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        胃癌組織中趨化因子及其受體相關變化及作用分析

        2019-04-17 08:21:36王鵬飛金勁激胡暢遠陳文靜朱冠保程駿
        溫州醫(yī)科大學學報 2019年3期
        關鍵詞:基因芯片趨化因子組織化學

        王鵬飛,金勁激,胡暢遠,陳文靜,朱冠保,程駿

        (溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院 胃腸外科,浙江 溫州 325015)

        胃惡性腫瘤在全球遍發(fā),腫瘤微環(huán)境中的細胞因子對腫瘤的發(fā)生發(fā)展起著重要作用。趨化因子可調控癌癥的發(fā)生發(fā)展[1]。每一種趨化因子的功能作用均有不同,CXC族趨化因子配基17(CXC chemokine ligand 17,CXCL17)是一個與黏膜相關的內環(huán)境穩(wěn)定趨化因子[2-3],在某些胃癌中也發(fā)現(xiàn)CXCL17的表達[4-5],但在其發(fā)生發(fā)展中的作用及機制少見報道。本課題組檢測胃癌微環(huán)境中趨化因子的差異表達情況,并通過生物信息學分析其相關作用,從中挑選出CXCL17在mRNA水平及蛋白水平分別進行驗證,并結合臨床病理數(shù)據(jù)分析其臨床相關性,為胃癌的綜合防治策略提供新的思路。

        1 材料和方法

        1.1 材料和標本 趨化因子及其受體基因表達譜PCR芯片由江蘇楚天生物科技有限公司定制。TRIzol試劑購自美國Invitrogen公司,ReverTra Ace反轉錄試劑盒和SYBR Master Mix熒光定量PCR試劑盒購自上海Toyobo公司,小鼠抗人CXCL17蛋白抗體購自美國R&D公司,HRP標記羊抗小鼠 II抗、羊血清和DAB顯色劑購自北京中杉金橋生物公司,引物由華大基因科技股份有限公司合成。30例胃癌及相應癌旁正常組織均取自溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院的胃癌術后標本,均經病理組織檢查證實。組織新鮮標本在手術切除后30 min內在液氮中保存,以備RNA提取,石蠟標本經4%中性甲醛固定,石蠟包埋,用于免疫組織化學檢測。本研究經溫州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院倫理委員會批準。

        1.2 方法

        1.2.1 RNA抽提和PCR基因芯片檢測:提自液氮保存的胃癌及其相應癌旁正常組織(距腫瘤病灶大于5 cm)3對,分別剪碎并混合,參照TRIzol試劑說明書抽提總RNA并進行純化、質檢,應用趨化因子及其受體PCR芯片進行qRT-PCR檢測胃癌組織及癌旁正常組織中基因表達差異情況。cDNA按照Rever-Tra Ace反轉錄試劑盒說明書進行反轉錄。以15 μL反應體系進行定量PCR,PCR芯片中每孔已固定有特異性引物,反應體系包括1 μL反轉錄產物、2×SYBR Green I Master Mix。步驟為:94 ℃ 5 min,94 ℃30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,循環(huán)40次(BIO-RAD,CFX96),采用相對定量法,以2-ΔΔCt表示標本中各基因相對表達量。

        1.2.2 癌癥基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)資料收集與分析:從TCGA數(shù)據(jù)庫中(https∶//cancergenome.nih.gov/)下載并預處理胃癌數(shù)據(jù)集(STAD)的mRNA表達數(shù)據(jù),共有32個正常樣本及376個腫瘤樣本。利用R語言對數(shù)據(jù)集進行差異基因分析,從中找出CXCL17基因的表達情況,明確其在腫瘤與正常組織中的表達差異情況。

        1.2.3 免疫組織化學染色:胃癌及癌旁配對正常組織石蠟切片分別經二甲苯脫蠟、梯度乙醇水化、3%H2O2阻斷內源性過氧化氫酶。經過微波修復,冷卻至室溫后,羊血清封閉1 h。甩去血清后滴加CXCL17特異性抗體,4 ℃冰箱孵育過夜。次日,室溫下復溫30 min后滴加羊抗鼠二抗,37 ℃孵育30 min。PBS清洗后進行DAB顯色、蘇木素復染、中性樹膠封片。以已知免疫組織化學染色陽性的切片作為陽性對照,以PBS代替一抗作為陰性對照。平均吸光度值由Image-Pro Plus 6.0軟件檢測所得。

        1.3 統(tǒng)計學處理方法 采用SPSS 21.0軟件進行統(tǒng)計分析。計量資料采用±s表示,對免疫組織化學結果與各臨床病理特征進行t檢驗或單因素方差分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結果

        2.1 胃癌微環(huán)境中趨化因子及其受體差異表達情況 提取胃癌組織及配對的癌旁正常組織中細胞總RNA,利用趨化因子表達譜PCR芯片,測量胃癌中腫瘤組織及癌旁正常組織中趨化因子及其受體的差異表達情況。芯片中取溶解曲線為單一尖峰的測量孔作為有效數(shù)據(jù),同時取比值大于2.0或小于0.5的數(shù)據(jù)點為存在顯著表達差異的基因點,3對組織樣本結果共測得差異表達基因49個,其中上調基因11個,下調基因38個,CXCL17差異量最大,見圖1。

        圖1 胃癌組織相對癌旁正常組織中趨化因子及其受體差異表達情況

        2.2 基因芯片結果分析 與癌旁正常組織相比,胃癌組織中相關趨化因子及其受體存在明顯差異表達情況,按照基因GO的功能分析,這些差異表達的基因功能主要表現(xiàn)在免疫應答、炎癥反應及趨化因子調節(jié)信號通路等,見圖2。

        2.3 TCGA數(shù)據(jù)庫中CXCL17 mRNA表達差異 通過基因芯片結果可見胃癌腫瘤組織中CXCL17 mRNA表達量明顯降低,而CXCL17作為芯片結果中差異顯著的基因,我們挑選其對芯片結果進行進一步的驗證。在TCGA數(shù)據(jù)庫中,我們利用R語言對32個正常組織及376個胃癌組織進行差異表達基因分析,發(fā)現(xiàn)CXCL17在胃癌組織中表達量明顯低于正常組織(P<0.01),其結果與基因芯片結果一致。見圖3。

        圖2 差異基因生物信息學功能分類情況

        圖3 TCGA數(shù)據(jù)庫中CXCL17在胃癌組織中mRNA表達量明顯降低

        2.4 CXCL17在胃癌組織中表達降低 免疫組織化學實驗結果示胃癌組織中CXCL17蛋白表達量與正常組織比明顯降低,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.01),結果與基因芯片結果相一致,進一步驗證了基因芯片結果的真實性與可靠性。見圖4。

        2.5 CXCL17蛋白表達與胃癌病理特征分析 對30例胃癌組織中CXCL17表達情況及其病理特征進行分析,結果顯示CXCL17與胃癌分化程度密切相關,主要表現(xiàn)為腫瘤分化程度越低,CXCL17蛋白表達越低,低分化組織幾乎不表達CXCL17蛋白,表達水平差異有統(tǒng)計學意義(P<0.01),見圖4D。

        3 討論

        本研究通過表達譜PCR基因芯片成功篩選出胃癌相關差異表達的趨化因子及其受體,并通過生物信息學分析差異基因的功能主要在于免疫應答、炎癥反應及趨化因子調節(jié)信號通路等方面。在腫瘤微環(huán)境中,多種腫瘤細胞和基質細胞可以分泌趨化因子。趨化因子及其受體的定向結合直接影響著腫瘤發(fā)展和腫瘤細胞轉移。機體的免疫系統(tǒng)可以識別腫瘤抗原,進而對腫瘤細胞產生免疫效應。隨著腫瘤演進,最初的免疫監(jiān)視作用往往被誘導形成免疫耐受,趨化因子在這一過程中發(fā)揮重要作用。大量研究證實了趨化因子及其受體在胃癌中起重要作用,而CCL19/CCL21-CCR7及CXCL12-CXCR4軸的作用尤為突出[6],CCL19/CCL21-CCR7在胃癌淋巴結轉移過程中起著突出作用,CCR7可能成為特異性評價胃癌淋巴結轉移潛能的分子標志物[7],而CXCL12-CXCR4軸在胃癌腹膜轉移過程中起著關鍵作用[8],阻斷CXCL12-CXCR4軸有助于推動胃癌腹膜轉移治療策略的進一步發(fā)展。

        而我們從差異表達基因中挑選出了CXCL17做進一步的研究與驗證,TCGA數(shù)據(jù)分析及免疫組織化學結果分別提示CXCL17在胃癌組織中表達量明顯降低,且與胃癌分化程度相關。而CXCL17是趨化因子CXC家族最新發(fā)現(xiàn)的一員,有研究指出,在胰腺癌中,CXCL17的表達隨著腫瘤惡性程度的提升而降低,而在肝癌、乳腺癌、結腸癌中,CXCL17在腫瘤中表達量上升[9-10]。針對CXCL17在不同腫瘤組織中呈現(xiàn)的不同表現(xiàn),WEINSTEIN等[11]認為CXCL17能夠誘導VEGF相關因子表達從而間接促進腫瘤血管生成,加速腫瘤生長;HIRAOKA等[12]則認為,CXCL17可介導T細胞的免疫應答,募集樹突狀細胞浸潤腫瘤組織,從而產生抗腫瘤免疫作用?;谏鲜鲅芯?,我們推測CXCL17在胃癌中的表達下調,可能在胃癌中作為一個抑癌角色參與胃癌的發(fā)生發(fā)展。

        圖4 CXCL17在胃癌中表達情況

        綜上所述,本研究利用基因芯片測量胃癌微環(huán)境中趨化因子相關改變,進一步驗證了趨化因子及其受體在胃癌的發(fā)生發(fā)展中的重要作用。另外,本研究進一步完善胃癌中CXCL17的背景資料,并為胃癌的特異性治療提供有力的實驗基礎和理論依據(jù)。但趨化因子及其受體在免疫反應及胃癌發(fā)生發(fā)展中存在極其復雜的聯(lián)系,尚需在今后的研究中進一步進行探究。

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