2O@MOR 3個過渡態(tài)所產(chǎn)生的能壘應(yīng)該是越來越小.但表1中的第7和8行的二面角數(shù)據(jù)表明,過渡態(tài)a_TS2·3H2O@MOR的9元環(huán)比過渡態(tài)a_TS2·2H2O@MOR的7元環(huán)偏離平面的程度大,結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性要差,這說明了a_TS2·3H2O@MOR產(chǎn)生的能壘可能比a_TS2·2H2O@MOR產(chǎn)生的能壘低.
此通道的討論只在溶劑環(huán)境下.限域在MOR分子篩12元環(huán)孔道孔道與水復(fù)合環(huán)境下的α-Ala在b通道的旋光異構(gòu)有兩條路徑b1和b2,路徑b1又分為b1x和b1y兩條分路徑.各駐點的幾何構(gòu)型和過渡態(tài)虛頻振動模式見圖5(第263~264頁);旋光異構(gòu)反應(yīng)前半程的吉布斯自由能勢能剖面見圖6(第265頁).以后的勢能面見圖4的a_INT2 以后的過程(第3和4基元反應(yīng)).篇幅所限,對路徑b1和b2的決速步第1基元反應(yīng)作詳細討論,其他基元反應(yīng)僅作一般討論.
對于b1路徑,反應(yīng)歷程的第1步見圖5(a)中的b1(c)_S-Ala·1H2O@MOR經(jīng)b1(c)_TS1·1H2O@MOR到b1(c)_INT1·1H2O@MOR的過程.反應(yīng)物S-Ala與其手性碳和羰基前面的1個水分子以氫鍵結(jié)合的水合分子的包結(jié)物b1(c)_S-Ala·1H2O@MOR,經(jīng)過以1個水分子作氫遷移媒介,手性碳上的H原子向羰基遷移的過渡態(tài)b1(c)_TS1·1H2O@MOR,異構(gòu)成質(zhì)子化羧基上部和下部的H原子分別在紙面里和外的中間體包結(jié)物b1(c)_INT1·1H2O@MOR.因為該過程是b通道的第1路徑和后面將要討論的c通道的公共步驟,所以該步反應(yīng)過程的駐點的前面都同時標記為b1(c).結(jié)構(gòu)分析表明,從b1(c)_S-Ala·1H2O@MOR到6元環(huán)結(jié)構(gòu)過渡態(tài)b1(c)_TS1·1H2O@MOR,反應(yīng)活性中心骨架二面角352N-347C-355C-360O從2.25°變?yōu)?8.04°,增加45.79°;鍵長347C-349H從0.10964nm變?yōu)?.14863nm,拉長了0.03899nm.這遠小于裸反應(yīng)此過程這兩個量的增加值88.74°和0.04713nm[6].又b1(c)_TS1·1H2O@MOR的分子內(nèi)氫鍵鍵角為155.83°和145.30°,氫鍵較強;二面角356O-361H-360O-359H和361H-360O-359H-347C分別為-9.90°和38.35°,六元環(huán)結(jié)構(gòu)偏離平面不大,過渡態(tài)b1(c)_TS1·1H2O@MOR較穩(wěn)定.因此,b1(c)_TS1·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘會遠小于此基元裸反應(yīng)的能壘326.6kJ·mol-1[6],但從b1(c)_S-Ala·1H2O@MOR到b1(c)_TS1·1H2O@MOR,構(gòu)象有了不小的形變,因此b1(c)_TS1·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘還是較高,能壘值是191.8kJ·mol-1,這是b1路徑的決速步能壘.
當b1(c)_INT1·1H2O@MOR中的水分子脫附后,INT1的質(zhì)子化羧基上部的H在紙面外,下部的H在紙面里,接下來分成兩個分路徑b1x和b1y.
分路徑b1x是,INT1的質(zhì)子化羧基下部的H與紙里面的2個水分子簇通過氫鍵作用形成的水合物包結(jié)物b1x_INT1·2H2O@MOR,經(jīng)過渡態(tài)b1x_TS2·2H2O@MOR,實現(xiàn)了質(zhì)子化羧基上的H在紙面里以2個H2O分子為媒介,從羥基向氨基氮的遷移,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物b1x_INT2(a_INT2)·2H2O@MOR.計算表明,b1x_INT2即是a_INT2,后面的過程全同于a通道a_INT2以后的過程.結(jié)構(gòu)分析表明,過渡態(tài)b1x_TS2·2H2O@MOR的氫鍵鍵角接近平角,且過渡態(tài)環(huán)形結(jié)構(gòu)基本共面,因此過渡態(tài)b1x_TS2·2H2O@MOR的構(gòu)象比較穩(wěn)定.其產(chǎn)生的能壘不高,只有37.9kJ·mol-1.
分路徑b1y是,b1(c)_INT1·1H2O@MOR中的INT1脫水后,b1y_INT1@MOR經(jīng)氨基上的兩個H在紙面里外擺動的過渡態(tài)b1y_TS2@MOR,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物包結(jié)物b1y_INT2@MOR.此基元反應(yīng)骨架結(jié)構(gòu)基本沒變,所以活化能較低,只有10.8kJ·mol-1.然后,b1y_INT2與手性碳和羧基前面(紙面外)的2個水分子簇通過氫鍵作用形成的水合物包結(jié)物b1y_INT2·2H2O@MOR,經(jīng)過以手性碳和羧基前面(紙面外)的2個水分子作氫遷移媒介的過渡態(tài)b1y_TS3·2H2O@MOR,異構(gòu)成中間體產(chǎn)物包結(jié)物b1y_INT3(aINT2)·2H2O@MOR,計算表明,此中間體產(chǎn)物即是aINT2,所以這個中間體產(chǎn)物包結(jié)物記為b1yINT3(aINT2)·2H2O@MOR.結(jié)構(gòu)分析表明,7元環(huán)過渡態(tài)b1y_TS3·2H2O@MOR的氫鍵鍵角接近平角,并且7元環(huán)結(jié)構(gòu)基本共面,所以,b1y_TS3·2H2O@MOR產(chǎn)生的能壘不高,只有45.5kJ·mol-1.接下來的過程同于a通道a_INT2以后的過程,不再贅述.
圖5 MOR分子篩內(nèi)水分子催化S-α-Ala在b通道旋光異構(gòu)反應(yīng)的前半程Fig.5 The first half section of optical isomerism reaction of S-α-Ala confined in the MOR zeolite in channel b (protonation process of amino group)
路徑b2的前兩步反應(yīng)歷程見圖5(b).首先,2個或3個水分子簇在S-Ala分子的前面與手性碳和羰基氧通過氫鍵作用形成的絡(luò)合物分子b2_S-Ala·2H2O@MOR和b2_S-Ala·3H2O@MOR,經(jīng)2和3個水分子簇作氫遷移媒介,手性碳上的H向羰基遷移,同時氨基上的2個H做俯視順時針微小旋轉(zhuǎn)的過渡態(tài)b2_TS1·2H2O@MOR和b2_TS1·3H2O@MOR,異構(gòu)成質(zhì)子化羧基和其他骨架原子基本在同一平面內(nèi)的中間體產(chǎn)物b2_INT1·2H2O@MOR和b2_INT1·3H2O@MOR.結(jié)構(gòu)分析表明,10元環(huán)結(jié)構(gòu)過渡態(tài)b2_TS1·3H2O@MOR的氫鍵鍵角分別為168.83°、172.55°、175.62°和172.10°,8元環(huán)結(jié)構(gòu)過渡態(tài)b2_TS1·2H2O@MOR的氫鍵鍵角分別為159.58°、165.01°和169.65°,前者更接近平角,氫鍵強,過渡態(tài)穩(wěn)定性好;從b2_S-Ala·3H2O@MOR到b2_TS1·3H2O@MOR和b2_S-Ala·2H2O@MOR到b2_TS1·2H2O@MOR過程,反應(yīng)活性中心骨架二面角352N-347C-355C-356O的增加值,前者是13.74°,后者是22.23°,前者形變能小.因此,b2_TS1·3H2O@MOR比b2_TS1·2H2O@MOR產(chǎn)生的能壘小,它們產(chǎn)生的能壘分別是150.2和171.4kJ·mol-1,與b1(c)_TS1·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘191.8kJ·mol-1相比較大幅降低.
計算表明,當b2_INT1·2H2O@MOR和b2_INT1·3H2O@MOR上的水分子脫附后,b2_INT1的氨基上的2個H做俯視逆時針旋轉(zhuǎn),一個H在紙面里,另一個H在紙面外,記為b2_INT1(p).b2_INT1(p)與在其氨基和質(zhì)子化羧基上部的氫之間的1個水分子以氫鍵結(jié)合的水合分子b2_INT1(p)·1H2O@MOR,經(jīng)過以1個水分子作氫遷移媒介的過渡態(tài)b2_TS2·1H2O@MOR,實現(xiàn)了質(zhì)子化羧基上部的H從羥基氧向氨基N的轉(zhuǎn)移,異構(gòu)成的中間體產(chǎn)物記為b2_INT2(a_INT2)·1H2O@MOR.計算表明b2_INT2即是a_INT2,其后面的過程全同于a_INT2以后的過程,不再贅述.結(jié)構(gòu)分析表明,7元環(huán)過渡態(tài)b2_TS2·1H2O@MOR的氫鍵鍵角接近平角,7元環(huán)結(jié)構(gòu)基本共面過渡態(tài)比較穩(wěn)定;又從b2_INT1(p)·1H2O@MOR到b2_TS2·1H2O@MOR,骨架結(jié)構(gòu)基本沒變.所以,從b2_INT1(p)·1H2O@MOR到b2_TS2·1H2O@MOR需要越過的能壘不高,只有10.8kJ·mol-1.
圖6 水溶劑環(huán)境下限域在MOR分子篩的S-α-Ala,在b通道旋光異構(gòu)前半程的吉布斯自由能勢能面Fig.6 Gibbs energy surface of the first half section of optical isomerism reaction of S-α-Ala confined in the MOR zeolite in channel b in aqueous solvent environment
綜合圖6和圖4看出,在b通道上S-α-Ala實現(xiàn)手性對映體轉(zhuǎn)變的決速步自由能壘來自于第一個過渡態(tài),即手性C上的H向羰基O轉(zhuǎn)移的過渡態(tài).在3個水分子作H遷移媒介與水溶劑的助催化作用下,決速步能壘被降到最低值150.2kJ·mol-1,與此通道裸反應(yīng)決速步能壘326.6kJ·mol-1[6]和只是限域在MOR分子篩12元環(huán)孔道孔道此反應(yīng)路徑的決速步能壘309.6kJ·mol-1[13]相比均大幅降低,與只在水環(huán)境下此通道的決速步能壘173.0kJ·mol-1[24]相比也明顯降低.說明MOR分子篩與水復(fù)合環(huán)境對質(zhì)子從手性C向羰基O的遷移反應(yīng)具有較好的共催化作用.150.2kJ·mol-1已經(jīng)低于質(zhì)子遷移的“極限能壘”167.0kJ·mol-1[23]許多,再考慮到生命體內(nèi)溫度的漲落、分子間的碰撞以及某種酶的作用是可以越過的.結(jié)合圖6和圖4可以看出,b2路徑具有優(yōu)勢,當3個水分子作決速步的H遷移媒介時,α-Ala分子可以在此路徑實現(xiàn)旋光異構(gòu).由于b1路徑?jīng)Q速步的自由能壘191.8kJ·mol-1已經(jīng)高于質(zhì)子遷移的“極限能壘”167.0kJ·mol-1[23]許多,因此,此路徑只是理論上存在.
反應(yīng)的第1基元(前半程)即是前面圖5(a)中的b1(c)_S-Ala·1H2O@MOR經(jīng)b1(c)_TS1·1H2O@MOR到b1(c)_INT1·1H2O@MOR的過程.當b1(c)_INT1·1H2O@MOR中的INT1脫水后,INT1的質(zhì)子化羧基上部的H在紙面外,下部的H在紙面里.
接下來是第2基元反應(yīng)(后半程),各駐點的幾何構(gòu)型和過渡態(tài)虛頻振動模式見圖7(第266頁),在c通道旋光異構(gòu)反應(yīng)的吉布斯自由能勢能剖面見圖8(第266頁).INT1的質(zhì)子化羧基下部的H與紙面里的1個水分子以氫鍵結(jié)合形成的水合分子包結(jié)物c_INT1·1H2O(q)@MOR[后綴q表示c_INT1·1H2O(q)區(qū)別于第1基元的b1(c)_INT1·1H2O,兩者水分子的位置不同],其經(jīng)過渡態(tài)c_TS2·1H2O@MOR,實現(xiàn)了質(zhì)子化羧基上的H在紙的里面以1個H2O分子為媒介從羥基向手性碳的遷移,異構(gòu)成產(chǎn)物c_R-Ala·1H2O@MOR,S-Ala完成了旋光異構(gòu).此基元反應(yīng)相似于第1基元反應(yīng)的逆過程,從c_INT1·1H2O(q)@MOR到c_TS2·1H2O@MOR過程,反應(yīng)活性中心二面角357O-355C-347C-352N改變5.8°,鍵長357O-362H和360O-359H分別拉長0.02282nm和0.02062nm,構(gòu)象形變較小.因此,c_TS2·1H2O@MOR產(chǎn)生的能壘不高,只有98.9kJ·mol-1.
圖7 α-丙氨酸限域在MOR分子篩與水溶劑復(fù)合環(huán)境下c通道的后半程Fig.7 The second half section of optical isomerism reaction of α-Ala confined in the MOR zeolite and water combined environment in channel c
圖8 α-Ala限域在MOR分子篩與水溶劑復(fù)合環(huán)境下,在c通道實現(xiàn)旋光異構(gòu)的自由能勢能剖面Fig.8 Gibbs energy surface of optical isomerism reaction of α-Ala confined in the MOR zeolite and water combined environment in channel c
從圖8可以看出,在c通道實現(xiàn)旋光異構(gòu)的決速步自由能壘是191.8kJ·mol-1,來自于第1個過渡態(tài),即質(zhì)子從手性C向羰基O轉(zhuǎn)移的過渡態(tài).由于決速步能壘191.8kJ·mol-1已經(jīng)遠高于質(zhì)子遷移的“極限能壘”167.0kJ·mol-1[23],因此,在路徑c的旋光異構(gòu),很難實現(xiàn).
文獻[7]的研究表明,氣相α-Ala還存在羧基內(nèi)氫遷移后α-氫向羰基氧遷移,形成質(zhì)子化羧基.這之后有兩個通道,1是質(zhì)子化羧基上的質(zhì)子在紙面里側(cè)向α-碳遷移,2是質(zhì)子化羧基上的質(zhì)子向甲基與甲基上的1個氫在紙面里向α-碳協(xié)同遷移.前者的機理相似于只以羰基氧為橋的通道,本工作沒有贅述.后者限域在分子篩內(nèi)的過渡態(tài)沒有找到,期望以后的工作會解決此問題.
標題反應(yīng)可以在3個通道實現(xiàn),分別是質(zhì)子α-氫以氨基氮、順次以羰基氧與氨基氮和只以羰基氧為橋,從α-碳的一側(cè)遷移到另一側(cè).勢能面計算表明: 質(zhì)子只以氨基氮為橋遷移的通道具有優(yōu)勢,水溶劑環(huán)境下2個和3個水分子簇做質(zhì)子轉(zhuǎn)移媒介以及分子篩的限域作用下,決速步能壘分別是116.1和111.2kJ·mol-1.結(jié)果表明: 水溶劑環(huán)境下MOR分子篩對α-Ala分子的旋光異構(gòu)有較好的限域催化作用,水溶劑環(huán)境下的MOR分子篩可作為實現(xiàn)α-Ala旋光異構(gòu)理想的納米反應(yīng)器.